More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1738 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1738  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
274 aa  560  1.0000000000000001e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.123373 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3995  MCP methyltransferase, CheR-type  63.91 
 
 
285 aa  364  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.318486  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0170  MCP methyltransferase, CheR-type  60.75 
 
 
269 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9100  chemotaxis methyltransferase  60.67 
 
 
277 aa  354  6.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.437866  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0648  MCP methyltransferase, CheR-type  63.02 
 
 
277 aa  353  1e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687034  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0627  MCP methyltransferase, CheR-type  63.02 
 
 
277 aa  353  1e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3830  MCP methyltransferase, CheR-type  61.42 
 
 
279 aa  350  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.109211  normal  0.0246625 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2588  MCP methyltransferase, CheR-type  59.48 
 
 
286 aa  350  2e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5389  MCP methyltransferase, CheR-type  63.16 
 
 
281 aa  346  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.087353 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4209  MCP methyltransferase, CheR-type  62.03 
 
 
282 aa  341  5.999999999999999e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4783  MCP methyltransferase CheR-type  57.3 
 
 
279 aa  340  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1217  MCP methyltransferase, CheR-type  62.03 
 
 
281 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702972  normal  0.558808 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2713  chemotaxis protein methyltransferase CheR, putative  56.23 
 
 
288 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0583099  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2647  MCP methyltransferase, CheR-type  55.47 
 
 
277 aa  334  7e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2143  MCP methyltransferase, CheR-type  55.51 
 
 
273 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255114  hitchhiker  0.000601426 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2107  MCP methyltransferase, CheR-type  56.6 
 
 
273 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.314277  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2003  MCP methyltransferase, CheR-type  55.15 
 
 
273 aa  331  8e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0541882 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3760  MCP methyltransferase, CheR-type  55.15 
 
 
273 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2446  MCP methyltransferase, CheR-type:MCP methyltransferase, CheR-type  54.58 
 
 
280 aa  330  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.676059  hitchhiker  0.0010522 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1072  MCP methyltransferase, CheR-type  53.68 
 
 
303 aa  325  6e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0475353  normal  0.619503 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5354  MCP methyltransferase, CheR-type  57.62 
 
 
274 aa  322  5e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.510015 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1943  MCP methyltransferase, CheR-type  57.58 
 
 
286 aa  322  5e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.125019  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2804  MCP methyltransferase, CheR-type  57.36 
 
 
284 aa  318  3.9999999999999996e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3785  MCP methyltransferase, CheR-type  45.66 
 
 
298 aa  279  5e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3720  CheR-type protein glutamate methyltransferase  47.97 
 
 
281 aa  278  5e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1268  MCP methyltransferase, CheR-type  47.17 
 
 
269 aa  271  6e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2079  MCP methyltransferase, CheR-type  46.59 
 
 
280 aa  268  7e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.166097 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2258  MCP methyltransferase, CheR-type  47.22 
 
 
273 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.232236  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4781  MCP methyltransferase, CheR-type  45.79 
 
 
276 aa  263  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.735388  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1647  protein-glutamate O-methyltransferase  48.48 
 
 
279 aa  263  3e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0021  MCP methyltransferase, CheR-type  46.21 
 
 
277 aa  259  4e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1962  MCP methyltransferase, CheR-type  43.59 
 
 
279 aa  258  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0162659  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1036  methyltransferase, CheR family  43.23 
 
 
285 aa  256  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4267  methyltransferase, CheR family  42.86 
 
 
285 aa  255  5e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109599 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0906  MCP methyltransferase, CheR-type  42.86 
 
 
285 aa  255  6e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1162  methyltransferase, CheR family  43.23 
 
 
285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1089  CheR family methyltransferase  42.86 
 
 
285 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0931  CheR family methyltransferase  42.86 
 
 
285 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0916  chemotaxis protein methyltransferase  43.23 
 
 
285 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0899  chemotaxis protein methyltransferase  42.86 
 
 
285 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.391368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0995  CheR family methyltransferase  42.86 
 
 
285 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1071  methyltransferase, CheR family  42.48 
 
 
285 aa  251  7e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29745e-42 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2641  MCP methyltransferase, CheR-type  47.06 
 
 
280 aa  246  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0696969  normal  0.649849 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0391  MCP methyltransferase, CheR-type  42.8 
 
 
269 aa  241  7e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.329659 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3008  MCP methyltransferase, CheR-type  42.65 
 
 
284 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.47371  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3352  protein-glutamate O-methyltransferase  41.35 
 
 
269 aa  236  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.110859  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4246  Protein-glutamate O-methyltransferase  41.57 
 
 
274 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.127197  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3336  MCP methyltransferase, CheR-type  44.71 
 
 
277 aa  232  6e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00537558 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1030  MCP methyltransferase, CheR-type  43.18 
 
 
275 aa  228  6e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0586  Protein-glutamate O-methyltransferase  42.11 
 
 
274 aa  228  8e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2077  MCP methyltransferase, CheR-type  46.09 
 
 
277 aa  223  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0541  protein-glutamate O-methyltransferase  47.58 
 
 
278 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126293  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1033  MCP methyltransferase, CheR-type  40.68 
 
 
269 aa  216  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1001  protein-glutamate O-methyltransferase  41.04 
 
 
275 aa  207  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1134  MCP methyltransferase, CheR-type  40.91 
 
 
271 aa  204  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0014664  normal  0.105937 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2113  MCP methyltransferase, CheR-type  37.07 
 
 
565 aa  179  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.982588  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0288  MCP methyltransferase, CheR-type  32.43 
 
 
369 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.891674  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2183  hypothetical protein  31.02 
 
 
980 aa  137  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.850093 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3046  hypothetical protein  33.09 
 
 
1010 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164382 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  34.72 
 
 
1399 aa  136  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0399  MCP methyltransferase, CheR-type  30.74 
 
 
820 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  33.72 
 
 
1027 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0809  MCP methyltransferase, CheR-type  29.04 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.82 
 
 
1215 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6211  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  35.66 
 
 
1061 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820077  normal  0.703655 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.12 
 
 
1348 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03023  methyltransferase  34.1 
 
 
604 aa  130  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.361036  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1716  MCP methyltransferase, CheR-type  35.64 
 
 
856 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.92135  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.8 
 
 
1407 aa  129  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1653  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.96 
 
 
993 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4422  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.09 
 
 
1274 aa  129  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.381764  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.33 
 
 
1408 aa  128  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.21 
 
 
1306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1500  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  35.04 
 
 
1483 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  33.61 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2355  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.35 
 
 
1008 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1788  putative PAS/PAC sensor protein  30.39 
 
 
998 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.97 
 
 
1218 aa  126  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1246  methyltransferase CheR, putative  34.81 
 
 
1378 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2384  protein-glutamate O-methyltransferase  30.38 
 
 
256 aa  125  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2460  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.73 
 
 
971 aa  125  7e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0433  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  31.62 
 
 
618 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  35.34 
 
 
1222 aa  125  8.000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2549  fused CheR-type MCP methyltransferase and PAS sensor protein  31.64 
 
 
1006 aa  125  9e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3739  MCP methyltransferase, CheR-type  32.36 
 
 
1045 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  34.35 
 
 
1160 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3755  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.07 
 
 
1063 aa  123  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  33.09 
 
 
1167 aa  123  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.47 
 
 
1445 aa  123  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  33.85 
 
 
1193 aa  123  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4605  MCP methyltransferase, CheR-type  31.11 
 
 
1092 aa  122  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315944  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5709  MCP methyltransferase, CheR-type  31.02 
 
 
853 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.729466 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2448  MCP methyltransferase, CheR-type  29.46 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000593357  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3640  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  31.88 
 
 
1303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.581797 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3121  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  30.77 
 
 
617 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0152355  normal  0.805919 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4203  MCP methyltransferase, CheR-type  31.35 
 
 
264 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0106813  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0327  putative PAS/PAC sensor protein  31.13 
 
 
1008 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1237  chemotaxis response regulator (methyltransferase)  30.55 
 
 
1618 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5237  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.4 
 
 
1324 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.395635 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2045  CheB methylesterase:MCP methyltransferase, CheR-type  31.42 
 
 
868 aa  119  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>