More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0524 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0524  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
280 aa  570  1.0000000000000001e-162  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3855  MCP methyltransferase, CheR-type  55.71 
 
 
291 aa  349  3e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4243  MCP methyltransferase, CheR-type  58.87 
 
 
290 aa  346  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3801  MCP methyltransferase, CheR-type  57.74 
 
 
294 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1874  MCP methyltransferase, CheR-type  56.98 
 
 
291 aa  342  4e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1494  protein-glutamate O-methyltransferase  54.42 
 
 
292 aa  342  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0527  MCP methyltransferase, CheR-type  58.87 
 
 
289 aa  339  4e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3372  MCP methyltransferase, CheR-type  56.98 
 
 
288 aa  337  9.999999999999999e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  56.55 
 
 
289 aa  333  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0524  MCP methyltransferase, CheR-type  56.23 
 
 
288 aa  331  1e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1533  putative chemotaxis protein methyltransferase cheR  55.85 
 
 
292 aa  328  5.0000000000000004e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1821  MCP methyltransferase, CheR-type  56.77 
 
 
292 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101872  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3916  MCP methyltransferase, CheR-type  55.47 
 
 
289 aa  326  3e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3674  protein-glutamate O-methyltransferase  54.34 
 
 
292 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4031  MCP methyltransferase, CheR-type  54.61 
 
 
287 aa  317  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236096  normal  0.66198 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1710  MCP methyltransferase, CheR-type  57.14 
 
 
285 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4834  MCP methyltransferase, CheR-type  57.89 
 
 
296 aa  315  6e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162738  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1533  protein-glutamate O-methyltransferase  54.91 
 
 
285 aa  310  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0781767 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1813  MCP methyltransferase, CheR-type  54.91 
 
 
285 aa  310  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1695  MCP methyltransferase, CheR-type  56.62 
 
 
289 aa  309  4e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0662  MCP methyltransferase, CheR-type  51.88 
 
 
278 aa  286  2.9999999999999996e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.893478 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1912  Protein-glutamate O-methyltransferase  50.94 
 
 
278 aa  268  8.999999999999999e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0842494  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0322  Protein-glutamate O-methyltransferase  44.19 
 
 
276 aa  237  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.294679 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1788  MCP methyltransferase, CheR-type  42.91 
 
 
316 aa  233  3e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.275448  normal  0.703081 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3598  MCP methyltransferase, CheR-type  42.8 
 
 
278 aa  233  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0123942  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5002  MCP methyltransferase, CheR-type  43.87 
 
 
274 aa  230  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0095  MCP methyltransferase, CheR-type  45.11 
 
 
275 aa  226  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2320  MCP methyltransferase, CheR-type  41.24 
 
 
291 aa  218  6e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30900  MCP methyltransferase, CheR-type  43.82 
 
 
272 aa  214  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  37.45 
 
 
414 aa  206  5e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1529  MCP methyltransferase, CheR-type  39.29 
 
 
273 aa  205  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4228  MCP methyltransferase, CheR-type  37.16 
 
 
274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  39.34 
 
 
276 aa  199  3e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.349462  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0069  MCP methyltransferase, CheR-type  40.16 
 
 
280 aa  195  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1430  MCP methyltransferase, CheR-type  38.67 
 
 
267 aa  185  6e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02929  chemotaxis protein methyltransferase CheR  37.41 
 
 
276 aa  185  8e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.723494  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2851  MCP methyltransferase, CheR-type  37.78 
 
 
282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.188729 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1736  MCP methyltransferase, CheR-type  35.94 
 
 
290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0460074 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20760  putative chemotaxis protein methyltransferase  37.55 
 
 
274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1782  putative chemotaxis protein methyltransferase  36.8 
 
 
274 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4252  MCP methyltransferase, CheR-type  37.04 
 
 
275 aa  180  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1069  protein-glutamate O-methyltransferase  36 
 
 
278 aa  180  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0178115  normal  0.0152511 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2215  chemotaxis protein methyltransferase CheR  37.12 
 
 
289 aa  179  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.171483  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1216  MCP methyltransferase, CheR-type  37.08 
 
 
275 aa  178  7e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.189092  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3582  MCP methyltransferase, CheR-type  33.57 
 
 
302 aa  178  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2305  MCP methyltransferase, CheR-type  35.21 
 
 
291 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3101  MCP methyltransferase, CheR-type  35.14 
 
 
278 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0448745  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3733  MCP methyltransferase, CheR-type  34.81 
 
 
275 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0499524  normal  0.833336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3953  MCP methyltransferase, CheR-type  34.44 
 
 
275 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4392  chemotaxis protein methyltransferase CheR  34.44 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3485  protein-glutamate O-methyltransferase  36.3 
 
 
280 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.405571  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1462  protein-glutamate O-methyltransferase  34.44 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1928  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.93 
 
 
280 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495072  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0987  MCP methyltransferase, CheR-type  33.82 
 
 
283 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2339  chemotaxis protein methyltransferase CheR  37.02 
 
 
275 aa  170  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1177  protein-glutamate O-methyltransferase  36.19 
 
 
275 aa  169  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0805405  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1476  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.88 
 
 
276 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1339  MCP methyltransferase, CheR-type  35.52 
 
 
277 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004174  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.88 
 
 
275 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1793  chemotaxis protein methyltransferase CheR  37.12 
 
 
275 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  35.77 
 
 
279 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2963  protein-glutamate O-methyltransferase  35.77 
 
 
279 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.643676  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1344  MCP methyltransferase, CheR-type  34.59 
 
 
277 aa  166  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.841955  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3101  protein-glutamate O-methyltransferase  35.77 
 
 
279 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2948  protein-glutamate O-methyltransferase  35.77 
 
 
279 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3251  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.91 
 
 
279 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  35.52 
 
 
279 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0925  MCP methyltransferase, CheR-type  36.67 
 
 
271 aa  165  9e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3139  protein-glutamate O-methyltransferase  33.59 
 
 
291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0521  protein-glutamate O-methyltransferase  37.01 
 
 
275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.644079  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1258  MCP methyltransferase, CheR-type  35.52 
 
 
279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1328  MCP methyltransferase, CheR-type  35.52 
 
 
279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2598  protein-glutamate O-methyltransferase  35.77 
 
 
279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1596  MCP methyltransferase, CheR-type  35.52 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2319  protein-glutamate O-methyltransferase  36.68 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.945432  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  36.05 
 
 
280 aa  163  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1302  protein-glutamate O-methyltransferase  36.15 
 
 
279 aa  163  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0040  CheR methyltransferase, SAM binding domain protein  34.09 
 
 
283 aa  163  4.0000000000000004e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01283  chemotaxis methyltransferase CheR  35.5 
 
 
275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0892  MCP methyltransferase, CheR-type  35.91 
 
 
275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763334  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2214  MCP methyltransferase, CheR-type  34.07 
 
 
285 aa  162  6e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3088  protein-glutamate O-methyltransferase  34.36 
 
 
277 aa  162  7e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1160  MCP methyltransferase, CheR-type  35.14 
 
 
277 aa  162  7e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2118  MCP methyltransferase, CheR-type  35.71 
 
 
283 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0428  MCP methyltransferase, CheR-type  34.21 
 
 
275 aa  159  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0215  MCP methyltransferase, CheR-type  38.28 
 
 
294 aa  159  7e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.177352  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3104  MCP methyltransferase, CheR-type  31.15 
 
 
285 aa  158  7e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3498  protein-glutamate O-methyltransferase  35.69 
 
 
273 aa  156  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  33.21 
 
 
280 aa  156  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0579  MCP methyltransferase, CheR-type  34.09 
 
 
280 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0159  chemotaxis protein methyltransferase CheR  36.86 
 
 
273 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  35 
 
 
288 aa  154  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2820  MCP methyltransferase, CheR-type  38.01 
 
 
277 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.353038  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1198  protein-glutamate O-methyltransferase  33.08 
 
 
327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.112441  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0207  CheR methyltransferase SAM-binding domain-containing protein  36.4 
 
 
270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4074  chemotaxis methyltransferase  33.47 
 
 
302 aa  152  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3299  protein-glutamate O-methyltransferase  34.98 
 
 
275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  32.95 
 
 
297 aa  152  8e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0332  MCP methyltransferase, CheR-type  34.26 
 
 
302 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.284961 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2282  MCP methyltransferase, CheR-type  39.15 
 
 
270 aa  151  8.999999999999999e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.977677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>