More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3855 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3855  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 		 291 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1494  protein-glutamate O-methyltransferase  87.67 
 
 		 292 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1874  MCP methyltransferase, CheR-type  85.57 
 
 		 291 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3801  MCP methyltransferase, CheR-type  85.02 
 
 		 294 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4243  MCP methyltransferase, CheR-type  70.71 
 
 		 290 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3916  MCP methyltransferase, CheR-type  71.79 
 
 		 289 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3674  protein-glutamate O-methyltransferase  71.07 
 
 		 292 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3372  MCP methyltransferase, CheR-type  70.21 
 
 		 288 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0527  MCP methyltransferase, CheR-type  68.97 
 
 		 289 aa  413  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0524  MCP methyltransferase, CheR-type  68.06 
 
 		 288 aa  409  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1533  putative chemotaxis protein methyltransferase cheR  70.37 
 
 		 292 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  69.86 
 
 		 289 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1821  MCP methyltransferase, CheR-type  68.09 
 
 		 292 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101872  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0524  MCP methyltransferase, CheR-type  55.71 
 
 		 280 aa  349  4e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4031  MCP methyltransferase, CheR-type  57.52 
 
 		 287 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236096  normal  0.66198 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1710  MCP methyltransferase, CheR-type  58.27 
 
 		 285 aa  328  4e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1533  protein-glutamate O-methyltransferase  55.63 
 
 		 285 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0781767 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1813  MCP methyltransferase, CheR-type  56.16 
 
 		 285 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4834  MCP methyltransferase, CheR-type  57.89 
 
 		 296 aa  324  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162738  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1695  MCP methyltransferase, CheR-type  57.52 
 
 		 289 aa  315  5e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0662  MCP methyltransferase, CheR-type  54.96 
 
 		 278 aa  299  5e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.893478 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1912  Protein-glutamate O-methyltransferase  53.38 
 
 		 278 aa  291  6e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0842494  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0322  Protein-glutamate O-methyltransferase  50.58 
 
 		 276 aa  264  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.294679 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5002  MCP methyltransferase, CheR-type  45.35 
 
 		 274 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3598  MCP methyltransferase, CheR-type  45.04 
 
 		 278 aa  242  6e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0123942  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30900  MCP methyltransferase, CheR-type  46.82 
 
 		 272 aa  239  5e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1788  MCP methyltransferase, CheR-type  42.25 
 
 		 316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.275448  normal  0.703081 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2851  MCP methyltransferase, CheR-type  45.11 
 
 		 282 aa  228  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.188729 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  43.43 
 
 		 276 aa  223  4e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.349462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  40.5 
 
 		 414 aa  219  5e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1529  MCP methyltransferase, CheR-type  42.29 
 
 		 273 aa  218  7e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1736  MCP methyltransferase, CheR-type  39.29 
 
 		 290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0460074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2320  MCP methyltransferase, CheR-type  42.75 
 
 		 291 aa  216  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4228  MCP methyltransferase, CheR-type  38.87 
 
 		 274 aa  216  5e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20760  putative chemotaxis protein methyltransferase  43.18 
 
 		 274 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1782  putative chemotaxis protein methyltransferase  42.8 
 
 		 274 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3733  MCP methyltransferase, CheR-type  42.48 
 
 		 275 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0499524  normal  0.833336 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0095  MCP methyltransferase, CheR-type  43.61 
 
 		 275 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4392  chemotaxis protein methyltransferase CheR  42.11 
 
 		 275 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3953  MCP methyltransferase, CheR-type  42.11 
 
 		 275 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1462  protein-glutamate O-methyltransferase  42.11 
 
 		 275 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4252  MCP methyltransferase, CheR-type  42.48 
 
 		 275 aa  212  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3485  protein-glutamate O-methyltransferase  42.48 
 
 		 280 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.405571  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1928  chemotaxis protein methyltransferase CheR  42.11 
 
 		 280 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495072  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1344  MCP methyltransferase, CheR-type  42.7 
 
 		 277 aa  206  3e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.841955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1216  MCP methyltransferase, CheR-type  39.7 
 
 		 275 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.189092  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3088  protein-glutamate O-methyltransferase  42.91 
 
 		 277 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2963  protein-glutamate O-methyltransferase  42.16 
 
 		 279 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.643676  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  42.16 
 
 		 279 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2948  protein-glutamate O-methyltransferase  42.16 
 
 		 279 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3101  protein-glutamate O-methyltransferase  42.16 
 
 		 279 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1069  protein-glutamate O-methyltransferase  40.29 
 
 		 278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0178115  normal  0.0152511 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2598  protein-glutamate O-methyltransferase  42.16 
 
 		 279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1302  protein-glutamate O-methyltransferase  42.16 
 
 		 279 aa  199  5e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1596  MCP methyltransferase, CheR-type  41.79 
 
 		 277 aa  199  7e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2339  chemotaxis protein methyltransferase CheR  39.39 
 
 		 275 aa  198  7.999999999999999e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1177  protein-glutamate O-methyltransferase  40.3 
 
 		 275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0805405  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2319  protein-glutamate O-methyltransferase  41.95 
 
 		 277 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.945432  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3251  chemotaxis protein methyltransferase CheR  41.04 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004174  chemotaxis protein methyltransferase CheR  39.39 
 
 		 275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01283  chemotaxis methyltransferase CheR  39.02 
 
 		 275 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  41.04 
 
 		 279 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1258  MCP methyltransferase, CheR-type  41.04 
 
 		 279 aa  195  6e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1328  MCP methyltransferase, CheR-type  41.04 
 
 		 279 aa  195  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1339  MCP methyltransferase, CheR-type  40.67 
 
 		 277 aa  195  7e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0892  MCP methyltransferase, CheR-type  37.89 
 
 		 275 aa  194  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1160  MCP methyltransferase, CheR-type  40.67 
 
 		 277 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1793  chemotaxis protein methyltransferase CheR  39.02 
 
 		 275 aa  193  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0069  MCP methyltransferase, CheR-type  39.02 
 
 		 280 aa  193  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02929  chemotaxis protein methyltransferase CheR  38.15 
 
 		 276 aa  191  9e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.723494  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1430  MCP methyltransferase, CheR-type  38.76 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3582  MCP methyltransferase, CheR-type  34.1 
 
 		 302 aa  189  4e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2214  MCP methyltransferase, CheR-type  38.06 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  37.45 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3101  MCP methyltransferase, CheR-type  35.96 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0448745  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0521  protein-glutamate O-methyltransferase  36.94 
 
 		 275 aa  183  3e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.644079  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  38.15 
 
 		 280 aa  183  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1476  chemotaxis protein methyltransferase CheR  36.6 
 
 		 276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3139  protein-glutamate O-methyltransferase  37.16 
 
 		 291 aa  180  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0215  MCP methyltransferase, CheR-type  39.76 
 
 		 294 aa  178  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.177352  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0428  MCP methyltransferase, CheR-type  38.7 
 
 		 275 aa  176  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2215  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.25 
 
 		 289 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.171483  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0635  MCP methyltransferase, CheR-type  40.56 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0987  MCP methyltransferase, CheR-type  34.52 
 
 		 283 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0626  MCP methyltransferase, CheR-type  40.21 
 
 		 301 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.325159  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3104  MCP methyltransferase, CheR-type  34.5 
 
 		 285 aa  172  7.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3299  protein-glutamate O-methyltransferase  36.23 
 
 		 275 aa  169  5e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0808  MCP methyltransferase, CheR-type  37.93 
 
 		 272 aa  168  9e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0295  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.34 
 
 		 277 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.468009  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2305  MCP methyltransferase, CheR-type  34.38 
 
 		 291 aa  167  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2815  MCP methyltransferase, CheR-type  37.16 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.904459  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0925  MCP methyltransferase, CheR-type  32.72 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0878  MCP methyltransferase, CheR-type  35.98 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0601  MCP methyltransferase, CheR-type  39.93 
 
 		 299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3267  MCP methyltransferase, CheR-type  36.26 
 
 		 277 aa  166  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.335431  hitchhiker  0.0000324119 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4421  protein-glutamate O-methyltransferase  36.78 
 
 		 277 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03244  chemotaxis protein methyltransferase CheR  34.88 
 
 		 284 aa  165  8e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0747  MCP methyltransferase, CheR-type  36.68 
 
 		 288 aa  165  9e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0579  MCP methyltransferase, CheR-type  34.69 
 
 		 280 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  35.27 
 
 		 288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>