More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0925 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0925  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
271 aa  554  1e-157  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1216  MCP methyltransferase, CheR-type  57.46 
 
 
275 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.189092  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2339  chemotaxis protein methyltransferase CheR  50 
 
 
275 aa  273  2.0000000000000002e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01283  chemotaxis methyltransferase CheR  49.63 
 
 
275 aa  267  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004174  chemotaxis protein methyltransferase CheR  49.63 
 
 
275 aa  263  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1793  chemotaxis protein methyltransferase CheR  48.52 
 
 
275 aa  261  8.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1177  protein-glutamate O-methyltransferase  48.53 
 
 
275 aa  259  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0805405  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3733  MCP methyltransferase, CheR-type  47.21 
 
 
275 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0499524  normal  0.833336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3953  MCP methyltransferase, CheR-type  47.21 
 
 
275 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2851  MCP methyltransferase, CheR-type  46.84 
 
 
282 aa  255  6e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.188729 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4392  chemotaxis protein methyltransferase CheR  46.84 
 
 
275 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1462  protein-glutamate O-methyltransferase  46.84 
 
 
275 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1928  chemotaxis protein methyltransferase CheR  46.47 
 
 
280 aa  251  7e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495072  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0892  MCP methyltransferase, CheR-type  46.84 
 
 
275 aa  251  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763334  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3485  protein-glutamate O-methyltransferase  46.47 
 
 
280 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.405571  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4252  MCP methyltransferase, CheR-type  46.47 
 
 
275 aa  249  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20760  putative chemotaxis protein methyltransferase  48.33 
 
 
274 aa  248  5e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1782  putative chemotaxis protein methyltransferase  48.33 
 
 
274 aa  248  7e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1302  protein-glutamate O-methyltransferase  46.07 
 
 
279 aa  246  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0521  protein-glutamate O-methyltransferase  46.32 
 
 
275 aa  245  4.9999999999999997e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.644079  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02929  chemotaxis protein methyltransferase CheR  47.31 
 
 
276 aa  245  4.9999999999999997e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.723494  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2319  protein-glutamate O-methyltransferase  47.53 
 
 
277 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.945432  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  46.59 
 
 
279 aa  243  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1258  MCP methyltransferase, CheR-type  46.21 
 
 
279 aa  241  6e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1328  MCP methyltransferase, CheR-type  46.21 
 
 
279 aa  241  6e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1596  MCP methyltransferase, CheR-type  46.97 
 
 
277 aa  241  6e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3101  protein-glutamate O-methyltransferase  45.63 
 
 
279 aa  241  7e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  45.63 
 
 
279 aa  241  7e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2963  protein-glutamate O-methyltransferase  45.63 
 
 
279 aa  241  7e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.643676  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2948  protein-glutamate O-methyltransferase  45.63 
 
 
279 aa  241  7e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2214  MCP methyltransferase, CheR-type  46.32 
 
 
285 aa  241  7.999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3251  chemotaxis protein methyltransferase CheR  45.63 
 
 
279 aa  240  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1160  MCP methyltransferase, CheR-type  45.66 
 
 
277 aa  241  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1476  chemotaxis protein methyltransferase CheR  43.75 
 
 
276 aa  240  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1344  MCP methyltransferase, CheR-type  47.15 
 
 
277 aa  240  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.841955  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2598  protein-glutamate O-methyltransferase  44.87 
 
 
279 aa  238  8e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3088  protein-glutamate O-methyltransferase  46.39 
 
 
277 aa  238  9e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1339  MCP methyltransferase, CheR-type  44.44 
 
 
277 aa  236  4e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1430  MCP methyltransferase, CheR-type  45.76 
 
 
267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3101  MCP methyltransferase, CheR-type  43.61 
 
 
278 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0448745  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1069  protein-glutamate O-methyltransferase  40.81 
 
 
278 aa  225  8e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0178115  normal  0.0152511 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4228  MCP methyltransferase, CheR-type  36.56 
 
 
274 aa  182  7e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0527  MCP methyltransferase, CheR-type  36.09 
 
 
289 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0322  Protein-glutamate O-methyltransferase  41.03 
 
 
276 aa  181  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.294679 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4834  MCP methyltransferase, CheR-type  37.93 
 
 
296 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162738  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1695  MCP methyltransferase, CheR-type  40.15 
 
 
289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3582  MCP methyltransferase, CheR-type  36.74 
 
 
302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1912  Protein-glutamate O-methyltransferase  38.26 
 
 
278 aa  179  4.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0842494  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1788  MCP methyltransferase, CheR-type  38.57 
 
 
316 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.275448  normal  0.703081 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  34.46 
 
 
414 aa  177  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4031  MCP methyltransferase, CheR-type  37.25 
 
 
287 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236096  normal  0.66198 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1710  MCP methyltransferase, CheR-type  37.93 
 
 
285 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1813  MCP methyltransferase, CheR-type  37.55 
 
 
285 aa  176  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1533  protein-glutamate O-methyltransferase  37.55 
 
 
285 aa  176  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0781767 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0662  MCP methyltransferase, CheR-type  39.2 
 
 
278 aa  176  4e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.893478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2320  MCP methyltransferase, CheR-type  35.16 
 
 
291 aa  175  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  37.01 
 
 
289 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3598  MCP methyltransferase, CheR-type  39.22 
 
 
278 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0123942  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3916  MCP methyltransferase, CheR-type  35.29 
 
 
289 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  41.2 
 
 
276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.349462  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1533  putative chemotaxis protein methyltransferase cheR  34.57 
 
 
292 aa  171  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3372  MCP methyltransferase, CheR-type  38.04 
 
 
288 aa  171  7.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4243  MCP methyltransferase, CheR-type  37.02 
 
 
290 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1821  MCP methyltransferase, CheR-type  35.14 
 
 
292 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101872  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1494  protein-glutamate O-methyltransferase  32.61 
 
 
292 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0524  MCP methyltransferase, CheR-type  37.89 
 
 
288 aa  168  7e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3801  MCP methyltransferase, CheR-type  34.25 
 
 
294 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5002  MCP methyltransferase, CheR-type  36.96 
 
 
274 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3855  MCP methyltransferase, CheR-type  32.72 
 
 
291 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1874  MCP methyltransferase, CheR-type  34.65 
 
 
291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30900  MCP methyltransferase, CheR-type  39.53 
 
 
272 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0524  MCP methyltransferase, CheR-type  36.67 
 
 
280 aa  165  8e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3674  protein-glutamate O-methyltransferase  34.19 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0987  MCP methyltransferase, CheR-type  35.18 
 
 
283 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  32.84 
 
 
297 aa  159  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1529  MCP methyltransferase, CheR-type  36.33 
 
 
273 aa  159  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0215  MCP methyltransferase, CheR-type  37.45 
 
 
294 aa  158  9e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.177352  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1143  chemotaxis protein methyltransferase CheR  36.13 
 
 
292 aa  158  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0207024  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  34.24 
 
 
280 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3204  MCP methyltransferase, CheR-type  34.47 
 
 
285 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.25041  normal  0.841939 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1573  MCP methyltransferase, CheR-type  33.72 
 
 
292 aa  155  8e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0438911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4027  MCP methyltransferase, CheR-type  33.21 
 
 
290 aa  154  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000815784 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3943  MCP methyltransferase, CheR-type  33.21 
 
 
290 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.331314  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1595  MCP methyltransferase, CheR-type  31.11 
 
 
284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2618  MCP methyltransferase, CheR-type  31.11 
 
 
292 aa  151  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2700  MCP methyltransferase, CheR-type  37.65 
 
 
288 aa  150  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  31.64 
 
 
281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.299383  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0579  MCP methyltransferase, CheR-type  33.59 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0335  MCP methyltransferase, CheR-type  35.55 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0904  MCP methyltransferase, CheR-type  33.97 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4421  protein-glutamate O-methyltransferase  30.71 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0878  MCP methyltransferase, CheR-type  31.2 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0625  MCP methyltransferase, CheR-type  29.57 
 
 
290 aa  146  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0778  MCP methyltransferase, CheR-type  32.21 
 
 
292 aa  145  5e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0203537 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3139  protein-glutamate O-methyltransferase  34.01 
 
 
291 aa  145  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2420  MCP methyltransferase, CheR-type  33.21 
 
 
289 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.503139  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1152  protein-glutamate O-methyltransferase  31.82 
 
 
291 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0040  CheR methyltransferase, SAM binding domain protein  32.14 
 
 
283 aa  145  8.000000000000001e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2162  protein-glutamate O-methyltransferase  36.33 
 
 
272 aa  145  9e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0657  MCP methyltransferase, CheR-type  36.8 
 
 
296 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.120935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>