More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1268 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1268  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
269 aa  560  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3008  MCP methyltransferase, CheR-type  59.48 
 
 
284 aa  337  9e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.47371  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0916  chemotaxis protein methyltransferase  56.02 
 
 
285 aa  317  1e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1036  methyltransferase, CheR family  55.06 
 
 
285 aa  317  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0906  MCP methyltransferase, CheR-type  55.06 
 
 
285 aa  315  5e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0931  CheR family methyltransferase  55.26 
 
 
285 aa  313  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0899  chemotaxis protein methyltransferase  55.26 
 
 
285 aa  313  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.391368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0995  CheR family methyltransferase  55.26 
 
 
285 aa  313  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1162  methyltransferase, CheR family  55.64 
 
 
285 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4781  MCP methyltransferase, CheR-type  55.22 
 
 
276 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.735388  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1089  CheR family methyltransferase  55.26 
 
 
285 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1071  methyltransferase, CheR family  54.89 
 
 
285 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29745e-42 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4267  methyltransferase, CheR family  54.31 
 
 
285 aa  310  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109599 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3785  MCP methyltransferase, CheR-type  54.14 
 
 
298 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2647  MCP methyltransferase, CheR-type  51.52 
 
 
277 aa  285  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2446  MCP methyltransferase, CheR-type:MCP methyltransferase, CheR-type  49.81 
 
 
280 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.676059  hitchhiker  0.0010522 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4783  MCP methyltransferase CheR-type  48.69 
 
 
279 aa  279  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2713  chemotaxis protein methyltransferase CheR, putative  50 
 
 
288 aa  278  5e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0583099  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2143  MCP methyltransferase, CheR-type  50.38 
 
 
273 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255114  hitchhiker  0.000601426 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0021  MCP methyltransferase, CheR-type  49.25 
 
 
277 aa  276  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2003  MCP methyltransferase, CheR-type  50 
 
 
273 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0541882 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3760  MCP methyltransferase, CheR-type  50 
 
 
273 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2077  MCP methyltransferase, CheR-type  51.16 
 
 
277 aa  273  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9100  chemotaxis methyltransferase  47.94 
 
 
277 aa  273  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.437866  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1072  MCP methyltransferase, CheR-type  49.05 
 
 
303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0475353  normal  0.619503 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2107  MCP methyltransferase, CheR-type  49.62 
 
 
273 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.314277  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0391  MCP methyltransferase, CheR-type  50 
 
 
269 aa  270  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.329659 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2588  MCP methyltransferase, CheR-type  49.43 
 
 
286 aa  270  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1033  MCP methyltransferase, CheR-type  49.44 
 
 
269 aa  265  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3995  MCP methyltransferase, CheR-type  46.59 
 
 
285 aa  265  7e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.318486  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0170  MCP methyltransferase, CheR-type  47.74 
 
 
269 aa  264  8.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3336  MCP methyltransferase, CheR-type  51.59 
 
 
277 aa  262  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00537558 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3352  protein-glutamate O-methyltransferase  46.1 
 
 
269 aa  262  4e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.110859  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1647  protein-glutamate O-methyltransferase  48.13 
 
 
279 aa  261  6e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2804  MCP methyltransferase, CheR-type  48.11 
 
 
284 aa  260  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1962  MCP methyltransferase, CheR-type  47.76 
 
 
279 aa  259  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0162659  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5354  MCP methyltransferase, CheR-type  45.9 
 
 
274 aa  259  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.510015 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3720  CheR-type protein glutamate methyltransferase  45.52 
 
 
281 aa  258  7e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3830  MCP methyltransferase, CheR-type  45.83 
 
 
279 aa  255  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.109211  normal  0.0246625 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1738  MCP methyltransferase, CheR-type  47.17 
 
 
274 aa  254  7e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.123373 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0627  MCP methyltransferase, CheR-type  46.21 
 
 
277 aa  255  7e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0648  MCP methyltransferase, CheR-type  46.21 
 
 
277 aa  254  8e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687034  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2079  MCP methyltransferase, CheR-type  45.28 
 
 
280 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.166097 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2258  MCP methyltransferase, CheR-type  48.21 
 
 
273 aa  251  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.232236  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0541  protein-glutamate O-methyltransferase  46.62 
 
 
278 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126293  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5389  MCP methyltransferase, CheR-type  46.21 
 
 
281 aa  247  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.087353 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2641  MCP methyltransferase, CheR-type  46.59 
 
 
280 aa  246  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0696969  normal  0.649849 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1943  MCP methyltransferase, CheR-type  45.28 
 
 
286 aa  244  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.125019  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1217  MCP methyltransferase, CheR-type  45.08 
 
 
281 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702972  normal  0.558808 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4246  Protein-glutamate O-methyltransferase  45.63 
 
 
274 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.127197  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1030  MCP methyltransferase, CheR-type  43.77 
 
 
275 aa  234  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4209  MCP methyltransferase, CheR-type  43.18 
 
 
282 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2113  MCP methyltransferase, CheR-type  43.19 
 
 
565 aa  214  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.982588  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0586  Protein-glutamate O-methyltransferase  42.42 
 
 
274 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1001  protein-glutamate O-methyltransferase  43.9 
 
 
275 aa  208  9e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1134  MCP methyltransferase, CheR-type  40.15 
 
 
271 aa  205  6e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0014664  normal  0.105937 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0288  MCP methyltransferase, CheR-type  36.12 
 
 
369 aa  184  9e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.891674  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  33.98 
 
 
1160 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  34.51 
 
 
256 aa  145  6e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2183  hypothetical protein  31.87 
 
 
980 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.850093 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.11 
 
 
1371 aa  141  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.980757 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 
1344 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3046  hypothetical protein  32.35 
 
 
1010 aa  139  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164382 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.05 
 
 
1361 aa  139  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.55 
 
 
1408 aa  139  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0227  MCP methyltransferase  30.97 
 
 
631 aa  137  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.993793  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  32.56 
 
 
1027 aa  136  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.07 
 
 
1380 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2355  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.66 
 
 
1008 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.12 
 
 
1218 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2549  fused CheR-type MCP methyltransferase and PAS sensor protein  31.32 
 
 
1006 aa  133  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1653  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.27 
 
 
993 aa  132  5e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  32.17 
 
 
1303 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  30.63 
 
 
1222 aa  132  9e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1246  methyltransferase CheR, putative  31.78 
 
 
1378 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.36 
 
 
1348 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5237  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.97 
 
 
1324 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.395635 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1716  MCP methyltransferase, CheR-type  31.23 
 
 
856 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.92135  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.89 
 
 
1167 aa  129  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  33.62 
 
 
1384 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6211  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.09 
 
 
1061 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820077  normal  0.703655 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3183  signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 
1279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3377  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.32 
 
 
1242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0983  chemotaxis protein methyltransferase  31.37 
 
 
302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0229  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.33 
 
 
1138 aa  126  5e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0809  MCP methyltransferase, CheR-type  31.56 
 
 
269 aa  124  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3121  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  29.26 
 
 
617 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0152355  normal  0.805919 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6264  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.43 
 
 
1163 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0563  putative PAS/PAC sensor protein  31.44 
 
 
1035 aa  124  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5709  MCP methyltransferase, CheR-type  31.11 
 
 
853 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.729466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4422  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.8 
 
 
1274 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.381764  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5176  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.77 
 
 
1404 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.190634 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0399  MCP methyltransferase, CheR-type  31.48 
 
 
820 aa  123  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2460  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.34 
 
 
971 aa  123  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.65 
 
 
1535 aa  123  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  33.06 
 
 
1193 aa  123  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4430  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  33.06 
 
 
1158 aa  122  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1237  chemotaxis response regulator (methyltransferase)  30.77 
 
 
1618 aa  122  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3755  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.77 
 
 
1063 aa  122  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0954  MCP methyltransferase, CheR-type  32.89 
 
 
281 aa  122  8e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>