More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30900 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_30900  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
272 aa  551  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  66.3 
 
 
276 aa  374  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.349462  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2320  MCP methyltransferase, CheR-type  56.2 
 
 
291 aa  297  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5002  MCP methyltransferase, CheR-type  57.25 
 
 
274 aa  296  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0322  Protein-glutamate O-methyltransferase  55.64 
 
 
276 aa  296  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.294679 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3598  MCP methyltransferase, CheR-type  54.65 
 
 
278 aa  282  4.0000000000000003e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0123942  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  51.49 
 
 
289 aa  251  7e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3801  MCP methyltransferase, CheR-type  47.94 
 
 
294 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0527  MCP methyltransferase, CheR-type  47.6 
 
 
289 aa  242  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1874  MCP methyltransferase, CheR-type  47.57 
 
 
291 aa  241  9e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3855  MCP methyltransferase, CheR-type  46.82 
 
 
291 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1788  MCP methyltransferase, CheR-type  48.54 
 
 
316 aa  239  4e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.275448  normal  0.703081 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1494  protein-glutamate O-methyltransferase  46.86 
 
 
292 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1813  MCP methyltransferase, CheR-type  50.59 
 
 
285 aa  237  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1533  protein-glutamate O-methyltransferase  50.59 
 
 
285 aa  237  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0781767 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4243  MCP methyltransferase, CheR-type  48.36 
 
 
290 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1710  MCP methyltransferase, CheR-type  50.2 
 
 
285 aa  232  5e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1912  Protein-glutamate O-methyltransferase  46.47 
 
 
278 aa  231  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0842494  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4031  MCP methyltransferase, CheR-type  47.24 
 
 
287 aa  230  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236096  normal  0.66198 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3372  MCP methyltransferase, CheR-type  49.22 
 
 
288 aa  230  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0524  MCP methyltransferase, CheR-type  48.83 
 
 
288 aa  229  5e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1533  putative chemotaxis protein methyltransferase cheR  47.37 
 
 
292 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3916  MCP methyltransferase, CheR-type  44.53 
 
 
289 aa  224  9e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4834  MCP methyltransferase, CheR-type  47.47 
 
 
296 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162738  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1821  MCP methyltransferase, CheR-type  46.18 
 
 
292 aa  221  9e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101872  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1695  MCP methyltransferase, CheR-type  45.62 
 
 
289 aa  219  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3674  protein-glutamate O-methyltransferase  43.07 
 
 
292 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0524  MCP methyltransferase, CheR-type  43.82 
 
 
280 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1529  MCP methyltransferase, CheR-type  41.85 
 
 
273 aa  212  3.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0662  MCP methyltransferase, CheR-type  45 
 
 
278 aa  212  3.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.893478 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4228  MCP methyltransferase, CheR-type  40.74 
 
 
274 aa  209  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3733  MCP methyltransferase, CheR-type  44.92 
 
 
275 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0499524  normal  0.833336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3953  MCP methyltransferase, CheR-type  44.92 
 
 
275 aa  208  9e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4252  MCP methyltransferase, CheR-type  44.14 
 
 
275 aa  206  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4392  chemotaxis protein methyltransferase CheR  44.53 
 
 
275 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1462  protein-glutamate O-methyltransferase  44.53 
 
 
275 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1928  chemotaxis protein methyltransferase CheR  44.75 
 
 
280 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495072  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2851  MCP methyltransferase, CheR-type  44.14 
 
 
282 aa  203  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.188729 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3485  protein-glutamate O-methyltransferase  43.75 
 
 
280 aa  202  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.405571  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20760  putative chemotaxis protein methyltransferase  43.07 
 
 
274 aa  201  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1782  putative chemotaxis protein methyltransferase  42.7 
 
 
274 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  40.58 
 
 
414 aa  192  4e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1430  MCP methyltransferase, CheR-type  41.34 
 
 
267 aa  189  5e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1069  protein-glutamate O-methyltransferase  38.69 
 
 
278 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0178115  normal  0.0152511 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3582  MCP methyltransferase, CheR-type  36.23 
 
 
302 aa  187  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0521  protein-glutamate O-methyltransferase  39.42 
 
 
275 aa  186  5e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.644079  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1177  protein-glutamate O-methyltransferase  40.88 
 
 
275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0805405  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1216  MCP methyltransferase, CheR-type  41.04 
 
 
275 aa  182  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.189092  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3088  protein-glutamate O-methyltransferase  40.15 
 
 
277 aa  181  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1339  MCP methyltransferase, CheR-type  40.84 
 
 
277 aa  181  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1344  MCP methyltransferase, CheR-type  40.88 
 
 
277 aa  181  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.841955  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1596  MCP methyltransferase, CheR-type  39.78 
 
 
277 aa  180  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004174  chemotaxis protein methyltransferase CheR  36.26 
 
 
275 aa  179  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2319  protein-glutamate O-methyltransferase  40.68 
 
 
277 aa  179  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.945432  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2963  protein-glutamate O-methyltransferase  40.46 
 
 
279 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.643676  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01283  chemotaxis methyltransferase CheR  36.26 
 
 
275 aa  179  5.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2948  protein-glutamate O-methyltransferase  40.46 
 
 
279 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  40.46 
 
 
279 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3101  protein-glutamate O-methyltransferase  40.46 
 
 
279 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1160  MCP methyltransferase, CheR-type  40.46 
 
 
277 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3251  chemotaxis protein methyltransferase CheR  40.46 
 
 
279 aa  177  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1793  chemotaxis protein methyltransferase CheR  36.59 
 
 
275 aa  178  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2214  MCP methyltransferase, CheR-type  39.53 
 
 
285 aa  178  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2598  protein-glutamate O-methyltransferase  40.46 
 
 
279 aa  177  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1258  MCP methyltransferase, CheR-type  40.08 
 
 
279 aa  176  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1328  MCP methyltransferase, CheR-type  40.08 
 
 
279 aa  176  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  40.08 
 
 
279 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0892  MCP methyltransferase, CheR-type  41.57 
 
 
275 aa  176  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763334  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1302  protein-glutamate O-methyltransferase  40.46 
 
 
279 aa  176  5e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02929  chemotaxis protein methyltransferase CheR  39.41 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.723494  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2339  chemotaxis protein methyltransferase CheR  37.05 
 
 
275 aa  171  7.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0925  MCP methyltransferase, CheR-type  39.53 
 
 
271 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3101  MCP methyltransferase, CheR-type  35.04 
 
 
278 aa  165  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0448745  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0095  MCP methyltransferase, CheR-type  42.58 
 
 
275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0069  MCP methyltransferase, CheR-type  37.25 
 
 
280 aa  162  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1476  chemotaxis protein methyltransferase CheR  36.26 
 
 
276 aa  161  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03244  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.21 
 
 
284 aa  158  9e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0647  chemotaxis protein methyltransferase  34.33 
 
 
271 aa  157  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.63831  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  33.21 
 
 
297 aa  156  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  37.64 
 
 
288 aa  156  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  37.35 
 
 
280 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0910  chemotaxis protein methyltransferase CheR  38.49 
 
 
269 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  36.08 
 
 
280 aa  155  6e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0987  MCP methyltransferase, CheR-type  34.55 
 
 
283 aa  155  7e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3546  MCP methyltransferase, CheR-type  39.18 
 
 
267 aa  155  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal  0.882443 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2305  MCP methyltransferase, CheR-type  32.48 
 
 
291 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0783  protein-glutamate O-methyltransferase  38.1 
 
 
269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.827996  normal  0.901412 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0428  MCP methyltransferase, CheR-type  36.63 
 
 
275 aa  152  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3498  protein-glutamate O-methyltransferase  38.28 
 
 
273 aa  152  5e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2448  MCP methyltransferase, CheR-type  36.44 
 
 
258 aa  151  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000593357  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0040  CheR methyltransferase, SAM binding domain protein  30.23 
 
 
283 aa  150  2e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3139  protein-glutamate O-methyltransferase  31.9 
 
 
291 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0033  protein-glutamate O-methyltransferase  34.55 
 
 
490 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2215  chemotaxis protein methyltransferase CheR  32.38 
 
 
289 aa  149  6e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.171483  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0728  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  34.88 
 
 
486 aa  147  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3299  protein-glutamate O-methyltransferase  31.91 
 
 
275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0875  MCP methyltransferase, CheR-type  32.95 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2282  MCP methyltransferase, CheR-type  35.37 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.977677  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1528  MCP methyltransferase, CheR-type  38.13 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.168715 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2820  MCP methyltransferase, CheR-type  35.25 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.353038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>