More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0141 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0141  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 		 280 aa  577  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0351158  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6731  MCP methyltransferase, CheR-type  71.53 
 
 		 273 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4669  MCP methyltransferase, CheR-type  67.97 
 
 		 283 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.225745  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7834  MCP methyltransferase, CheR-type  68.5 
 
 		 275 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4819  MCP methyltransferase, CheR-type  58.46 
 
 		 282 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728077  hitchhiker  0.00962017 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1405  MCP methyltransferase, CheR-type  52.92 
 
 		 284 aa  288  6e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216379  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1587  chemotaxis methyltransferase, CheR2  49.64 
 
 		 278 aa  268  7e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0239  protein-glutamate O-methyltransferase  49.64 
 
 		 278 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2420  MCP methyltransferase, CheR-type  47.67 
 
 		 289 aa  259  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.503139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2984  protein-glutamate O-methyltransferase  46.59 
 
 		 285 aa  260  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1731  MCP methyltransferase, CheR-type  46.18 
 
 		 290 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0267  protein-glutamate O-methyltransferase  50.57 
 
 		 278 aa  258  8e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.647736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0617  MCP methyltransferase, CheR-type  48.53 
 
 		 285 aa  256  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3557  MCP methyltransferase, CheR-type  49.08 
 
 		 285 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.132708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3258  MCP methyltransferase, CheR-type  48.72 
 
 		 285 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.572283  normal  0.159022 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1595  MCP methyltransferase, CheR-type  45.96 
 
 		 284 aa  251  6e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2618  MCP methyltransferase, CheR-type  45.59 
 
 		 292 aa  250  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0625  MCP methyltransferase, CheR-type  43.96 
 
 		 290 aa  250  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0466  MCP methyltransferase, CheR-type  49.64 
 
 		 295 aa  248  8e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.176521 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2105  MCP methyltransferase, CheR-type  44.16 
 
 		 283 aa  246  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1610  MCP methyltransferase, CheR-type  45.09 
 
 		 274 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  42.07 
 
 		 281 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.299383  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1143  chemotaxis protein methyltransferase CheR  45.05 
 
 		 292 aa  240  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0207024  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4310  chemotaxis methyltransferase  46.52 
 
 		 293 aa  240  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1539  protein-glutamate O-methyltransferase  43.07 
 
 		 291 aa  238  8e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0875  MCP methyltransferase, CheR-type  44.12 
 
 		 271 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1382  MCP methyltransferase, CheR-type  44.89 
 
 		 303 aa  215  8e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2475  MCP methyltransferase, CheR-type  43.96 
 
 		 303 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0126751  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2571  MCP methyltransferase, CheR-type  43.96 
 
 		 303 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0089  MCP methyltransferase, CheR-type  37.59 
 
 		 283 aa  201  9e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0626  MCP methyltransferase, CheR-type  38.91 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.325159  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0635  MCP methyltransferase, CheR-type  38.55 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22590  Protein-glutamate O-methyltransferase  36.78 
 
 		 309 aa  187  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0601  MCP methyltransferase, CheR-type  39.49 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0808  MCP methyltransferase, CheR-type  36.13 
 
 		 272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0040  CheR methyltransferase, SAM binding domain protein  34.59 
 
 		 283 aa  183  3e-45  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3299  protein-glutamate O-methyltransferase  38.97 
 
 		 275 aa  183  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1573  MCP methyltransferase, CheR-type  37.4 
 
 		 292 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0438911  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0757  MCP methyltransferase, CheR-type  34.56 
 
 		 275 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2146  MCP methyltransferase, CheR-type  40.23 
 
 		 271 aa  182  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0645  protein-glutamate O-methyltransferase  36.92 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0464454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1330  protein-glutamate O-methyltransferase  37.09 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  37 
 
 		 269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711153  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0152  chemotaxis protein methyltransferase CheR  36.82 
 
 		 276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0614  MCP methyltransferase, CheR-type  34.63 
 
 		 275 aa  178  9e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0483798 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3204  MCP methyltransferase, CheR-type  37.13 
 
 		 285 aa  178  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.25041  normal  0.841939 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  35.66 
 
 		 280 aa  176  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0281  MCP methyltransferase, CheR-type  37.55 
 
 		 292 aa  175  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0428  MCP methyltransferase, CheR-type  37.45 
 
 		 275 aa  175  6e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  34.24 
 
 		 280 aa  175  7e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  36.69 
 
 		 297 aa  175  9e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2434  putative MCP methyltransferase, CheR1  36.13 
 
 		 305 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0661  MCP methyltransferase, CheR-type  34.59 
 
 		 271 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1146  MCP methyltransferase, CheR-type  37.37 
 
 		 270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.492811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0904  MCP methyltransferase, CheR-type  36.03 
 
 		 267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1845  MCP methyltransferase, CheR-type  38.46 
 
 		 289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.516279 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2710  protein-glutamate O-methyltransferase  34.8 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1098  protein-glutamate O-methyltransferase  36.13 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3546  MCP methyltransferase, CheR-type  37.96 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal  0.882443 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3302  protein-glutamate O-methyltransferase  35.14 
 
 		 265 aa  172  6.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  36.03 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2117  chemotaxis methyltransferase CheR  37.74 
 
 		 286 aa  171  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.396301  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2622  chemotaxis methyltransferase CheR  37.74 
 
 		 286 aa  170  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206628 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0207  CheR methyltransferase SAM-binding domain-containing protein  37.74 
 
 		 270 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1199  methylase of chemotaxis methyl-accepting protein, CheR-like  36.05 
 
 		 291 aa  169  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2177  chemotaxis methyltransferase CheR  37.74 
 
 		 286 aa  170  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1748  chemotaxis methyltransferase CheR  37.74 
 
 		 286 aa  170  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1756  MCP methyltransferase, CheR-type  37.74 
 
 		 286 aa  169  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0553359  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1980  chemotaxis methyltransferase CheR  37.74 
 
 		 286 aa  169  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01855  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  37.74 
 
 		 286 aa  169  5e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.435118  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01844  hypothetical protein  37.74 
 
 		 286 aa  169  5e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.370669  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0783  protein-glutamate O-methyltransferase  35.51 
 
 		 269 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.827996  normal  0.901412 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4052  MCP methyltransferase, CheR-type  35.98 
 
 		 293 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4164  MCP methyltransferase, CheR-type  35.98 
 
 		 293 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1152  protein-glutamate O-methyltransferase  35.77 
 
 		 291 aa  169  7e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0159  chemotaxis protein methyltransferase CheR  37.5 
 
 		 273 aa  168  8e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1565  protein-glutamate O-methyltransferase  36.96 
 
 		 269 aa  167  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.724121  normal  0.553309 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2115  protein-glutamate O-methyltransferase  38.66 
 
 		 281 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04754  CheR methyltransferase, SAM binding domain  35.66 
 
 		 268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584849  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0335  MCP methyltransferase, CheR-type  37.32 
 
 		 280 aa  166  5e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00055  chemotaxis protein methyltransferase 2  36.29 
 
 		 286 aa  165  9e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00310975  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1988  Protein-glutamate O-methyltransferase  34.62 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0975  MCP methyltransferase, CheR-type  32.03 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1379  MCP methyltransferase, CheR-type  36.92 
 
 		 553 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4154  MCP methyltransferase, CheR-type  36.46 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0730  MCP methyltransferase, CheR-type  35.43 
 
 		 300 aa  163  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0443063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1300  chemotaxis methyltransferase CheR  36.58 
 
 		 286 aa  163  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000891589 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0647  chemotaxis protein methyltransferase  35.8 
 
 		 271 aa  163  4.0000000000000004e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.63831  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1444  MCP methyltransferase, CheR-type  33.58 
 
 		 300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2166  protein-glutamate O-methyltransferase  37.26 
 
 		 292 aa  162  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00016475  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1405  chemotaxis protein methyltransferase  34.85 
 
 		 292 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.0669102 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0778  MCP methyltransferase, CheR-type  35.11 
 
 		 292 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0203537 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0910  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.51 
 
 		 269 aa  161  9e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0700  MCP methyltransferase, CheR-type  35.66 
 
 		 284 aa  161  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2124  chemotaxis protein methyltransferase CheR  38.59 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2101  MCP methyltransferase, CheR-type  36.82 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.60784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2090  MCP methyltransferase, CheR-type  37.34 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.853389 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0295  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.04 
 
 		 277 aa  160  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.468009  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2361  protein-glutamate O-methyltransferase  36.82 
 
 		 281 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3498  protein-glutamate O-methyltransferase  38.82 
 
 		 273 aa  160  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>