More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0910 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0910  chemotaxis protein methyltransferase CheR  100 
 
 
269 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0783  protein-glutamate O-methyltransferase  91.08 
 
 
269 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.827996  normal  0.901412 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0904  MCP methyltransferase, CheR-type  60.84 
 
 
267 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1146  MCP methyltransferase, CheR-type  57.78 
 
 
270 aa  325  7e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.492811  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3299  protein-glutamate O-methyltransferase  55.64 
 
 
275 aa  314  9e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3546  MCP methyltransferase, CheR-type  55.35 
 
 
267 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal  0.882443 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04754  CheR methyltransferase, SAM binding domain  52.04 
 
 
268 aa  300  1e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584849  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  51.89 
 
 
269 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711153  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2325  chemotaxis protein methyltransferase CheR  48.88 
 
 
275 aa  261  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1528  MCP methyltransferase, CheR-type  47.71 
 
 
266 aa  241  6e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.168715 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1565  protein-glutamate O-methyltransferase  46.01 
 
 
269 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.724121  normal  0.553309 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0626  MCP methyltransferase, CheR-type  44.28 
 
 
301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.325159  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0635  MCP methyltransferase, CheR-type  44.28 
 
 
301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0601  MCP methyltransferase, CheR-type  43.17 
 
 
299 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0428  MCP methyltransferase, CheR-type  45.19 
 
 
275 aa  226  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0335  MCP methyltransferase, CheR-type  42.44 
 
 
280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0645  protein-glutamate O-methyltransferase  43.01 
 
 
302 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0464454  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1731  MCP methyltransferase, CheR-type  40.36 
 
 
290 aa  209  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1300  chemotaxis methyltransferase CheR  42.44 
 
 
286 aa  206  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000891589 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2117  chemotaxis methyltransferase CheR  42.07 
 
 
286 aa  206  5e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.396301  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2622  chemotaxis methyltransferase CheR  42.07 
 
 
286 aa  206  5e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000206628 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1748  chemotaxis methyltransferase CheR  42.07 
 
 
286 aa  205  6e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2177  chemotaxis methyltransferase CheR  42.07 
 
 
286 aa  205  6e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1756  MCP methyltransferase, CheR-type  42.07 
 
 
286 aa  205  8e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0553359  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1980  chemotaxis methyltransferase CheR  42.07 
 
 
286 aa  205  8e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01855  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  42.07 
 
 
286 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.435118  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0661  MCP methyltransferase, CheR-type  40.74 
 
 
271 aa  204  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01844  hypothetical protein  42.07 
 
 
286 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.370669  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1143  chemotaxis protein methyltransferase CheR  39.64 
 
 
292 aa  202  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0207024  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2455  chemotaxis methyltransferase CheR  41.26 
 
 
288 aa  202  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2420  MCP methyltransferase, CheR-type  41.88 
 
 
289 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.503139  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2078  chemotaxis methyltransferase CheR  40.89 
 
 
288 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.687941  hitchhiker  2.73756e-16 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2073  chemotaxis methyltransferase CheR  40.89 
 
 
288 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.50771  hitchhiker  0.000251677 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1204  chemotaxis methyltransferase CheR  40.89 
 
 
288 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1327  chemotaxis methyltransferase CheR  40.89 
 
 
288 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000151288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2133  chemotaxis methyltransferase CheR  40.89 
 
 
288 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000021864 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2618  MCP methyltransferase, CheR-type  39.05 
 
 
292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  39.78 
 
 
281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.299383  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1610  MCP methyltransferase, CheR-type  39.27 
 
 
274 aa  196  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1595  MCP methyltransferase, CheR-type  38.83 
 
 
284 aa  195  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3218  MCP methyltransferase, CheR-type  39.11 
 
 
295 aa  194  9e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1539  protein-glutamate O-methyltransferase  38.75 
 
 
291 aa  193  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1043  MCP methyltransferase, CheR-type  38.75 
 
 
283 aa  192  6e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0808  MCP methyltransferase, CheR-type  40.22 
 
 
272 aa  191  8e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1077  MCP methyltransferase, CheR-type  38.02 
 
 
300 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329536 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2984  protein-glutamate O-methyltransferase  38.46 
 
 
285 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1405  chemotaxis protein methyltransferase  39.62 
 
 
292 aa  187  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.0669102 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2124  chemotaxis protein methyltransferase CheR  39.62 
 
 
277 aa  187  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5610  MCP methyltransferase, CheR-type  38.78 
 
 
303 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0089  MCP methyltransferase, CheR-type  38.71 
 
 
283 aa  187  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24390  protein-glutamate O-methyltransferase. chemotaxis protein  38.64 
 
 
287 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.273905  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4052  MCP methyltransferase, CheR-type  40 
 
 
293 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3691  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  39.54 
 
 
303 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00198927  normal  0.0225149 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4164  MCP methyltransferase, CheR-type  40 
 
 
293 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4819  MCP methyltransferase, CheR-type  40.23 
 
 
282 aa  186  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728077  hitchhiker  0.00962017 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1932  MCP methyltransferase, CheR-type  38.4 
 
 
283 aa  186  4e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2115  protein-glutamate O-methyltransferase  39.38 
 
 
281 aa  185  7e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0159  chemotaxis protein methyltransferase CheR  38.31 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0207  CheR methyltransferase SAM-binding domain-containing protein  39 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3302  protein-glutamate O-methyltransferase  40 
 
 
265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0255  putative chemotaxis protein methyltransferase  42.69 
 
 
280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2215  MCP methyltransferase, CheR-type  38.85 
 
 
276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.556164  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2244  protein-glutamate O-methyltransferase  38.08 
 
 
281 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00847323  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22590  Protein-glutamate O-methyltransferase  37.23 
 
 
309 aa  182  7e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2146  MCP methyltransferase, CheR-type  35.53 
 
 
271 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0730  MCP methyltransferase, CheR-type  38.72 
 
 
300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0443063  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2101  MCP methyltransferase, CheR-type  37.69 
 
 
281 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.60784  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02200  putative chemotaxis protein methyltransferase  41.7 
 
 
280 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.077708  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2166  protein-glutamate O-methyltransferase  38.61 
 
 
292 aa  179  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00016475  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00055  chemotaxis protein methyltransferase 2  36.76 
 
 
286 aa  179  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00310975  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0614  MCP methyltransferase, CheR-type  36.26 
 
 
275 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0483798 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2361  protein-glutamate O-methyltransferase  37.69 
 
 
281 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1617  MCP methyltransferase, CheR-type  38.46 
 
 
289 aa  178  7e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1515  chemotaxis methyltransferase CheR  39.85 
 
 
290 aa  177  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1756  chemotaxis methyltransferase CheR  38.87 
 
 
295 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.456402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1644  chemotaxis methyltransferase CheR  38.87 
 
 
272 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0657  MCP methyltransferase, CheR-type  37.26 
 
 
296 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.120935 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  39.69 
 
 
280 aa  176  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3518  chemotaxis methyltransferase CheR  38.87 
 
 
272 aa  177  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.577755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1884  MCP methyltransferase, CheR-type  38.46 
 
 
276 aa  176  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0878954 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2090  MCP methyltransferase, CheR-type  38.08 
 
 
276 aa  176  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.853389 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0757  MCP methyltransferase, CheR-type  36.94 
 
 
275 aa  175  6e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0625  MCP methyltransferase, CheR-type  37.41 
 
 
290 aa  175  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3811  MCP methyltransferase, CheR-type  37.69 
 
 
318 aa  175  9e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7834  MCP methyltransferase, CheR-type  37.73 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2608  chemotaxis methyltransferase CheR  39.11 
 
 
290 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.215293  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0040  CheR methyltransferase, SAM binding domain protein  36.8 
 
 
283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1858  chemotaxis methyltransferase CheR  39.48 
 
 
290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1845  MCP methyltransferase, CheR-type  36.53 
 
 
289 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.516279 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4310  chemotaxis methyltransferase  37.55 
 
 
293 aa  172  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1543  chemotaxis methyltransferase CheR  37.64 
 
 
290 aa  172  5e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.520759  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2981  chemotaxis methyltransferase CheR  40 
 
 
290 aa  172  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0875  MCP methyltransferase, CheR-type  35.71 
 
 
271 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2105  MCP methyltransferase, CheR-type  34.07 
 
 
283 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  38.02 
 
 
280 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0168  MCP methyltransferase, CheR-type  38.93 
 
 
328 aa  170  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.419483 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3179  chemotaxis protein methyltransferase CheR  38.93 
 
 
314 aa  170  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4669  MCP methyltransferase, CheR-type  38.24 
 
 
283 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.225745  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  38.1 
 
 
288 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4252  MCP methyltransferase, CheR-type  37.41 
 
 
275 aa  169  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>