More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1565 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1565  protein-glutamate O-methyltransferase  100 
 
 		 269 aa  545  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.724121  normal  0.553309 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  47.74 
 
 		 269 aa  235  4e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711153  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0910  chemotaxis protein methyltransferase CheR  46.01 
 
 		 269 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1146  MCP methyltransferase, CheR-type  41.83 
 
 		 270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.492811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0904  MCP methyltransferase, CheR-type  45.25 
 
 		 267 aa  232  5e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3299  protein-glutamate O-methyltransferase  41.35 
 
 		 275 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04754  CheR methyltransferase, SAM binding domain  45.04 
 
 		 268 aa  231  7.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584849  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0783  protein-glutamate O-methyltransferase  44.87 
 
 		 269 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.827996  normal  0.901412 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3546  MCP methyltransferase, CheR-type  43.35 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal  0.882443 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1528  MCP methyltransferase, CheR-type  45 
 
 		 266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.168715 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0335  MCP methyltransferase, CheR-type  43.82 
 
 		 280 aa  212  7e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0626  MCP methyltransferase, CheR-type  42.65 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.325159  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0635  MCP methyltransferase, CheR-type  41.54 
 
 		 301 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0601  MCP methyltransferase, CheR-type  41.18 
 
 		 299 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0428  MCP methyltransferase, CheR-type  41.26 
 
 		 275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2325  chemotaxis protein methyltransferase CheR  37.27 
 
 		 275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1756  MCP methyltransferase, CheR-type  43.27 
 
 		 286 aa  193  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0553359  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2622  chemotaxis methyltransferase CheR  43.27 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206628 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1748  chemotaxis methyltransferase CheR  43.27 
 
 		 286 aa  193  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1980  chemotaxis methyltransferase CheR  43.27 
 
 		 286 aa  193  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2177  chemotaxis methyltransferase CheR  43.27 
 
 		 286 aa  193  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01855  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  43.27 
 
 		 286 aa  192  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.435118  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01844  hypothetical protein  43.27 
 
 		 286 aa  192  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.370669  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1300  chemotaxis methyltransferase CheR  43.67 
 
 		 286 aa  193  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000891589 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2117  chemotaxis methyltransferase CheR  42.86 
 
 		 286 aa  192  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.396301  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2078  chemotaxis methyltransferase CheR  41.63 
 
 		 288 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.687941  hitchhiker  2.73756e-16 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1327  chemotaxis methyltransferase CheR  41.63 
 
 		 288 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000151288 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1204  chemotaxis methyltransferase CheR  41.63 
 
 		 288 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2133  chemotaxis methyltransferase CheR  41.63 
 
 		 288 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000021864 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2073  chemotaxis methyltransferase CheR  41.63 
 
 		 288 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.50771  hitchhiker  0.000251677 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2455  chemotaxis methyltransferase CheR  41.22 
 
 		 288 aa  189  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0875  MCP methyltransferase, CheR-type  41.41 
 
 		 271 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1405  MCP methyltransferase, CheR-type  39.3 
 
 		 284 aa  186  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216379  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0645  protein-glutamate O-methyltransferase  41.49 
 
 		 302 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0464454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1595  MCP methyltransferase, CheR-type  37.09 
 
 		 284 aa  186  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1143  chemotaxis protein methyltransferase CheR  36.86 
 
 		 292 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0207024  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2618  MCP methyltransferase, CheR-type  36.13 
 
 		 292 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  36.03 
 
 		 281 aa  179  4e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.299383  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1043  MCP methyltransferase, CheR-type  41.34 
 
 		 283 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3218  MCP methyltransferase, CheR-type  40.94 
 
 		 295 aa  178  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2984  protein-glutamate O-methyltransferase  36.3 
 
 		 285 aa  178  9e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24390  protein-glutamate O-methyltransferase. chemotaxis protein  39.92 
 
 		 287 aa  176  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.273905  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  38.25 
 
 		 280 aa  176  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1731  MCP methyltransferase, CheR-type  35.11 
 
 		 290 aa  175  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1098  protein-glutamate O-methyltransferase  41.18 
 
 		 305 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2434  putative MCP methyltransferase, CheR1  40.78 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1539  protein-glutamate O-methyltransferase  38.13 
 
 		 291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5610  MCP methyltransferase, CheR-type  37.86 
 
 		 303 aa  172  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3691  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  39.51 
 
 		 303 aa  172  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00198927  normal  0.0225149 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2146  MCP methyltransferase, CheR-type  37.36 
 
 		 271 aa  172  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0661  MCP methyltransferase, CheR-type  34.33 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2166  protein-glutamate O-methyltransferase  36.05 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00016475  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  37.36 
 
 		 288 aa  170  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0466  MCP methyltransferase, CheR-type  39.05 
 
 		 295 aa  169  4e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.176521 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4669  MCP methyltransferase, CheR-type  37.23 
 
 		 283 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.225745  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0159  chemotaxis protein methyltransferase CheR  38.06 
 
 		 273 aa  168  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1077  MCP methyltransferase, CheR-type  39.84 
 
 		 300 aa  167  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329536 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0141  MCP methyltransferase, CheR-type  36.96 
 
 		 280 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0351158  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0808  MCP methyltransferase, CheR-type  36.03 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1845  MCP methyltransferase, CheR-type  40.16 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.516279 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1515  chemotaxis methyltransferase CheR  40 
 
 		 290 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2475  MCP methyltransferase, CheR-type  38.18 
 
 		 303 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0126751  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2608  chemotaxis methyltransferase CheR  40 
 
 		 290 aa  166  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.215293  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1382  MCP methyltransferase, CheR-type  37.13 
 
 		 303 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1543  chemotaxis methyltransferase CheR  39.18 
 
 		 290 aa  165  9e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.520759  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  38.21 
 
 		 280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7834  MCP methyltransferase, CheR-type  37.36 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2420  MCP methyltransferase, CheR-type  34.91 
 
 		 289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.503139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1796  protein-glutamate O-methyltransferase  40.62 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3302  protein-glutamate O-methyltransferase  37.4 
 
 		 265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1858  chemotaxis methyltransferase CheR  39.59 
 
 		 290 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4819  MCP methyltransferase, CheR-type  37.23 
 
 		 282 aa  163  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728077  hitchhiker  0.00962017 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  35.5 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1756  chemotaxis methyltransferase CheR  39.18 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.456402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1644  chemotaxis methyltransferase CheR  39.18 
 
 		 272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4310  chemotaxis methyltransferase  36.3 
 
 		 293 aa  162  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3518  chemotaxis methyltransferase CheR  39.18 
 
 		 272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.577755 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1932  MCP methyltransferase, CheR-type  35.1 
 
 		 283 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1617  MCP methyltransferase, CheR-type  37.6 
 
 		 289 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1610  MCP methyltransferase, CheR-type  33.21 
 
 		 274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2105  MCP methyltransferase, CheR-type  34.32 
 
 		 283 aa  162  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0625  MCP methyltransferase, CheR-type  33.57 
 
 		 290 aa  162  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2839  MCP methyltransferase, CheR-type  36.76 
 
 		 293 aa  161  9e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.40202  normal  0.212015 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1405  chemotaxis protein methyltransferase  36.99 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.0669102 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0152  chemotaxis protein methyltransferase CheR  34.32 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22590  Protein-glutamate O-methyltransferase  34.24 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6731  MCP methyltransferase, CheR-type  34.81 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079631  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0089  MCP methyltransferase, CheR-type  30.82 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4164  MCP methyltransferase, CheR-type  36.99 
 
 		 293 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4052  MCP methyltransferase, CheR-type  36.99 
 
 		 293 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3258  MCP methyltransferase, CheR-type  36.53 
 
 		 285 aa  158  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.572283  normal  0.159022 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3179  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.36 
 
 		 314 aa  158  8e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0207  CheR methyltransferase SAM-binding domain-containing protein  36.59 
 
 		 270 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2571  MCP methyltransferase, CheR-type  37.45 
 
 		 303 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3557  MCP methyltransferase, CheR-type  36.53 
 
 		 285 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.132708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2981  chemotaxis methyltransferase CheR  39.92 
 
 		 290 aa  157  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3811  MCP methyltransferase, CheR-type  35.22 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00055  chemotaxis protein methyltransferase 2  36.36 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00310975  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3933  chemotaxis protein methyltransferase CheR  34.98 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0239  protein-glutamate O-methyltransferase  38.6 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>