More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3485 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_3485  protein-glutamate O-methyltransferase  100 
 
 
280 aa  577  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.405571  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1928  chemotaxis protein methyltransferase CheR  98.57 
 
 
280 aa  570  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495072  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4252  MCP methyltransferase, CheR-type  93.09 
 
 
275 aa  531  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3953  MCP methyltransferase, CheR-type  88.36 
 
 
275 aa  510  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3733  MCP methyltransferase, CheR-type  88.73 
 
 
275 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0499524  normal  0.833336 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4392  chemotaxis protein methyltransferase CheR  88.36 
 
 
275 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1462  protein-glutamate O-methyltransferase  88.36 
 
 
275 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2851  MCP methyltransferase, CheR-type  86.91 
 
 
282 aa  498  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.188729 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20760  putative chemotaxis protein methyltransferase  84 
 
 
274 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1782  putative chemotaxis protein methyltransferase  83.27 
 
 
274 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1177  protein-glutamate O-methyltransferase  60.59 
 
 
275 aa  345  7e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0805405  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1069  protein-glutamate O-methyltransferase  55.97 
 
 
278 aa  318  6e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0178115  normal  0.0152511 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1216  MCP methyltransferase, CheR-type  55.02 
 
 
275 aa  315  5e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.189092  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2214  MCP methyltransferase, CheR-type  52.67 
 
 
285 aa  306  3e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1596  MCP methyltransferase, CheR-type  54.74 
 
 
277 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1476  chemotaxis protein methyltransferase CheR  53.73 
 
 
276 aa  303  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1258  MCP methyltransferase, CheR-type  55.11 
 
 
279 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1328  MCP methyltransferase, CheR-type  55.11 
 
 
279 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1160  MCP methyltransferase, CheR-type  54.74 
 
 
277 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  55.11 
 
 
279 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2319  protein-glutamate O-methyltransferase  55.11 
 
 
277 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.945432  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3251  chemotaxis protein methyltransferase CheR  54.74 
 
 
279 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1344  MCP methyltransferase, CheR-type  54.38 
 
 
277 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.841955  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3088  protein-glutamate O-methyltransferase  55.39 
 
 
277 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2598  protein-glutamate O-methyltransferase  54.38 
 
 
279 aa  301  1e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2948  protein-glutamate O-methyltransferase  54.01 
 
 
279 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  54.01 
 
 
279 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2963  protein-glutamate O-methyltransferase  54.01 
 
 
279 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.643676  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3101  protein-glutamate O-methyltransferase  54.01 
 
 
279 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1339  MCP methyltransferase, CheR-type  54.28 
 
 
277 aa  296  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02929  chemotaxis protein methyltransferase CheR  54.14 
 
 
276 aa  296  3e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.723494  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1302  protein-glutamate O-methyltransferase  54.65 
 
 
279 aa  295  4e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01283  chemotaxis methyltransferase CheR  53.82 
 
 
275 aa  295  6e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004174  chemotaxis protein methyltransferase CheR  53.45 
 
 
275 aa  292  5e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1793  chemotaxis protein methyltransferase CheR  52.54 
 
 
275 aa  289  3e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0521  protein-glutamate O-methyltransferase  48.39 
 
 
275 aa  281  9e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.644079  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2339  chemotaxis protein methyltransferase CheR  51.09 
 
 
275 aa  276  3e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0892  MCP methyltransferase, CheR-type  48.51 
 
 
275 aa  274  1.0000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763334  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3101  MCP methyltransferase, CheR-type  45.52 
 
 
278 aa  253  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0448745  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0925  MCP methyltransferase, CheR-type  46.47 
 
 
271 aa  249  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1430  MCP methyltransferase, CheR-type  46.95 
 
 
267 aa  232  5e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3582  MCP methyltransferase, CheR-type  42.39 
 
 
302 aa  213  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1494  protein-glutamate O-methyltransferase  44.03 
 
 
292 aa  212  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3855  MCP methyltransferase, CheR-type  42.48 
 
 
291 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3801  MCP methyltransferase, CheR-type  41.73 
 
 
294 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1874  MCP methyltransferase, CheR-type  43.07 
 
 
291 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4031  MCP methyltransferase, CheR-type  42.19 
 
 
287 aa  203  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236096  normal  0.66198 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  43.87 
 
 
289 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30900  MCP methyltransferase, CheR-type  43.75 
 
 
272 aa  202  6e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0527  MCP methyltransferase, CheR-type  42.25 
 
 
289 aa  201  9e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1821  MCP methyltransferase, CheR-type  44.02 
 
 
292 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101872  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1533  protein-glutamate O-methyltransferase  44.31 
 
 
285 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0781767 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1813  MCP methyltransferase, CheR-type  44.31 
 
 
285 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1529  MCP methyltransferase, CheR-type  41.39 
 
 
273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3598  MCP methyltransferase, CheR-type  38.18 
 
 
278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0123942  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3372  MCP methyltransferase, CheR-type  41.7 
 
 
288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1710  MCP methyltransferase, CheR-type  43.14 
 
 
285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2320  MCP methyltransferase, CheR-type  39.16 
 
 
291 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  40.44 
 
 
276 aa  194  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.349462  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1533  putative chemotaxis protein methyltransferase cheR  40.6 
 
 
292 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1788  MCP methyltransferase, CheR-type  39.54 
 
 
316 aa  191  9e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.275448  normal  0.703081 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4243  MCP methyltransferase, CheR-type  41.86 
 
 
290 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3674  protein-glutamate O-methyltransferase  40.93 
 
 
292 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0662  MCP methyltransferase, CheR-type  41.18 
 
 
278 aa  189  4e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.893478 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3916  MCP methyltransferase, CheR-type  40.82 
 
 
289 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4228  MCP methyltransferase, CheR-type  36.1 
 
 
274 aa  188  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4834  MCP methyltransferase, CheR-type  40.23 
 
 
296 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162738  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  37.09 
 
 
414 aa  187  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0322  Protein-glutamate O-methyltransferase  40.39 
 
 
276 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.294679 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5002  MCP methyltransferase, CheR-type  37.59 
 
 
274 aa  186  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0524  MCP methyltransferase, CheR-type  40.61 
 
 
288 aa  185  6e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1912  Protein-glutamate O-methyltransferase  39.55 
 
 
278 aa  181  9.000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0842494  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1695  MCP methyltransferase, CheR-type  38.98 
 
 
289 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0524  MCP methyltransferase, CheR-type  36.3 
 
 
280 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0987  MCP methyltransferase, CheR-type  34.85 
 
 
283 aa  169  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0783  protein-glutamate O-methyltransferase  37.86 
 
 
269 aa  168  8e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.827996  normal  0.901412 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0910  chemotaxis protein methyltransferase CheR  36.13 
 
 
269 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0215  MCP methyltransferase, CheR-type  37.1 
 
 
294 aa  165  8e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.177352  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3943  MCP methyltransferase, CheR-type  36.23 
 
 
290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.331314  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4027  MCP methyltransferase, CheR-type  35.87 
 
 
290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000815784 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1152  protein-glutamate O-methyltransferase  34.29 
 
 
291 aa  163  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  34.29 
 
 
297 aa  162  6e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0614  MCP methyltransferase, CheR-type  34.69 
 
 
275 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0483798 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1573  MCP methyltransferase, CheR-type  34.08 
 
 
292 aa  159  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0438911  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  33.59 
 
 
280 aa  158  9e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0700  MCP methyltransferase, CheR-type  36.92 
 
 
284 aa  157  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  33.2 
 
 
280 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2710  protein-glutamate O-methyltransferase  34.88 
 
 
298 aa  154  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0878  MCP methyltransferase, CheR-type  32.62 
 
 
275 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4074  chemotaxis methyltransferase  33.83 
 
 
302 aa  152  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0904  MCP methyltransferase, CheR-type  34.69 
 
 
267 aa  151  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4421  protein-glutamate O-methyltransferase  32.97 
 
 
277 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2618  MCP methyltransferase, CheR-type  33.21 
 
 
292 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0428  MCP methyltransferase, CheR-type  34.56 
 
 
275 aa  150  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0237  protein-glutamate O-methyltransferase  34.39 
 
 
307 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.291409 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1595  MCP methyltransferase, CheR-type  34.36 
 
 
284 aa  150  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0778  MCP methyltransferase, CheR-type  33.09 
 
 
292 aa  149  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0203537 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2815  MCP methyltransferase, CheR-type  32.86 
 
 
275 aa  149  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.904459  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  32.94 
 
 
281 aa  149  6e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.299383  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0808  MCP methyltransferase, CheR-type  32.58 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>