More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3372 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_3372  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
288 aa  593  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0524  MCP methyltransferase, CheR-type  87.76 
 
 
288 aa  527  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3674  protein-glutamate O-methyltransferase  75.17 
 
 
292 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1821  MCP methyltransferase, CheR-type  74.91 
 
 
292 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101872  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3916  MCP methyltransferase, CheR-type  73.43 
 
 
289 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4243  MCP methyltransferase, CheR-type  73.85 
 
 
290 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0527  MCP methyltransferase, CheR-type  72.92 
 
 
289 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  73.14 
 
 
289 aa  441  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1533  putative chemotaxis protein methyltransferase cheR  70.14 
 
 
292 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1874  MCP methyltransferase, CheR-type  70.61 
 
 
291 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1494  protein-glutamate O-methyltransferase  69.86 
 
 
292 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3855  MCP methyltransferase, CheR-type  70.21 
 
 
291 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3801  MCP methyltransferase, CheR-type  68.88 
 
 
294 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4031  MCP methyltransferase, CheR-type  62.17 
 
 
287 aa  345  4e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236096  normal  0.66198 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0524  MCP methyltransferase, CheR-type  56.98 
 
 
280 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1710  MCP methyltransferase, CheR-type  59.77 
 
 
285 aa  325  7e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1533  protein-glutamate O-methyltransferase  56.89 
 
 
285 aa  324  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0781767 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4834  MCP methyltransferase, CheR-type  59.48 
 
 
296 aa  323  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162738  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1813  MCP methyltransferase, CheR-type  57.19 
 
 
285 aa  324  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1695  MCP methyltransferase, CheR-type  57.29 
 
 
289 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0662  MCP methyltransferase, CheR-type  52.38 
 
 
278 aa  270  1e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.893478 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1912  Protein-glutamate O-methyltransferase  50.94 
 
 
278 aa  270  2e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0842494  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0322  Protein-glutamate O-methyltransferase  49.8 
 
 
276 aa  249  4e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.294679 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5002  MCP methyltransferase, CheR-type  45.91 
 
 
274 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3598  MCP methyltransferase, CheR-type  46.21 
 
 
278 aa  234  9e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0123942  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30900  MCP methyltransferase, CheR-type  49.22 
 
 
272 aa  230  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1788  MCP methyltransferase, CheR-type  42.76 
 
 
316 aa  231  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.275448  normal  0.703081 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4228  MCP methyltransferase, CheR-type  41.63 
 
 
274 aa  226  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2320  MCP methyltransferase, CheR-type  43.73 
 
 
291 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  40 
 
 
414 aa  217  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0095  MCP methyltransferase, CheR-type  45.86 
 
 
275 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  44.75 
 
 
276 aa  213  3.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.349462  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2851  MCP methyltransferase, CheR-type  43.41 
 
 
282 aa  208  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.188729 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20760  putative chemotaxis protein methyltransferase  42.97 
 
 
274 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1782  putative chemotaxis protein methyltransferase  42.58 
 
 
274 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4252  MCP methyltransferase, CheR-type  42.64 
 
 
275 aa  202  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02929  chemotaxis protein methyltransferase CheR  41.76 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.723494  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3733  MCP methyltransferase, CheR-type  41.86 
 
 
275 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0499524  normal  0.833336 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4392  chemotaxis protein methyltransferase CheR  41.86 
 
 
275 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1462  protein-glutamate O-methyltransferase  41.86 
 
 
275 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3953  MCP methyltransferase, CheR-type  41.86 
 
 
275 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1529  MCP methyltransferase, CheR-type  39.13 
 
 
273 aa  199  5e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3485  protein-glutamate O-methyltransferase  41.7 
 
 
280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.405571  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1069  protein-glutamate O-methyltransferase  39.7 
 
 
278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0178115  normal  0.0152511 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1928  chemotaxis protein methyltransferase CheR  42.08 
 
 
280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495072  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1177  protein-glutamate O-methyltransferase  40.23 
 
 
275 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0805405  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1216  MCP methyltransferase, CheR-type  39.38 
 
 
275 aa  192  5e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.189092  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0215  MCP methyltransferase, CheR-type  39.93 
 
 
294 aa  190  2e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.177352  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1736  MCP methyltransferase, CheR-type  38.26 
 
 
290 aa  190  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0460074 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1430  MCP methyltransferase, CheR-type  41.8 
 
 
267 aa  189  5e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2339  chemotaxis protein methyltransferase CheR  41.41 
 
 
275 aa  189  5e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004174  chemotaxis protein methyltransferase CheR  40.46 
 
 
275 aa  188  8e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1344  MCP methyltransferase, CheR-type  39.85 
 
 
277 aa  188  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.841955  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3101  protein-glutamate O-methyltransferase  41.86 
 
 
279 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2948  protein-glutamate O-methyltransferase  41.86 
 
 
279 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2963  protein-glutamate O-methyltransferase  41.86 
 
 
279 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.643676  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  41.86 
 
 
279 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3251  chemotaxis protein methyltransferase CheR  40.86 
 
 
279 aa  186  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1793  chemotaxis protein methyltransferase CheR  40.8 
 
 
275 aa  186  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0069  MCP methyltransferase, CheR-type  39.77 
 
 
280 aa  186  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0892  MCP methyltransferase, CheR-type  38.43 
 
 
275 aa  186  5e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763334  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2598  protein-glutamate O-methyltransferase  41.47 
 
 
279 aa  186  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01283  chemotaxis methyltransferase CheR  39.69 
 
 
275 aa  185  7e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  40.47 
 
 
279 aa  185  7e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1258  MCP methyltransferase, CheR-type  40.47 
 
 
279 aa  185  9e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1328  MCP methyltransferase, CheR-type  40.47 
 
 
279 aa  185  9e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2214  MCP methyltransferase, CheR-type  39.68 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3582  MCP methyltransferase, CheR-type  34.69 
 
 
302 aa  183  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3101  MCP methyltransferase, CheR-type  37.08 
 
 
278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0448745  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1339  MCP methyltransferase, CheR-type  38.6 
 
 
277 aa  182  6e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1160  MCP methyltransferase, CheR-type  39.33 
 
 
277 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1596  MCP methyltransferase, CheR-type  37.64 
 
 
277 aa  181  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2319  protein-glutamate O-methyltransferase  40.86 
 
 
277 aa  181  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.945432  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0521  protein-glutamate O-methyltransferase  38.98 
 
 
275 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.644079  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1302  protein-glutamate O-methyltransferase  40.31 
 
 
279 aa  179  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  37.64 
 
 
280 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3088  protein-glutamate O-methyltransferase  39.45 
 
 
277 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0987  MCP methyltransferase, CheR-type  34.42 
 
 
283 aa  178  9e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1476  chemotaxis protein methyltransferase CheR  38.28 
 
 
276 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3104  MCP methyltransferase, CheR-type  37.21 
 
 
285 aa  176  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  38.61 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0925  MCP methyltransferase, CheR-type  38.04 
 
 
271 aa  171  9e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  35.79 
 
 
280 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0428  MCP methyltransferase, CheR-type  39.1 
 
 
275 aa  166  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2475  MCP methyltransferase, CheR-type  39.39 
 
 
303 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0126751  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2571  MCP methyltransferase, CheR-type  38.02 
 
 
303 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3498  protein-glutamate O-methyltransferase  36.86 
 
 
273 aa  161  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03244  chemotaxis protein methyltransferase CheR  34.51 
 
 
284 aa  160  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3299  protein-glutamate O-methyltransferase  35.8 
 
 
275 aa  159  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0757  MCP methyltransferase, CheR-type  33.85 
 
 
275 aa  157  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1382  MCP methyltransferase, CheR-type  37.88 
 
 
303 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3139  protein-glutamate O-methyltransferase  35.36 
 
 
291 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0040  CheR methyltransferase, SAM binding domain protein  33.33 
 
 
283 aa  155  6e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0635  MCP methyltransferase, CheR-type  39.45 
 
 
301 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2305  MCP methyltransferase, CheR-type  34.23 
 
 
291 aa  155  7e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2215  chemotaxis protein methyltransferase CheR  34.21 
 
 
289 aa  155  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.171483  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2710  protein-glutamate O-methyltransferase  37.74 
 
 
298 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  37.5 
 
 
269 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711153  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0295  chemotaxis protein methyltransferase CheR  33.96 
 
 
277 aa  152  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.468009  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0626  MCP methyltransferase, CheR-type  39.3 
 
 
301 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.325159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>