More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2448 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2448  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
258 aa  531  1e-150  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000593357  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0833  MCP methyltransferase, CheR-type  60.7 
 
 
260 aa  334  7.999999999999999e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1727  MCP methyltransferase, CheR-type  63.64 
 
 
265 aa  332  3e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0717  MCP methyltransferase, CheR-type  62.26 
 
 
260 aa  329  3e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00142456  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1609  protein-glutamate O-methyltransferase  53.15 
 
 
259 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00317018  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1604  MCP methyltransferase, CheR-type  49.04 
 
 
260 aa  278  7e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0143514  unclonable  1.76137e-23 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2147  MCP methyltransferase, CheR-type  50.59 
 
 
257 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363754  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0472  MCP methyltransferase, CheR-type  49.41 
 
 
256 aa  270  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4203  MCP methyltransferase, CheR-type  46.88 
 
 
264 aa  260  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0106813  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0695  protein-glutamate O-methyltransferase  47.24 
 
 
259 aa  244  8e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0809  MCP methyltransferase, CheR-type  44.53 
 
 
269 aa  240  1e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0471  MCP methyltransferase, CheR-type  45.49 
 
 
282 aa  238  1e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0456  protein-glutamate O-methyltransferase  47.08 
 
 
250 aa  235  6e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1754  chemotaxis protein methyltransferase CheR  44.4 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1547  chemotaxis protein methyltransferase CheR  44.81 
 
 
265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1522  chemotaxis protein methyltransferase  44.81 
 
 
265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.129899  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1511  chemotaxis protein methyltransferase  44.81 
 
 
265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1810  chemotaxis protein methyltransferase CheR  44.4 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1665  chemotaxis protein methyltransferase CheR  44.81 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1732  chemotaxis protein methyltransferase CheR  44.81 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1104  protein-glutamate O-methyltransferase  46.09 
 
 
259 aa  233  3e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.849239  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1347  protein-glutamate O-methyltransferase  45.45 
 
 
231 aa  233  3e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1700  chemotaxis protein methyltransferase CheR  44.4 
 
 
260 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2384  protein-glutamate O-methyltransferase  43.97 
 
 
256 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3646  chemotaxis protein methyltransferase CheR  44.4 
 
 
260 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1551  MCP methyltransferase, CheR-type  44.81 
 
 
260 aa  231  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.742709  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1740  protein-glutamate O-methyltransferase  44.27 
 
 
269 aa  231  1e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0862  MCP methyltransferase, CheR-type  41.96 
 
 
272 aa  229  3e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0987  protein-glutamate O-methyltransferase  44.75 
 
 
270 aa  223  3e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0956387  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0801  MCP methyltransferase, CheR-type  41.2 
 
 
259 aa  222  4e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.507771  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  42.32 
 
 
256 aa  216  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0713  MCP methyltransferase, CheR-type  40.16 
 
 
256 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0058  MCP methyltransferase, CheR-type  35.91 
 
 
286 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20280  Protein-glutamate O-methyltransferase  39.85 
 
 
263 aa  198  6e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1689  MCP methyltransferase, CheR-type  37.21 
 
 
255 aa  194  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1581  protein-glutamate O-methyltransferase  38.49 
 
 
269 aa  179  4e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.175681  normal  0.125652 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0983  chemotaxis protein methyltransferase  36.15 
 
 
302 aa  176  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1767  MCP methyltransferase, CheR-type  37.5 
 
 
264 aa  169  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1545  protein-glutamate O-methyltransferase  36.21 
 
 
264 aa  168  7e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.474689  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0259  protein-glutamate O-methyltransferase  35.22 
 
 
279 aa  159  3e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0737  protein-glutamate O-methyltransferase  35.34 
 
 
270 aa  159  5e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.730545  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0177  protein-glutamate O-methyltransferase  32.79 
 
 
270 aa  154  1e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3121  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  33.19 
 
 
617 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0152355  normal  0.805919 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3498  protein-glutamate O-methyltransferase  40.3 
 
 
273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0433  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  33.76 
 
 
618 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1725  MCP methyltransferase, CheR-type  33.2 
 
 
270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0227  MCP methyltransferase  33.33 
 
 
631 aa  152  7e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.993793  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1653  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.33 
 
 
993 aa  152  7e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30900  MCP methyltransferase, CheR-type  36.44 
 
 
272 aa  151  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  36.99 
 
 
280 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2355  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  33.75 
 
 
1008 aa  149  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22590  Protein-glutamate O-methyltransferase  36.2 
 
 
309 aa  148  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0961  MCP methyltransferase, CheR-type  36.44 
 
 
283 aa  148  8e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.230734  normal  0.936992 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  32.5 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2183  hypothetical protein  34.07 
 
 
980 aa  146  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.850093 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0040  CheR methyltransferase, SAM binding domain protein  33.33 
 
 
283 aa  145  4.0000000000000006e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2820  MCP methyltransferase, CheR-type  36.89 
 
 
277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.353038  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  33.06 
 
 
289 aa  145  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  31.5 
 
 
297 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3390  MCP methyltransferase, CheR-type  35.04 
 
 
617 aa  144  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2282  MCP methyltransferase, CheR-type  36.44 
 
 
270 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.977677  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3104  MCP methyltransferase, CheR-type  31.28 
 
 
285 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  33.76 
 
 
280 aa  143  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.48 
 
 
1407 aa  143  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3625  MCP methyltransferase, CheR-type  32 
 
 
298 aa  143  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0636111 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0780  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  33.05 
 
 
887 aa  142  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0460  MCP methyltransferase, CheR-type  31.49 
 
 
837 aa  142  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.604812  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0229  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  33.48 
 
 
1138 aa  142  7e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1246  methyltransferase CheR, putative  32.64 
 
 
1378 aa  141  8e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2162  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB  32.2 
 
 
879 aa  141  8e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1177  protein-glutamate O-methyltransferase  35.32 
 
 
275 aa  142  8e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0805405  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1988  Protein-glutamate O-methyltransferase  32.82 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0255  putative chemotaxis protein methyltransferase  32.94 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3336  MCP methyltransferase, CheR-type  34.04 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0626  MCP methyltransferase, CheR-type  29.96 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0152  chemotaxis protein methyltransferase CheR  33.04 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3372  MCP methyltransferase, CheR-type  32.65 
 
 
288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3352  protein-glutamate O-methyltransferase  33.06 
 
 
269 aa  140  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.110859  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3212  MCP methyltransferase, CheR-type  31.35 
 
 
291 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.409906  hitchhiker  0.0000000000690371 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1072  MCP methyltransferase, CheR-type  36.52 
 
 
303 aa  140  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0475353  normal  0.619503 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0808  MCP methyltransferase, CheR-type  31.49 
 
 
272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0640  MCP methyltransferase, CheR-type  29.96 
 
 
277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01594e-25 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0370  protein-glutamate O-methyltransferase  33.48 
 
 
639 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.181962  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.05 
 
 
1190 aa  139  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2710  protein-glutamate O-methyltransferase  32.23 
 
 
298 aa  138  7e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2258  MCP methyltransferase, CheR-type  33.62 
 
 
273 aa  138  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.232236  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1788  putative PAS/PAC sensor protein  32.19 
 
 
998 aa  138  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2549  fused CheR-type MCP methyltransferase and PAS sensor protein  34.01 
 
 
1006 aa  138  7.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2045  CheB methylesterase:MCP methyltransferase, CheR-type  31.3 
 
 
868 aa  137  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4246  Protein-glutamate O-methyltransferase  33.06 
 
 
274 aa  138  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.127197  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3046  hypothetical protein  33.91 
 
 
1010 aa  137  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164382 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.4 
 
 
1218 aa  137  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1030  MCP methyltransferase, CheR-type  32.9 
 
 
275 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1596  MCP methyltransferase, CheR-type  34.55 
 
 
277 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4168  response regulator receiver protein  32.67 
 
 
622 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2641  MCP methyltransferase, CheR-type  34.06 
 
 
280 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0696969  normal  0.649849 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3916  MCP methyltransferase, CheR-type  33.47 
 
 
289 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2454  protein-glutamate O-methyltransferase  28.11 
 
 
279 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02200  putative chemotaxis protein methyltransferase  32.14 
 
 
280 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.077708  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.93 
 
 
1306 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>