More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6555 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 		 289 aa  589  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3372  MCP methyltransferase, CheR-type  73.14 
 
 		 288 aa  441  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4243  MCP methyltransferase, CheR-type  72.76 
 
 		 290 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0524  MCP methyltransferase, CheR-type  71.53 
 
 		 288 aa  431  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0527  MCP methyltransferase, CheR-type  71.18 
 
 		 289 aa  431  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3916  MCP methyltransferase, CheR-type  73.14 
 
 		 289 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3674  protein-glutamate O-methyltransferase  70.69 
 
 		 292 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1821  MCP methyltransferase, CheR-type  74.09 
 
 		 292 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101872  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1874  MCP methyltransferase, CheR-type  70.38 
 
 		 291 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1533  putative chemotaxis protein methyltransferase cheR  69.79 
 
 		 292 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3801  MCP methyltransferase, CheR-type  72 
 
 		 294 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1494  protein-glutamate O-methyltransferase  69.9 
 
 		 292 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3855  MCP methyltransferase, CheR-type  69.86 
 
 		 291 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1710  MCP methyltransferase, CheR-type  62.78 
 
 		 285 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1813  MCP methyltransferase, CheR-type  61.42 
 
 		 285 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1533  protein-glutamate O-methyltransferase  61.42 
 
 		 285 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0781767 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0524  MCP methyltransferase, CheR-type  56.55 
 
 		 280 aa  333  3e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4031  MCP methyltransferase, CheR-type  60.15 
 
 		 287 aa  332  6e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236096  normal  0.66198 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4834  MCP methyltransferase, CheR-type  58.24 
 
 		 296 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162738  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1695  MCP methyltransferase, CheR-type  57.45 
 
 		 289 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1912  Protein-glutamate O-methyltransferase  55.34 
 
 		 278 aa  276  3e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0842494  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0662  MCP methyltransferase, CheR-type  53.78 
 
 		 278 aa  269  4e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.893478 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0322  Protein-glutamate O-methyltransferase  48.75 
 
 		 276 aa  261  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.294679 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30900  MCP methyltransferase, CheR-type  51.49 
 
 		 272 aa  251  7e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3598  MCP methyltransferase, CheR-type  48.11 
 
 		 278 aa  242  5e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0123942  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5002  MCP methyltransferase, CheR-type  46.88 
 
 		 274 aa  240  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1788  MCP methyltransferase, CheR-type  47.01 
 
 		 316 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.275448  normal  0.703081 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4228  MCP methyltransferase, CheR-type  43.75 
 
 		 274 aa  236  4e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0095  MCP methyltransferase, CheR-type  49.63 
 
 		 275 aa  236  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  42.76 
 
 		 414 aa  231  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2320  MCP methyltransferase, CheR-type  44.37 
 
 		 291 aa  227  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  45.35 
 
 		 276 aa  223  3e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.349462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2851  MCP methyltransferase, CheR-type  46.3 
 
 		 282 aa  219  6e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.188729 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02929  chemotaxis protein methyltransferase CheR  44.32 
 
 		 276 aa  212  5.999999999999999e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.723494  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1782  putative chemotaxis protein methyltransferase  43.91 
 
 		 274 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20760  putative chemotaxis protein methyltransferase  44.74 
 
 		 274 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4252  MCP methyltransferase, CheR-type  44.85 
 
 		 275 aa  209  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1069  protein-glutamate O-methyltransferase  44.24 
 
 		 278 aa  209  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0178115  normal  0.0152511 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1216  MCP methyltransferase, CheR-type  42.64 
 
 		 275 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.189092  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3733  MCP methyltransferase, CheR-type  43.54 
 
 		 275 aa  204  9e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0499524  normal  0.833336 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4392  chemotaxis protein methyltransferase CheR  43.54 
 
 		 275 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3953  MCP methyltransferase, CheR-type  43.54 
 
 		 275 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1462  protein-glutamate O-methyltransferase  43.54 
 
 		 275 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3485  protein-glutamate O-methyltransferase  43.87 
 
 		 280 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.405571  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1928  chemotaxis protein methyltransferase CheR  44.24 
 
 		 280 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495072  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3101  MCP methyltransferase, CheR-type  39.41 
 
 		 278 aa  201  8e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0448745  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1344  MCP methyltransferase, CheR-type  43.45 
 
 		 277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.841955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3101  protein-glutamate O-methyltransferase  43.33 
 
 		 279 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2948  protein-glutamate O-methyltransferase  43.33 
 
 		 279 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2963  protein-glutamate O-methyltransferase  43.33 
 
 		 279 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.643676  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  43.33 
 
 		 279 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2319  protein-glutamate O-methyltransferase  43.49 
 
 		 277 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.945432  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1302  protein-glutamate O-methyltransferase  42.91 
 
 		 279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1177  protein-glutamate O-methyltransferase  42.91 
 
 		 275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0805405  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2598  protein-glutamate O-methyltransferase  42.96 
 
 		 279 aa  196  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1339  MCP methyltransferase, CheR-type  42.01 
 
 		 277 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1596  MCP methyltransferase, CheR-type  41.73 
 
 		 277 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0892  MCP methyltransferase, CheR-type  41.34 
 
 		 275 aa  195  7e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1160  MCP methyltransferase, CheR-type  42.01 
 
 		 277 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3251  chemotaxis protein methyltransferase CheR  41.64 
 
 		 279 aa  194  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1529  MCP methyltransferase, CheR-type  40.08 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  41.64 
 
 		 279 aa  194  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0987  MCP methyltransferase, CheR-type  37.55 
 
 		 283 aa  194  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1258  MCP methyltransferase, CheR-type  41.64 
 
 		 279 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1328  MCP methyltransferase, CheR-type  41.64 
 
 		 279 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1430  MCP methyltransferase, CheR-type  41.41 
 
 		 267 aa  194  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  41.63 
 
 		 280 aa  192  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004174  chemotaxis protein methyltransferase CheR  41.18 
 
 		 275 aa  191  9e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3088  protein-glutamate O-methyltransferase  41.64 
 
 		 277 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2214  MCP methyltransferase, CheR-type  41.3 
 
 		 285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1736  MCP methyltransferase, CheR-type  38.97 
 
 		 290 aa  189  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0460074 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01283  chemotaxis methyltransferase CheR  40 
 
 		 275 aa  188  8e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2339  chemotaxis protein methyltransferase CheR  41.18 
 
 		 275 aa  188  9e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3582  MCP methyltransferase, CheR-type  36.39 
 
 		 302 aa  187  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1476  chemotaxis protein methyltransferase CheR  41.31 
 
 		 276 aa  187  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0069  MCP methyltransferase, CheR-type  39.68 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1793  chemotaxis protein methyltransferase CheR  40 
 
 		 275 aa  186  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0521  protein-glutamate O-methyltransferase  40.16 
 
 		 275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.644079  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3498  protein-glutamate O-methyltransferase  41.96 
 
 		 273 aa  182  7e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  38.91 
 
 		 280 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  41.31 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3139  protein-glutamate O-methyltransferase  37.02 
 
 		 291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3104  MCP methyltransferase, CheR-type  35.82 
 
 		 285 aa  176  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2215  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.21 
 
 		 289 aa  176  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.171483  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0215  MCP methyltransferase, CheR-type  40.39 
 
 		 294 aa  175  7e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.177352  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2305  MCP methyltransferase, CheR-type  34.88 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0925  MCP methyltransferase, CheR-type  37.01 
 
 		 271 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0089  MCP methyltransferase, CheR-type  35.34 
 
 		 283 aa  169  4e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0428  MCP methyltransferase, CheR-type  40.54 
 
 		 275 aa  169  5e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0040  CheR methyltransferase, SAM binding domain protein  35.48 
 
 		 283 aa  168  9e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0747  MCP methyltransferase, CheR-type  37.07 
 
 		 288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2118  MCP methyltransferase, CheR-type  36.93 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0635  MCP methyltransferase, CheR-type  40.31 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1573  MCP methyltransferase, CheR-type  35.32 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0438911  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0757  MCP methyltransferase, CheR-type  33.46 
 
 		 275 aa  163  3e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2571  MCP methyltransferase, CheR-type  38.2 
 
 		 303 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0762  MCP methyltransferase, CheR-type  36.68 
 
 		 288 aa  162  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.454256 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0626  MCP methyltransferase, CheR-type  39.92 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.325159  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2475  MCP methyltransferase, CheR-type  38.49 
 
 		 303 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0126751  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3267  MCP methyltransferase, CheR-type  37.88 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.335431  hitchhiker  0.0000324119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>