More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5389 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5389  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
281 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.087353 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1217  MCP methyltransferase, CheR-type  95.37 
 
 
281 aa  549  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702972  normal  0.558808 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4209  MCP methyltransferase, CheR-type  86.91 
 
 
282 aa  490  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3995  MCP methyltransferase, CheR-type  64.29 
 
 
285 aa  360  1e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.318486  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9100  chemotaxis methyltransferase  64.15 
 
 
277 aa  357  9.999999999999999e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.437866  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0648  MCP methyltransferase, CheR-type  63.74 
 
 
277 aa  353  2e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687034  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0627  MCP methyltransferase, CheR-type  63.74 
 
 
277 aa  352  2.9999999999999997e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4783  MCP methyltransferase CheR-type  60.38 
 
 
279 aa  344  8e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2588  MCP methyltransferase, CheR-type  58.8 
 
 
286 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3830  MCP methyltransferase, CheR-type  62.78 
 
 
279 aa  340  1e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.109211  normal  0.0246625 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0170  MCP methyltransferase, CheR-type  61.28 
 
 
269 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5354  MCP methyltransferase, CheR-type  62.26 
 
 
274 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.510015 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2804  MCP methyltransferase, CheR-type  59.56 
 
 
284 aa  335  5.999999999999999e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1943  MCP methyltransferase, CheR-type  61.74 
 
 
286 aa  333  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.125019  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1738  MCP methyltransferase, CheR-type  63.16 
 
 
274 aa  332  6e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.123373 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2143  MCP methyltransferase, CheR-type  57.74 
 
 
273 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255114  hitchhiker  0.000601426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2713  chemotaxis protein methyltransferase CheR, putative  56.02 
 
 
288 aa  323  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0583099  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2647  MCP methyltransferase, CheR-type  56.6 
 
 
277 aa  323  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3760  MCP methyltransferase, CheR-type  56.6 
 
 
273 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2107  MCP methyltransferase, CheR-type  56.23 
 
 
273 aa  319  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.314277  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2003  MCP methyltransferase, CheR-type  56.23 
 
 
273 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0541882 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2446  MCP methyltransferase, CheR-type:MCP methyltransferase, CheR-type  54.24 
 
 
280 aa  314  8e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.676059  hitchhiker  0.0010522 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1072  MCP methyltransferase, CheR-type  57.46 
 
 
303 aa  312  3.9999999999999997e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0475353  normal  0.619503 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3720  CheR-type protein glutamate methyltransferase  50.57 
 
 
281 aa  278  8e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3785  MCP methyltransferase, CheR-type  48.5 
 
 
298 aa  276  4e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4781  MCP methyltransferase, CheR-type  48.68 
 
 
276 aa  265  5.999999999999999e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.735388  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0021  MCP methyltransferase, CheR-type  50.19 
 
 
277 aa  264  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1962  MCP methyltransferase, CheR-type  46.42 
 
 
279 aa  263  3e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0162659  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2641  MCP methyltransferase, CheR-type  50 
 
 
280 aa  255  5e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0696969  normal  0.649849 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1036  methyltransferase, CheR family  44.53 
 
 
285 aa  255  7e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4267  methyltransferase, CheR family  44.53 
 
 
285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109599 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0931  CheR family methyltransferase  44.91 
 
 
285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0899  chemotaxis protein methyltransferase  44.91 
 
 
285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.391368  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1162  methyltransferase, CheR family  44.91 
 
 
285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0995  CheR family methyltransferase  44.91 
 
 
285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0916  chemotaxis protein methyltransferase  44.91 
 
 
285 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0906  MCP methyltransferase, CheR-type  44.53 
 
 
285 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2079  MCP methyltransferase, CheR-type  42.14 
 
 
280 aa  252  5.000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.166097 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1071  methyltransferase, CheR family  44.53 
 
 
285 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29745e-42 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1089  CheR family methyltransferase  44.53 
 
 
285 aa  251  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1268  MCP methyltransferase, CheR-type  46.21 
 
 
269 aa  247  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2258  MCP methyltransferase, CheR-type  45 
 
 
273 aa  248  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.232236  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1647  protein-glutamate O-methyltransferase  46.79 
 
 
279 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3008  MCP methyltransferase, CheR-type  44.32 
 
 
284 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.47371  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0391  MCP methyltransferase, CheR-type  42.21 
 
 
269 aa  229  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.329659 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1033  MCP methyltransferase, CheR-type  42.05 
 
 
269 aa  227  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4246  Protein-glutamate O-methyltransferase  41.51 
 
 
274 aa  225  6e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.127197  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3352  protein-glutamate O-methyltransferase  41.13 
 
 
269 aa  223  4e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.110859  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3336  MCP methyltransferase, CheR-type  44.05 
 
 
277 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00537558 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1030  MCP methyltransferase, CheR-type  40.74 
 
 
275 aa  219  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0541  protein-glutamate O-methyltransferase  50.68 
 
 
278 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126293  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0586  Protein-glutamate O-methyltransferase  44.4 
 
 
274 aa  218  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2077  MCP methyltransferase, CheR-type  42.97 
 
 
277 aa  212  4.9999999999999996e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1134  MCP methyltransferase, CheR-type  42.21 
 
 
271 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0014664  normal  0.105937 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1001  protein-glutamate O-methyltransferase  41.98 
 
 
275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0288  MCP methyltransferase, CheR-type  31.14 
 
 
369 aa  170  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.891674  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2113  MCP methyltransferase, CheR-type  33.72 
 
 
565 aa  162  8.000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.982588  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3046  hypothetical protein  33.7 
 
 
1010 aa  138  7.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164382 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  35 
 
 
1027 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2045  CheB methylesterase:MCP methyltransferase, CheR-type  34.73 
 
 
868 aa  133  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2183  hypothetical protein  30.91 
 
 
980 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.850093 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.57 
 
 
1348 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.82 
 
 
1215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1118  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.1 
 
 
852 aa  126  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.742809 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0809  MCP methyltransferase, CheR-type  31.75 
 
 
269 aa  125  6e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1788  putative PAS/PAC sensor protein  31.94 
 
 
998 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  34.65 
 
 
256 aa  123  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.63 
 
 
1218 aa  123  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3183  signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
1279 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4605  MCP methyltransferase, CheR-type  31.42 
 
 
1092 aa  122  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315944  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1653  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.08 
 
 
993 aa  122  7e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7206  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.25 
 
 
1499 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  31.66 
 
 
1399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  31.23 
 
 
1222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2264  putative PAS/PAC sensor protein  31.91 
 
 
1165 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.620072  normal  0.0600346 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.9 
 
 
1408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.27 
 
 
1453 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4422  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.82 
 
 
1274 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.381764  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.21 
 
 
1380 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3377  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.85 
 
 
1242 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0327  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
1008 aa  119  6e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1246  methyltransferase CheR, putative  32.47 
 
 
1378 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2549  fused CheR-type MCP methyltransferase and PAS sensor protein  30.8 
 
 
1006 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  31.56 
 
 
1170 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2448  MCP methyltransferase, CheR-type  31 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000593357  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0905  putative PAS/PAC sensor protein  31.56 
 
 
1170 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.968727 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.07 
 
 
1407 aa  117  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1716  MCP methyltransferase, CheR-type  32.47 
 
 
856 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.92135  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  34.14 
 
 
1384 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3640  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  29.63 
 
 
1303 aa  116  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.581797 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2460  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.73 
 
 
971 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.96 
 
 
1371 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.980757 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1600  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.71 
 
 
1000 aa  116  5e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.95 
 
 
1167 aa  115  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0713  MCP methyltransferase, CheR-type  31.15 
 
 
256 aa  115  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2975  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.45 
 
 
1084 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.62 
 
 
1445 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0780  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.68 
 
 
887 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03023  methyltransferase  33.96 
 
 
604 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.361036  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1028  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30 
 
 
1248 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.507304 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>