More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1033 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1033  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
269 aa  556  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0391  MCP methyltransferase, CheR-type  75.66 
 
 
269 aa  426  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.329659 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4246  Protein-glutamate O-methyltransferase  67.79 
 
 
274 aa  381  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.127197  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3352  protein-glutamate O-methyltransferase  63.3 
 
 
269 aa  365  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.110859  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3336  MCP methyltransferase, CheR-type  63.14 
 
 
277 aa  331  8e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00537558 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4781  MCP methyltransferase, CheR-type  50.19 
 
 
276 aa  286  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.735388  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2258  MCP methyltransferase, CheR-type  55.95 
 
 
273 aa  284  8e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.232236  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1030  MCP methyltransferase, CheR-type  49.44 
 
 
275 aa  275  5e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3785  MCP methyltransferase, CheR-type  49.43 
 
 
298 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1268  MCP methyltransferase, CheR-type  49.44 
 
 
269 aa  265  4e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3720  CheR-type protein glutamate methyltransferase  48.85 
 
 
281 aa  265  5.999999999999999e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1036  methyltransferase, CheR family  48.29 
 
 
285 aa  260  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2079  MCP methyltransferase, CheR-type  47.17 
 
 
280 aa  259  3e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.166097 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1089  CheR family methyltransferase  48.29 
 
 
285 aa  258  7e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0916  chemotaxis protein methyltransferase  47.91 
 
 
285 aa  258  7e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0906  MCP methyltransferase, CheR-type  47.91 
 
 
285 aa  258  8e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4267  methyltransferase, CheR family  47.53 
 
 
285 aa  258  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109599 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1071  methyltransferase, CheR family  47.91 
 
 
285 aa  256  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29745e-42 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1162  methyltransferase, CheR family  47.53 
 
 
285 aa  256  4e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0931  CheR family methyltransferase  47.53 
 
 
285 aa  255  5e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0899  chemotaxis protein methyltransferase  47.53 
 
 
285 aa  255  5e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.391368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0995  CheR family methyltransferase  47.53 
 
 
285 aa  255  5e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3008  MCP methyltransferase, CheR-type  48.31 
 
 
284 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.47371  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1962  MCP methyltransferase, CheR-type  47.94 
 
 
279 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0162659  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0586  Protein-glutamate O-methyltransferase  48.81 
 
 
274 aa  251  7e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2641  MCP methyltransferase, CheR-type  46.39 
 
 
280 aa  248  8e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0696969  normal  0.649849 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3830  MCP methyltransferase, CheR-type  45.28 
 
 
279 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.109211  normal  0.0246625 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2143  MCP methyltransferase, CheR-type  46.42 
 
 
273 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255114  hitchhiker  0.000601426 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0170  MCP methyltransferase, CheR-type  44.61 
 
 
269 aa  242  5e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0021  MCP methyltransferase, CheR-type  46.44 
 
 
277 aa  241  7e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2107  MCP methyltransferase, CheR-type  47.17 
 
 
273 aa  241  9e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.314277  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2003  MCP methyltransferase, CheR-type  46.04 
 
 
273 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0541882 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3760  MCP methyltransferase, CheR-type  46.04 
 
 
273 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5354  MCP methyltransferase, CheR-type  46.18 
 
 
274 aa  238  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.510015 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1072  MCP methyltransferase, CheR-type  45.32 
 
 
303 aa  238  6.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0475353  normal  0.619503 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2647  MCP methyltransferase, CheR-type  45.28 
 
 
277 aa  236  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2588  MCP methyltransferase, CheR-type  46.01 
 
 
286 aa  236  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1647  protein-glutamate O-methyltransferase  44.7 
 
 
279 aa  235  7e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9100  chemotaxis methyltransferase  43.45 
 
 
277 aa  235  7e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.437866  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2077  MCP methyltransferase, CheR-type  49.21 
 
 
277 aa  234  8e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2446  MCP methyltransferase, CheR-type:MCP methyltransferase, CheR-type  44.49 
 
 
280 aa  234  9e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.676059  hitchhiker  0.0010522 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3995  MCP methyltransferase, CheR-type  44.27 
 
 
285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.318486  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4783  MCP methyltransferase CheR-type  44.4 
 
 
279 aa  233  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1943  MCP methyltransferase, CheR-type  44.53 
 
 
286 aa  233  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.125019  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2713  chemotaxis protein methyltransferase CheR, putative  43.61 
 
 
288 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0583099  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2804  MCP methyltransferase, CheR-type  43.07 
 
 
284 aa  228  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1217  MCP methyltransferase, CheR-type  42.48 
 
 
281 aa  226  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702972  normal  0.558808 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5389  MCP methyltransferase, CheR-type  42.05 
 
 
281 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.087353 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0648  MCP methyltransferase, CheR-type  41.95 
 
 
277 aa  224  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687034  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0627  MCP methyltransferase, CheR-type  41.95 
 
 
277 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4209  MCP methyltransferase, CheR-type  42.64 
 
 
282 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1001  protein-glutamate O-methyltransferase  45.12 
 
 
275 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0541  protein-glutamate O-methyltransferase  44.93 
 
 
278 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126293  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1134  MCP methyltransferase, CheR-type  39.77 
 
 
271 aa  211  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0014664  normal  0.105937 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1738  MCP methyltransferase, CheR-type  40.68 
 
 
274 aa  205  7e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.123373 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0288  MCP methyltransferase, CheR-type  37.14 
 
 
369 aa  186  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.891674  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2113  MCP methyltransferase, CheR-type  36.4 
 
 
565 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.982588  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  34.14 
 
 
256 aa  149  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3046  hypothetical protein  34.57 
 
 
1010 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164382 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  34.96 
 
 
1399 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.68 
 
 
1371 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.980757 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1246  methyltransferase CheR, putative  34.45 
 
 
1378 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1740  protein-glutamate O-methyltransferase  35.96 
 
 
269 aa  138  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1653  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.28 
 
 
993 aa  137  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.05 
 
 
1408 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2448  MCP methyltransferase, CheR-type  32 
 
 
258 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000593357  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2183  hypothetical protein  33.33 
 
 
980 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.850093 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.89 
 
 
1407 aa  134  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2384  protein-glutamate O-methyltransferase  30.86 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  32.42 
 
 
1303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.91 
 
 
1361 aa  133  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0695  protein-glutamate O-methyltransferase  32.75 
 
 
259 aa  132  7.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0471  MCP methyltransferase, CheR-type  32.79 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1609  protein-glutamate O-methyltransferase  31.88 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00317018  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  33.75 
 
 
1190 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0809  MCP methyltransferase, CheR-type  30.52 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0780  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  33.6 
 
 
887 aa  130  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1788  putative PAS/PAC sensor protein  33.74 
 
 
998 aa  130  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  31.91 
 
 
1344 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1118  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.69 
 
 
852 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.742809 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2549  fused CheR-type MCP methyltransferase and PAS sensor protein  31.4 
 
 
1006 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1600  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.1 
 
 
1000 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.78 
 
 
1380 aa  129  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.66 
 
 
1348 aa  129  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  29.2 
 
 
1160 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3013  MCP methyltransferase, CheR-type  31.33 
 
 
877 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404945  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3183  signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 
1279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0399  MCP methyltransferase, CheR-type  29.64 
 
 
820 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0456  protein-glutamate O-methyltransferase  33.48 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0370  protein-glutamate O-methyltransferase  34.66 
 
 
639 aa  127  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.181962  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4605  MCP methyltransferase, CheR-type  32.64 
 
 
1092 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315944  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  29.18 
 
 
1218 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2045  CheB methylesterase:MCP methyltransferase, CheR-type  29.92 
 
 
868 aa  126  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3377  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  29.3 
 
 
1242 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0563  putative PAS/PAC sensor protein  31.89 
 
 
1035 aa  125  5e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0310  MCP methyltransferase, CheR-type  32.3 
 
 
1149 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.512157  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1989  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  32.58 
 
 
1110 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175442  normal  0.013335 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0472  MCP methyltransferase, CheR-type  30.43 
 
 
256 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4430  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.25 
 
 
1158 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.7 
 
 
1306 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>