More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2804 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_2804  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
284 aa  580  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0170  MCP methyltransferase, CheR-type  75.47 
 
 
269 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1072  MCP methyltransferase, CheR-type  72.95 
 
 
303 aa  414  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0475353  normal  0.619503 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2647  MCP methyltransferase, CheR-type  72.01 
 
 
277 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2143  MCP methyltransferase, CheR-type  71.64 
 
 
273 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255114  hitchhiker  0.000601426 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2446  MCP methyltransferase, CheR-type:MCP methyltransferase, CheR-type  70.04 
 
 
280 aa  401  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.676059  hitchhiker  0.0010522 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2713  chemotaxis protein methyltransferase CheR, putative  69.66 
 
 
288 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0583099  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3760  MCP methyltransferase, CheR-type  69.4 
 
 
273 aa  394  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2107  MCP methyltransferase, CheR-type  69.03 
 
 
273 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.314277  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2003  MCP methyltransferase, CheR-type  69.78 
 
 
273 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0541882 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2588  MCP methyltransferase, CheR-type  69.26 
 
 
286 aa  393  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5389  MCP methyltransferase, CheR-type  59.56 
 
 
281 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.087353 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0648  MCP methyltransferase, CheR-type  60.07 
 
 
277 aa  335  5.999999999999999e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687034  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0627  MCP methyltransferase, CheR-type  60.07 
 
 
277 aa  334  9e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3995  MCP methyltransferase, CheR-type  63.02 
 
 
285 aa  334  1e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.318486  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3830  MCP methyltransferase, CheR-type  60.36 
 
 
279 aa  333  3e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.109211  normal  0.0246625 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1217  MCP methyltransferase, CheR-type  58.82 
 
 
281 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702972  normal  0.558808 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4783  MCP methyltransferase CheR-type  57.04 
 
 
279 aa  328  5.0000000000000004e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3785  MCP methyltransferase, CheR-type  55.39 
 
 
298 aa  326  3e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5354  MCP methyltransferase, CheR-type  60 
 
 
274 aa  323  3e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.510015 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4209  MCP methyltransferase, CheR-type  56.99 
 
 
282 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9100  chemotaxis methyltransferase  55.64 
 
 
277 aa  319  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.437866  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1738  MCP methyltransferase, CheR-type  57.36 
 
 
274 aa  309  2.9999999999999997e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.123373 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1943  MCP methyltransferase, CheR-type  58.52 
 
 
286 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.125019  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0021  MCP methyltransferase, CheR-type  54.55 
 
 
277 aa  294  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1962  MCP methyltransferase, CheR-type  50.94 
 
 
279 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0162659  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1647  protein-glutamate O-methyltransferase  51.87 
 
 
279 aa  280  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3720  CheR-type protein glutamate methyltransferase  49.81 
 
 
281 aa  279  3e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4781  MCP methyltransferase, CheR-type  50.72 
 
 
276 aa  278  5e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.735388  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2079  MCP methyltransferase, CheR-type  43.75 
 
 
280 aa  271  1e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.166097 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2258  MCP methyltransferase, CheR-type  48.26 
 
 
273 aa  270  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.232236  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3008  MCP methyltransferase, CheR-type  49.06 
 
 
284 aa  265  4e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.47371  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1268  MCP methyltransferase, CheR-type  48.11 
 
 
269 aa  260  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1036  methyltransferase, CheR family  45.86 
 
 
285 aa  258  7e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0906  MCP methyltransferase, CheR-type  45.86 
 
 
285 aa  256  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0916  chemotaxis protein methyltransferase  45.86 
 
 
285 aa  255  5e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0931  CheR family methyltransferase  45.49 
 
 
285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0899  chemotaxis protein methyltransferase  45.49 
 
 
285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.391368  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1162  methyltransferase, CheR family  45.49 
 
 
285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2641  MCP methyltransferase, CheR-type  48.87 
 
 
280 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0696969  normal  0.649849 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0995  CheR family methyltransferase  45.49 
 
 
285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4267  methyltransferase, CheR family  45.49 
 
 
285 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109599 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1089  CheR family methyltransferase  45.49 
 
 
285 aa  253  3e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1071  methyltransferase, CheR family  45.11 
 
 
285 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29745e-42 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0391  MCP methyltransferase, CheR-type  46.04 
 
 
269 aa  252  5.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.329659 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3352  protein-glutamate O-methyltransferase  44.15 
 
 
269 aa  248  6e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.110859  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2077  MCP methyltransferase, CheR-type  47.66 
 
 
277 aa  246  4e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1030  MCP methyltransferase, CheR-type  45.08 
 
 
275 aa  245  6.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3336  MCP methyltransferase, CheR-type  48.82 
 
 
277 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00537558 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4246  Protein-glutamate O-methyltransferase  44.66 
 
 
274 aa  234  9e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.127197  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1033  MCP methyltransferase, CheR-type  43.07 
 
 
269 aa  228  9e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0586  Protein-glutamate O-methyltransferase  43.35 
 
 
274 aa  223  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0541  protein-glutamate O-methyltransferase  49.77 
 
 
278 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126293  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1001  protein-glutamate O-methyltransferase  44.86 
 
 
275 aa  208  8e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2113  MCP methyltransferase, CheR-type  39.53 
 
 
565 aa  202  7e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.982588  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1134  MCP methyltransferase, CheR-type  39.92 
 
 
271 aa  194  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0014664  normal  0.105937 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0288  MCP methyltransferase, CheR-type  33.2 
 
 
369 aa  178  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.891674  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.78 
 
 
1218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2183  hypothetical protein  31.37 
 
 
980 aa  140  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.850093 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  35.86 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  36.5 
 
 
1535 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1246  methyltransferase CheR, putative  33.71 
 
 
1378 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3046  hypothetical protein  32.39 
 
 
1010 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164382 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1500  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  34.07 
 
 
1483 aa  130  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1716  MCP methyltransferase, CheR-type  33.85 
 
 
856 aa  130  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.92135  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0460  MCP methyltransferase, CheR-type  33.21 
 
 
837 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.604812  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.31 
 
 
1167 aa  126  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4422  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.09 
 
 
1274 aa  125  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.381764  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.62 
 
 
1215 aa  126  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  34.48 
 
 
1027 aa  125  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.2 
 
 
1408 aa  125  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2448  MCP methyltransferase, CheR-type  33.04 
 
 
258 aa  125  7e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000593357  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1653  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.64 
 
 
993 aa  125  9e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5709  MCP methyltransferase, CheR-type  32.73 
 
 
853 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.729466 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0801  MCP methyltransferase, CheR-type  32.49 
 
 
259 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.507771  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1788  putative PAS/PAC sensor protein  35.29 
 
 
998 aa  123  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0833  MCP methyltransferase, CheR-type  32.14 
 
 
260 aa  122  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.29 
 
 
1348 aa  122  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  34.12 
 
 
1384 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2460  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.47 
 
 
971 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1237  chemotaxis response regulator (methyltransferase)  31.49 
 
 
1618 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2384  protein-glutamate O-methyltransferase  32.49 
 
 
256 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2549  fused CheR-type MCP methyltransferase and PAS sensor protein  32.45 
 
 
1006 aa  120  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2045  CheB methylesterase:MCP methyltransferase, CheR-type  33.21 
 
 
868 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2227  MCP methyltransferase, CheR-type  32.31 
 
 
824 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3377  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.71 
 
 
1242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  33.45 
 
 
1303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  33.72 
 
 
1344 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6211  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  35.23 
 
 
1061 aa  119  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820077  normal  0.703655 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03023  methyltransferase  34.8 
 
 
604 aa  119  7.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.361036  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1028  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.87 
 
 
1248 aa  119  7.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.507304 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5237  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.82 
 
 
1324 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.395635 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3183  signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 
1279 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2355  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  29.66 
 
 
1008 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0695  protein-glutamate O-methyltransferase  32.02 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7206  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.63 
 
 
1499 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  34.69 
 
 
1399 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0809  MCP methyltransferase, CheR-type  28.57 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1609  protein-glutamate O-methyltransferase  31.72 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00317018  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.82 
 
 
1371 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.980757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>