More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3674 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3674  protein-glutamate O-methyltransferase  100 
 
 		 292 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3916  MCP methyltransferase, CheR-type  89.47 
 
 		 289 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1821  MCP methyltransferase, CheR-type  80.76 
 
 		 292 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101872  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4243  MCP methyltransferase, CheR-type  77.59 
 
 		 290 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3372  MCP methyltransferase, CheR-type  75.17 
 
 		 288 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0524  MCP methyltransferase, CheR-type  73.93 
 
 		 288 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0527  MCP methyltransferase, CheR-type  69.93 
 
 		 289 aa  424  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  70.69 
 
 		 289 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1494  protein-glutamate O-methyltransferase  70.49 
 
 		 292 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1533  putative chemotaxis protein methyltransferase cheR  69.47 
 
 		 292 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3855  MCP methyltransferase, CheR-type  71.07 
 
 		 291 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1874  MCP methyltransferase, CheR-type  67.35 
 
 		 291 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3801  MCP methyltransferase, CheR-type  70.15 
 
 		 294 aa  407  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4031  MCP methyltransferase, CheR-type  58.27 
 
 		 287 aa  328  9e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236096  normal  0.66198 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0524  MCP methyltransferase, CheR-type  54.34 
 
 		 280 aa  323  2e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1710  MCP methyltransferase, CheR-type  56.39 
 
 		 285 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1533  protein-glutamate O-methyltransferase  55.26 
 
 		 285 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0781767 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1813  MCP methyltransferase, CheR-type  55.26 
 
 		 285 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4834  MCP methyltransferase, CheR-type  54.74 
 
 		 296 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162738  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1695  MCP methyltransferase, CheR-type  53.65 
 
 		 289 aa  295  8e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1912  Protein-glutamate O-methyltransferase  51.88 
 
 		 278 aa  280  2e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0842494  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0662  MCP methyltransferase, CheR-type  50.4 
 
 		 278 aa  259  5.0000000000000005e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.893478 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0322  Protein-glutamate O-methyltransferase  47.47 
 
 		 276 aa  241  7.999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.294679 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5002  MCP methyltransferase, CheR-type  44.75 
 
 		 274 aa  231  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1788  MCP methyltransferase, CheR-type  40.55 
 
 		 316 aa  224  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.275448  normal  0.703081 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3598  MCP methyltransferase, CheR-type  43.51 
 
 		 278 aa  221  7e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0123942  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0095  MCP methyltransferase, CheR-type  45.86 
 
 		 275 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30900  MCP methyltransferase, CheR-type  43.07 
 
 		 272 aa  218  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  40.59 
 
 		 414 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  42.28 
 
 		 276 aa  213  3.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.349462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4228  MCP methyltransferase, CheR-type  38.49 
 
 		 274 aa  212  4.9999999999999996e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2320  MCP methyltransferase, CheR-type  44.05 
 
 		 291 aa  211  7.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1069  protein-glutamate O-methyltransferase  41.64 
 
 		 278 aa  206  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0178115  normal  0.0152511 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1782  putative chemotaxis protein methyltransferase  42.25 
 
 		 274 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20760  putative chemotaxis protein methyltransferase  41.86 
 
 		 274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3733  MCP methyltransferase, CheR-type  41.54 
 
 		 275 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0499524  normal  0.833336 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1216  MCP methyltransferase, CheR-type  39.7 
 
 		 275 aa  199  6e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.189092  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2851  MCP methyltransferase, CheR-type  42.31 
 
 		 282 aa  199  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.188729 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4392  chemotaxis protein methyltransferase CheR  41.15 
 
 		 275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1462  protein-glutamate O-methyltransferase  41.15 
 
 		 275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1430  MCP methyltransferase, CheR-type  42.58 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1529  MCP methyltransferase, CheR-type  38.74 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3953  MCP methyltransferase, CheR-type  41.15 
 
 		 275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4252  MCP methyltransferase, CheR-type  41.47 
 
 		 275 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02929  chemotaxis protein methyltransferase CheR  39.63 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.723494  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2339  chemotaxis protein methyltransferase CheR  38.43 
 
 		 275 aa  191  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3251  chemotaxis protein methyltransferase CheR  41.2 
 
 		 279 aa  190  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3485  protein-glutamate O-methyltransferase  40.93 
 
 		 280 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.405571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0892  MCP methyltransferase, CheR-type  39.61 
 
 		 275 aa  190  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1344  MCP methyltransferase, CheR-type  40.98 
 
 		 277 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.841955  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1928  chemotaxis protein methyltransferase CheR  40.93 
 
 		 280 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495072  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2598  protein-glutamate O-methyltransferase  40.82 
 
 		 279 aa  189  4e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  40.45 
 
 		 279 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3101  protein-glutamate O-methyltransferase  40.45 
 
 		 279 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1177  protein-glutamate O-methyltransferase  40 
 
 		 275 aa  189  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0805405  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2963  protein-glutamate O-methyltransferase  40.45 
 
 		 279 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.643676  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2948  protein-glutamate O-methyltransferase  40.45 
 
 		 279 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  40.82 
 
 		 279 aa  189  5e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1258  MCP methyltransferase, CheR-type  40.82 
 
 		 279 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1328  MCP methyltransferase, CheR-type  40.82 
 
 		 279 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0069  MCP methyltransferase, CheR-type  38.72 
 
 		 280 aa  188  9e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1596  MCP methyltransferase, CheR-type  40.23 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0987  MCP methyltransferase, CheR-type  35.51 
 
 		 283 aa  186  5e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3582  MCP methyltransferase, CheR-type  37.55 
 
 		 302 aa  185  7e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004174  chemotaxis protein methyltransferase CheR  37.76 
 
 		 275 aa  185  9e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1736  MCP methyltransferase, CheR-type  38.26 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0460074 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1793  chemotaxis protein methyltransferase CheR  38.13 
 
 		 275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0215  MCP methyltransferase, CheR-type  41.37 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.177352  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01283  chemotaxis methyltransferase CheR  37.06 
 
 		 275 aa  183  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0521  protein-glutamate O-methyltransferase  38.98 
 
 		 275 aa  183  3e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.644079  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1302  protein-glutamate O-methyltransferase  39.33 
 
 		 279 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2319  protein-glutamate O-methyltransferase  40.82 
 
 		 277 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.945432  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3088  protein-glutamate O-methyltransferase  39.47 
 
 		 277 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1160  MCP methyltransferase, CheR-type  39.33 
 
 		 277 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2214  MCP methyltransferase, CheR-type  39.68 
 
 		 285 aa  180  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1476  chemotaxis protein methyltransferase CheR  38.28 
 
 		 276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1339  MCP methyltransferase, CheR-type  38.95 
 
 		 277 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  39.77 
 
 		 280 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0428  MCP methyltransferase, CheR-type  37.5 
 
 		 275 aa  172  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3104  MCP methyltransferase, CheR-type  35.27 
 
 		 285 aa  169  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  38.46 
 
 		 288 aa  169  7e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3101  MCP methyltransferase, CheR-type  34.08 
 
 		 278 aa  168  9e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0448745  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  37.74 
 
 		 280 aa  168  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0635  MCP methyltransferase, CheR-type  40.21 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3139  protein-glutamate O-methyltransferase  35.98 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0626  MCP methyltransferase, CheR-type  39.86 
 
 		 301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.325159  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0925  MCP methyltransferase, CheR-type  34.19 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0601  MCP methyltransferase, CheR-type  41.31 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2215  chemotaxis protein methyltransferase CheR  33.08 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.171483  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0757  MCP methyltransferase, CheR-type  33.46 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3299  protein-glutamate O-methyltransferase  35 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2571  MCP methyltransferase, CheR-type  36.57 
 
 		 303 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2475  MCP methyltransferase, CheR-type  37.22 
 
 		 303 aa  158  8e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0126751  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3498  protein-glutamate O-methyltransferase  36.47 
 
 		 273 aa  159  8e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0295  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.45 
 
 		 277 aa  158  9e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.468009  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2305  MCP methyltransferase, CheR-type  33.33 
 
 		 291 aa  157  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0300  MCP methyltransferase, CheR-type  37.39 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000961073  normal  0.256387 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4421  protein-glutamate O-methyltransferase  35.36 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1573  MCP methyltransferase, CheR-type  33.58 
 
 		 292 aa  157  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0438911  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0237  protein-glutamate O-methyltransferase  36.82 
 
 		 307 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.291409 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>