More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1595 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_1595  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
284 aa  592  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2618  MCP methyltransferase, CheR-type  96.83 
 
 
292 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2984  protein-glutamate O-methyltransferase  74.1 
 
 
285 aa  429  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2420  MCP methyltransferase, CheR-type  65.58 
 
 
289 aa  381  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.503139  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1143  chemotaxis protein methyltransferase CheR  63.77 
 
 
292 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0207024  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1731  MCP methyltransferase, CheR-type  57.51 
 
 
290 aa  342  4e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1610  MCP methyltransferase, CheR-type  57.56 
 
 
274 aa  337  9.999999999999999e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  54.98 
 
 
281 aa  324  1e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.299383  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2105  MCP methyltransferase, CheR-type  54.51 
 
 
283 aa  317  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1539  protein-glutamate O-methyltransferase  54.04 
 
 
291 aa  308  5e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1405  MCP methyltransferase, CheR-type  51.06 
 
 
284 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216379  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0466  MCP methyltransferase, CheR-type  56.16 
 
 
295 aa  297  1e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.176521 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0625  MCP methyltransferase, CheR-type  53.11 
 
 
290 aa  295  4e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0875  MCP methyltransferase, CheR-type  51.66 
 
 
271 aa  293  2e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1382  MCP methyltransferase, CheR-type  50.9 
 
 
303 aa  285  8e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2475  MCP methyltransferase, CheR-type  51.42 
 
 
303 aa  279  3e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0126751  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2571  MCP methyltransferase, CheR-type  51.06 
 
 
303 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0617  MCP methyltransferase, CheR-type  47.97 
 
 
285 aa  275  8e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3557  MCP methyltransferase, CheR-type  49.63 
 
 
285 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.132708  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4669  MCP methyltransferase, CheR-type  46.26 
 
 
283 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.225745  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4310  chemotaxis methyltransferase  48.54 
 
 
293 aa  265  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3258  MCP methyltransferase, CheR-type  48.52 
 
 
285 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.572283  normal  0.159022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7834  MCP methyltransferase, CheR-type  47.62 
 
 
275 aa  260  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0141  MCP methyltransferase, CheR-type  45.96 
 
 
280 aa  251  7e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0351158  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6731  MCP methyltransferase, CheR-type  44.07 
 
 
273 aa  244  8e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079631  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4819  MCP methyltransferase, CheR-type  43.87 
 
 
282 aa  240  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728077  hitchhiker  0.00962017 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0089  MCP methyltransferase, CheR-type  42.18 
 
 
283 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0626  MCP methyltransferase, CheR-type  41.45 
 
 
301 aa  224  9e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.325159  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0635  MCP methyltransferase, CheR-type  41.09 
 
 
301 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0601  MCP methyltransferase, CheR-type  41.45 
 
 
299 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0808  MCP methyltransferase, CheR-type  42.34 
 
 
272 aa  217  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0267  protein-glutamate O-methyltransferase  40.23 
 
 
278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.647736 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0428  MCP methyltransferase, CheR-type  41.26 
 
 
275 aa  211  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0281  MCP methyltransferase, CheR-type  39.57 
 
 
292 aa  211  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354754  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1330  protein-glutamate O-methyltransferase  41.54 
 
 
270 aa  211  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0757  MCP methyltransferase, CheR-type  39.56 
 
 
275 aa  209  4e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0152  chemotaxis protein methyltransferase CheR  39.11 
 
 
276 aa  208  6e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0040  CheR methyltransferase, SAM binding domain protein  38.55 
 
 
283 aa  208  8e-53  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1587  chemotaxis methyltransferase, CheR2  40.6 
 
 
278 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0661  MCP methyltransferase, CheR-type  39.13 
 
 
271 aa  206  3e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3104  MCP methyltransferase, CheR-type  39.66 
 
 
285 aa  206  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0239  protein-glutamate O-methyltransferase  40.23 
 
 
278 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  38.38 
 
 
269 aa  204  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711153  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0645  protein-glutamate O-methyltransferase  41.24 
 
 
302 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0464454  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0614  MCP methyltransferase, CheR-type  38.01 
 
 
275 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0483798 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1199  methylase of chemotaxis methyl-accepting protein, CheR-like  40.36 
 
 
291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2215  MCP methyltransferase, CheR-type  39.64 
 
 
276 aa  198  9e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.556164  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0910  chemotaxis protein methyltransferase CheR  38.83 
 
 
269 aa  195  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1371  MCP methyltransferase, CheR-type  45.25 
 
 
268 aa  195  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.214752  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4376  MCP methyltransferase, CheR-type  38.28 
 
 
295 aa  195  6e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.525329  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0783  protein-glutamate O-methyltransferase  40.36 
 
 
269 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.827996  normal  0.901412 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22590  Protein-glutamate O-methyltransferase  35.94 
 
 
309 aa  195  8.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3811  MCP methyltransferase, CheR-type  40.23 
 
 
318 aa  195  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1043  MCP methyltransferase, CheR-type  40.94 
 
 
283 aa  194  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1988  Protein-glutamate O-methyltransferase  37.59 
 
 
275 aa  194  1e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3299  protein-glutamate O-methyltransferase  36.67 
 
 
275 aa  194  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3625  MCP methyltransferase, CheR-type  37.94 
 
 
298 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0636111 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3062  MCP methyltransferase, CheR-type  37.45 
 
 
297 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1077  MCP methyltransferase, CheR-type  41.04 
 
 
300 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329536 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3218  MCP methyltransferase, CheR-type  40.16 
 
 
295 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3788  MCP methyltransferase, CheR-type  37.45 
 
 
297 aa  193  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2710  protein-glutamate O-methyltransferase  39.18 
 
 
298 aa  193  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2146  MCP methyltransferase, CheR-type  38.46 
 
 
271 aa  192  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1146  MCP methyltransferase, CheR-type  38.77 
 
 
270 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.492811  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3204  MCP methyltransferase, CheR-type  40.23 
 
 
285 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.25041  normal  0.841939 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2090  MCP methyltransferase, CheR-type  38.55 
 
 
276 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.853389 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  37.78 
 
 
280 aa  190  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1884  MCP methyltransferase, CheR-type  38.18 
 
 
276 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0878954 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0657  MCP methyltransferase, CheR-type  38.19 
 
 
296 aa  190  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.120935 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1405  chemotaxis protein methyltransferase  38.98 
 
 
292 aa  189  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.0669102 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0730  MCP methyltransferase, CheR-type  40.94 
 
 
300 aa  189  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0443063  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0159  chemotaxis protein methyltransferase CheR  38.74 
 
 
273 aa  189  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0207  CheR methyltransferase SAM-binding domain-containing protein  38.74 
 
 
270 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5610  MCP methyltransferase, CheR-type  39.22 
 
 
303 aa  188  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  35.69 
 
 
280 aa  188  9e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2486  MCP methyltransferase, CheR-type  43.7 
 
 
268 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.613564  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0569  MCP methyltransferase, CheR-type  37.92 
 
 
298 aa  186  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.429442  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1565  protein-glutamate O-methyltransferase  37.09 
 
 
269 aa  186  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.724121  normal  0.553309 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2582  MCP methyltransferase, CheR-type  43.7 
 
 
268 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3691  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  39.22 
 
 
303 aa  186  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00198927  normal  0.0225149 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2174  protein-glutamate O-methyltransferase  36.94 
 
 
296 aa  185  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432884  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1444  MCP methyltransferase, CheR-type  39.53 
 
 
300 aa  185  7e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2115  protein-glutamate O-methyltransferase  35.92 
 
 
281 aa  185  7e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4164  MCP methyltransferase, CheR-type  38.58 
 
 
293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4052  MCP methyltransferase, CheR-type  38.58 
 
 
293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1573  MCP methyltransferase, CheR-type  37.16 
 
 
292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0438911  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1932  MCP methyltransferase, CheR-type  41.2 
 
 
283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  36.16 
 
 
288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4154  MCP methyltransferase, CheR-type  39.62 
 
 
273 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2848  MCP methyltransferase, CheR-type  40.15 
 
 
330 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.242371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0259  MCP methyltransferase, CheR-type  40.15 
 
 
330 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000294494  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0241  MCP methyltransferase, CheR-type  40.15 
 
 
325 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0215152  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0168  MCP methyltransferase, CheR-type  40.15 
 
 
328 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.419483 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4074  chemotaxis methyltransferase  37.11 
 
 
302 aa  182  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3546  MCP methyltransferase, CheR-type  36.96 
 
 
267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal  0.882443 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3302  protein-glutamate O-methyltransferase  36.06 
 
 
265 aa  182  6e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2839  MCP methyltransferase, CheR-type  41.33 
 
 
293 aa  182  7e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.40202  normal  0.212015 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3361  MCP methyltransferase, CheR-type  40.15 
 
 
327 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0405517  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2117  chemotaxis methyltransferase CheR  38.1 
 
 
286 aa  181  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.396301  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0172  MCP methyltransferase, CheR-type  39.77 
 
 
325 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>