More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2258 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2258  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
273 aa  568  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.232236  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1030  MCP methyltransferase, CheR-type  56.72 
 
 
275 aa  332  3e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4246  Protein-glutamate O-methyltransferase  55.95 
 
 
274 aa  292  3e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.127197  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3785  MCP methyltransferase, CheR-type  52.31 
 
 
298 aa  290  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0391  MCP methyltransferase, CheR-type  55.38 
 
 
269 aa  290  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.329659 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1033  MCP methyltransferase, CheR-type  55.95 
 
 
269 aa  284  8e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2079  MCP methyltransferase, CheR-type  50.76 
 
 
280 aa  280  1e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.166097 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3336  MCP methyltransferase, CheR-type  56.35 
 
 
277 aa  280  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00537558 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0170  MCP methyltransferase, CheR-type  49.62 
 
 
269 aa  277  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1647  protein-glutamate O-methyltransferase  50 
 
 
279 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1072  MCP methyltransferase, CheR-type  51.59 
 
 
303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0475353  normal  0.619503 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2588  MCP methyltransferase, CheR-type  49.04 
 
 
286 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2804  MCP methyltransferase, CheR-type  48.26 
 
 
284 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2143  MCP methyltransferase, CheR-type  48.85 
 
 
273 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255114  hitchhiker  0.000601426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2713  chemotaxis protein methyltransferase CheR, putative  48.08 
 
 
288 aa  268  7e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0583099  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3720  CheR-type protein glutamate methyltransferase  48.21 
 
 
281 aa  268  7e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3830  MCP methyltransferase, CheR-type  48.46 
 
 
279 aa  268  8.999999999999999e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.109211  normal  0.0246625 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2647  MCP methyltransferase, CheR-type  48.46 
 
 
277 aa  267  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2446  MCP methyltransferase, CheR-type:MCP methyltransferase, CheR-type  47.88 
 
 
280 aa  266  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.676059  hitchhiker  0.0010522 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1962  MCP methyltransferase, CheR-type  47.49 
 
 
279 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0162659  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3995  MCP methyltransferase, CheR-type  47.31 
 
 
285 aa  265  7e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.318486  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2003  MCP methyltransferase, CheR-type  47.31 
 
 
273 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0541882 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0021  MCP methyltransferase, CheR-type  47.31 
 
 
277 aa  263  3e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3760  MCP methyltransferase, CheR-type  46.92 
 
 
273 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0648  MCP methyltransferase, CheR-type  46.54 
 
 
277 aa  262  6e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687034  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2107  MCP methyltransferase, CheR-type  46.92 
 
 
273 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.314277  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0627  MCP methyltransferase, CheR-type  46.54 
 
 
277 aa  261  8e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3352  protein-glutamate O-methyltransferase  47.94 
 
 
269 aa  259  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.110859  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1738  MCP methyltransferase, CheR-type  47.22 
 
 
274 aa  256  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.123373 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1071  methyltransferase, CheR family  48.4 
 
 
285 aa  255  6e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29745e-42 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4267  methyltransferase, CheR family  48 
 
 
285 aa  255  7e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109599 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0931  CheR family methyltransferase  48 
 
 
285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0899  chemotaxis protein methyltransferase  48 
 
 
285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.391368  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0906  MCP methyltransferase, CheR-type  48 
 
 
285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0995  CheR family methyltransferase  48 
 
 
285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5354  MCP methyltransferase, CheR-type  48.02 
 
 
274 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.510015 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1162  methyltransferase, CheR family  48 
 
 
285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4781  MCP methyltransferase, CheR-type  49.4 
 
 
276 aa  252  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.735388  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1036  methyltransferase, CheR family  47.2 
 
 
285 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0916  chemotaxis protein methyltransferase  47.6 
 
 
285 aa  251  7e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1089  CheR family methyltransferase  47.6 
 
 
285 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1268  MCP methyltransferase, CheR-type  48.21 
 
 
269 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0586  Protein-glutamate O-methyltransferase  46.54 
 
 
274 aa  251  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9100  chemotaxis methyltransferase  42.75 
 
 
277 aa  248  8e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.437866  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2641  MCP methyltransferase, CheR-type  45.38 
 
 
280 aa  248  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0696969  normal  0.649849 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5389  MCP methyltransferase, CheR-type  45 
 
 
281 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.087353 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1943  MCP methyltransferase, CheR-type  46.12 
 
 
286 aa  246  3e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.125019  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3008  MCP methyltransferase, CheR-type  48.02 
 
 
284 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.47371  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1001  protein-glutamate O-methyltransferase  50.22 
 
 
275 aa  241  7.999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1217  MCP methyltransferase, CheR-type  43.85 
 
 
281 aa  241  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702972  normal  0.558808 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4783  MCP methyltransferase CheR-type  45.06 
 
 
279 aa  240  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0541  protein-glutamate O-methyltransferase  45.59 
 
 
278 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126293  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4209  MCP methyltransferase, CheR-type  43.08 
 
 
282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2077  MCP methyltransferase, CheR-type  46.03 
 
 
277 aa  236  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1134  MCP methyltransferase, CheR-type  42.47 
 
 
271 aa  223  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0014664  normal  0.105937 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0288  MCP methyltransferase, CheR-type  39.13 
 
 
369 aa  202  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.891674  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2113  MCP methyltransferase, CheR-type  39.69 
 
 
565 aa  198  9e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.982588  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  36.4 
 
 
256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1653  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  33.57 
 
 
993 aa  149  4e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5709  MCP methyltransferase, CheR-type  33.21 
 
 
853 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.729466 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2045  CheB methylesterase:MCP methyltransferase, CheR-type  32.38 
 
 
868 aa  146  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2183  hypothetical protein  31.97 
 
 
980 aa  146  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.850093 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3046  hypothetical protein  32.46 
 
 
1010 aa  146  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164382 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.48 
 
 
1306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  33.46 
 
 
1384 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1788  putative PAS/PAC sensor protein  32.59 
 
 
998 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1716  MCP methyltransferase, CheR-type  33.7 
 
 
856 aa  144  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.92135  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.21 
 
 
1361 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2355  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  33.09 
 
 
1008 aa  143  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.31 
 
 
1348 aa  143  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1740  protein-glutamate O-methyltransferase  34.16 
 
 
269 aa  143  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.07 
 
 
1407 aa  141  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2460  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.87 
 
 
971 aa  140  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1410  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  33.7 
 
 
1120 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132886  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.8 
 
 
1215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2448  MCP methyltransferase, CheR-type  33.62 
 
 
258 aa  138  8.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000593357  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1237  chemotaxis response regulator (methyltransferase)  31.88 
 
 
1618 aa  138  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  31.05 
 
 
1193 aa  138  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1246  methyltransferase CheR, putative  30.96 
 
 
1378 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  31.85 
 
 
1399 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0780  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.62 
 
 
887 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0801  MCP methyltransferase, CheR-type  30.45 
 
 
259 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.507771  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2384  protein-glutamate O-methyltransferase  33.76 
 
 
256 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3183  signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 
1279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.23 
 
 
1380 aa  136  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3377  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.82 
 
 
1242 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2264  putative PAS/PAC sensor protein  29.24 
 
 
1165 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.620072  normal  0.0600346 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2549  fused CheR-type MCP methyltransferase and PAS sensor protein  33.85 
 
 
1006 aa  135  6.0000000000000005e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4430  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.66 
 
 
1158 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1600  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.12 
 
 
1000 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5176  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  28.83 
 
 
1404 aa  133  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.190634 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4203  MCP methyltransferase, CheR-type  33.61 
 
 
264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0106813  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1604  MCP methyltransferase, CheR-type  34.76 
 
 
260 aa  132  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0143514  unclonable  1.76137e-23 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0227  MCP methyltransferase  30.56 
 
 
631 aa  132  6e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.993793  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.75 
 
 
1167 aa  132  7.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3390  MCP methyltransferase, CheR-type  32.21 
 
 
617 aa  132  7.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.49 
 
 
1445 aa  132  9e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1500  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  30.11 
 
 
1483 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  28.52 
 
 
1170 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3013  MCP methyltransferase, CheR-type  33.7 
 
 
877 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>