More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2339 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2339  chemotaxis protein methyltransferase CheR  100 
 
 
275 aa  565  1e-160  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01283  chemotaxis methyltransferase CheR  84.36 
 
 
275 aa  494  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1793  chemotaxis protein methyltransferase CheR  82.91 
 
 
275 aa  491  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004174  chemotaxis protein methyltransferase CheR  82.55 
 
 
275 aa  484  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1344  MCP methyltransferase, CheR-type  62.77 
 
 
277 aa  359  2e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.841955  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1596  MCP methyltransferase, CheR-type  61.59 
 
 
277 aa  359  3e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1160  MCP methyltransferase, CheR-type  61.96 
 
 
277 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2319  protein-glutamate O-methyltransferase  60.51 
 
 
277 aa  353  2e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.945432  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1258  MCP methyltransferase, CheR-type  61.4 
 
 
279 aa  352  5e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1328  MCP methyltransferase, CheR-type  61.4 
 
 
279 aa  352  5e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  61.4 
 
 
279 aa  350  1e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2948  protein-glutamate O-methyltransferase  61.76 
 
 
279 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2963  protein-glutamate O-methyltransferase  61.76 
 
 
279 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.643676  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  61.76 
 
 
279 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3101  protein-glutamate O-methyltransferase  61.76 
 
 
279 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1339  MCP methyltransferase, CheR-type  59.85 
 
 
277 aa  349  3e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3088  protein-glutamate O-methyltransferase  60.14 
 
 
277 aa  348  5e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3251  chemotaxis protein methyltransferase CheR  61.4 
 
 
279 aa  347  9e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1476  chemotaxis protein methyltransferase CheR  56.88 
 
 
276 aa  347  1e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2598  protein-glutamate O-methyltransferase  61.4 
 
 
279 aa  347  1e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1302  protein-glutamate O-methyltransferase  60.14 
 
 
279 aa  347  1e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02929  chemotaxis protein methyltransferase CheR  51.45 
 
 
276 aa  304  9.000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.723494  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1177  protein-glutamate O-methyltransferase  53.31 
 
 
275 aa  300  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0805405  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1216  MCP methyltransferase, CheR-type  52.19 
 
 
275 aa  299  3e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.189092  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3101  MCP methyltransferase, CheR-type  52.92 
 
 
278 aa  291  7e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0448745  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2851  MCP methyltransferase, CheR-type  52.42 
 
 
282 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.188729 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1928  chemotaxis protein methyltransferase CheR  52.17 
 
 
280 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495072  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3733  MCP methyltransferase, CheR-type  52.04 
 
 
275 aa  278  9e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0499524  normal  0.833336 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3485  protein-glutamate O-methyltransferase  51.09 
 
 
280 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.405571  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3953  MCP methyltransferase, CheR-type  51.67 
 
 
275 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4252  MCP methyltransferase, CheR-type  52.04 
 
 
275 aa  275  7e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4392  chemotaxis protein methyltransferase CheR  51.67 
 
 
275 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1462  protein-glutamate O-methyltransferase  51.67 
 
 
275 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1782  putative chemotaxis protein methyltransferase  51.67 
 
 
274 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0925  MCP methyltransferase, CheR-type  50 
 
 
271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0892  MCP methyltransferase, CheR-type  47.45 
 
 
275 aa  271  6e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763334  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20760  putative chemotaxis protein methyltransferase  51.67 
 
 
274 aa  271  6e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1069  protein-glutamate O-methyltransferase  48.36 
 
 
278 aa  270  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0178115  normal  0.0152511 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0521  protein-glutamate O-methyltransferase  45.65 
 
 
275 aa  258  6e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.644079  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2214  MCP methyltransferase, CheR-type  44.85 
 
 
285 aa  252  4.0000000000000004e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1430  MCP methyltransferase, CheR-type  45.72 
 
 
267 aa  231  1e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4031  MCP methyltransferase, CheR-type  41.7 
 
 
287 aa  209  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236096  normal  0.66198 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1813  MCP methyltransferase, CheR-type  42.41 
 
 
285 aa  209  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1533  protein-glutamate O-methyltransferase  42.41 
 
 
285 aa  209  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0781767 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1710  MCP methyltransferase, CheR-type  42.02 
 
 
285 aa  206  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  41.28 
 
 
414 aa  203  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1695  MCP methyltransferase, CheR-type  41.25 
 
 
289 aa  202  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4834  MCP methyltransferase, CheR-type  40.47 
 
 
296 aa  202  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162738  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1912  Protein-glutamate O-methyltransferase  40.44 
 
 
278 aa  201  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0842494  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1494  protein-glutamate O-methyltransferase  40.75 
 
 
292 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3582  MCP methyltransferase, CheR-type  38.99 
 
 
302 aa  201  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3855  MCP methyltransferase, CheR-type  39.39 
 
 
291 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0527  MCP methyltransferase, CheR-type  40.38 
 
 
289 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1874  MCP methyltransferase, CheR-type  39.39 
 
 
291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4243  MCP methyltransferase, CheR-type  39.84 
 
 
290 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1821  MCP methyltransferase, CheR-type  39.93 
 
 
292 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101872  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3916  MCP methyltransferase, CheR-type  39.77 
 
 
289 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0987  MCP methyltransferase, CheR-type  38.11 
 
 
283 aa  192  6e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3801  MCP methyltransferase, CheR-type  37.88 
 
 
294 aa  191  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3674  protein-glutamate O-methyltransferase  38.43 
 
 
292 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3372  MCP methyltransferase, CheR-type  41.41 
 
 
288 aa  189  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  41.18 
 
 
289 aa  188  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0524  MCP methyltransferase, CheR-type  40.23 
 
 
288 aa  186  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1533  putative chemotaxis protein methyltransferase cheR  38.26 
 
 
292 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0662  MCP methyltransferase, CheR-type  38.74 
 
 
278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.893478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2320  MCP methyltransferase, CheR-type  37.59 
 
 
291 aa  179  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0322  Protein-glutamate O-methyltransferase  38.55 
 
 
276 aa  178  9e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.294679 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  35.38 
 
 
276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.349462  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30900  MCP methyltransferase, CheR-type  37.05 
 
 
272 aa  171  7.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0524  MCP methyltransferase, CheR-type  37.02 
 
 
280 aa  170  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4228  MCP methyltransferase, CheR-type  34.64 
 
 
274 aa  167  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  33.82 
 
 
297 aa  166  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4027  MCP methyltransferase, CheR-type  35.74 
 
 
290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000815784 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3943  MCP methyltransferase, CheR-type  35.74 
 
 
290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.331314  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1529  MCP methyltransferase, CheR-type  37.32 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3598  MCP methyltransferase, CheR-type  34.67 
 
 
278 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0123942  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5002  MCP methyltransferase, CheR-type  34.85 
 
 
274 aa  162  7e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0878  MCP methyltransferase, CheR-type  34.77 
 
 
275 aa  159  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0069  MCP methyltransferase, CheR-type  36.33 
 
 
280 aa  157  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2118  MCP methyltransferase, CheR-type  32.49 
 
 
283 aa  158  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1573  MCP methyltransferase, CheR-type  34.66 
 
 
292 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0438911  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1736  MCP methyltransferase, CheR-type  34.72 
 
 
290 aa  157  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0460074 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2215  chemotaxis protein methyltransferase CheR  31.9 
 
 
289 aa  156  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.171483  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1788  MCP methyltransferase, CheR-type  35.16 
 
 
316 aa  156  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.275448  normal  0.703081 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3299  protein-glutamate O-methyltransferase  34.41 
 
 
275 aa  154  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4421  protein-glutamate O-methyltransferase  34.29 
 
 
277 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0808  MCP methyltransferase, CheR-type  34.21 
 
 
272 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2305  MCP methyltransferase, CheR-type  31.54 
 
 
291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2710  protein-glutamate O-methyltransferase  33.33 
 
 
298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3302  MCP methyltransferase, CheR-type  33.97 
 
 
274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.905154 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1382  MCP methyltransferase, CheR-type  33.94 
 
 
303 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1143  chemotaxis protein methyltransferase CheR  34.07 
 
 
292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0207024  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1617  MCP methyltransferase, CheR-type  35.96 
 
 
289 aa  152  7e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1152  protein-glutamate O-methyltransferase  33.21 
 
 
291 aa  152  7e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1405  MCP methyltransferase, CheR-type  36.16 
 
 
284 aa  152  7e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216379  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0332  MCP methyltransferase, CheR-type  35.48 
 
 
302 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.284961 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2162  protein-glutamate O-methyltransferase  32.83 
 
 
272 aa  152  7e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2475  MCP methyltransferase, CheR-type  35.74 
 
 
303 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0126751  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0904  MCP methyltransferase, CheR-type  33.7 
 
 
267 aa  152  8e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2571  MCP methyltransferase, CheR-type  35.74 
 
 
303 aa  151  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>