More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0391 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0391  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
269 aa  551  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.329659 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1033  MCP methyltransferase, CheR-type  75.66 
 
 
269 aa  426  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3352  protein-glutamate O-methyltransferase  66.42 
 
 
269 aa  386  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.110859  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4246  Protein-glutamate O-methyltransferase  68.28 
 
 
274 aa  379  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.127197  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3336  MCP methyltransferase, CheR-type  67.06 
 
 
277 aa  342  2.9999999999999997e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00537558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2258  MCP methyltransferase, CheR-type  55.38 
 
 
273 aa  290  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.232236  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1030  MCP methyltransferase, CheR-type  53.91 
 
 
275 aa  286  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4781  MCP methyltransferase, CheR-type  48.51 
 
 
276 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.735388  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3720  CheR-type protein glutamate methyltransferase  49.24 
 
 
281 aa  273  3e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1036  methyltransferase, CheR family  48.86 
 
 
285 aa  271  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1268  MCP methyltransferase, CheR-type  50 
 
 
269 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0906  MCP methyltransferase, CheR-type  48.11 
 
 
285 aa  268  7e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1089  CheR family methyltransferase  48.48 
 
 
285 aa  268  8e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3785  MCP methyltransferase, CheR-type  49.81 
 
 
298 aa  268  8e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0916  chemotaxis protein methyltransferase  48.11 
 
 
285 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2079  MCP methyltransferase, CheR-type  47.74 
 
 
280 aa  268  8.999999999999999e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.166097 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1071  methyltransferase, CheR family  48.11 
 
 
285 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29745e-42 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1162  methyltransferase, CheR family  47.73 
 
 
285 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0931  CheR family methyltransferase  47.73 
 
 
285 aa  265  8e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0899  chemotaxis protein methyltransferase  47.73 
 
 
285 aa  265  8e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.391368  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4267  methyltransferase, CheR family  47.73 
 
 
285 aa  265  8e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109599 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0995  CheR family methyltransferase  47.73 
 
 
285 aa  265  8e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1962  MCP methyltransferase, CheR-type  49.07 
 
 
279 aa  264  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0162659  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1072  MCP methyltransferase, CheR-type  47.94 
 
 
303 aa  261  8e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0475353  normal  0.619503 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0021  MCP methyltransferase, CheR-type  49.25 
 
 
277 aa  260  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1647  protein-glutamate O-methyltransferase  46.77 
 
 
279 aa  259  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2588  MCP methyltransferase, CheR-type  48.11 
 
 
286 aa  259  3e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2143  MCP methyltransferase, CheR-type  48.68 
 
 
273 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255114  hitchhiker  0.000601426 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2647  MCP methyltransferase, CheR-type  47.55 
 
 
277 aa  258  8e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2446  MCP methyltransferase, CheR-type:MCP methyltransferase, CheR-type  47.35 
 
 
280 aa  255  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.676059  hitchhiker  0.0010522 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0170  MCP methyltransferase, CheR-type  46.27 
 
 
269 aa  256  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2107  MCP methyltransferase, CheR-type  47.81 
 
 
273 aa  255  5e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.314277  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3008  MCP methyltransferase, CheR-type  47.01 
 
 
284 aa  254  8e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.47371  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2003  MCP methyltransferase, CheR-type  47.92 
 
 
273 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0541882 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3760  MCP methyltransferase, CheR-type  47.55 
 
 
273 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5354  MCP methyltransferase, CheR-type  46.27 
 
 
274 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.510015 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2713  chemotaxis protein methyltransferase CheR, putative  46.79 
 
 
288 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0583099  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2804  MCP methyltransferase, CheR-type  46.04 
 
 
284 aa  252  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2641  MCP methyltransferase, CheR-type  45.63 
 
 
280 aa  250  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0696969  normal  0.649849 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0586  Protein-glutamate O-methyltransferase  46.47 
 
 
274 aa  250  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2077  MCP methyltransferase, CheR-type  49.8 
 
 
277 aa  248  8e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3830  MCP methyltransferase, CheR-type  45.38 
 
 
279 aa  242  6e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.109211  normal  0.0246625 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3995  MCP methyltransferase, CheR-type  45.04 
 
 
285 aa  240  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.318486  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9100  chemotaxis methyltransferase  42.32 
 
 
277 aa  237  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.437866  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1943  MCP methyltransferase, CheR-type  44.53 
 
 
286 aa  234  8e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.125019  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1738  MCP methyltransferase, CheR-type  42.8 
 
 
274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.123373 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5389  MCP methyltransferase, CheR-type  42.21 
 
 
281 aa  229  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.087353 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0648  MCP methyltransferase, CheR-type  42.26 
 
 
277 aa  228  8e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687034  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0627  MCP methyltransferase, CheR-type  42.26 
 
 
277 aa  228  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4783  MCP methyltransferase CheR-type  42.7 
 
 
279 aa  226  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0541  protein-glutamate O-methyltransferase  42.86 
 
 
278 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126293  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4209  MCP methyltransferase, CheR-type  41.44 
 
 
282 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1217  MCP methyltransferase, CheR-type  42.26 
 
 
281 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702972  normal  0.558808 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1001  protein-glutamate O-methyltransferase  45.12 
 
 
275 aa  223  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1134  MCP methyltransferase, CheR-type  40.15 
 
 
271 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0014664  normal  0.105937 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2113  MCP methyltransferase, CheR-type  39.44 
 
 
565 aa  188  8e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.982588  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0288  MCP methyltransferase, CheR-type  37.75 
 
 
369 aa  185  7e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.891674  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  37.39 
 
 
256 aa  158  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2045  CheB methylesterase:MCP methyltransferase, CheR-type  30.08 
 
 
868 aa  146  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.33 
 
 
1408 aa  143  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2183  hypothetical protein  33.76 
 
 
980 aa  142  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.850093 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3046  hypothetical protein  34.77 
 
 
1010 aa  142  6e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164382 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2384  protein-glutamate O-methyltransferase  32.1 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1653  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.86 
 
 
993 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3013  MCP methyltransferase, CheR-type  35.59 
 
 
877 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404945  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.21 
 
 
1348 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2549  fused CheR-type MCP methyltransferase and PAS sensor protein  32.97 
 
 
1006 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1600  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.71 
 
 
1000 aa  139  6e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1788  putative PAS/PAC sensor protein  33.05 
 
 
998 aa  137  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  33.47 
 
 
1027 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  29.8 
 
 
1371 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.980757 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1740  protein-glutamate O-methyltransferase  35.09 
 
 
269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  34.18 
 
 
1303 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1609  protein-glutamate O-methyltransferase  33.47 
 
 
259 aa  136  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00317018  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0780  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.57 
 
 
887 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  32.94 
 
 
1344 aa  135  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0229  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.38 
 
 
1138 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4203  MCP methyltransferase, CheR-type  33.91 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0106813  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.15 
 
 
1190 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.62 
 
 
1361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0399  MCP methyltransferase, CheR-type  30.83 
 
 
820 aa  133  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1604  MCP methyltransferase, CheR-type  32.4 
 
 
260 aa  133  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0143514  unclonable  1.76137e-23 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0563  putative PAS/PAC sensor protein  31.12 
 
 
1035 aa  132  5e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  30.43 
 
 
1160 aa  132  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  31.51 
 
 
1222 aa  132  7.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2448  MCP methyltransferase, CheR-type  32.2 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000593357  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.8 
 
 
1445 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  31.91 
 
 
1384 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1716  MCP methyltransferase, CheR-type  29.92 
 
 
856 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.92135  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2460  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  29.8 
 
 
971 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.25 
 
 
1407 aa  130  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1118  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.66 
 
 
852 aa  130  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.742809 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  29.46 
 
 
1218 aa  130  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0695  protein-glutamate O-methyltransferase  34.76 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.65 
 
 
1380 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  32.69 
 
 
1399 aa  128  8.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0809  MCP methyltransferase, CheR-type  30.4 
 
 
269 aa  128  8.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3183  signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
1279 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1237  chemotaxis response regulator (methyltransferase)  31.87 
 
 
1618 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0310  MCP methyltransferase, CheR-type  32.1 
 
 
1149 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.512157  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>