More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3088 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3088  protein-glutamate O-methyltransferase  100 
 
 		 277 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1596  MCP methyltransferase, CheR-type  94.57 
 
 		 277 aa  550  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1344  MCP methyltransferase, CheR-type  91.7 
 
 		 277 aa  533  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.841955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2948  protein-glutamate O-methyltransferase  90.25 
 
 		 279 aa  521  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2963  protein-glutamate O-methyltransferase  90.25 
 
 		 279 aa  521  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.643676  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1258  MCP methyltransferase, CheR-type  89.89 
 
 		 279 aa  521  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1328  MCP methyltransferase, CheR-type  89.89 
 
 		 279 aa  521  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3101  protein-glutamate O-methyltransferase  90.25 
 
 		 279 aa  521  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  90.25 
 
 		 279 aa  521  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  90.25 
 
 		 279 aa  522  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3251  chemotaxis protein methyltransferase CheR  89.17 
 
 		 279 aa  517  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2598  protein-glutamate O-methyltransferase  89.53 
 
 		 279 aa  519  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1302  protein-glutamate O-methyltransferase  88.73 
 
 		 279 aa  511  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1160  MCP methyltransferase, CheR-type  88.09 
 
 		 277 aa  511  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1339  MCP methyltransferase, CheR-type  87.36 
 
 		 277 aa  512  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2319  protein-glutamate O-methyltransferase  87 
 
 		 277 aa  507  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.945432  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004174  chemotaxis protein methyltransferase CheR  62.68 
 
 		 275 aa  367  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1476  chemotaxis protein methyltransferase CheR  60.14 
 
 		 276 aa  366  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1793  chemotaxis protein methyltransferase CheR  63.04 
 
 		 275 aa  364  1e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01283  chemotaxis methyltransferase CheR  62.32 
 
 		 275 aa  362  3e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2339  chemotaxis protein methyltransferase CheR  60.14 
 
 		 275 aa  348  5e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02929  chemotaxis protein methyltransferase CheR  56.88 
 
 		 276 aa  338  7e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.723494  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1928  chemotaxis protein methyltransferase CheR  56.13 
 
 		 280 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3485  protein-glutamate O-methyltransferase  55.39 
 
 		 280 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.405571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3101  MCP methyltransferase, CheR-type  51.08 
 
 		 278 aa  300  1e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0448745  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4252  MCP methyltransferase, CheR-type  55.02 
 
 		 275 aa  299  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2851  MCP methyltransferase, CheR-type  55.02 
 
 		 282 aa  298  4e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.188729 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3733  MCP methyltransferase, CheR-type  53.16 
 
 		 275 aa  295  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0499524  normal  0.833336 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4392  chemotaxis protein methyltransferase CheR  53.16 
 
 		 275 aa  294  8e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1462  protein-glutamate O-methyltransferase  53.16 
 
 		 275 aa  294  8e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1216  MCP methyltransferase, CheR-type  50.18 
 
 		 275 aa  294  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.189092  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3953  MCP methyltransferase, CheR-type  53.16 
 
 		 275 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1782  putative chemotaxis protein methyltransferase  53.28 
 
 		 274 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20760  putative chemotaxis protein methyltransferase  53.28 
 
 		 274 aa  285  7e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1177  protein-glutamate O-methyltransferase  50.73 
 
 		 275 aa  278  5e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0805405  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0892  MCP methyltransferase, CheR-type  46.38 
 
 		 275 aa  266  2e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2214  MCP methyltransferase, CheR-type  47.27 
 
 		 285 aa  265  8.999999999999999e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1069  protein-glutamate O-methyltransferase  44.85 
 
 		 278 aa  262  6e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0178115  normal  0.0152511 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0521  protein-glutamate O-methyltransferase  45.49 
 
 		 275 aa  249  3e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.644079  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0925  MCP methyltransferase, CheR-type  46.39 
 
 		 271 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1430  MCP methyltransferase, CheR-type  46.39 
 
 		 267 aa  227  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3855  MCP methyltransferase, CheR-type  42.91 
 
 		 291 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1874  MCP methyltransferase, CheR-type  41.57 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1494  protein-glutamate O-methyltransferase  42.32 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4031  MCP methyltransferase, CheR-type  39.93 
 
 		 287 aa  193  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236096  normal  0.66198 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  41.64 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0527  MCP methyltransferase, CheR-type  40.45 
 
 		 289 aa  189  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0662  MCP methyltransferase, CheR-type  39 
 
 		 278 aa  189  5.999999999999999e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.893478 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3801  MCP methyltransferase, CheR-type  39.85 
 
 		 294 aa  188  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1533  protein-glutamate O-methyltransferase  39.93 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0781767 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1813  MCP methyltransferase, CheR-type  39.93 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3916  MCP methyltransferase, CheR-type  40.98 
 
 		 289 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1710  MCP methyltransferase, CheR-type  41.31 
 
 		 285 aa  185  7e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1533  putative chemotaxis protein methyltransferase cheR  39.85 
 
 		 292 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3674  protein-glutamate O-methyltransferase  39.47 
 
 		 292 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4834  MCP methyltransferase, CheR-type  38.37 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162738  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30900  MCP methyltransferase, CheR-type  40.15 
 
 		 272 aa  181  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1821  MCP methyltransferase, CheR-type  39.33 
 
 		 292 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101872  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1695  MCP methyltransferase, CheR-type  38.37 
 
 		 289 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3372  MCP methyltransferase, CheR-type  39.45 
 
 		 288 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1912  Protein-glutamate O-methyltransferase  38.24 
 
 		 278 aa  179  5.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0842494  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4243  MCP methyltransferase, CheR-type  39 
 
 		 290 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1788  MCP methyltransferase, CheR-type  37.17 
 
 		 316 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.275448  normal  0.703081 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3582  MCP methyltransferase, CheR-type  36.84 
 
 		 302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0322  Protein-glutamate O-methyltransferase  39.44 
 
 		 276 aa  171  9e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.294679 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0524  MCP methyltransferase, CheR-type  38.72 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  34.05 
 
 		 414 aa  171  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4228  MCP methyltransferase, CheR-type  36.63 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5002  MCP methyltransferase, CheR-type  39.1 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2320  MCP methyltransferase, CheR-type  40.08 
 
 		 291 aa  166  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0987  MCP methyltransferase, CheR-type  33.58 
 
 		 283 aa  165  8e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3598  MCP methyltransferase, CheR-type  38.2 
 
 		 278 aa  165  9e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0123942  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  35.48 
 
 		 280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  34.53 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.349462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0524  MCP methyltransferase, CheR-type  34.36 
 
 		 280 aa  162  7e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2571  MCP methyltransferase, CheR-type  36.2 
 
 		 303 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  36.55 
 
 		 280 aa  157  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1382  MCP methyltransferase, CheR-type  36.36 
 
 		 303 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1529  MCP methyltransferase, CheR-type  37.5 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2475  MCP methyltransferase, CheR-type  35.71 
 
 		 303 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0126751  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1065  MCP methyltransferase, CheR-type  33.45 
 
 		 271 aa  155  8e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0808  MCP methyltransferase, CheR-type  33.58 
 
 		 272 aa  155  9e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0647  chemotaxis protein methyltransferase  34.18 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.63831  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  32.95 
 
 		 281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.299383  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0614  MCP methyltransferase, CheR-type  32.97 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0483798 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0237  protein-glutamate O-methyltransferase  34.8 
 
 		 307 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.291409 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0757  MCP methyltransferase, CheR-type  32.34 
 
 		 275 aa  150  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2118  MCP methyltransferase, CheR-type  32.97 
 
 		 283 aa  149  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3139  protein-glutamate O-methyltransferase  30.99 
 
 		 291 aa  149  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3498  protein-glutamate O-methyltransferase  35.5 
 
 		 273 aa  149  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  30.66 
 
 		 297 aa  149  6e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4203  MCP methyltransferase, CheR-type  36.58 
 
 		 264 aa  148  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0106813  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  33.59 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0215  MCP methyltransferase, CheR-type  35.86 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.177352  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0332  MCP methyltransferase, CheR-type  34.93 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.284961 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3204  MCP methyltransferase, CheR-type  32.69 
 
 		 285 aa  146  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.25041  normal  0.841939 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1043  MCP methyltransferase, CheR-type  36.16 
 
 		 283 aa  147  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0809  MCP methyltransferase, CheR-type  34.82 
 
 		 269 aa  146  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0300  MCP methyltransferase, CheR-type  34.56 
 
 		 302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000961073  normal  0.256387 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2434  putative MCP methyltransferase, CheR1  33.07 
 
 		 305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>