More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0987 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0987  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
283 aa  579  1e-164  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  51.24 
 
 
414 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  37.55 
 
 
289 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1912  Protein-glutamate O-methyltransferase  38.46 
 
 
278 aa  192  4e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0842494  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2339  chemotaxis protein methyltransferase CheR  38.11 
 
 
275 aa  192  7e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0521  protein-glutamate O-methyltransferase  36.29 
 
 
275 aa  192  8e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.644079  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004174  chemotaxis protein methyltransferase CheR  38.81 
 
 
275 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3916  MCP methyltransferase, CheR-type  35.87 
 
 
289 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4243  MCP methyltransferase, CheR-type  35.87 
 
 
290 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3674  protein-glutamate O-methyltransferase  35.51 
 
 
292 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01283  chemotaxis methyltransferase CheR  38.66 
 
 
275 aa  186  6e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1793  chemotaxis protein methyltransferase CheR  37.69 
 
 
275 aa  182  6e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1782  putative chemotaxis protein methyltransferase  35.63 
 
 
274 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20760  putative chemotaxis protein methyltransferase  35.63 
 
 
274 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0527  MCP methyltransferase, CheR-type  34.06 
 
 
289 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3733  MCP methyltransferase, CheR-type  34.55 
 
 
275 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0499524  normal  0.833336 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1160  MCP methyltransferase, CheR-type  36.86 
 
 
277 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4392  chemotaxis protein methyltransferase CheR  34.55 
 
 
275 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1462  protein-glutamate O-methyltransferase  34.55 
 
 
275 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3953  MCP methyltransferase, CheR-type  34.55 
 
 
275 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1821  MCP methyltransferase, CheR-type  35.74 
 
 
292 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101872  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1494  protein-glutamate O-methyltransferase  34.75 
 
 
292 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3372  MCP methyltransferase, CheR-type  34.42 
 
 
288 aa  178  9e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3801  MCP methyltransferase, CheR-type  34.77 
 
 
294 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1533  putative chemotaxis protein methyltransferase cheR  33.93 
 
 
292 aa  178  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0892  MCP methyltransferase, CheR-type  34.05 
 
 
275 aa  177  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763334  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1476  chemotaxis protein methyltransferase CheR  34.07 
 
 
276 aa  176  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1216  MCP methyltransferase, CheR-type  35.09 
 
 
275 aa  176  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.189092  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1813  MCP methyltransferase, CheR-type  32.97 
 
 
285 aa  176  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1533  protein-glutamate O-methyltransferase  32.97 
 
 
285 aa  176  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0781767 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4031  MCP methyltransferase, CheR-type  31.79 
 
 
287 aa  175  7e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236096  normal  0.66198 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1177  protein-glutamate O-methyltransferase  36.02 
 
 
275 aa  175  8e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0805405  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3582  MCP methyltransferase, CheR-type  36.3 
 
 
302 aa  175  8e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1710  MCP methyltransferase, CheR-type  33.33 
 
 
285 aa  175  9e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2851  MCP methyltransferase, CheR-type  34.33 
 
 
282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.188729 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0524  MCP methyltransferase, CheR-type  34.42 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1339  MCP methyltransferase, CheR-type  35.77 
 
 
277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3855  MCP methyltransferase, CheR-type  34.52 
 
 
291 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1874  MCP methyltransferase, CheR-type  33.69 
 
 
291 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4252  MCP methyltransferase, CheR-type  33.09 
 
 
275 aa  172  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2319  protein-glutamate O-methyltransferase  35.74 
 
 
277 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.945432  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4834  MCP methyltransferase, CheR-type  34.8 
 
 
296 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162738  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0524  MCP methyltransferase, CheR-type  33.82 
 
 
280 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1596  MCP methyltransferase, CheR-type  34.31 
 
 
277 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3101  MCP methyltransferase, CheR-type  35.48 
 
 
278 aa  171  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0448745  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3101  protein-glutamate O-methyltransferase  34.67 
 
 
279 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2963  protein-glutamate O-methyltransferase  34.67 
 
 
279 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.643676  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  34.67 
 
 
279 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1258  MCP methyltransferase, CheR-type  35.04 
 
 
279 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1328  MCP methyltransferase, CheR-type  35.04 
 
 
279 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2948  protein-glutamate O-methyltransferase  34.67 
 
 
279 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  35.04 
 
 
279 aa  171  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3251  chemotaxis protein methyltransferase CheR  34.67 
 
 
279 aa  170  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1302  protein-glutamate O-methyltransferase  34.67 
 
 
279 aa  169  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3485  protein-glutamate O-methyltransferase  34.85 
 
 
280 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.405571  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2598  protein-glutamate O-methyltransferase  34.67 
 
 
279 aa  169  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0662  MCP methyltransferase, CheR-type  36.15 
 
 
278 aa  169  7e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.893478 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02929  chemotaxis protein methyltransferase CheR  33.81 
 
 
276 aa  168  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.723494  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1928  chemotaxis protein methyltransferase CheR  34.85 
 
 
280 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495072  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1344  MCP methyltransferase, CheR-type  33.94 
 
 
277 aa  165  8e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.841955  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3088  protein-glutamate O-methyltransferase  33.58 
 
 
277 aa  165  8e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0069  MCP methyltransferase, CheR-type  34.04 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1430  MCP methyltransferase, CheR-type  35.74 
 
 
267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1069  protein-glutamate O-methyltransferase  33.46 
 
 
278 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0178115  normal  0.0152511 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0925  MCP methyltransferase, CheR-type  35.18 
 
 
271 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1695  MCP methyltransferase, CheR-type  33.7 
 
 
289 aa  158  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2214  MCP methyltransferase, CheR-type  34.25 
 
 
285 aa  158  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1788  MCP methyltransferase, CheR-type  34.31 
 
 
316 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.275448  normal  0.703081 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30900  MCP methyltransferase, CheR-type  34.55 
 
 
272 aa  155  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3302  MCP methyltransferase, CheR-type  34.32 
 
 
274 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.905154 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1573  MCP methyltransferase, CheR-type  35.23 
 
 
292 aa  151  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0438911  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1529  MCP methyltransferase, CheR-type  31.64 
 
 
273 aa  151  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  32.62 
 
 
276 aa  150  3e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.349462  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2118  MCP methyltransferase, CheR-type  34.91 
 
 
283 aa  148  9e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3139  protein-glutamate O-methyltransferase  33.8 
 
 
291 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2215  chemotaxis protein methyltransferase CheR  34.53 
 
 
289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.171483  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2305  MCP methyltransferase, CheR-type  34.04 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1152  protein-glutamate O-methyltransferase  35.23 
 
 
291 aa  146  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0808  MCP methyltransferase, CheR-type  34.29 
 
 
272 aa  145  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0322  Protein-glutamate O-methyltransferase  31.13 
 
 
276 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.294679 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1330  protein-glutamate O-methyltransferase  31.97 
 
 
270 aa  143  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4027  MCP methyltransferase, CheR-type  33.09 
 
 
290 aa  142  8e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000815784 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3943  MCP methyltransferase, CheR-type  33.09 
 
 
290 aa  142  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.331314  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5002  MCP methyltransferase, CheR-type  29.8 
 
 
274 aa  140  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0778  MCP methyltransferase, CheR-type  33.57 
 
 
292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0203537 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4228  MCP methyltransferase, CheR-type  31.64 
 
 
274 aa  139  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0040  CheR methyltransferase, SAM binding domain protein  34.11 
 
 
283 aa  137  2e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2320  MCP methyltransferase, CheR-type  32.27 
 
 
291 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2325  MCP methyltransferase, CheR-type  30.69 
 
 
276 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0747  MCP methyltransferase, CheR-type  34.62 
 
 
288 aa  136  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1379  MCP methyltransferase, CheR-type  35.61 
 
 
553 aa  136  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0878  MCP methyltransferase, CheR-type  31.09 
 
 
275 aa  135  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2146  MCP methyltransferase, CheR-type  33.85 
 
 
271 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1736  MCP methyltransferase, CheR-type  30.11 
 
 
290 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0460074 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4421  protein-glutamate O-methyltransferase  31.6 
 
 
277 aa  135  9e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1849  Protein-glutamate O-methyltransferase  27.72 
 
 
291 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.313486  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3598  MCP methyltransferase, CheR-type  30.67 
 
 
278 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0123942  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3104  MCP methyltransferase, CheR-type  33.85 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0215  MCP methyltransferase, CheR-type  30.66 
 
 
294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.177352  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0579  MCP methyltransferase, CheR-type  30.42 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>