More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1072 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1072  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
303 aa  621  1e-177  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0475353  normal  0.619503 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2647  MCP methyltransferase, CheR-type  74.54 
 
 
277 aa  429  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2143  MCP methyltransferase, CheR-type  74.44 
 
 
273 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255114  hitchhiker  0.000601426 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2107  MCP methyltransferase, CheR-type  74.06 
 
 
273 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.314277  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3760  MCP methyltransferase, CheR-type  73.68 
 
 
273 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0170  MCP methyltransferase, CheR-type  75.47 
 
 
269 aa  424  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2003  MCP methyltransferase, CheR-type  74.06 
 
 
273 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0541882 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2713  chemotaxis protein methyltransferase CheR, putative  73.03 
 
 
288 aa  417  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0583099  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2446  MCP methyltransferase, CheR-type:MCP methyltransferase, CheR-type  69.53 
 
 
280 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.676059  hitchhiker  0.0010522 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2804  MCP methyltransferase, CheR-type  72.95 
 
 
284 aa  414  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2588  MCP methyltransferase, CheR-type  68.95 
 
 
286 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3995  MCP methyltransferase, CheR-type  62.64 
 
 
285 aa  352  5e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.318486  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3830  MCP methyltransferase, CheR-type  59.56 
 
 
279 aa  347  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.109211  normal  0.0246625 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0648  MCP methyltransferase, CheR-type  60.75 
 
 
277 aa  341  8e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687034  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0627  MCP methyltransferase, CheR-type  60.75 
 
 
277 aa  341  1e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4783  MCP methyltransferase CheR-type  53.43 
 
 
279 aa  325  7e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3785  MCP methyltransferase, CheR-type  57.41 
 
 
298 aa  323  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9100  chemotaxis methyltransferase  54.72 
 
 
277 aa  319  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.437866  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1738  MCP methyltransferase, CheR-type  53.68 
 
 
274 aa  317  1e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.123373 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5389  MCP methyltransferase, CheR-type  57.46 
 
 
281 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.087353 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4209  MCP methyltransferase, CheR-type  56.98 
 
 
282 aa  310  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5354  MCP methyltransferase, CheR-type  55.26 
 
 
274 aa  308  5.9999999999999995e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.510015 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1943  MCP methyltransferase, CheR-type  54.68 
 
 
286 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.125019  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1217  MCP methyltransferase, CheR-type  56.34 
 
 
281 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702972  normal  0.558808 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2079  MCP methyltransferase, CheR-type  51.32 
 
 
280 aa  302  5.000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.166097 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4781  MCP methyltransferase, CheR-type  52.57 
 
 
276 aa  296  4e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.735388  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3720  CheR-type protein glutamate methyltransferase  51.27 
 
 
281 aa  288  9e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0021  MCP methyltransferase, CheR-type  51.33 
 
 
277 aa  279  5e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1962  MCP methyltransferase, CheR-type  49.81 
 
 
279 aa  278  6e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0162659  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1268  MCP methyltransferase, CheR-type  49.05 
 
 
269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2258  MCP methyltransferase, CheR-type  51.59 
 
 
273 aa  273  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.232236  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2641  MCP methyltransferase, CheR-type  52.45 
 
 
280 aa  271  7e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0696969  normal  0.649849 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1647  protein-glutamate O-methyltransferase  49.43 
 
 
279 aa  269  5e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4267  methyltransferase, CheR family  47.83 
 
 
285 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109599 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0906  MCP methyltransferase, CheR-type  48.12 
 
 
285 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1036  methyltransferase, CheR family  46.52 
 
 
285 aa  264  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0931  CheR family methyltransferase  46.89 
 
 
285 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0899  chemotaxis protein methyltransferase  46.89 
 
 
285 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.391368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0995  CheR family methyltransferase  46.89 
 
 
285 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1162  methyltransferase, CheR family  47.74 
 
 
285 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3008  MCP methyltransferase, CheR-type  48.29 
 
 
284 aa  261  8e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.47371  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0391  MCP methyltransferase, CheR-type  47.94 
 
 
269 aa  261  8.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.329659 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0916  chemotaxis protein methyltransferase  47.37 
 
 
285 aa  261  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1071  methyltransferase, CheR family  46.52 
 
 
285 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29745e-42 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2077  MCP methyltransferase, CheR-type  48.44 
 
 
277 aa  261  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1089  CheR family methyltransferase  46.52 
 
 
285 aa  260  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1030  MCP methyltransferase, CheR-type  46.86 
 
 
275 aa  258  9e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3336  MCP methyltransferase, CheR-type  51.38 
 
 
277 aa  258  9e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00537558 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3352  protein-glutamate O-methyltransferase  45.49 
 
 
269 aa  254  2.0000000000000002e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.110859  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4246  Protein-glutamate O-methyltransferase  46.99 
 
 
274 aa  253  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.127197  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1033  MCP methyltransferase, CheR-type  45.32 
 
 
269 aa  238  8e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0586  Protein-glutamate O-methyltransferase  45.76 
 
 
274 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0541  protein-glutamate O-methyltransferase  48.92 
 
 
278 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126293  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1001  protein-glutamate O-methyltransferase  45.21 
 
 
275 aa  223  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1134  MCP methyltransferase, CheR-type  42.05 
 
 
271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0014664  normal  0.105937 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2113  MCP methyltransferase, CheR-type  37.96 
 
 
565 aa  200  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.982588  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0288  MCP methyltransferase, CheR-type  36.75 
 
 
369 aa  183  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.891674  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.39 
 
 
1218 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  36.73 
 
 
1408 aa  142  8e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2183  hypothetical protein  32.23 
 
 
980 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.850093 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2448  MCP methyltransferase, CheR-type  36.52 
 
 
258 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000593357  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2355  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  33.33 
 
 
1008 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3046  hypothetical protein  33.09 
 
 
1010 aa  139  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164382 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3183  signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 
1279 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.69 
 
 
1348 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3377  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.77 
 
 
1242 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  32.29 
 
 
1027 aa  135  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  35.44 
 
 
256 aa  135  9e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1246  methyltransferase CheR, putative  34.41 
 
 
1378 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03023  methyltransferase  33.33 
 
 
604 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.361036  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5709  MCP methyltransferase, CheR-type  32.75 
 
 
853 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.729466 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1653  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.19 
 
 
993 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5237  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.54 
 
 
1324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.395635 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.33 
 
 
1535 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.12 
 
 
1306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2549  fused CheR-type MCP methyltransferase and PAS sensor protein  33.85 
 
 
1006 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1788  putative PAS/PAC sensor protein  32.83 
 
 
998 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1716  MCP methyltransferase, CheR-type  33.2 
 
 
856 aa  130  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.92135  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0227  MCP methyltransferase  30.66 
 
 
631 aa  130  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.993793  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6211  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.03 
 
 
1061 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820077  normal  0.703655 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3755  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.62 
 
 
1063 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1609  protein-glutamate O-methyltransferase  31.2 
 
 
259 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00317018  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1600  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.37 
 
 
1000 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3121  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  32.71 
 
 
617 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0152355  normal  0.805919 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1028  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.48 
 
 
1248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.507304 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0563  putative PAS/PAC sensor protein  31.99 
 
 
1035 aa  127  3e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.91 
 
 
1371 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.980757 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5176  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.3 
 
 
1404 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.190634 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  31.21 
 
 
1344 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6264  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.45 
 
 
1163 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1989  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  32.63 
 
 
1110 aa  126  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175442  normal  0.013335 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2045  CheB methylesterase:MCP methyltransferase, CheR-type  32.16 
 
 
868 aa  125  6e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0460  MCP methyltransferase, CheR-type  31.87 
 
 
837 aa  125  8.000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.604812  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0327  putative PAS/PAC sensor protein  30.07 
 
 
1008 aa  125  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.3 
 
 
1215 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  31.63 
 
 
1384 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  31.91 
 
 
1303 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3102  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.97 
 
 
1418 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4422  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.21 
 
 
1274 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.381764  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.42 
 
 
1407 aa  124  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>