More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04754 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04754  CheR methyltransferase, SAM binding domain  100 
 
 
268 aa  554  1e-157  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584849  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3546  MCP methyltransferase, CheR-type  63.6 
 
 
267 aa  348  6e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal  0.882443 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0904  MCP methyltransferase, CheR-type  59.16 
 
 
267 aa  321  8e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0783  protein-glutamate O-methyltransferase  53.16 
 
 
269 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.827996  normal  0.901412 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0910  chemotaxis protein methyltransferase CheR  52.04 
 
 
269 aa  300  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1146  MCP methyltransferase, CheR-type  51.11 
 
 
270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.492811  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3299  protein-glutamate O-methyltransferase  48.28 
 
 
275 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  50.75 
 
 
269 aa  258  8e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711153  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1565  protein-glutamate O-methyltransferase  45.04 
 
 
269 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.724121  normal  0.553309 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2325  chemotaxis protein methyltransferase CheR  43.94 
 
 
275 aa  224  9e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1528  MCP methyltransferase, CheR-type  43.98 
 
 
266 aa  222  6e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.168715 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0335  MCP methyltransferase, CheR-type  41.35 
 
 
280 aa  218  6e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0635  MCP methyltransferase, CheR-type  41.33 
 
 
301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0626  MCP methyltransferase, CheR-type  41.33 
 
 
301 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.325159  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0645  protein-glutamate O-methyltransferase  40.81 
 
 
302 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0464454  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0601  MCP methyltransferase, CheR-type  39.78 
 
 
299 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1143  chemotaxis protein methyltransferase CheR  40.43 
 
 
292 aa  187  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0207024  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1610  MCP methyltransferase, CheR-type  38.46 
 
 
274 aa  186  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3218  MCP methyltransferase, CheR-type  42.11 
 
 
295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3788  MCP methyltransferase, CheR-type  42.17 
 
 
297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1748  chemotaxis methyltransferase CheR  42.08 
 
 
286 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3062  MCP methyltransferase, CheR-type  42.17 
 
 
297 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2177  chemotaxis methyltransferase CheR  42.08 
 
 
286 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1756  MCP methyltransferase, CheR-type  42.08 
 
 
286 aa  183  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0553359  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2117  chemotaxis methyltransferase CheR  42.02 
 
 
286 aa  183  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.396301  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0428  MCP methyltransferase, CheR-type  37.78 
 
 
275 aa  183  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2622  chemotaxis methyltransferase CheR  42.08 
 
 
286 aa  183  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000206628 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2455  chemotaxis methyltransferase CheR  41.8 
 
 
288 aa  183  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1980  chemotaxis methyltransferase CheR  42.08 
 
 
286 aa  183  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01855  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  42.08 
 
 
286 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.435118  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01844  hypothetical protein  42.08 
 
 
286 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.370669  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1043  MCP methyltransferase, CheR-type  42.57 
 
 
283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  38.75 
 
 
281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.299383  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1327  chemotaxis methyltransferase CheR  41.02 
 
 
288 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000151288 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2073  chemotaxis methyltransferase CheR  41.02 
 
 
288 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.50771  hitchhiker  0.000251677 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2133  chemotaxis methyltransferase CheR  41.02 
 
 
288 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000021864 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2078  chemotaxis methyltransferase CheR  41.02 
 
 
288 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.687941  hitchhiker  2.73756e-16 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1204  chemotaxis methyltransferase CheR  41.02 
 
 
288 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1300  chemotaxis methyltransferase CheR  41.7 
 
 
286 aa  180  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000891589 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0207  CheR methyltransferase SAM-binding domain-containing protein  41.6 
 
 
270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2618  MCP methyltransferase, CheR-type  37.09 
 
 
292 aa  178  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0657  MCP methyltransferase, CheR-type  39.68 
 
 
296 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.120935 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1595  MCP methyltransferase, CheR-type  36.96 
 
 
284 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1731  MCP methyltransferase, CheR-type  37.32 
 
 
290 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4376  MCP methyltransferase, CheR-type  40.49 
 
 
295 aa  176  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.525329  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0159  chemotaxis protein methyltransferase CheR  40.4 
 
 
273 aa  175  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1539  protein-glutamate O-methyltransferase  37.13 
 
 
291 aa  174  9e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1932  MCP methyltransferase, CheR-type  41.13 
 
 
283 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24390  protein-glutamate O-methyltransferase. chemotaxis protein  40.47 
 
 
287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.273905  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7834  MCP methyltransferase, CheR-type  38.46 
 
 
275 aa  171  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0661  MCP methyltransferase, CheR-type  36.8 
 
 
271 aa  171  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2420  MCP methyltransferase, CheR-type  38.43 
 
 
289 aa  170  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.503139  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3691  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  40.73 
 
 
303 aa  170  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00198927  normal  0.0225149 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0808  MCP methyltransferase, CheR-type  34.32 
 
 
272 aa  170  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0466  MCP methyltransferase, CheR-type  36.36 
 
 
295 aa  170  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.176521 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0757  MCP methyltransferase, CheR-type  35.34 
 
 
275 aa  169  5e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2984  protein-glutamate O-methyltransferase  37 
 
 
285 aa  169  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  39.6 
 
 
290 aa  168  7e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2146  MCP methyltransferase, CheR-type  38.52 
 
 
271 aa  168  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6731  MCP methyltransferase, CheR-type  37.04 
 
 
273 aa  168  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079631  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3811  MCP methyltransferase, CheR-type  40.56 
 
 
318 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5610  MCP methyltransferase, CheR-type  39.92 
 
 
303 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1756  chemotaxis methyltransferase CheR  41.9 
 
 
295 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.456402  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3518  chemotaxis methyltransferase CheR  42.06 
 
 
272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.577755 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0141  MCP methyltransferase, CheR-type  35.66 
 
 
280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0351158  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1644  chemotaxis methyltransferase CheR  42.06 
 
 
272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0569  MCP methyltransferase, CheR-type  37.75 
 
 
298 aa  166  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.429442  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2115  protein-glutamate O-methyltransferase  37.22 
 
 
281 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4669  MCP methyltransferase, CheR-type  38.41 
 
 
283 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.225745  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4052  MCP methyltransferase, CheR-type  37.75 
 
 
293 aa  165  8e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4164  MCP methyltransferase, CheR-type  37.75 
 
 
293 aa  165  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1405  chemotaxis protein methyltransferase  38.55 
 
 
292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.0669102 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1077  MCP methyltransferase, CheR-type  38.85 
 
 
300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329536 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4819  MCP methyltransferase, CheR-type  36.16 
 
 
282 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728077  hitchhiker  0.00962017 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2105  MCP methyltransferase, CheR-type  34.91 
 
 
283 aa  163  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2174  protein-glutamate O-methyltransferase  39.37 
 
 
296 aa  160  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432884  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0875  MCP methyltransferase, CheR-type  36.3 
 
 
271 aa  160  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1845  MCP methyltransferase, CheR-type  37.12 
 
 
289 aa  160  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.516279 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1617  MCP methyltransferase, CheR-type  38.25 
 
 
289 aa  159  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1515  chemotaxis methyltransferase CheR  39.13 
 
 
290 aa  159  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1587  chemotaxis methyltransferase, CheR2  37.22 
 
 
278 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2215  MCP methyltransferase, CheR-type  37.5 
 
 
276 aa  159  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.556164  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0239  protein-glutamate O-methyltransferase  37.22 
 
 
278 aa  158  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4310  chemotaxis methyltransferase  37.92 
 
 
293 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3557  MCP methyltransferase, CheR-type  37.17 
 
 
285 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.132708  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1543  chemotaxis methyltransferase CheR  39.68 
 
 
290 aa  157  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.520759  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2244  protein-glutamate O-methyltransferase  34.85 
 
 
281 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00847323  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2608  chemotaxis methyltransferase CheR  39.29 
 
 
290 aa  156  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.215293  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1069  protein-glutamate O-methyltransferase  35.02 
 
 
278 aa  156  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0178115  normal  0.0152511 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22590  Protein-glutamate O-methyltransferase  35.86 
 
 
309 aa  156  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00055  chemotaxis protein methyltransferase 2  34.47 
 
 
286 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00310975  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0700  MCP methyltransferase, CheR-type  38.1 
 
 
284 aa  155  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0267  protein-glutamate O-methyltransferase  37.22 
 
 
278 aa  155  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.647736 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2981  chemotaxis methyltransferase CheR  41.04 
 
 
290 aa  155  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1884  MCP methyltransferase, CheR-type  36.29 
 
 
276 aa  155  7e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0878954 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0730  MCP methyltransferase, CheR-type  38.06 
 
 
300 aa  155  8e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0443063  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2101  MCP methyltransferase, CheR-type  34.47 
 
 
281 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.60784  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  34.59 
 
 
288 aa  154  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4154  MCP methyltransferase, CheR-type  34.7 
 
 
273 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2090  MCP methyltransferase, CheR-type  36.29 
 
 
276 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.853389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>