More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2325 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2325  chemotaxis protein methyltransferase CheR  100 
 
 		 275 aa  573  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0910  chemotaxis protein methyltransferase CheR  48.88 
 
 		 269 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0783  protein-glutamate O-methyltransferase  48.31 
 
 		 269 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.827996  normal  0.901412 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  43.49 
 
 		 269 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711153  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3299  protein-glutamate O-methyltransferase  46.27 
 
 		 275 aa  248  6e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1146  MCP methyltransferase, CheR-type  43.4 
 
 		 270 aa  236  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.492811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0904  MCP methyltransferase, CheR-type  44.32 
 
 		 267 aa  231  9e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3546  MCP methyltransferase, CheR-type  41.79 
 
 		 267 aa  228  7e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal  0.882443 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04754  CheR methyltransferase, SAM binding domain  43.94 
 
 		 268 aa  224  9e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584849  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1528  MCP methyltransferase, CheR-type  39.85 
 
 		 266 aa  209  5e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.168715 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0335  MCP methyltransferase, CheR-type  38.69 
 
 		 280 aa  209  5e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0428  MCP methyltransferase, CheR-type  38.89 
 
 		 275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1565  protein-glutamate O-methyltransferase  37.27 
 
 		 269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.724121  normal  0.553309 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0626  MCP methyltransferase, CheR-type  39.07 
 
 		 301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.325159  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0635  MCP methyltransferase, CheR-type  38.35 
 
 		 301 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4376  MCP methyltransferase, CheR-type  37.79 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.525329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0601  MCP methyltransferase, CheR-type  38.35 
 
 		 299 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0645  protein-glutamate O-methyltransferase  37.55 
 
 		 302 aa  191  8e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0464454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0657  MCP methyltransferase, CheR-type  36.26 
 
 		 296 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120935 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3062  MCP methyltransferase, CheR-type  36.98 
 
 		 297 aa  187  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3788  MCP methyltransferase, CheR-type  36.98 
 
 		 297 aa  187  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0569  MCP methyltransferase, CheR-type  35.61 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.429442  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2622  chemotaxis methyltransferase CheR  39.3 
 
 		 286 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206628 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1756  MCP methyltransferase, CheR-type  39.3 
 
 		 286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0553359  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1980  chemotaxis methyltransferase CheR  39.3 
 
 		 286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2117  chemotaxis methyltransferase CheR  39.3 
 
 		 286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.396301  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01855  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  39.3 
 
 		 286 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.435118  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01844  hypothetical protein  39.3 
 
 		 286 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.370669  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2177  chemotaxis methyltransferase CheR  39.3 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1748  chemotaxis methyltransferase CheR  39.3 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1300  chemotaxis methyltransferase CheR  38.52 
 
 		 286 aa  180  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000891589 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0730  MCP methyltransferase, CheR-type  34.53 
 
 		 300 aa  179  4.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0443063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2090  MCP methyltransferase, CheR-type  36.6 
 
 		 276 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.853389 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2174  protein-glutamate O-methyltransferase  35.74 
 
 		 296 aa  177  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2073  chemotaxis methyltransferase CheR  37 
 
 		 288 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.50771  hitchhiker  0.000251677 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1884  MCP methyltransferase, CheR-type  36.23 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0878954 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1405  chemotaxis protein methyltransferase  35.46 
 
 		 292 aa  176  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.0669102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1204  chemotaxis methyltransferase CheR  37.94 
 
 		 288 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2215  MCP methyltransferase, CheR-type  36.47 
 
 		 276 aa  176  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.556164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22590  Protein-glutamate O-methyltransferase  38.49 
 
 		 309 aa  176  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3811  MCP methyltransferase, CheR-type  36.74 
 
 		 318 aa  176  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2078  chemotaxis methyltransferase CheR  37.94 
 
 		 288 aa  175  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.687941  hitchhiker  2.73756e-16 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1327  chemotaxis methyltransferase CheR  37.94 
 
 		 288 aa  175  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000151288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2133  chemotaxis methyltransferase CheR  37.94 
 
 		 288 aa  175  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000021864 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1143  chemotaxis protein methyltransferase CheR  34.89 
 
 		 292 aa  175  8e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0207024  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0700  MCP methyltransferase, CheR-type  33.94 
 
 		 284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2455  chemotaxis methyltransferase CheR  38.74 
 
 		 288 aa  173  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2618  MCP methyltransferase, CheR-type  34.3 
 
 		 292 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1595  MCP methyltransferase, CheR-type  34.66 
 
 		 284 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  37.31 
 
 		 280 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0207  CheR methyltransferase SAM-binding domain-containing protein  39.52 
 
 		 270 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  35.93 
 
 		 281 aa  169  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.299383  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2124  chemotaxis protein methyltransferase CheR  38.46 
 
 		 277 aa  168  7e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5610  MCP methyltransferase, CheR-type  36.36 
 
 		 303 aa  168  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2700  MCP methyltransferase, CheR-type  34.22 
 
 		 288 aa  168  8e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0159  chemotaxis protein methyltransferase CheR  36.99 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3691  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  37.22 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00198927  normal  0.0225149 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4164  MCP methyltransferase, CheR-type  35.85 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4052  MCP methyltransferase, CheR-type  35.85 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2420  MCP methyltransferase, CheR-type  34.04 
 
 		 289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.503139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  37.45 
 
 		 288 aa  166  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0661  MCP methyltransferase, CheR-type  35.25 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0757  MCP methyltransferase, CheR-type  33.96 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0152  chemotaxis protein methyltransferase CheR  34.33 
 
 		 276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2166  protein-glutamate O-methyltransferase  37.55 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00016475  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1932  MCP methyltransferase, CheR-type  34.85 
 
 		 283 aa  163  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2244  protein-glutamate O-methyltransferase  35.66 
 
 		 281 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00847323  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3179  chemotaxis protein methyltransferase CheR  36.17 
 
 		 314 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2115  protein-glutamate O-methyltransferase  37.5 
 
 		 281 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1610  MCP methyltransferase, CheR-type  33.7 
 
 		 274 aa  162  7e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4154  MCP methyltransferase, CheR-type  34.87 
 
 		 273 aa  161  9e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2101  MCP methyltransferase, CheR-type  35.66 
 
 		 281 aa  161  9e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.60784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2361  protein-glutamate O-methyltransferase  35.66 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1731  MCP methyltransferase, CheR-type  32.61 
 
 		 290 aa  159  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1617  MCP methyltransferase, CheR-type  33.08 
 
 		 289 aa  159  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1539  protein-glutamate O-methyltransferase  33.57 
 
 		 291 aa  159  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2856  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.84 
 
 		 314 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0073  chemotaxis protein methyltransferase  35.84 
 
 		 314 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2984  protein-glutamate O-methyltransferase  33.82 
 
 		 285 aa  159  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2971  MCP methyltransferase, CheR-type  35.98 
 
 		 313 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000784275 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1687  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.84 
 
 		 315 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.460756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3119  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.84 
 
 		 315 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830428  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3104  MCP methyltransferase, CheR-type  33.58 
 
 		 285 aa  159  5e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3218  MCP methyltransferase, CheR-type  35.98 
 
 		 295 aa  159  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3933  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.84 
 
 		 315 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0241  MCP methyltransferase, CheR-type  35.19 
 
 		 325 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0215152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0122  MCP methyltransferase, CheR-type  36.36 
 
 		 316 aa  158  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2848  MCP methyltransferase, CheR-type  35.19 
 
 		 330 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.242371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0259  MCP methyltransferase, CheR-type  35.19 
 
 		 330 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000294494  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1515  chemotaxis methyltransferase CheR  38.04 
 
 		 290 aa  158  9e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2608  chemotaxis methyltransferase CheR  37.65 
 
 		 290 aa  158  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.215293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3852  chemotaxis protein methyltransferase  35.48 
 
 		 315 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0089  MCP methyltransferase, CheR-type  34.42 
 
 		 283 aa  158  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  33.96 
 
 		 290 aa  158  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3361  MCP methyltransferase, CheR-type  35.09 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0405517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1043  MCP methyltransferase, CheR-type  35.42 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1858  chemotaxis methyltransferase CheR  38.04 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  34.46 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24390  protein-glutamate O-methyltransferase. chemotaxis protein  34.6 
 
 		 287 aa  155  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.273905  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3498  protein-glutamate O-methyltransferase  38.35 
 
 		 273 aa  155  6e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>