More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4074 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4074  chemotaxis methyltransferase  100 
 
 		 302 aa  629  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0237  protein-glutamate O-methyltransferase  85.96 
 
 		 307 aa  525  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.291409 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0300  MCP methyltransferase, CheR-type  82.12 
 
 		 302 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000961073  normal  0.256387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0332  MCP methyltransferase, CheR-type  81.79 
 
 		 302 aa  525  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.284961 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2710  protein-glutamate O-methyltransferase  54.9 
 
 		 298 aa  331  9e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1444  MCP methyltransferase, CheR-type  54.39 
 
 		 300 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3625  MCP methyltransferase, CheR-type  53.77 
 
 		 298 aa  318  6e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0636111 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0281  MCP methyltransferase, CheR-type  52.82 
 
 		 292 aa  317  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2434  putative MCP methyltransferase, CheR1  47.48 
 
 		 305 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1098  protein-glutamate O-methyltransferase  47.48 
 
 		 305 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3469  MCP methyltransferase, CheR-type  44.96 
 
 		 280 aa  245  9e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.912759  normal  0.640591 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0757  MCP methyltransferase, CheR-type  43.12 
 
 		 275 aa  244  9.999999999999999e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3204  MCP methyltransferase, CheR-type  45.22 
 
 		 285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.25041  normal  0.841939 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2839  MCP methyltransferase, CheR-type  46.07 
 
 		 293 aa  243  3.9999999999999997e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.40202  normal  0.212015 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1796  protein-glutamate O-methyltransferase  47.21 
 
 		 294 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  42.28 
 
 		 288 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  41.18 
 
 		 280 aa  218  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  40.65 
 
 		 280 aa  217  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3104  MCP methyltransferase, CheR-type  40.81 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2146  MCP methyltransferase, CheR-type  40.81 
 
 		 271 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3498  protein-glutamate O-methyltransferase  43.01 
 
 		 273 aa  209  5e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3062  MCP methyltransferase, CheR-type  40.29 
 
 		 297 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3788  MCP methyltransferase, CheR-type  40.29 
 
 		 297 aa  195  9e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1932  MCP methyltransferase, CheR-type  41.09 
 
 		 283 aa  189  5e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1617  MCP methyltransferase, CheR-type  41.85 
 
 		 289 aa  188  8e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0700  MCP methyltransferase, CheR-type  39.57 
 
 		 284 aa  187  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4376  MCP methyltransferase, CheR-type  37.72 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.525329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0569  MCP methyltransferase, CheR-type  38.13 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.429442  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0040  CheR methyltransferase, SAM binding domain protein  37 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0089  MCP methyltransferase, CheR-type  39.69 
 
 		 283 aa  187  3e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2475  MCP methyltransferase, CheR-type  38.27 
 
 		 303 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0126751  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5610  MCP methyltransferase, CheR-type  42.75 
 
 		 303 aa  186  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1988  Protein-glutamate O-methyltransferase  38.72 
 
 		 275 aa  185  8e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0661  MCP methyltransferase, CheR-type  39.29 
 
 		 271 aa  185  8e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2571  MCP methyltransferase, CheR-type  38.79 
 
 		 303 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1539  protein-glutamate O-methyltransferase  35.29 
 
 		 291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4154  MCP methyltransferase, CheR-type  39.64 
 
 		 273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3691  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  40.21 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00198927  normal  0.0225149 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2162  protein-glutamate O-methyltransferase  38.43 
 
 		 272 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0657  MCP methyltransferase, CheR-type  36.69 
 
 		 296 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120935 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0975  MCP methyltransferase, CheR-type  38.35 
 
 		 281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2174  protein-glutamate O-methyltransferase  37.36 
 
 		 296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0466  MCP methyltransferase, CheR-type  35.51 
 
 		 295 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.176521 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1595  MCP methyltransferase, CheR-type  37.11 
 
 		 284 aa  182  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1043  MCP methyltransferase, CheR-type  41.37 
 
 		 283 aa  182  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22590  Protein-glutamate O-methyltransferase  36.43 
 
 		 309 aa  182  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1845  MCP methyltransferase, CheR-type  37.14 
 
 		 289 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.516279 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2420  MCP methyltransferase, CheR-type  39 
 
 		 289 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.503139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0159  chemotaxis protein methyltransferase CheR  39.46 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3218  MCP methyltransferase, CheR-type  41.28 
 
 		 295 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2984  protein-glutamate O-methyltransferase  35.16 
 
 		 285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0808  MCP methyltransferase, CheR-type  35.71 
 
 		 272 aa  179  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2618  MCP methyltransferase, CheR-type  36.33 
 
 		 292 aa  179  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0730  MCP methyltransferase, CheR-type  38.41 
 
 		 300 aa  179  4.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0443063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2622  chemotaxis methyltransferase CheR  40.49 
 
 		 286 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206628 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1756  MCP methyltransferase, CheR-type  40.49 
 
 		 286 aa  179  7e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0553359  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1980  chemotaxis methyltransferase CheR  40.49 
 
 		 286 aa  179  7e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0207  CheR methyltransferase SAM-binding domain-containing protein  38.91 
 
 		 270 aa  178  9e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1748  chemotaxis methyltransferase CheR  40.49 
 
 		 286 aa  178  9e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2177  chemotaxis methyltransferase CheR  40.49 
 
 		 286 aa  178  9e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0152  chemotaxis protein methyltransferase CheR  38.63 
 
 		 276 aa  178  9e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01855  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  40.49 
 
 		 286 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.435118  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1143  chemotaxis protein methyltransferase CheR  37.98 
 
 		 292 aa  178  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0207024  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3811  MCP methyltransferase, CheR-type  36.67 
 
 		 318 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01844  hypothetical protein  40.49 
 
 		 286 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.370669  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1382  MCP methyltransferase, CheR-type  38.43 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00055  chemotaxis protein methyltransferase 2  35.92 
 
 		 286 aa  176  4e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00310975  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1300  chemotaxis methyltransferase CheR  40.08 
 
 		 286 aa  176  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000891589 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2117  chemotaxis methyltransferase CheR  39.68 
 
 		 286 aa  175  7e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.396301  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  40.94 
 
 		 290 aa  175  8e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2700  MCP methyltransferase, CheR-type  36.23 
 
 		 288 aa  175  9e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0168  MCP methyltransferase, CheR-type  39.29 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.419483 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2166  protein-glutamate O-methyltransferase  39.15 
 
 		 292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00016475  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2455  chemotaxis methyltransferase CheR  37.19 
 
 		 288 aa  172  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2133  chemotaxis methyltransferase CheR  36.92 
 
 		 288 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000021864 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1327  chemotaxis methyltransferase CheR  36.92 
 
 		 288 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000151288 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1204  chemotaxis methyltransferase CheR  37.05 
 
 		 288 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2078  chemotaxis methyltransferase CheR  37.05 
 
 		 288 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.687941  hitchhiker  2.73756e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1077  MCP methyltransferase, CheR-type  41.24 
 
 		 300 aa  170  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329536 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2105  MCP methyltransferase, CheR-type  31.85 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2971  MCP methyltransferase, CheR-type  36.33 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000784275 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2073  chemotaxis methyltransferase CheR  39.11 
 
 		 288 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.50771  hitchhiker  0.000251677 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0635  MCP methyltransferase, CheR-type  38.91 
 
 		 301 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4164  MCP methyltransferase, CheR-type  37.45 
 
 		 293 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4052  MCP methyltransferase, CheR-type  37.45 
 
 		 293 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  32.16 
 
 		 281 aa  169  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.299383  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0241  MCP methyltransferase, CheR-type  38.52 
 
 		 325 aa  168  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0215152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2848  MCP methyltransferase, CheR-type  38.98 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.242371  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24390  protein-glutamate O-methyltransferase. chemotaxis protein  39.29 
 
 		 287 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.273905  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0259  MCP methyltransferase, CheR-type  38.98 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000294494  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1515  chemotaxis methyltransferase CheR  38.17 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2361  protein-glutamate O-methyltransferase  39.13 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0185  MCP methyltransferase, CheR-type  39.22 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1065  MCP methyltransferase, CheR-type  36.57 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0172  MCP methyltransferase, CheR-type  38.76 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581337  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1543  chemotaxis methyltransferase CheR  39.45 
 
 		 290 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.520759  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0255  putative chemotaxis protein methyltransferase  38.35 
 
 		 280 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3518  chemotaxis methyltransferase CheR  38.1 
 
 		 272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.577755 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2101  MCP methyltransferase, CheR-type  39.13 
 
 		 281 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.60784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2115  protein-glutamate O-methyltransferase  38.41 
 
 		 281 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>