More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01283 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01283  chemotaxis methyltransferase CheR  100 
 
 
275 aa  566  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004174  chemotaxis protein methyltransferase CheR  96.73 
 
 
275 aa  548  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1793  chemotaxis protein methyltransferase CheR  94.55 
 
 
275 aa  542  1e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2339  chemotaxis protein methyltransferase CheR  84.36 
 
 
275 aa  494  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1344  MCP methyltransferase, CheR-type  64.96 
 
 
277 aa  374  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.841955  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1596  MCP methyltransferase, CheR-type  63.04 
 
 
277 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1160  MCP methyltransferase, CheR-type  63.04 
 
 
277 aa  364  1e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2319  protein-glutamate O-methyltransferase  61.96 
 
 
277 aa  363  2e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.945432  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3088  protein-glutamate O-methyltransferase  62.32 
 
 
277 aa  362  3e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  63.24 
 
 
279 aa  361  6e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  63.24 
 
 
279 aa  360  1e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3101  protein-glutamate O-methyltransferase  63.24 
 
 
279 aa  360  1e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2963  protein-glutamate O-methyltransferase  63.24 
 
 
279 aa  360  1e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.643676  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1258  MCP methyltransferase, CheR-type  62.87 
 
 
279 aa  360  1e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1339  MCP methyltransferase, CheR-type  62.04 
 
 
277 aa  360  1e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1328  MCP methyltransferase, CheR-type  62.87 
 
 
279 aa  360  1e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2948  protein-glutamate O-methyltransferase  63.24 
 
 
279 aa  360  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1476  chemotaxis protein methyltransferase CheR  58.33 
 
 
276 aa  358  5e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3251  chemotaxis protein methyltransferase CheR  62.5 
 
 
279 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2598  protein-glutamate O-methyltransferase  62.5 
 
 
279 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1302  protein-glutamate O-methyltransferase  61.96 
 
 
279 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02929  chemotaxis protein methyltransferase CheR  53.99 
 
 
276 aa  321  7e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.723494  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1216  MCP methyltransferase, CheR-type  52.55 
 
 
275 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.189092  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1177  protein-glutamate O-methyltransferase  53.31 
 
 
275 aa  303  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0805405  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2851  MCP methyltransferase, CheR-type  53.09 
 
 
282 aa  297  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.188729 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1928  chemotaxis protein methyltransferase CheR  53.45 
 
 
280 aa  296  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3485  protein-glutamate O-methyltransferase  53.82 
 
 
280 aa  295  6e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.405571  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4252  MCP methyltransferase, CheR-type  53.09 
 
 
275 aa  293  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1782  putative chemotaxis protein methyltransferase  53.09 
 
 
274 aa  291  7e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20760  putative chemotaxis protein methyltransferase  53.09 
 
 
274 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3733  MCP methyltransferase, CheR-type  50.91 
 
 
275 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0499524  normal  0.833336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3953  MCP methyltransferase, CheR-type  50.55 
 
 
275 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4392  chemotaxis protein methyltransferase CheR  50.55 
 
 
275 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1462  protein-glutamate O-methyltransferase  50.55 
 
 
275 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3101  MCP methyltransferase, CheR-type  50.36 
 
 
278 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0448745  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1069  protein-glutamate O-methyltransferase  47.43 
 
 
278 aa  270  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0178115  normal  0.0152511 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0925  MCP methyltransferase, CheR-type  49.63 
 
 
271 aa  267  1e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0892  MCP methyltransferase, CheR-type  46.72 
 
 
275 aa  262  4e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763334  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0521  protein-glutamate O-methyltransferase  47.1 
 
 
275 aa  262  4e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.644079  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2214  MCP methyltransferase, CheR-type  45.72 
 
 
285 aa  255  4e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1430  MCP methyltransferase, CheR-type  46.47 
 
 
267 aa  238  1e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4031  MCP methyltransferase, CheR-type  40.93 
 
 
287 aa  208  8e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236096  normal  0.66198 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1813  MCP methyltransferase, CheR-type  41.87 
 
 
285 aa  203  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1533  protein-glutamate O-methyltransferase  41.87 
 
 
285 aa  203  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0781767 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3582  MCP methyltransferase, CheR-type  38.77 
 
 
302 aa  202  5e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1710  MCP methyltransferase, CheR-type  39.69 
 
 
285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3855  MCP methyltransferase, CheR-type  39.02 
 
 
291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4834  MCP methyltransferase, CheR-type  38.52 
 
 
296 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162738  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1912  Protein-glutamate O-methyltransferase  38.46 
 
 
278 aa  195  6e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0842494  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0527  MCP methyltransferase, CheR-type  40.23 
 
 
289 aa  195  8.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1494  protein-glutamate O-methyltransferase  39.25 
 
 
292 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  38.27 
 
 
414 aa  192  5e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1695  MCP methyltransferase, CheR-type  38.13 
 
 
289 aa  191  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  40 
 
 
289 aa  188  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1874  MCP methyltransferase, CheR-type  37.88 
 
 
291 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2320  MCP methyltransferase, CheR-type  38.69 
 
 
291 aa  188  9e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0987  MCP methyltransferase, CheR-type  38.66 
 
 
283 aa  186  5e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3372  MCP methyltransferase, CheR-type  39.69 
 
 
288 aa  185  6e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3801  MCP methyltransferase, CheR-type  36.74 
 
 
294 aa  185  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0662  MCP methyltransferase, CheR-type  39.53 
 
 
278 aa  185  9e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.893478 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1821  MCP methyltransferase, CheR-type  39.06 
 
 
292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101872  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3916  MCP methyltransferase, CheR-type  37.92 
 
 
289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1533  putative chemotaxis protein methyltransferase cheR  37.5 
 
 
292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0524  MCP methyltransferase, CheR-type  38.93 
 
 
288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3674  protein-glutamate O-methyltransferase  37.06 
 
 
292 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4243  MCP methyltransferase, CheR-type  36.54 
 
 
290 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30900  MCP methyltransferase, CheR-type  36.26 
 
 
272 aa  179  5.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  35.66 
 
 
297 aa  176  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3598  MCP methyltransferase, CheR-type  36.86 
 
 
278 aa  176  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0123942  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  34.8 
 
 
276 aa  175  8e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.349462  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0322  Protein-glutamate O-methyltransferase  37.5 
 
 
276 aa  172  7.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.294679 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4027  MCP methyltransferase, CheR-type  35.82 
 
 
290 aa  169  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000815784 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4228  MCP methyltransferase, CheR-type  35.14 
 
 
274 aa  169  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3943  MCP methyltransferase, CheR-type  35.82 
 
 
290 aa  168  8e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.331314  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2118  MCP methyltransferase, CheR-type  34.66 
 
 
283 aa  168  8e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1529  MCP methyltransferase, CheR-type  37.55 
 
 
273 aa  168  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0295  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.36 
 
 
277 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.468009  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4421  protein-glutamate O-methyltransferase  35.94 
 
 
277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0878  MCP methyltransferase, CheR-type  35.84 
 
 
275 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1573  MCP methyltransferase, CheR-type  35.74 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0438911  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2710  protein-glutamate O-methyltransferase  34.87 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1788  MCP methyltransferase, CheR-type  38.77 
 
 
316 aa  163  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.275448  normal  0.703081 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0524  MCP methyltransferase, CheR-type  35.5 
 
 
280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5002  MCP methyltransferase, CheR-type  36.6 
 
 
274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2215  chemotaxis protein methyltransferase CheR  34.05 
 
 
289 aa  162  6e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.171483  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0332  MCP methyltransferase, CheR-type  39.11 
 
 
302 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.284961 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0300  MCP methyltransferase, CheR-type  39.11 
 
 
302 aa  161  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000961073  normal  0.256387 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2305  MCP methyltransferase, CheR-type  34.05 
 
 
291 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3267  MCP methyltransferase, CheR-type  35.82 
 
 
277 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.335431  hitchhiker  0.0000324119 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3139  protein-glutamate O-methyltransferase  33.45 
 
 
291 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2815  MCP methyltransferase, CheR-type  34.77 
 
 
275 aa  159  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.904459  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1143  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.42 
 
 
292 aa  159  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0207024  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2571  MCP methyltransferase, CheR-type  38.02 
 
 
303 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2475  MCP methyltransferase, CheR-type  37.64 
 
 
303 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0126751  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0215  MCP methyltransferase, CheR-type  37.5 
 
 
294 aa  157  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.177352  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1043  MCP methyltransferase, CheR-type  37.79 
 
 
283 aa  156  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0237  protein-glutamate O-methyltransferase  37.6 
 
 
307 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.291409 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1382  MCP methyltransferase, CheR-type  35.77 
 
 
303 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0808  MCP methyltransferase, CheR-type  34.59 
 
 
272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3218  MCP methyltransferase, CheR-type  38.52 
 
 
295 aa  155  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108561 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>