More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0875 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0875  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
271 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2984  protein-glutamate O-methyltransferase  50.74 
 
 
285 aa  297  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1595  MCP methyltransferase, CheR-type  51.66 
 
 
284 aa  293  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2618  MCP methyltransferase, CheR-type  51.29 
 
 
292 aa  292  4e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1539  protein-glutamate O-methyltransferase  49.45 
 
 
291 aa  283  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2105  MCP methyltransferase, CheR-type  46.13 
 
 
283 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  47.97 
 
 
281 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.299383  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0466  MCP methyltransferase, CheR-type  49.82 
 
 
295 aa  268  8e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.176521 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1143  chemotaxis protein methyltransferase CheR  48.72 
 
 
292 aa  267  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0207024  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2420  MCP methyltransferase, CheR-type  47.99 
 
 
289 aa  266  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.503139  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1731  MCP methyltransferase, CheR-type  45.82 
 
 
290 aa  266  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1610  MCP methyltransferase, CheR-type  46.64 
 
 
274 aa  263  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4819  MCP methyltransferase, CheR-type  46.47 
 
 
282 aa  246  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728077  hitchhiker  0.00962017 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6731  MCP methyltransferase, CheR-type  45.22 
 
 
273 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079631  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0617  MCP methyltransferase, CheR-type  44.65 
 
 
285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3258  MCP methyltransferase, CheR-type  44.44 
 
 
285 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.572283  normal  0.159022 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3557  MCP methyltransferase, CheR-type  45.15 
 
 
285 aa  238  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.132708  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0625  MCP methyltransferase, CheR-type  42.44 
 
 
290 aa  238  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1382  MCP methyltransferase, CheR-type  45.96 
 
 
303 aa  234  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1405  MCP methyltransferase, CheR-type  44.98 
 
 
284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216379  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0141  MCP methyltransferase, CheR-type  44.12 
 
 
280 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0351158  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7834  MCP methyltransferase, CheR-type  43.22 
 
 
275 aa  229  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4310  chemotaxis methyltransferase  43.01 
 
 
293 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4669  MCP methyltransferase, CheR-type  41.18 
 
 
283 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.225745  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2475  MCP methyltransferase, CheR-type  45.42 
 
 
303 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0126751  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2571  MCP methyltransferase, CheR-type  44.69 
 
 
303 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0626  MCP methyltransferase, CheR-type  42.38 
 
 
301 aa  211  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.325159  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  42.8 
 
 
269 aa  209  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711153  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0635  MCP methyltransferase, CheR-type  41.64 
 
 
301 aa  208  7e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0601  MCP methyltransferase, CheR-type  42.01 
 
 
299 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0645  protein-glutamate O-methyltransferase  42.44 
 
 
302 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0464454  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0757  MCP methyltransferase, CheR-type  39.11 
 
 
275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0428  MCP methyltransferase, CheR-type  40.36 
 
 
275 aa  192  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0808  MCP methyltransferase, CheR-type  37.13 
 
 
272 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0267  protein-glutamate O-methyltransferase  38.26 
 
 
278 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.647736 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1565  protein-glutamate O-methyltransferase  41.41 
 
 
269 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.724121  normal  0.553309 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3104  MCP methyltransferase, CheR-type  39.11 
 
 
285 aa  188  8e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0089  MCP methyltransferase, CheR-type  35.27 
 
 
283 aa  188  8e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0661  MCP methyltransferase, CheR-type  35.42 
 
 
271 aa  188  9e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1587  chemotaxis methyltransferase, CheR2  38.55 
 
 
278 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0239  protein-glutamate O-methyltransferase  38.55 
 
 
278 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0152  chemotaxis protein methyltransferase CheR  36.67 
 
 
276 aa  185  7e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3204  MCP methyltransferase, CheR-type  37.92 
 
 
285 aa  185  8e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.25041  normal  0.841939 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3546  MCP methyltransferase, CheR-type  42.47 
 
 
267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal  0.882443 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3299  protein-glutamate O-methyltransferase  34.69 
 
 
275 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1098  protein-glutamate O-methyltransferase  38.66 
 
 
305 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2434  putative MCP methyltransferase, CheR1  38.66 
 
 
305 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1573  MCP methyltransferase, CheR-type  34.87 
 
 
292 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0438911  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  36.9 
 
 
280 aa  178  7e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2146  MCP methyltransferase, CheR-type  37.59 
 
 
271 aa  178  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  36.26 
 
 
280 aa  177  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0281  MCP methyltransferase, CheR-type  36.03 
 
 
292 aa  175  8e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354754  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1152  protein-glutamate O-methyltransferase  32.97 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1710  MCP methyltransferase, CheR-type  37.21 
 
 
285 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3469  MCP methyltransferase, CheR-type  38.6 
 
 
280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.912759  normal  0.640591 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1043  MCP methyltransferase, CheR-type  40.71 
 
 
283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2710  protein-glutamate O-methyltransferase  37.74 
 
 
298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2162  protein-glutamate O-methyltransferase  36.67 
 
 
272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0910  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.71 
 
 
269 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1813  MCP methyltransferase, CheR-type  36.54 
 
 
285 aa  171  9e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1533  protein-glutamate O-methyltransferase  36.54 
 
 
285 aa  171  9e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0781767 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1796  protein-glutamate O-methyltransferase  35.43 
 
 
294 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0783  protein-glutamate O-methyltransferase  35.56 
 
 
269 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.827996  normal  0.901412 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0904  MCP methyltransferase, CheR-type  35.93 
 
 
267 aa  170  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4031  MCP methyltransferase, CheR-type  36.58 
 
 
287 aa  169  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236096  normal  0.66198 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1146  MCP methyltransferase, CheR-type  35.06 
 
 
270 aa  169  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.492811  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3218  MCP methyltransferase, CheR-type  39.13 
 
 
295 aa  169  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1199  methylase of chemotaxis methyl-accepting protein, CheR-like  36.23 
 
 
291 aa  169  5e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0614  MCP methyltransferase, CheR-type  32.72 
 
 
275 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0483798 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  36.9 
 
 
288 aa  169  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0778  MCP methyltransferase, CheR-type  32.57 
 
 
292 aa  168  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0203537 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0040  CheR methyltransferase, SAM binding domain protein  34.42 
 
 
283 aa  167  2e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1371  MCP methyltransferase, CheR-type  41.34 
 
 
268 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.214752  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3625  MCP methyltransferase, CheR-type  36.08 
 
 
298 aa  167  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0636111 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0332  MCP methyltransferase, CheR-type  34.24 
 
 
302 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.284961 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0237  protein-glutamate O-methyltransferase  34.63 
 
 
307 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.291409 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0300  MCP methyltransferase, CheR-type  34.24 
 
 
302 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000961073  normal  0.256387 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1330  protein-glutamate O-methyltransferase  33.82 
 
 
270 aa  165  6.9999999999999995e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1300  chemotaxis methyltransferase CheR  37.93 
 
 
286 aa  165  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000891589 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2622  chemotaxis methyltransferase CheR  37.69 
 
 
286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000206628 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0975  MCP methyltransferase, CheR-type  32.37 
 
 
281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1756  MCP methyltransferase, CheR-type  37.69 
 
 
286 aa  163  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0553359  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1748  chemotaxis methyltransferase CheR  37.69 
 
 
286 aa  163  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1980  chemotaxis methyltransferase CheR  37.69 
 
 
286 aa  163  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2177  chemotaxis methyltransferase CheR  37.69 
 
 
286 aa  163  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2486  MCP methyltransferase, CheR-type  39.76 
 
 
268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.613564  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3855  MCP methyltransferase, CheR-type  34.5 
 
 
291 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2582  MCP methyltransferase, CheR-type  39.76 
 
 
268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2215  MCP methyltransferase, CheR-type  37.04 
 
 
276 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.556164  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01855  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  37.69 
 
 
286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.435118  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2117  chemotaxis methyltransferase CheR  37.69 
 
 
286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.396301  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01844  hypothetical protein  37.69 
 
 
286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.370669  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1204  chemotaxis methyltransferase CheR  37.45 
 
 
288 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1177  protein-glutamate O-methyltransferase  37.45 
 
 
275 aa  162  6e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0805405  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1405  chemotaxis protein methyltransferase  37.15 
 
 
292 aa  162  7e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.0669102 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1444  MCP methyltransferase, CheR-type  37.8 
 
 
300 aa  162  7e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2078  chemotaxis methyltransferase CheR  37.45 
 
 
288 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.687941  hitchhiker  2.73756e-16 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1884  MCP methyltransferase, CheR-type  36.3 
 
 
276 aa  161  9e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0878954 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2073  chemotaxis methyltransferase CheR  37.45 
 
 
288 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.50771  hitchhiker  0.000251677 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04754  CheR methyltransferase, SAM binding domain  36.3 
 
 
268 aa  160  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>