More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3104 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3104  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 		 285 aa  595  1e-169  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0757  MCP methyltransferase, CheR-type  53.87 
 
 		 275 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2146  MCP methyltransferase, CheR-type  54.65 
 
 		 271 aa  299  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  48.48 
 
 		 280 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  47.97 
 
 		 288 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  47.73 
 
 		 280 aa  269  4e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3498  protein-glutamate O-methyltransferase  50 
 
 		 273 aa  255  5e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2162  protein-glutamate O-methyltransferase  47.99 
 
 		 272 aa  246  3e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0730  MCP methyltransferase, CheR-type  43.8 
 
 		 300 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0443063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0152  chemotaxis protein methyltransferase CheR  41.85 
 
 		 276 aa  229  5e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1932  MCP methyltransferase, CheR-type  43.96 
 
 		 283 aa  228  8e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2710  protein-glutamate O-methyltransferase  41.76 
 
 		 298 aa  227  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0281  MCP methyltransferase, CheR-type  41.01 
 
 		 292 aa  227  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3811  MCP methyltransferase, CheR-type  43.57 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0207  CheR methyltransferase SAM-binding domain-containing protein  42.8 
 
 		 270 aa  222  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3469  MCP methyltransferase, CheR-type  41.73 
 
 		 280 aa  219  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.912759  normal  0.640591 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3625  MCP methyltransferase, CheR-type  40.44 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0636111 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0159  chemotaxis protein methyltransferase CheR  41.7 
 
 		 273 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2839  MCP methyltransferase, CheR-type  41.81 
 
 		 293 aa  218  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.40202  normal  0.212015 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1444  MCP methyltransferase, CheR-type  41.97 
 
 		 300 aa  218  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1077  MCP methyltransferase, CheR-type  41.39 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329536 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4074  chemotaxis methyltransferase  40.81 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4154  MCP methyltransferase, CheR-type  41.85 
 
 		 273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2166  protein-glutamate O-methyltransferase  42.65 
 
 		 292 aa  216  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00016475  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0300  MCP methyltransferase, CheR-type  41.39 
 
 		 302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000961073  normal  0.256387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0332  MCP methyltransferase, CheR-type  41.39 
 
 		 302 aa  215  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.284961 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1845  MCP methyltransferase, CheR-type  42.34 
 
 		 289 aa  214  9e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.516279 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1617  MCP methyltransferase, CheR-type  42.09 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1405  chemotaxis protein methyltransferase  39.13 
 
 		 292 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.0669102 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5610  MCP methyltransferase, CheR-type  43.12 
 
 		 303 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4164  MCP methyltransferase, CheR-type  39.13 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4052  MCP methyltransferase, CheR-type  39.13 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2618  MCP methyltransferase, CheR-type  40 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4376  MCP methyltransferase, CheR-type  41.45 
 
 		 295 aa  210  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.525329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0569  MCP methyltransferase, CheR-type  40.43 
 
 		 298 aa  209  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.429442  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0237  protein-glutamate O-methyltransferase  41.03 
 
 		 307 aa  210  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.291409 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0122  MCP methyltransferase, CheR-type  43.9 
 
 		 316 aa  209  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1043  MCP methyltransferase, CheR-type  41.67 
 
 		 283 aa  209  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1539  protein-glutamate O-methyltransferase  38.89 
 
 		 291 aa  209  4e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0089  MCP methyltransferase, CheR-type  38.6 
 
 		 283 aa  209  6e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3062  MCP methyltransferase, CheR-type  41.82 
 
 		 297 aa  208  7e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3218  MCP methyltransferase, CheR-type  41.64 
 
 		 295 aa  208  9e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3691  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  41.97 
 
 		 303 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00198927  normal  0.0225149 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3788  MCP methyltransferase, CheR-type  41.82 
 
 		 297 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0626  MCP methyltransferase, CheR-type  39.86 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.325159  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1595  MCP methyltransferase, CheR-type  39.66 
 
 		 284 aa  206  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2434  putative MCP methyltransferase, CheR1  38.24 
 
 		 305 aa  205  5e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2971  MCP methyltransferase, CheR-type  42.16 
 
 		 313 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000784275 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0635  MCP methyltransferase, CheR-type  39.52 
 
 		 301 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1098  protein-glutamate O-methyltransferase  38.24 
 
 		 305 aa  206  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2622  chemotaxis methyltransferase CheR  41.95 
 
 		 286 aa  205  7e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206628 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1756  MCP methyltransferase, CheR-type  41.95 
 
 		 286 aa  205  9e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0553359  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1980  chemotaxis methyltransferase CheR  41.95 
 
 		 286 aa  205  9e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0700  MCP methyltransferase, CheR-type  39.49 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1748  chemotaxis methyltransferase CheR  41.95 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2177  chemotaxis methyltransferase CheR  41.95 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01855  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  41.95 
 
 		 286 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.435118  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0466  MCP methyltransferase, CheR-type  39.07 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.176521 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2117  chemotaxis methyltransferase CheR  41.57 
 
 		 286 aa  203  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.396301  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0601  MCP methyltransferase, CheR-type  40.14 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01844  hypothetical protein  41.95 
 
 		 286 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.370669  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2105  MCP methyltransferase, CheR-type  38.01 
 
 		 283 aa  203  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1300  chemotaxis methyltransferase CheR  41.91 
 
 		 286 aa  202  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000891589 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2984  protein-glutamate O-methyltransferase  38.91 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  38.97 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2073  chemotaxis methyltransferase CheR  39.58 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.50771  hitchhiker  0.000251677 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3204  MCP methyltransferase, CheR-type  37.74 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.25041  normal  0.841939 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24390  protein-glutamate O-methyltransferase. chemotaxis protein  38.83 
 
 		 287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.273905  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0645  protein-glutamate O-methyltransferase  40.37 
 
 		 302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0464454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2078  chemotaxis methyltransferase CheR  39.22 
 
 		 288 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.687941  hitchhiker  2.73756e-16 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2174  protein-glutamate O-methyltransferase  40.36 
 
 		 296 aa  200  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1204  chemotaxis methyltransferase CheR  39.22 
 
 		 288 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0657  MCP methyltransferase, CheR-type  39.13 
 
 		 296 aa  199  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120935 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0255  putative chemotaxis protein methyltransferase  43.31 
 
 		 280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1884  MCP methyltransferase, CheR-type  39.34 
 
 		 276 aa  199  6e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0878954 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2133  chemotaxis methyltransferase CheR  38.87 
 
 		 288 aa  198  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000021864 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1327  chemotaxis methyltransferase CheR  38.87 
 
 		 288 aa  198  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000151288 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00055  chemotaxis protein methyltransferase 2  39.71 
 
 		 286 aa  198  9e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00310975  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0168  MCP methyltransferase, CheR-type  42.7 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.419483 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2115  protein-glutamate O-methyltransferase  39.19 
 
 		 281 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2455  chemotaxis methyltransferase CheR  38.73 
 
 		 288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2090  MCP methyltransferase, CheR-type  39.34 
 
 		 276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.853389 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2215  MCP methyltransferase, CheR-type  39.34 
 
 		 276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.556164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1756  chemotaxis methyltransferase CheR  40.64 
 
 		 295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.456402  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3302  protein-glutamate O-methyltransferase  40.59 
 
 		 265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1796  protein-glutamate O-methyltransferase  39.11 
 
 		 294 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2608  chemotaxis methyltransferase CheR  40.89 
 
 		 290 aa  195  8.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.215293  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22590  Protein-glutamate O-methyltransferase  39.19 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0808  MCP methyltransferase, CheR-type  39.04 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1731  MCP methyltransferase, CheR-type  37.87 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2124  chemotaxis protein methyltransferase CheR  39.85 
 
 		 277 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3518  chemotaxis methyltransferase CheR  42.07 
 
 		 272 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.577755 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1858  chemotaxis methyltransferase CheR  40.89 
 
 		 290 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3179  chemotaxis protein methyltransferase CheR  41.61 
 
 		 314 aa  193  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1644  chemotaxis methyltransferase CheR  42.07 
 
 		 272 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1143  chemotaxis protein methyltransferase CheR  42.75 
 
 		 292 aa  192  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0207024  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4310  chemotaxis methyltransferase  39.79 
 
 		 293 aa  192  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1515  chemotaxis methyltransferase CheR  39.41 
 
 		 290 aa  192  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0073  chemotaxis protein methyltransferase  41.61 
 
 		 314 aa  191  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1687  chemotaxis protein methyltransferase CheR  41.61 
 
 		 315 aa  191  8e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.460756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>