More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1617 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1617  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 		 289 aa  598  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1932  MCP methyltransferase, CheR-type  70.11 
 
 		 283 aa  420  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1405  chemotaxis protein methyltransferase  63.7 
 
 		 292 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.0669102 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0730  MCP methyltransferase, CheR-type  61.65 
 
 		 300 aa  363  2e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0443063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4052  MCP methyltransferase, CheR-type  61.48 
 
 		 293 aa  358  7e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4164  MCP methyltransferase, CheR-type  61.48 
 
 		 293 aa  358  7e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3811  MCP methyltransferase, CheR-type  61.01 
 
 		 318 aa  351  7e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5610  MCP methyltransferase, CheR-type  61.01 
 
 		 303 aa  346  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3691  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  62.08 
 
 		 303 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00198927  normal  0.0225149 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3179  chemotaxis protein methyltransferase CheR  62.77 
 
 		 314 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  59.47 
 
 		 290 aa  342  4e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1077  MCP methyltransferase, CheR-type  60.36 
 
 		 300 aa  338  5.9999999999999996e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329536 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3852  chemotaxis protein methyltransferase  62.41 
 
 		 315 aa  338  8e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1687  chemotaxis protein methyltransferase CheR  62.04 
 
 		 315 aa  338  9e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.460756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3119  chemotaxis protein methyltransferase CheR  62.04 
 
 		 315 aa  338  9e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830428  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2856  chemotaxis protein methyltransferase CheR  62.04 
 
 		 314 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0073  chemotaxis protein methyltransferase  62.04 
 
 		 314 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3933  chemotaxis protein methyltransferase CheR  62.04 
 
 		 315 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2971  MCP methyltransferase, CheR-type  60.29 
 
 		 313 aa  332  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000784275 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2166  protein-glutamate O-methyltransferase  61.05 
 
 		 292 aa  332  3e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00016475  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0168  MCP methyltransferase, CheR-type  62.27 
 
 		 328 aa  332  4e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.419483 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0122  MCP methyltransferase, CheR-type  61.37 
 
 		 316 aa  332  6e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4154  MCP methyltransferase, CheR-type  59.09 
 
 		 273 aa  330  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24390  protein-glutamate O-methyltransferase. chemotaxis protein  60.46 
 
 		 287 aa  327  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.273905  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0241  MCP methyltransferase, CheR-type  60.81 
 
 		 325 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0215152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2848  MCP methyltransferase, CheR-type  60.81 
 
 		 330 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.242371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0259  MCP methyltransferase, CheR-type  60.81 
 
 		 330 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000294494  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0185  MCP methyltransferase, CheR-type  60.81 
 
 		 325 aa  325  7e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0172  MCP methyltransferase, CheR-type  60.81 
 
 		 325 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581337  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3361  MCP methyltransferase, CheR-type  60.44 
 
 		 327 aa  323  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0405517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00055  chemotaxis protein methyltransferase 2  57.45 
 
 		 286 aa  322  4e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00310975  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1845  MCP methyltransferase, CheR-type  58.71 
 
 		 289 aa  314  9.999999999999999e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.516279 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1543  chemotaxis methyltransferase CheR  60.7 
 
 		 290 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.520759  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0657  MCP methyltransferase, CheR-type  58.11 
 
 		 296 aa  312  3.9999999999999997e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120935 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1515  chemotaxis methyltransferase CheR  59.92 
 
 		 290 aa  311  9e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3788  MCP methyltransferase, CheR-type  57.2 
 
 		 297 aa  306  3e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3062  MCP methyltransferase, CheR-type  57.2 
 
 		 297 aa  305  5.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0159  chemotaxis protein methyltransferase CheR  53.79 
 
 		 273 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0700  MCP methyltransferase, CheR-type  57.62 
 
 		 284 aa  303  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1300  chemotaxis methyltransferase CheR  56.42 
 
 		 286 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000891589 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1756  MCP methyltransferase, CheR-type  56.03 
 
 		 286 aa  302  5.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0553359  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2608  chemotaxis methyltransferase CheR  59.53 
 
 		 290 aa  302  5.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.215293  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1980  chemotaxis methyltransferase CheR  56.03 
 
 		 286 aa  302  5.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2177  chemotaxis methyltransferase CheR  56.03 
 
 		 286 aa  301  6.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1748  chemotaxis methyltransferase CheR  56.03 
 
 		 286 aa  301  6.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01855  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  56.03 
 
 		 286 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.435118  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01844  hypothetical protein  56.03 
 
 		 286 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.370669  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1756  chemotaxis methyltransferase CheR  58.37 
 
 		 295 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.456402  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2622  chemotaxis methyltransferase CheR  55.64 
 
 		 286 aa  299  4e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206628 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1858  chemotaxis methyltransferase CheR  58.75 
 
 		 290 aa  299  4e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1644  chemotaxis methyltransferase CheR  58.37 
 
 		 272 aa  298  5e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2117  chemotaxis methyltransferase CheR  55.25 
 
 		 286 aa  298  5e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.396301  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3518  chemotaxis methyltransferase CheR  58.37 
 
 		 272 aa  298  5e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.577755 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3218  MCP methyltransferase, CheR-type  58.11 
 
 		 295 aa  298  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1043  MCP methyltransferase, CheR-type  58.49 
 
 		 283 aa  297  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2078  chemotaxis methyltransferase CheR  56.42 
 
 		 288 aa  296  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.687941  hitchhiker  2.73756e-16 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4376  MCP methyltransferase, CheR-type  55.3 
 
 		 295 aa  297  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.525329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2073  chemotaxis methyltransferase CheR  56.42 
 
 		 288 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.50771  hitchhiker  0.000251677 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1204  chemotaxis methyltransferase CheR  56.42 
 
 		 288 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0207  CheR methyltransferase SAM-binding domain-containing protein  51.89 
 
 		 270 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2174  protein-glutamate O-methyltransferase  54.61 
 
 		 296 aa  295  5e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1327  chemotaxis methyltransferase CheR  56.03 
 
 		 288 aa  295  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000151288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2133  chemotaxis methyltransferase CheR  56.03 
 
 		 288 aa  295  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000021864 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2455  chemotaxis methyltransferase CheR  56.03 
 
 		 288 aa  290  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0569  MCP methyltransferase, CheR-type  53.96 
 
 		 298 aa  289  3e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.429442  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2700  MCP methyltransferase, CheR-type  55.81 
 
 		 288 aa  285  4e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2981  chemotaxis methyltransferase CheR  58.75 
 
 		 290 aa  285  7e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2124  chemotaxis protein methyltransferase CheR  51.71 
 
 		 277 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02200  putative chemotaxis protein methyltransferase  56.23 
 
 		 280 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.077708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0255  putative chemotaxis protein methyltransferase  55.85 
 
 		 280 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2215  MCP methyltransferase, CheR-type  52.08 
 
 		 276 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.556164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2115  protein-glutamate O-methyltransferase  50.76 
 
 		 281 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1884  MCP methyltransferase, CheR-type  50.94 
 
 		 276 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0878954 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2090  MCP methyltransferase, CheR-type  50.94 
 
 		 276 aa  263  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.853389 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3302  protein-glutamate O-methyltransferase  50.38 
 
 		 265 aa  260  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2244  protein-glutamate O-methyltransferase  49.24 
 
 		 281 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00847323  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2361  protein-glutamate O-methyltransferase  49.62 
 
 		 281 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2101  MCP methyltransferase, CheR-type  49.24 
 
 		 281 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.60784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2162  protein-glutamate O-methyltransferase  49.05 
 
 		 272 aa  249  3e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0757  MCP methyltransferase, CheR-type  45.26 
 
 		 275 aa  236  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  46.13 
 
 		 288 aa  234  9e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0281  MCP methyltransferase, CheR-type  45.93 
 
 		 292 aa  231  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3498  protein-glutamate O-methyltransferase  48.7 
 
 		 273 aa  222  6e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  43.7 
 
 		 280 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  44.32 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2146  MCP methyltransferase, CheR-type  45.52 
 
 		 271 aa  219  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3104  MCP methyltransferase, CheR-type  42.09 
 
 		 285 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0152  chemotaxis protein methyltransferase CheR  39.93 
 
 		 276 aa  205  6e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2710  protein-glutamate O-methyltransferase  40.62 
 
 		 298 aa  198  7e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22590  Protein-glutamate O-methyltransferase  37.59 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0089  MCP methyltransferase, CheR-type  39.56 
 
 		 283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1444  MCP methyltransferase, CheR-type  44.13 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0661  MCP methyltransferase, CheR-type  37.84 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0635  MCP methyltransferase, CheR-type  41.85 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0626  MCP methyltransferase, CheR-type  41.26 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.325159  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1405  MCP methyltransferase, CheR-type  38.1 
 
 		 284 aa  189  5e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216379  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1143  chemotaxis protein methyltransferase CheR  39.21 
 
 		 292 aa  188  7e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0207024  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4074  chemotaxis methyltransferase  41.85 
 
 		 302 aa  188  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0332  MCP methyltransferase, CheR-type  39.64 
 
 		 302 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.284961 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0601  MCP methyltransferase, CheR-type  39.86 
 
 		 299 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>