More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1405 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1405  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 		 284 aa  585  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216379  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0617  MCP methyltransferase, CheR-type  56.41 
 
 		 285 aa  314  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3258  MCP methyltransferase, CheR-type  55.64 
 
 		 285 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.572283  normal  0.159022 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3557  MCP methyltransferase, CheR-type  55.27 
 
 		 285 aa  304  9.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.132708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1595  MCP methyltransferase, CheR-type  51.06 
 
 		 284 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2618  MCP methyltransferase, CheR-type  50.53 
 
 		 292 aa  300  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4310  chemotaxis methyltransferase  54.32 
 
 		 293 aa  300  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4819  MCP methyltransferase, CheR-type  55.64 
 
 		 282 aa  296  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728077  hitchhiker  0.00962017 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4669  MCP methyltransferase, CheR-type  53.24 
 
 		 283 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.225745  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0141  MCP methyltransferase, CheR-type  52.92 
 
 		 280 aa  288  6e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0351158  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2420  MCP methyltransferase, CheR-type  48.72 
 
 		 289 aa  287  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.503139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2984  protein-glutamate O-methyltransferase  50.18 
 
 		 285 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6731  MCP methyltransferase, CheR-type  50.91 
 
 		 273 aa  276  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1610  MCP methyltransferase, CheR-type  46.49 
 
 		 274 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1143  chemotaxis protein methyltransferase CheR  47.41 
 
 		 292 aa  270  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0207024  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7834  MCP methyltransferase, CheR-type  50.92 
 
 		 275 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1731  MCP methyltransferase, CheR-type  44.33 
 
 		 290 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2105  MCP methyltransferase, CheR-type  46.15 
 
 		 283 aa  265  7e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0466  MCP methyltransferase, CheR-type  50.36 
 
 		 295 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.176521 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1539  protein-glutamate O-methyltransferase  45.52 
 
 		 291 aa  256  3e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0625  MCP methyltransferase, CheR-type  43.01 
 
 		 290 aa  248  8e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  42.96 
 
 		 281 aa  245  6e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.299383  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0267  protein-glutamate O-methyltransferase  47.21 
 
 		 278 aa  241  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.647736 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1382  MCP methyltransferase, CheR-type  45.79 
 
 		 303 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0239  protein-glutamate O-methyltransferase  46.1 
 
 		 278 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1587  chemotaxis methyltransferase, CheR2  45.72 
 
 		 278 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2475  MCP methyltransferase, CheR-type  45.62 
 
 		 303 aa  235  7e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0126751  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0875  MCP methyltransferase, CheR-type  44.98 
 
 		 271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2571  MCP methyltransferase, CheR-type  45.62 
 
 		 303 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0626  MCP methyltransferase, CheR-type  41.67 
 
 		 301 aa  208  7e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.325159  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0601  MCP methyltransferase, CheR-type  41.67 
 
 		 299 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0635  MCP methyltransferase, CheR-type  41.3 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1043  MCP methyltransferase, CheR-type  41.2 
 
 		 283 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0757  MCP methyltransferase, CheR-type  35.53 
 
 		 275 aa  195  6e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0645  protein-glutamate O-methyltransferase  39.01 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0464454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3218  MCP methyltransferase, CheR-type  39.7 
 
 		 295 aa  192  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  40 
 
 		 269 aa  192  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711153  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3302  protein-glutamate O-methyltransferase  36.63 
 
 		 265 aa  192  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0040  CheR methyltransferase, SAM binding domain protein  35.38 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0152  chemotaxis protein methyltransferase CheR  37.96 
 
 		 276 aa  190  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0281  MCP methyltransferase, CheR-type  36.43 
 
 		 292 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0730  MCP methyltransferase, CheR-type  36.4 
 
 		 300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0443063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1617  MCP methyltransferase, CheR-type  38.1 
 
 		 289 aa  189  4e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0159  chemotaxis protein methyltransferase CheR  37.69 
 
 		 273 aa  189  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0207  CheR methyltransferase SAM-binding domain-containing protein  38.29 
 
 		 270 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1932  MCP methyltransferase, CheR-type  39.03 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1565  protein-glutamate O-methyltransferase  39.3 
 
 		 269 aa  186  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.724121  normal  0.553309 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00055  chemotaxis protein methyltransferase 2  35.54 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00310975  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2215  MCP methyltransferase, CheR-type  38.66 
 
 		 276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.556164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3104  MCP methyltransferase, CheR-type  36.26 
 
 		 285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2115  protein-glutamate O-methyltransferase  37.92 
 
 		 281 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2090  MCP methyltransferase, CheR-type  37.92 
 
 		 276 aa  182  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.853389 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2146  MCP methyltransferase, CheR-type  37.73 
 
 		 271 aa  182  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0808  MCP methyltransferase, CheR-type  37.99 
 
 		 272 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1884  MCP methyltransferase, CheR-type  37.55 
 
 		 276 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0878954 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0428  MCP methyltransferase, CheR-type  37.87 
 
 		 275 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1405  chemotaxis protein methyltransferase  34.19 
 
 		 292 aa  179  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.0669102 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0661  MCP methyltransferase, CheR-type  33.33 
 
 		 271 aa  178  8e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3788  MCP methyltransferase, CheR-type  35.93 
 
 		 297 aa  177  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1845  MCP methyltransferase, CheR-type  37.5 
 
 		 289 aa  177  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.516279 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4154  MCP methyltransferase, CheR-type  36.94 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3062  MCP methyltransferase, CheR-type  35.93 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2124  chemotaxis protein methyltransferase CheR  36.8 
 
 		 277 aa  176  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0700  MCP methyltransferase, CheR-type  37.36 
 
 		 284 aa  176  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0089  MCP methyltransferase, CheR-type  29.93 
 
 		 283 aa  176  4e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3546  MCP methyltransferase, CheR-type  37.73 
 
 		 267 aa  176  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal  0.882443 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3204  MCP methyltransferase, CheR-type  38.1 
 
 		 285 aa  176  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.25041  normal  0.841939 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4164  MCP methyltransferase, CheR-type  33.82 
 
 		 293 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4052  MCP methyltransferase, CheR-type  33.82 
 
 		 293 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1330  protein-glutamate O-methyltransferase  34.55 
 
 		 270 aa  175  7e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2166  protein-glutamate O-methyltransferase  35.77 
 
 		 292 aa  175  8e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00016475  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2710  protein-glutamate O-methyltransferase  37.6 
 
 		 298 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0255  putative chemotaxis protein methyltransferase  36.43 
 
 		 280 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1077  MCP methyltransferase, CheR-type  36.43 
 
 		 300 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329536 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3299  protein-glutamate O-methyltransferase  37.82 
 
 		 275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3811  MCP methyltransferase, CheR-type  36.19 
 
 		 318 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2700  MCP methyltransferase, CheR-type  36.03 
 
 		 288 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2078  chemotaxis methyltransferase CheR  38.46 
 
 		 288 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.687941  hitchhiker  2.73756e-16 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2117  chemotaxis methyltransferase CheR  37.64 
 
 		 286 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.396301  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2244  protein-glutamate O-methyltransferase  36.06 
 
 		 281 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00847323  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2073  chemotaxis methyltransferase CheR  38.46 
 
 		 288 aa  172  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.50771  hitchhiker  0.000251677 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1204  chemotaxis methyltransferase CheR  38.46 
 
 		 288 aa  172  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4376  MCP methyltransferase, CheR-type  34.57 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.525329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2101  MCP methyltransferase, CheR-type  35.69 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.60784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3625  MCP methyltransferase, CheR-type  36.43 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0636111 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2174  protein-glutamate O-methyltransferase  36.43 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24390  protein-glutamate O-methyltransferase. chemotaxis protein  35.42 
 
 		 287 aa  170  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.273905  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5610  MCP methyltransferase, CheR-type  35.77 
 
 		 303 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2622  chemotaxis methyltransferase CheR  38.1 
 
 		 286 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206628 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0657  MCP methyltransferase, CheR-type  35.9 
 
 		 296 aa  170  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120935 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2361  protein-glutamate O-methyltransferase  35.69 
 
 		 281 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1327  chemotaxis methyltransferase CheR  38.1 
 
 		 288 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000151288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2133  chemotaxis methyltransferase CheR  38.1 
 
 		 288 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000021864 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22590  Protein-glutamate O-methyltransferase  33.46 
 
 		 309 aa  170  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  34.56 
 
 		 288 aa  170  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0783  protein-glutamate O-methyltransferase  34.91 
 
 		 269 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.827996  normal  0.901412 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1748  chemotaxis methyltransferase CheR  38.1 
 
 		 286 aa  170  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2177  chemotaxis methyltransferase CheR  38.1 
 
 		 286 aa  170  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1444  MCP methyltransferase, CheR-type  37.69 
 
 		 300 aa  169  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0904  MCP methyltransferase, CheR-type  37 
 
 		 267 aa  170  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>