More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1533 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1533  putative chemotaxis protein methyltransferase cheR  100 
 
 		 292 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0527  MCP methyltransferase, CheR-type  79.51 
 
 		 289 aa  483  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3372  MCP methyltransferase, CheR-type  70.14 
 
 		 288 aa  429  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0524  MCP methyltransferase, CheR-type  69.42 
 
 		 288 aa  426  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3916  MCP methyltransferase, CheR-type  74.25 
 
 		 289 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4243  MCP methyltransferase, CheR-type  73.23 
 
 		 290 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3674  protein-glutamate O-methyltransferase  69.47 
 
 		 292 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1494  protein-glutamate O-methyltransferase  68.62 
 
 		 292 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1874  MCP methyltransferase, CheR-type  67.47 
 
 		 291 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  69.79 
 
 		 289 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1821  MCP methyltransferase, CheR-type  67.81 
 
 		 292 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101872  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3855  MCP methyltransferase, CheR-type  70.37 
 
 		 291 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3801  MCP methyltransferase, CheR-type  69.23 
 
 		 294 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4031  MCP methyltransferase, CheR-type  59.4 
 
 		 287 aa  330  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236096  normal  0.66198 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0524  MCP methyltransferase, CheR-type  55.85 
 
 		 280 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1813  MCP methyltransferase, CheR-type  54.38 
 
 		 285 aa  315  4e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1533  protein-glutamate O-methyltransferase  54.38 
 
 		 285 aa  315  4e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0781767 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4834  MCP methyltransferase, CheR-type  56.09 
 
 		 296 aa  314  9e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162738  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1710  MCP methyltransferase, CheR-type  55.64 
 
 		 285 aa  311  1e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1695  MCP methyltransferase, CheR-type  53.5 
 
 		 289 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1912  Protein-glutamate O-methyltransferase  52.26 
 
 		 278 aa  270  1e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0842494  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0662  MCP methyltransferase, CheR-type  52.4 
 
 		 278 aa  271  1e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.893478 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1788  MCP methyltransferase, CheR-type  47.19 
 
 		 316 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.275448  normal  0.703081 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0322  Protein-glutamate O-methyltransferase  47.04 
 
 		 276 aa  249  4e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.294679 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3598  MCP methyltransferase, CheR-type  47.53 
 
 		 278 aa  240  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0123942  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5002  MCP methyltransferase, CheR-type  43.77 
 
 		 274 aa  231  9e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2320  MCP methyltransferase, CheR-type  46.24 
 
 		 291 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30900  MCP methyltransferase, CheR-type  47.37 
 
 		 272 aa  228  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  41.48 
 
 		 414 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  43.23 
 
 		 276 aa  216  5e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.349462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4228  MCP methyltransferase, CheR-type  40.53 
 
 		 274 aa  212  5.999999999999999e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0095  MCP methyltransferase, CheR-type  43.61 
 
 		 275 aa  210  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1529  MCP methyltransferase, CheR-type  40.08 
 
 		 273 aa  205  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1216  MCP methyltransferase, CheR-type  42.86 
 
 		 275 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.189092  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2851  MCP methyltransferase, CheR-type  41.57 
 
 		 282 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.188729 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20760  putative chemotaxis protein methyltransferase  41.2 
 
 		 274 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1782  putative chemotaxis protein methyltransferase  40.82 
 
 		 274 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3733  MCP methyltransferase, CheR-type  40.3 
 
 		 275 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0499524  normal  0.833336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4252  MCP methyltransferase, CheR-type  41.13 
 
 		 275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0892  MCP methyltransferase, CheR-type  40 
 
 		 275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1462  protein-glutamate O-methyltransferase  39.93 
 
 		 275 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4392  chemotaxis protein methyltransferase CheR  39.93 
 
 		 275 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3953  MCP methyltransferase, CheR-type  39.93 
 
 		 275 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1069  protein-glutamate O-methyltransferase  39.49 
 
 		 278 aa  196  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0178115  normal  0.0152511 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3485  protein-glutamate O-methyltransferase  40.6 
 
 		 280 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.405571  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1928  chemotaxis protein methyltransferase CheR  40.6 
 
 		 280 aa  192  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495072  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3101  protein-glutamate O-methyltransferase  41.42 
 
 		 279 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2948  protein-glutamate O-methyltransferase  41.42 
 
 		 279 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  41.42 
 
 		 279 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2963  protein-glutamate O-methyltransferase  41.42 
 
 		 279 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.643676  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3251  chemotaxis protein methyltransferase CheR  41.04 
 
 		 279 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02929  chemotaxis protein methyltransferase CheR  40.3 
 
 		 276 aa  189  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.723494  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1344  MCP methyltransferase, CheR-type  41.2 
 
 		 277 aa  189  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.841955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1736  MCP methyltransferase, CheR-type  37.36 
 
 		 290 aa  189  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0460074 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1177  protein-glutamate O-methyltransferase  39.85 
 
 		 275 aa  189  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0805405  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2598  protein-glutamate O-methyltransferase  40.52 
 
 		 279 aa  189  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  40.15 
 
 		 279 aa  188  9e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1258  MCP methyltransferase, CheR-type  40.15 
 
 		 279 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1328  MCP methyltransferase, CheR-type  40.15 
 
 		 279 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3582  MCP methyltransferase, CheR-type  35.14 
 
 		 302 aa  187  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0215  MCP methyltransferase, CheR-type  37.02 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.177352  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1430  MCP methyltransferase, CheR-type  39.7 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004174  chemotaxis protein methyltransferase CheR  38.58 
 
 		 275 aa  186  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2339  chemotaxis protein methyltransferase CheR  38.26 
 
 		 275 aa  186  5e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  37.64 
 
 		 280 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01283  chemotaxis methyltransferase CheR  37.5 
 
 		 275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1302  protein-glutamate O-methyltransferase  39.93 
 
 		 279 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1793  chemotaxis protein methyltransferase CheR  37.88 
 
 		 275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1160  MCP methyltransferase, CheR-type  39.78 
 
 		 277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2319  protein-glutamate O-methyltransferase  40.07 
 
 		 277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.945432  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1596  MCP methyltransferase, CheR-type  39.1 
 
 		 277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3088  protein-glutamate O-methyltransferase  39.85 
 
 		 277 aa  183  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1339  MCP methyltransferase, CheR-type  39.7 
 
 		 277 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0521  protein-glutamate O-methyltransferase  38.28 
 
 		 275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.644079  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2214  MCP methyltransferase, CheR-type  38.46 
 
 		 285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0069  MCP methyltransferase, CheR-type  37.79 
 
 		 280 aa  179  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0987  MCP methyltransferase, CheR-type  33.93 
 
 		 283 aa  178  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3139  protein-glutamate O-methyltransferase  37.5 
 
 		 291 aa  175  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0428  MCP methyltransferase, CheR-type  38.99 
 
 		 275 aa  174  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2305  MCP methyltransferase, CheR-type  37.55 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2215  chemotaxis protein methyltransferase CheR  37.36 
 
 		 289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.171483  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1476  chemotaxis protein methyltransferase CheR  38.67 
 
 		 276 aa  172  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0925  MCP methyltransferase, CheR-type  34.57 
 
 		 271 aa  171  9e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3104  MCP methyltransferase, CheR-type  35.38 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3101  MCP methyltransferase, CheR-type  34.46 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0448745  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  35.54 
 
 		 280 aa  169  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0295  chemotaxis protein methyltransferase CheR  34.73 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.468009  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  36.3 
 
 		 288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0040  CheR methyltransferase, SAM binding domain protein  34.8 
 
 		 283 aa  160  3e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3267  MCP methyltransferase, CheR-type  34.35 
 
 		 277 aa  159  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.335431  hitchhiker  0.0000324119 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3498  protein-glutamate O-methyltransferase  36.33 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  32.95 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0730  MCP methyltransferase, CheR-type  35.55 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0443063  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0647  chemotaxis protein methyltransferase  36.22 
 
 		 271 aa  156  3e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.63831  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4421  protein-glutamate O-methyltransferase  33.59 
 
 		 277 aa  156  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2282  MCP methyltransferase, CheR-type  37.33 
 
 		 270 aa  155  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.977677  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3299  protein-glutamate O-methyltransferase  33.98 
 
 		 275 aa  155  7e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0089  MCP methyltransferase, CheR-type  35.96 
 
 		 283 aa  155  8e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03244  chemotaxis protein methyltransferase CheR  34.12 
 
 		 284 aa  155  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0762  MCP methyltransferase, CheR-type  35 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.454256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>