More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3720 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_3720  CheR-type protein glutamate methyltransferase  100 
 
 
281 aa  583  1.0000000000000001e-165  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3785  MCP methyltransferase, CheR-type  59.85 
 
 
298 aa  340  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1962  MCP methyltransferase, CheR-type  55.07 
 
 
279 aa  334  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0162659  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0021  MCP methyltransferase, CheR-type  51.69 
 
 
277 aa  293  2e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2641  MCP methyltransferase, CheR-type  50.55 
 
 
280 aa  291  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0696969  normal  0.649849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2143  MCP methyltransferase, CheR-type  52.09 
 
 
273 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255114  hitchhiker  0.000601426 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3760  MCP methyltransferase, CheR-type  52.09 
 
 
273 aa  289  4e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2003  MCP methyltransferase, CheR-type  52.09 
 
 
273 aa  289  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0541882 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4781  MCP methyltransferase, CheR-type  50.19 
 
 
276 aa  288  7e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.735388  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2588  MCP methyltransferase, CheR-type  52.09 
 
 
286 aa  288  7e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1072  MCP methyltransferase, CheR-type  51.27 
 
 
303 aa  288  8e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0475353  normal  0.619503 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3830  MCP methyltransferase, CheR-type  49.27 
 
 
279 aa  285  5e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.109211  normal  0.0246625 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1647  protein-glutamate O-methyltransferase  48.54 
 
 
279 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2107  MCP methyltransferase, CheR-type  50.95 
 
 
273 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.314277  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2647  MCP methyltransferase, CheR-type  50.57 
 
 
277 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0170  MCP methyltransferase, CheR-type  51.71 
 
 
269 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9100  chemotaxis methyltransferase  47.39 
 
 
277 aa  280  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.437866  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2713  chemotaxis protein methyltransferase CheR, putative  50.57 
 
 
288 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0583099  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2804  MCP methyltransferase, CheR-type  49.81 
 
 
284 aa  279  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0906  MCP methyltransferase, CheR-type  50.78 
 
 
285 aa  278  6e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5389  MCP methyltransferase, CheR-type  50.57 
 
 
281 aa  278  8e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.087353 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1036  methyltransferase, CheR family  47.45 
 
 
285 aa  277  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2446  MCP methyltransferase, CheR-type:MCP methyltransferase, CheR-type  49.43 
 
 
280 aa  276  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.676059  hitchhiker  0.0010522 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4267  methyltransferase, CheR family  47.45 
 
 
285 aa  275  7e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1030  MCP methyltransferase, CheR-type  49.81 
 
 
275 aa  275  9e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3995  MCP methyltransferase, CheR-type  48.29 
 
 
285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.318486  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2079  MCP methyltransferase, CheR-type  50.19 
 
 
280 aa  273  3e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.166097 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0391  MCP methyltransferase, CheR-type  49.24 
 
 
269 aa  273  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.329659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1217  MCP methyltransferase, CheR-type  48.75 
 
 
281 aa  271  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702972  normal  0.558808 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0931  CheR family methyltransferase  46.89 
 
 
285 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0899  chemotaxis protein methyltransferase  46.89 
 
 
285 aa  271  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.391368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0995  CheR family methyltransferase  46.89 
 
 
285 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1089  CheR family methyltransferase  48.83 
 
 
285 aa  270  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1071  methyltransferase, CheR family  46.52 
 
 
285 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29745e-42 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1162  methyltransferase, CheR family  46.89 
 
 
285 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4209  MCP methyltransferase, CheR-type  50.57 
 
 
282 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0648  MCP methyltransferase, CheR-type  47.15 
 
 
277 aa  269  4e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687034  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5354  MCP methyltransferase, CheR-type  47.39 
 
 
274 aa  269  5e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.510015 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2258  MCP methyltransferase, CheR-type  48.21 
 
 
273 aa  268  7e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.232236  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0916  chemotaxis protein methyltransferase  46.52 
 
 
285 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0627  MCP methyltransferase, CheR-type  46.77 
 
 
277 aa  267  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1738  MCP methyltransferase, CheR-type  47.97 
 
 
274 aa  268  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.123373 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4783  MCP methyltransferase CheR-type  45.32 
 
 
279 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3352  protein-glutamate O-methyltransferase  45.9 
 
 
269 aa  266  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.110859  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1033  MCP methyltransferase, CheR-type  48.85 
 
 
269 aa  265  7e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3008  MCP methyltransferase, CheR-type  45.76 
 
 
284 aa  261  6.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.47371  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1268  MCP methyltransferase, CheR-type  45.52 
 
 
269 aa  258  8e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1943  MCP methyltransferase, CheR-type  45.59 
 
 
286 aa  257  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.125019  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4246  Protein-glutamate O-methyltransferase  47.01 
 
 
274 aa  257  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.127197  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0586  Protein-glutamate O-methyltransferase  50.21 
 
 
274 aa  251  9.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3336  MCP methyltransferase, CheR-type  48.05 
 
 
277 aa  248  8e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00537558 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2077  MCP methyltransferase, CheR-type  47.45 
 
 
277 aa  248  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0541  protein-glutamate O-methyltransferase  44.28 
 
 
278 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126293  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1001  protein-glutamate O-methyltransferase  45.16 
 
 
275 aa  231  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1134  MCP methyltransferase, CheR-type  39.63 
 
 
271 aa  222  6e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0014664  normal  0.105937 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2113  MCP methyltransferase, CheR-type  38.7 
 
 
565 aa  194  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.982588  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0288  MCP methyltransferase, CheR-type  36.23 
 
 
369 aa  191  9e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.891674  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1653  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.32 
 
 
993 aa  150  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  36.72 
 
 
1361 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  35.91 
 
 
1027 aa  149  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2183  hypothetical protein  31.73 
 
 
980 aa  145  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.850093 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1788  putative PAS/PAC sensor protein  31.25 
 
 
998 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.65 
 
 
1408 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3046  hypothetical protein  36.1 
 
 
1010 aa  143  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164382 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.67 
 
 
1535 aa  143  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4422  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.16 
 
 
1274 aa  142  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.381764  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0227  MCP methyltransferase  34.24 
 
 
631 aa  142  7e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.993793  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0809  MCP methyltransferase, CheR-type  32.64 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0460  MCP methyltransferase, CheR-type  32.6 
 
 
837 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.604812  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.93 
 
 
1218 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2227  MCP methyltransferase, CheR-type  34.19 
 
 
824 aa  139  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1600  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.57 
 
 
1000 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  34.8 
 
 
1222 aa  139  6e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  32.87 
 
 
1160 aa  139  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1246  methyltransferase CheR, putative  32.27 
 
 
1378 aa  139  7e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  33.46 
 
 
1167 aa  139  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  34.07 
 
 
1384 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0471  MCP methyltransferase, CheR-type  32.53 
 
 
282 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0780  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.04 
 
 
887 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2549  fused CheR-type MCP methyltransferase and PAS sensor protein  32.97 
 
 
1006 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4203  MCP methyltransferase, CheR-type  32.64 
 
 
264 aa  135  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0106813  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.1 
 
 
1371 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.980757 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  31.43 
 
 
256 aa  135  7.000000000000001e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2045  CheB methylesterase:MCP methyltransferase, CheR-type  30.14 
 
 
868 aa  135  8e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.13 
 
 
1190 aa  135  8e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5709  MCP methyltransferase, CheR-type  31.56 
 
 
853 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.729466 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.96 
 
 
1380 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.2 
 
 
1306 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3121  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  34.14 
 
 
617 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0152355  normal  0.805919 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0229  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.42 
 
 
1138 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2448  MCP methyltransferase, CheR-type  30.47 
 
 
258 aa  133  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000593357  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2564  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.18 
 
 
1089 aa  133  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2264  putative PAS/PAC sensor protein  31.47 
 
 
1165 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.620072  normal  0.0600346 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2460  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  29.81 
 
 
971 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  31.6 
 
 
1399 aa  132  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0456  protein-glutamate O-methyltransferase  32.62 
 
 
250 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.23 
 
 
1407 aa  132  9e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0327  putative PAS/PAC sensor protein  33.46 
 
 
1008 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5237  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  29.86 
 
 
1324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.395635 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3377  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.7 
 
 
1242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>