More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4669 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_4669  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
283 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.225745  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0141  MCP methyltransferase, CheR-type  67.97 
 
 
280 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0351158  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7834  MCP methyltransferase, CheR-type  69.31 
 
 
275 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6731  MCP methyltransferase, CheR-type  66.3 
 
 
273 aa  368  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079631  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4819  MCP methyltransferase, CheR-type  58.24 
 
 
282 aa  310  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728077  hitchhiker  0.00962017 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1405  MCP methyltransferase, CheR-type  53.24 
 
 
284 aa  291  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216379  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0617  MCP methyltransferase, CheR-type  50.55 
 
 
285 aa  270  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1595  MCP methyltransferase, CheR-type  46.26 
 
 
284 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1587  chemotaxis methyltransferase, CheR2  50.37 
 
 
278 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0239  protein-glutamate O-methyltransferase  50.37 
 
 
278 aa  265  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2984  protein-glutamate O-methyltransferase  46.13 
 
 
285 aa  264  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2618  MCP methyltransferase, CheR-type  45.55 
 
 
292 aa  262  4e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4310  chemotaxis methyltransferase  50.36 
 
 
293 aa  262  4.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0267  protein-glutamate O-methyltransferase  50.37 
 
 
278 aa  262  6e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.647736 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0625  MCP methyltransferase, CheR-type  46.59 
 
 
290 aa  261  8e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2105  MCP methyltransferase, CheR-type  45.82 
 
 
283 aa  258  6e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0466  MCP methyltransferase, CheR-type  51.09 
 
 
295 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.176521 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3557  MCP methyltransferase, CheR-type  48 
 
 
285 aa  251  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.132708  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2420  MCP methyltransferase, CheR-type  46.74 
 
 
289 aa  250  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.503139  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1610  MCP methyltransferase, CheR-type  44.89 
 
 
274 aa  250  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3258  MCP methyltransferase, CheR-type  48 
 
 
285 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.572283  normal  0.159022 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1731  MCP methyltransferase, CheR-type  45 
 
 
290 aa  249  4e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1539  protein-glutamate O-methyltransferase  46.15 
 
 
291 aa  246  2e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1143  chemotaxis protein methyltransferase CheR  43.8 
 
 
292 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0207024  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  41.18 
 
 
281 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.299383  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0875  MCP methyltransferase, CheR-type  41.18 
 
 
271 aa  226  3e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1382  MCP methyltransferase, CheR-type  42.96 
 
 
303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0808  MCP methyltransferase, CheR-type  39.78 
 
 
272 aa  209  5e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0635  MCP methyltransferase, CheR-type  40 
 
 
301 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0626  MCP methyltransferase, CheR-type  40 
 
 
301 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.325159  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22590  Protein-glutamate O-methyltransferase  37.11 
 
 
309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2475  MCP methyltransferase, CheR-type  42.24 
 
 
303 aa  198  9e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0126751  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1330  protein-glutamate O-methyltransferase  37.87 
 
 
270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2571  MCP methyltransferase, CheR-type  42.24 
 
 
303 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0040  CheR methyltransferase, SAM binding domain protein  36.84 
 
 
283 aa  195  6e-49  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1199  methylase of chemotaxis methyl-accepting protein, CheR-like  37.32 
 
 
291 aa  195  8.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0601  MCP methyltransferase, CheR-type  38.21 
 
 
299 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2146  MCP methyltransferase, CheR-type  44.02 
 
 
271 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0757  MCP methyltransferase, CheR-type  38.13 
 
 
275 aa  192  5e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0614  MCP methyltransferase, CheR-type  35.25 
 
 
275 aa  192  7e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0483798 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0661  MCP methyltransferase, CheR-type  38.2 
 
 
271 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0089  MCP methyltransferase, CheR-type  34.16 
 
 
283 aa  187  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5610  MCP methyltransferase, CheR-type  39.76 
 
 
303 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0152  chemotaxis protein methyltransferase CheR  39.84 
 
 
276 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4154  MCP methyltransferase, CheR-type  41.83 
 
 
273 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0159  chemotaxis protein methyltransferase CheR  40.32 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  40.07 
 
 
269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711153  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  38.6 
 
 
288 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0428  MCP methyltransferase, CheR-type  39.78 
 
 
275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0700  MCP methyltransferase, CheR-type  36.62 
 
 
284 aa  183  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3691  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  39.84 
 
 
303 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00198927  normal  0.0225149 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0207  CheR methyltransferase SAM-binding domain-containing protein  40.56 
 
 
270 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1146  MCP methyltransferase, CheR-type  39.13 
 
 
270 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.492811  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0645  protein-glutamate O-methyltransferase  37.59 
 
 
302 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0464454  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00055  chemotaxis protein methyltransferase 2  38.22 
 
 
286 aa  179  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00310975  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0730  MCP methyltransferase, CheR-type  38.49 
 
 
300 aa  177  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0443063  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1617  MCP methyltransferase, CheR-type  38.43 
 
 
289 aa  177  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2622  chemotaxis methyltransferase CheR  39.08 
 
 
286 aa  177  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000206628 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1845  MCP methyltransferase, CheR-type  39.45 
 
 
289 aa  178  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.516279 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2117  chemotaxis methyltransferase CheR  38.98 
 
 
286 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.396301  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1043  MCP methyltransferase, CheR-type  39.92 
 
 
283 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4052  MCP methyltransferase, CheR-type  38.11 
 
 
293 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4164  MCP methyltransferase, CheR-type  38.11 
 
 
293 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1756  MCP methyltransferase, CheR-type  38.98 
 
 
286 aa  176  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0553359  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2177  chemotaxis methyltransferase CheR  38.98 
 
 
286 aa  176  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0783  protein-glutamate O-methyltransferase  38.75 
 
 
269 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.827996  normal  0.901412 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1748  chemotaxis methyltransferase CheR  38.98 
 
 
286 aa  176  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1980  chemotaxis methyltransferase CheR  38.98 
 
 
286 aa  176  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01855  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  38.98 
 
 
286 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.435118  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3062  MCP methyltransferase, CheR-type  37.5 
 
 
297 aa  176  5e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01844  hypothetical protein  38.98 
 
 
286 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.370669  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1405  chemotaxis protein methyltransferase  37.36 
 
 
292 aa  176  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.0669102 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2455  chemotaxis methyltransferase CheR  39.37 
 
 
288 aa  175  6e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2073  chemotaxis methyltransferase CheR  39.76 
 
 
288 aa  175  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.50771  hitchhiker  0.000251677 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2078  chemotaxis methyltransferase CheR  39.76 
 
 
288 aa  175  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.687941  hitchhiker  2.73756e-16 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0975  MCP methyltransferase, CheR-type  37.91 
 
 
281 aa  175  7e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3218  MCP methyltransferase, CheR-type  39.16 
 
 
295 aa  175  7e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1204  chemotaxis methyltransferase CheR  39.76 
 
 
288 aa  175  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3204  MCP methyltransferase, CheR-type  38.97 
 
 
285 aa  175  7e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.25041  normal  0.841939 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  36.84 
 
 
280 aa  175  7e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  39.77 
 
 
297 aa  175  8e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3299  protein-glutamate O-methyltransferase  38.1 
 
 
275 aa  175  8e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3788  MCP methyltransferase, CheR-type  37.5 
 
 
297 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0281  MCP methyltransferase, CheR-type  39.76 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354754  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2133  chemotaxis methyltransferase CheR  39.37 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000021864 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2166  protein-glutamate O-methyltransferase  39.52 
 
 
292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00016475  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1327  chemotaxis methyltransferase CheR  39.37 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000151288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0255  putative chemotaxis protein methyltransferase  39.33 
 
 
280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1756  chemotaxis methyltransferase CheR  39.92 
 
 
295 aa  172  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.456402  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1300  chemotaxis methyltransferase CheR  38.58 
 
 
286 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000891589 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3811  MCP methyltransferase, CheR-type  39 
 
 
318 aa  172  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2608  chemotaxis methyltransferase CheR  40 
 
 
290 aa  172  5.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.215293  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1644  chemotaxis methyltransferase CheR  39.92 
 
 
272 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3518  chemotaxis methyltransferase CheR  39.92 
 
 
272 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.577755 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2710  protein-glutamate O-methyltransferase  39.53 
 
 
298 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2115  protein-glutamate O-methyltransferase  38.34 
 
 
281 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1528  MCP methyltransferase, CheR-type  38.46 
 
 
266 aa  171  9e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.168715 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3302  protein-glutamate O-methyltransferase  37.2 
 
 
265 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3104  MCP methyltransferase, CheR-type  37.35 
 
 
285 aa  171  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1515  chemotaxis methyltransferase CheR  39.62 
 
 
290 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>