More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2971 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2971  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
313 aa  647    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000784275 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3811  MCP methyltransferase, CheR-type  86.39 
 
 
318 aa  564  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0122  MCP methyltransferase, CheR-type  90.07 
 
 
316 aa  535  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0168  MCP methyltransferase, CheR-type  82.25 
 
 
328 aa  475  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.419483 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0241  MCP methyltransferase, CheR-type  81.57 
 
 
325 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0215152  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2848  MCP methyltransferase, CheR-type  81.57 
 
 
330 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.242371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0259  MCP methyltransferase, CheR-type  81.57 
 
 
330 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000294494  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3361  MCP methyltransferase, CheR-type  76.43 
 
 
327 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0405517  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3179  chemotaxis protein methyltransferase CheR  80.82 
 
 
314 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0185  MCP methyltransferase, CheR-type  80.89 
 
 
325 aa  467  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0172  MCP methyltransferase, CheR-type  80.89 
 
 
325 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581337  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2856  chemotaxis protein methyltransferase CheR  79.79 
 
 
314 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3933  chemotaxis protein methyltransferase CheR  79.86 
 
 
315 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0073  chemotaxis protein methyltransferase  80.14 
 
 
314 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1687  chemotaxis protein methyltransferase CheR  79.86 
 
 
315 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.460756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3852  chemotaxis protein methyltransferase  79.86 
 
 
315 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3119  chemotaxis protein methyltransferase CheR  79.86 
 
 
315 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830428  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3691  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  67.15 
 
 
303 aa  378  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00198927  normal  0.0225149 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5610  MCP methyltransferase, CheR-type  67.4 
 
 
303 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  63.12 
 
 
290 aa  364  1e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4164  MCP methyltransferase, CheR-type  61.09 
 
 
293 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4052  MCP methyltransferase, CheR-type  61.09 
 
 
293 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1617  MCP methyltransferase, CheR-type  60.29 
 
 
289 aa  351  8e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1405  chemotaxis protein methyltransferase  60.36 
 
 
292 aa  350  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.0669102 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4154  MCP methyltransferase, CheR-type  60.73 
 
 
273 aa  344  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1932  MCP methyltransferase, CheR-type  58.61 
 
 
283 aa  341  7e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2608  chemotaxis methyltransferase CheR  56.16 
 
 
290 aa  330  1e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.215293  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1515  chemotaxis methyltransferase CheR  56.69 
 
 
290 aa  328  9e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1858  chemotaxis methyltransferase CheR  55.48 
 
 
290 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24390  protein-glutamate O-methyltransferase. chemotaxis protein  58.24 
 
 
287 aa  327  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.273905  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1204  chemotaxis methyltransferase CheR  58.65 
 
 
288 aa  326  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2078  chemotaxis methyltransferase CheR  58.65 
 
 
288 aa  325  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.687941  hitchhiker  2.73756e-16 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2073  chemotaxis methyltransferase CheR  58.65 
 
 
288 aa  325  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.50771  hitchhiker  0.000251677 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1543  chemotaxis methyltransferase CheR  55.99 
 
 
290 aa  325  6e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.520759  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2133  chemotaxis methyltransferase CheR  58.27 
 
 
288 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000021864 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1327  chemotaxis methyltransferase CheR  58.27 
 
 
288 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000151288 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0730  MCP methyltransferase, CheR-type  56.46 
 
 
300 aa  323  3e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0443063  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1756  chemotaxis methyltransferase CheR  54.98 
 
 
295 aa  319  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.456402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1644  chemotaxis methyltransferase CheR  59.39 
 
 
272 aa  316  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3518  chemotaxis methyltransferase CheR  59.39 
 
 
272 aa  316  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.577755 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2622  chemotaxis methyltransferase CheR  55.64 
 
 
286 aa  315  7e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000206628 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1756  MCP methyltransferase, CheR-type  55.64 
 
 
286 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0553359  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1748  chemotaxis methyltransferase CheR  55.64 
 
 
286 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1300  chemotaxis methyltransferase CheR  56.02 
 
 
286 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000891589 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2117  chemotaxis methyltransferase CheR  55.26 
 
 
286 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.396301  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1980  chemotaxis methyltransferase CheR  55.64 
 
 
286 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2177  chemotaxis methyltransferase CheR  55.64 
 
 
286 aa  314  9.999999999999999e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2455  chemotaxis methyltransferase CheR  56.02 
 
 
288 aa  314  9.999999999999999e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01855  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  55.64 
 
 
286 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.435118  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01844  hypothetical protein  55.64 
 
 
286 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.370669  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2981  chemotaxis methyltransferase CheR  55.75 
 
 
290 aa  310  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2166  protein-glutamate O-methyltransferase  55.91 
 
 
292 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00016475  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4376  MCP methyltransferase, CheR-type  56.13 
 
 
295 aa  309  5e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.525329  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1077  MCP methyltransferase, CheR-type  55.32 
 
 
300 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329536 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3788  MCP methyltransferase, CheR-type  55.76 
 
 
297 aa  305  6e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3062  MCP methyltransferase, CheR-type  55.39 
 
 
297 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2174  protein-glutamate O-methyltransferase  54.42 
 
 
296 aa  300  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432884  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0657  MCP methyltransferase, CheR-type  54.07 
 
 
296 aa  296  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.120935 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0569  MCP methyltransferase, CheR-type  53.7 
 
 
298 aa  293  4e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.429442  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0700  MCP methyltransferase, CheR-type  54.61 
 
 
284 aa  288  9e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2700  MCP methyltransferase, CheR-type  51.89 
 
 
288 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0207  CheR methyltransferase SAM-binding domain-containing protein  47.94 
 
 
270 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0159  chemotaxis protein methyltransferase CheR  47.94 
 
 
273 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1043  MCP methyltransferase, CheR-type  51.5 
 
 
283 aa  264  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00055  chemotaxis protein methyltransferase 2  48.19 
 
 
286 aa  262  4.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00310975  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3218  MCP methyltransferase, CheR-type  50.75 
 
 
295 aa  261  8e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1845  MCP methyltransferase, CheR-type  48.76 
 
 
289 aa  261  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.516279 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3302  protein-glutamate O-methyltransferase  47.55 
 
 
265 aa  257  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0255  putative chemotaxis protein methyltransferase  51.31 
 
 
280 aa  249  6e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02200  putative chemotaxis protein methyltransferase  49.63 
 
 
280 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.077708  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2115  protein-glutamate O-methyltransferase  45.29 
 
 
281 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0757  MCP methyltransferase, CheR-type  44.69 
 
 
275 aa  241  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2215  MCP methyltransferase, CheR-type  44.81 
 
 
276 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.556164  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1884  MCP methyltransferase, CheR-type  44.07 
 
 
276 aa  236  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0878954 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2124  chemotaxis protein methyltransferase CheR  43.84 
 
 
277 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2090  MCP methyltransferase, CheR-type  44.07 
 
 
276 aa  235  9e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.853389 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2244  protein-glutamate O-methyltransferase  44.2 
 
 
281 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00847323  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2162  protein-glutamate O-methyltransferase  46.04 
 
 
272 aa  231  9e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2361  protein-glutamate O-methyltransferase  43.48 
 
 
281 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2101  MCP methyltransferase, CheR-type  43.48 
 
 
281 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.60784  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0089  MCP methyltransferase, CheR-type  40.59 
 
 
283 aa  222  6e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3104  MCP methyltransferase, CheR-type  42.16 
 
 
285 aa  222  8e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22590  Protein-glutamate O-methyltransferase  38.14 
 
 
309 aa  215  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  42.81 
 
 
280 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  43.84 
 
 
288 aa  207  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  44.91 
 
 
280 aa  207  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3432  chemotaxis protein methyltransferase  77.46 
 
 
189 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.615844  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2146  MCP methyltransferase, CheR-type  42.16 
 
 
271 aa  202  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3498  protein-glutamate O-methyltransferase  44.74 
 
 
273 aa  199  5e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0152  chemotaxis protein methyltransferase CheR  38.52 
 
 
276 aa  199  6e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0635  MCP methyltransferase, CheR-type  39.43 
 
 
301 aa  198  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2618  MCP methyltransferase, CheR-type  38.95 
 
 
292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0281  MCP methyltransferase, CheR-type  40.22 
 
 
292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354754  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0626  MCP methyltransferase, CheR-type  39.07 
 
 
301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.325159  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1988  Protein-glutamate O-methyltransferase  38.64 
 
 
275 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1595  MCP methyltransferase, CheR-type  38.58 
 
 
284 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0645  protein-glutamate O-methyltransferase  38.67 
 
 
302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0464454  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0661  MCP methyltransferase, CheR-type  36.5 
 
 
271 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0601  MCP methyltransferase, CheR-type  39.26 
 
 
299 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1146  MCP methyltransferase, CheR-type  39.03 
 
 
270 aa  188  9e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.492811  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>