More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4310 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4310  chemotaxis methyltransferase  100 
 
 		 293 aa  612  9.999999999999999e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3258  MCP methyltransferase, CheR-type  63.38 
 
 		 285 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.572283  normal  0.159022 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3557  MCP methyltransferase, CheR-type  62.32 
 
 		 285 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.132708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0617  MCP methyltransferase, CheR-type  56.51 
 
 		 285 aa  312  4.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1405  MCP methyltransferase, CheR-type  54.32 
 
 		 284 aa  310  1e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216379  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2420  MCP methyltransferase, CheR-type  51.9 
 
 		 289 aa  305  6e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.503139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2984  protein-glutamate O-methyltransferase  48.94 
 
 		 285 aa  291  7e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1143  chemotaxis protein methyltransferase CheR  49.48 
 
 		 292 aa  289  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0207024  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1539  protein-glutamate O-methyltransferase  49.26 
 
 		 291 aa  278  7e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1595  MCP methyltransferase, CheR-type  48.54 
 
 		 284 aa  278  8e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2618  MCP methyltransferase, CheR-type  46.92 
 
 		 292 aa  278  9e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1731  MCP methyltransferase, CheR-type  47.06 
 
 		 290 aa  276  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0466  MCP methyltransferase, CheR-type  51.64 
 
 		 295 aa  275  5e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.176521 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4669  MCP methyltransferase, CheR-type  50.36 
 
 		 283 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.225745  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1610  MCP methyltransferase, CheR-type  48.15 
 
 		 274 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2105  MCP methyltransferase, CheR-type  45.96 
 
 		 283 aa  264  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4819  MCP methyltransferase, CheR-type  50 
 
 		 282 aa  263  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728077  hitchhiker  0.00962017 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  46.13 
 
 		 281 aa  259  4e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.299383  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7834  MCP methyltransferase, CheR-type  48 
 
 		 275 aa  251  8.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0141  MCP methyltransferase, CheR-type  46.52 
 
 		 280 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0351158  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6731  MCP methyltransferase, CheR-type  45.93 
 
 		 273 aa  249  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0625  MCP methyltransferase, CheR-type  42.65 
 
 		 290 aa  242  6e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1382  MCP methyltransferase, CheR-type  45.16 
 
 		 303 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2475  MCP methyltransferase, CheR-type  44.33 
 
 		 303 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0126751  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0875  MCP methyltransferase, CheR-type  43.01 
 
 		 271 aa  239  5e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2571  MCP methyltransferase, CheR-type  45.58 
 
 		 303 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0239  protein-glutamate O-methyltransferase  43.22 
 
 		 278 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1587  chemotaxis methyltransferase, CheR2  42.86 
 
 		 278 aa  211  9e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0267  protein-glutamate O-methyltransferase  43.07 
 
 		 278 aa  209  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.647736 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3104  MCP methyltransferase, CheR-type  39.79 
 
 		 285 aa  206  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0040  CheR methyltransferase, SAM binding domain protein  38.61 
 
 		 283 aa  206  4e-52  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  39.18 
 
 		 288 aa  205  7e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  38.43 
 
 		 280 aa  204  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0757  MCP methyltransferase, CheR-type  36.53 
 
 		 275 aa  203  3e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0635  MCP methyltransferase, CheR-type  39.56 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  37.5 
 
 		 280 aa  200  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0626  MCP methyltransferase, CheR-type  39.19 
 
 		 301 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.325159  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0661  MCP methyltransferase, CheR-type  37.55 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0601  MCP methyltransferase, CheR-type  38.49 
 
 		 299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1043  MCP methyltransferase, CheR-type  41.67 
 
 		 283 aa  195  9e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0808  MCP methyltransferase, CheR-type  39.19 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0281  MCP methyltransferase, CheR-type  36.52 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0645  protein-glutamate O-methyltransferase  38.24 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0464454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3218  MCP methyltransferase, CheR-type  41.11 
 
 		 295 aa  193  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1444  MCP methyltransferase, CheR-type  38.21 
 
 		 300 aa  192  8e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  38.6 
 
 		 269 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711153  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0428  MCP methyltransferase, CheR-type  37.27 
 
 		 275 aa  189  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2090  MCP methyltransferase, CheR-type  37.41 
 
 		 276 aa  188  7e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.853389 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0783  protein-glutamate O-methyltransferase  38.29 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.827996  normal  0.901412 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0975  MCP methyltransferase, CheR-type  36.79 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0089  MCP methyltransferase, CheR-type  33.82 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2146  MCP methyltransferase, CheR-type  39.19 
 
 		 271 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3625  MCP methyltransferase, CheR-type  38.49 
 
 		 298 aa  186  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0636111 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3498  protein-glutamate O-methyltransferase  40.67 
 
 		 273 aa  186  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1884  MCP methyltransferase, CheR-type  37.04 
 
 		 276 aa  186  5e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0878954 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1330  protein-glutamate O-methyltransferase  36.63 
 
 		 270 aa  186  5e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0730  MCP methyltransferase, CheR-type  38.04 
 
 		 300 aa  185  8e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0443063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1300  chemotaxis methyltransferase CheR  39.33 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000891589 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2710  protein-glutamate O-methyltransferase  39 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2117  chemotaxis methyltransferase CheR  38.95 
 
 		 286 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.396301  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2215  MCP methyltransferase, CheR-type  36.57 
 
 		 276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.556164  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0910  chemotaxis protein methyltransferase CheR  37.55 
 
 		 269 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2622  chemotaxis methyltransferase CheR  38.95 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206628 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2115  protein-glutamate O-methyltransferase  36.92 
 
 		 281 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1748  chemotaxis methyltransferase CheR  38.95 
 
 		 286 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2177  chemotaxis methyltransferase CheR  38.95 
 
 		 286 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1756  MCP methyltransferase, CheR-type  38.95 
 
 		 286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0553359  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1980  chemotaxis methyltransferase CheR  38.95 
 
 		 286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01855  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  38.95 
 
 		 286 aa  182  7e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.435118  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01844  hypothetical protein  38.95 
 
 		 286 aa  182  7e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.370669  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0152  chemotaxis protein methyltransferase CheR  34.83 
 
 		 276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22590  Protein-glutamate O-methyltransferase  35.04 
 
 		 309 aa  179  5.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2078  chemotaxis methyltransferase CheR  37.83 
 
 		 288 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.687941  hitchhiker  2.73756e-16 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2073  chemotaxis methyltransferase CheR  37.83 
 
 		 288 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.50771  hitchhiker  0.000251677 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2166  protein-glutamate O-methyltransferase  39.11 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00016475  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1199  methylase of chemotaxis methyl-accepting protein, CheR-like  37.55 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1528  MCP methyltransferase, CheR-type  37.08 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.168715 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1204  chemotaxis methyltransferase CheR  37.83 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0614  MCP methyltransferase, CheR-type  36.16 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0483798 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1988  Protein-glutamate O-methyltransferase  36.16 
 
 		 275 aa  176  3e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2455  chemotaxis methyltransferase CheR  38.95 
 
 		 288 aa  176  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2133  chemotaxis methyltransferase CheR  37.45 
 
 		 288 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000021864 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1327  chemotaxis methyltransferase CheR  37.45 
 
 		 288 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000151288 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0778  MCP methyltransferase, CheR-type  35.11 
 
 		 292 aa  175  6e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0203537 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1077  MCP methyltransferase, CheR-type  38.43 
 
 		 300 aa  176  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329536 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2244  protein-glutamate O-methyltransferase  34.5 
 
 		 281 aa  175  7e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00847323  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0237  protein-glutamate O-methyltransferase  35.38 
 
 		 307 aa  175  9e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.291409 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2101  MCP methyltransferase, CheR-type  34.5 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.60784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2361  protein-glutamate O-methyltransferase  34.5 
 
 		 281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2434  putative MCP methyltransferase, CheR1  37.93 
 
 		 305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4074  chemotaxis methyltransferase  34.62 
 
 		 302 aa  172  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1098  protein-glutamate O-methyltransferase  37.93 
 
 		 305 aa  172  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3299  protein-glutamate O-methyltransferase  34.07 
 
 		 275 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2162  protein-glutamate O-methyltransferase  34.43 
 
 		 272 aa  172  6.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1565  protein-glutamate O-methyltransferase  36.3 
 
 		 269 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.724121  normal  0.553309 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0300  MCP methyltransferase, CheR-type  34.23 
 
 		 302 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000961073  normal  0.256387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0332  MCP methyltransferase, CheR-type  34.62 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.284961 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1573  MCP methyltransferase, CheR-type  35.11 
 
 		 292 aa  170  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0438911  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3546  MCP methyltransferase, CheR-type  35.69 
 
 		 267 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal  0.882443 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04754  CheR methyltransferase, SAM binding domain  37.92 
 
 		 268 aa  169  7e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>