More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3008 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3008  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
284 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.47371  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1268  MCP methyltransferase, CheR-type  59.48 
 
 
269 aa  337  9e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4781  MCP methyltransferase, CheR-type  58.58 
 
 
276 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.735388  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3785  MCP methyltransferase, CheR-type  53.7 
 
 
298 aa  305  6e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1036  methyltransferase, CheR family  53.43 
 
 
285 aa  304  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0916  chemotaxis protein methyltransferase  55.64 
 
 
285 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0931  CheR family methyltransferase  53.43 
 
 
285 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0899  chemotaxis protein methyltransferase  53.43 
 
 
285 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.391368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0995  CheR family methyltransferase  53.43 
 
 
285 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1162  methyltransferase, CheR family  55.26 
 
 
285 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1071  methyltransferase, CheR family  53.07 
 
 
285 aa  301  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29745e-42 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1089  CheR family methyltransferase  53.43 
 
 
285 aa  300  1e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4267  methyltransferase, CheR family  53.07 
 
 
285 aa  300  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109599 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0906  MCP methyltransferase, CheR-type  54.89 
 
 
285 aa  298  8e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0170  MCP methyltransferase, CheR-type  49.62 
 
 
269 aa  275  6e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2647  MCP methyltransferase, CheR-type  50.56 
 
 
277 aa  271  7e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1962  MCP methyltransferase, CheR-type  49.26 
 
 
279 aa  271  9e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0162659  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2143  MCP methyltransferase, CheR-type  48.89 
 
 
273 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255114  hitchhiker  0.000601426 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2077  MCP methyltransferase, CheR-type  51.56 
 
 
277 aa  268  7e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2446  MCP methyltransferase, CheR-type:MCP methyltransferase, CheR-type  46.76 
 
 
280 aa  266  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.676059  hitchhiker  0.0010522 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2588  MCP methyltransferase, CheR-type  47.37 
 
 
286 aa  266  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2804  MCP methyltransferase, CheR-type  49.06 
 
 
284 aa  265  4e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2107  MCP methyltransferase, CheR-type  48.15 
 
 
273 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.314277  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2003  MCP methyltransferase, CheR-type  47.78 
 
 
273 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0541882 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2713  chemotaxis protein methyltransferase CheR, putative  45.74 
 
 
288 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0583099  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0021  MCP methyltransferase, CheR-type  47.41 
 
 
277 aa  263  3e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3760  MCP methyltransferase, CheR-type  47.41 
 
 
273 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1072  MCP methyltransferase, CheR-type  48.29 
 
 
303 aa  261  6.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0475353  normal  0.619503 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3720  CheR-type protein glutamate methyltransferase  45.76 
 
 
281 aa  261  8e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3352  protein-glutamate O-methyltransferase  47.58 
 
 
269 aa  259  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.110859  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1647  protein-glutamate O-methyltransferase  50.75 
 
 
279 aa  259  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0541  protein-glutamate O-methyltransferase  49.62 
 
 
278 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126293  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0391  MCP methyltransferase, CheR-type  47.01 
 
 
269 aa  254  9e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.329659 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1033  MCP methyltransferase, CheR-type  48.31 
 
 
269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9100  chemotaxis methyltransferase  44.98 
 
 
277 aa  253  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.437866  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3995  MCP methyltransferase, CheR-type  43.32 
 
 
285 aa  249  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.318486  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3830  MCP methyltransferase, CheR-type  42.05 
 
 
279 aa  246  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.109211  normal  0.0246625 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1030  MCP methyltransferase, CheR-type  45.35 
 
 
275 aa  247  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0648  MCP methyltransferase, CheR-type  42.65 
 
 
277 aa  247  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687034  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0627  MCP methyltransferase, CheR-type  42.65 
 
 
277 aa  246  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3336  MCP methyltransferase, CheR-type  49.01 
 
 
277 aa  245  6e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00537558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2258  MCP methyltransferase, CheR-type  48.02 
 
 
273 aa  244  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.232236  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4783  MCP methyltransferase CheR-type  40.36 
 
 
279 aa  238  6.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5389  MCP methyltransferase, CheR-type  44.32 
 
 
281 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.087353 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5354  MCP methyltransferase, CheR-type  43.28 
 
 
274 aa  236  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.510015 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1217  MCP methyltransferase, CheR-type  44.32 
 
 
281 aa  234  9e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702972  normal  0.558808 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2079  MCP methyltransferase, CheR-type  43.22 
 
 
280 aa  233  3e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.166097 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2641  MCP methyltransferase, CheR-type  43.12 
 
 
280 aa  231  9e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0696969  normal  0.649849 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4209  MCP methyltransferase, CheR-type  43.56 
 
 
282 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1943  MCP methyltransferase, CheR-type  44.15 
 
 
286 aa  230  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.125019  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4246  Protein-glutamate O-methyltransferase  45.63 
 
 
274 aa  229  5e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.127197  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1738  MCP methyltransferase, CheR-type  42.65 
 
 
274 aa  228  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.123373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0586  Protein-glutamate O-methyltransferase  42.46 
 
 
274 aa  203  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1001  protein-glutamate O-methyltransferase  42.11 
 
 
275 aa  202  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0288  MCP methyltransferase, CheR-type  38.52 
 
 
369 aa  198  7.999999999999999e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.891674  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1134  MCP methyltransferase, CheR-type  37.92 
 
 
271 aa  194  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0014664  normal  0.105937 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2113  MCP methyltransferase, CheR-type  36.43 
 
 
565 aa  176  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.982588  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2183  hypothetical protein  33.2 
 
 
980 aa  137  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.850093 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  33.19 
 
 
256 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1246  methyltransferase CheR, putative  31.84 
 
 
1378 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3046  hypothetical protein  33.97 
 
 
1010 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164382 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2549  fused CheR-type MCP methyltransferase and PAS sensor protein  33.33 
 
 
1006 aa  132  5e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0227  MCP methyltransferase  29.82 
 
 
631 aa  132  6e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.993793  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1118  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  33.2 
 
 
852 aa  132  7.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.742809 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0809  MCP methyltransferase, CheR-type  33.21 
 
 
269 aa  130  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.62 
 
 
1348 aa  129  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0983  chemotaxis protein methyltransferase  34.69 
 
 
302 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.27 
 
 
1361 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  32.39 
 
 
1399 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1788  putative PAS/PAC sensor protein  31.56 
 
 
998 aa  125  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  32.97 
 
 
1344 aa  125  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.19 
 
 
1408 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7206  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.25 
 
 
1499 aa  124  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5709  MCP methyltransferase, CheR-type  31.16 
 
 
853 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.729466 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2564  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.45 
 
 
1089 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0471  MCP methyltransferase, CheR-type  31.6 
 
 
282 aa  124  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.33 
 
 
1218 aa  123  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  30.89 
 
 
1160 aa  123  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1653  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.54 
 
 
993 aa  122  5e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0460  MCP methyltransferase, CheR-type  30.92 
 
 
837 aa  122  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.604812  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2384  protein-glutamate O-methyltransferase  31.22 
 
 
256 aa  122  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.95 
 
 
1215 aa  122  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2227  MCP methyltransferase, CheR-type  32.56 
 
 
824 aa  122  7e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3212  MCP methyltransferase, CheR-type  30.5 
 
 
291 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.409906  hitchhiker  0.0000000000690371 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0456  protein-glutamate O-methyltransferase  35.53 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.79 
 
 
1407 aa  121  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  32.68 
 
 
1384 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1609  protein-glutamate O-methyltransferase  30.71 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00317018  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5175  MCP methyltransferase, CheR-type  31.56 
 
 
823 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.367936 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4430  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.77 
 
 
1158 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  32.43 
 
 
1303 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.58 
 
 
1167 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0780  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30 
 
 
887 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0310  MCP methyltransferase, CheR-type  30.62 
 
 
1149 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.512157  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5237  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  28.57 
 
 
1324 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.395635 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1740  protein-glutamate O-methyltransferase  32.24 
 
 
269 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2045  CheB methylesterase:MCP methyltransferase, CheR-type  31.3 
 
 
868 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12648  Signal Transduction Histidine Kinase (STHK) with CheB and CheRactivity  32.59 
 
 
1200 aa  119  4.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1545  protein-glutamate O-methyltransferase  32.02 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.474689  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.21 
 
 
1306 aa  119  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>