More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3204 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3204  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 		 285 aa  593  1e-168  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.25041  normal  0.841939 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1098  protein-glutamate O-methyltransferase  47.37 
 
 		 305 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2434  putative MCP methyltransferase, CheR1  46.99 
 
 		 305 aa  262  4e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1444  MCP methyltransferase, CheR-type  46.86 
 
 		 300 aa  258  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2710  protein-glutamate O-methyltransferase  46.27 
 
 		 298 aa  258  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0237  protein-glutamate O-methyltransferase  45.96 
 
 		 307 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.291409 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0300  MCP methyltransferase, CheR-type  47.23 
 
 		 302 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000961073  normal  0.256387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0332  MCP methyltransferase, CheR-type  46.86 
 
 		 302 aa  248  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.284961 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3625  MCP methyltransferase, CheR-type  45.22 
 
 		 298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0636111 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4074  chemotaxis methyltransferase  45.22 
 
 		 302 aa  243  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1796  protein-glutamate O-methyltransferase  43.27 
 
 		 294 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2839  MCP methyltransferase, CheR-type  43.17 
 
 		 293 aa  237  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.40202  normal  0.212015 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0281  MCP methyltransferase, CheR-type  43.17 
 
 		 292 aa  233  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3469  MCP methyltransferase, CheR-type  40.53 
 
 		 280 aa  214  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.912759  normal  0.640591 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  40.6 
 
 		 280 aa  204  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0152  chemotaxis protein methyltransferase CheR  39.78 
 
 		 276 aa  203  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0757  MCP methyltransferase, CheR-type  38.06 
 
 		 275 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3104  MCP methyltransferase, CheR-type  37.74 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2146  MCP methyltransferase, CheR-type  38.11 
 
 		 271 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2105  MCP methyltransferase, CheR-type  37.6 
 
 		 283 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0040  CheR methyltransferase, SAM binding domain protein  39.46 
 
 		 283 aa  192  6e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2618  MCP methyltransferase, CheR-type  39.85 
 
 		 292 aa  192  8e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1595  MCP methyltransferase, CheR-type  40.23 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1043  MCP methyltransferase, CheR-type  40.66 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3218  MCP methyltransferase, CheR-type  40.29 
 
 		 295 aa  190  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  37.59 
 
 		 280 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1539  protein-glutamate O-methyltransferase  36.47 
 
 		 291 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0614  MCP methyltransferase, CheR-type  39.45 
 
 		 275 aa  189  5e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0483798 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  38.72 
 
 		 288 aa  188  7e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22590  Protein-glutamate O-methyltransferase  37.82 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0808  MCP methyltransferase, CheR-type  37.21 
 
 		 272 aa  186  5e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1143  chemotaxis protein methyltransferase CheR  39.26 
 
 		 292 aa  185  6e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0207024  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0625  MCP methyltransferase, CheR-type  40.36 
 
 		 290 aa  185  7e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4819  MCP methyltransferase, CheR-type  38.1 
 
 		 282 aa  185  8e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728077  hitchhiker  0.00962017 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0875  MCP methyltransferase, CheR-type  37.92 
 
 		 271 aa  185  9e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2475  MCP methyltransferase, CheR-type  39.45 
 
 		 303 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0126751  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3498  protein-glutamate O-methyltransferase  41.11 
 
 		 273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  37.5 
 
 		 281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.299383  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0159  chemotaxis protein methyltransferase CheR  40.08 
 
 		 273 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0466  MCP methyltransferase, CheR-type  36.36 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.176521 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2984  protein-glutamate O-methyltransferase  38.91 
 
 		 285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0089  MCP methyltransferase, CheR-type  37.96 
 
 		 283 aa  179  5.999999999999999e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3139  protein-glutamate O-methyltransferase  37.64 
 
 		 291 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0207  CheR methyltransferase SAM-binding domain-containing protein  39.29 
 
 		 270 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0579  MCP methyltransferase, CheR-type  39.84 
 
 		 280 aa  178  7e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1610  MCP methyltransferase, CheR-type  39.15 
 
 		 274 aa  178  9e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0141  MCP methyltransferase, CheR-type  37.13 
 
 		 280 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0351158  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0428  MCP methyltransferase, CheR-type  37.87 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3062  MCP methyltransferase, CheR-type  38.98 
 
 		 297 aa  176  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0661  MCP methyltransferase, CheR-type  37.7 
 
 		 271 aa  176  3e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1405  MCP methyltransferase, CheR-type  38.1 
 
 		 284 aa  176  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216379  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2571  MCP methyltransferase, CheR-type  38.67 
 
 		 303 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4669  MCP methyltransferase, CheR-type  38.97 
 
 		 283 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.225745  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2118  MCP methyltransferase, CheR-type  38.52 
 
 		 283 aa  175  8e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3788  MCP methyltransferase, CheR-type  38.98 
 
 		 297 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1330  protein-glutamate O-methyltransferase  36.61 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1731  MCP methyltransferase, CheR-type  37.36 
 
 		 290 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2305  MCP methyltransferase, CheR-type  39.76 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2420  MCP methyltransferase, CheR-type  38.01 
 
 		 289 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.503139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1382  MCP methyltransferase, CheR-type  38.67 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2162  protein-glutamate O-methyltransferase  37.17 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0569  MCP methyltransferase, CheR-type  37.74 
 
 		 298 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.429442  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6731  MCP methyltransferase, CheR-type  37.5 
 
 		 273 aa  172  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079631  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24390  protein-glutamate O-methyltransferase. chemotaxis protein  36.57 
 
 		 287 aa  172  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.273905  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2215  chemotaxis protein methyltransferase CheR  37.05 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.171483  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0783  protein-glutamate O-methyltransferase  37.36 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.827996  normal  0.901412 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2455  chemotaxis methyltransferase CheR  38.77 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3691  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  38.29 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00198927  normal  0.0225149 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0635  MCP methyltransferase, CheR-type  37.21 
 
 		 301 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1077  MCP methyltransferase, CheR-type  37.59 
 
 		 300 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329536 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0645  protein-glutamate O-methyltransferase  36.03 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0464454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3302  protein-glutamate O-methyltransferase  37.55 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7834  MCP methyltransferase, CheR-type  35.77 
 
 		 275 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1988  Protein-glutamate O-methyltransferase  37.6 
 
 		 275 aa  169  4e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0626  MCP methyltransferase, CheR-type  36.82 
 
 		 301 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.325159  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1199  methylase of chemotaxis methyl-accepting protein, CheR-like  35.58 
 
 		 291 aa  169  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1617  MCP methyltransferase, CheR-type  38.24 
 
 		 289 aa  169  6e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0975  MCP methyltransferase, CheR-type  37.31 
 
 		 281 aa  168  8e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  36.84 
 
 		 297 aa  167  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3299  protein-glutamate O-methyltransferase  37.01 
 
 		 275 aa  168  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  35.64 
 
 		 290 aa  168  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2117  chemotaxis methyltransferase CheR  39.15 
 
 		 286 aa  167  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.396301  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00055  chemotaxis protein methyltransferase 2  35.27 
 
 		 286 aa  168  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00310975  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4376  MCP methyltransferase, CheR-type  36.54 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.525329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1146  MCP methyltransferase, CheR-type  38.04 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.492811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2622  chemotaxis methyltransferase CheR  38.76 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206628 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0601  MCP methyltransferase, CheR-type  34.89 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2700  MCP methyltransferase, CheR-type  34.44 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1204  chemotaxis methyltransferase CheR  38.61 
 
 		 288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2133  chemotaxis methyltransferase CheR  38.7 
 
 		 288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000021864 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1932  MCP methyltransferase, CheR-type  36.9 
 
 		 283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2078  chemotaxis methyltransferase CheR  38.7 
 
 		 288 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.687941  hitchhiker  2.73756e-16 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1327  chemotaxis methyltransferase CheR  38.7 
 
 		 288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000151288 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0910  chemotaxis protein methyltransferase CheR  36.4 
 
 		 269 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5610  MCP methyltransferase, CheR-type  36.58 
 
 		 303 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2073  chemotaxis methyltransferase CheR  38.7 
 
 		 288 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.50771  hitchhiker  0.000251677 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1756  MCP methyltransferase, CheR-type  38.76 
 
 		 286 aa  166  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0553359  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1980  chemotaxis methyltransferase CheR  38.76 
 
 		 286 aa  166  5e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0335  MCP methyltransferase, CheR-type  37.97 
 
 		 280 aa  166  5e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1748  chemotaxis methyltransferase CheR  38.76 
 
 		 286 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>