More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2079 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2079  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
280 aa  577  1e-164  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.166097 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3785  MCP methyltransferase, CheR-type  54.75 
 
 
298 aa  302  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1072  MCP methyltransferase, CheR-type  51.32 
 
 
303 aa  302  5.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0475353  normal  0.619503 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2647  MCP methyltransferase, CheR-type  51.33 
 
 
277 aa  295  4e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1030  MCP methyltransferase, CheR-type  51.7 
 
 
275 aa  290  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2588  MCP methyltransferase, CheR-type  49.24 
 
 
286 aa  289  4e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2713  chemotaxis protein methyltransferase CheR, putative  49.43 
 
 
288 aa  287  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0583099  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0170  MCP methyltransferase, CheR-type  49.06 
 
 
269 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2446  MCP methyltransferase, CheR-type:MCP methyltransferase, CheR-type  48.86 
 
 
280 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.676059  hitchhiker  0.0010522 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3995  MCP methyltransferase, CheR-type  49.03 
 
 
285 aa  281  6.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.318486  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2258  MCP methyltransferase, CheR-type  50.76 
 
 
273 aa  280  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.232236  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1962  MCP methyltransferase, CheR-type  50.76 
 
 
279 aa  280  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0162659  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2107  MCP methyltransferase, CheR-type  48.67 
 
 
273 aa  279  4e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.314277  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0627  MCP methyltransferase, CheR-type  47.43 
 
 
277 aa  278  8e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0648  MCP methyltransferase, CheR-type  47.43 
 
 
277 aa  277  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687034  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2143  MCP methyltransferase, CheR-type  47.91 
 
 
273 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255114  hitchhiker  0.000601426 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3830  MCP methyltransferase, CheR-type  47.53 
 
 
279 aa  275  7e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.109211  normal  0.0246625 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3760  MCP methyltransferase, CheR-type  47.53 
 
 
273 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2003  MCP methyltransferase, CheR-type  47.53 
 
 
273 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0541882 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3720  CheR-type protein glutamate methyltransferase  50.19 
 
 
281 aa  273  3e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2804  MCP methyltransferase, CheR-type  43.75 
 
 
284 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0391  MCP methyltransferase, CheR-type  47.74 
 
 
269 aa  268  8.999999999999999e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.329659 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4781  MCP methyltransferase, CheR-type  48.48 
 
 
276 aa  267  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.735388  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1071  methyltransferase, CheR family  46.79 
 
 
285 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29745e-42 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0931  CheR family methyltransferase  46.42 
 
 
285 aa  259  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0899  chemotaxis protein methyltransferase  46.42 
 
 
285 aa  259  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.391368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0995  CheR family methyltransferase  46.42 
 
 
285 aa  259  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1162  methyltransferase, CheR family  46.79 
 
 
285 aa  260  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1738  MCP methyltransferase, CheR-type  46.59 
 
 
274 aa  259  3e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.123373 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4267  methyltransferase, CheR family  46.04 
 
 
285 aa  259  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109599 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0021  MCP methyltransferase, CheR-type  46.42 
 
 
277 aa  259  3e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1033  MCP methyltransferase, CheR-type  47.17 
 
 
269 aa  259  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4783  MCP methyltransferase CheR-type  43.18 
 
 
279 aa  259  4e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1036  methyltransferase, CheR family  46.04 
 
 
285 aa  258  6e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1089  CheR family methyltransferase  46.04 
 
 
285 aa  257  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0916  chemotaxis protein methyltransferase  46.42 
 
 
285 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0906  MCP methyltransferase, CheR-type  46.04 
 
 
285 aa  257  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0586  Protein-glutamate O-methyltransferase  48.3 
 
 
274 aa  256  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9100  chemotaxis methyltransferase  42.97 
 
 
277 aa  255  5e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.437866  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5354  MCP methyltransferase, CheR-type  45.45 
 
 
274 aa  254  8e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.510015 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4246  Protein-glutamate O-methyltransferase  46.04 
 
 
274 aa  253  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.127197  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1268  MCP methyltransferase, CheR-type  45.28 
 
 
269 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5389  MCP methyltransferase, CheR-type  42.14 
 
 
281 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.087353 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1647  protein-glutamate O-methyltransferase  47.17 
 
 
279 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3352  protein-glutamate O-methyltransferase  45.9 
 
 
269 aa  251  8.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.110859  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2641  MCP methyltransferase, CheR-type  43.35 
 
 
280 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0696969  normal  0.649849 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3336  MCP methyltransferase, CheR-type  48.41 
 
 
277 aa  249  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00537558 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1217  MCP methyltransferase, CheR-type  43.73 
 
 
281 aa  248  9e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702972  normal  0.558808 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1943  MCP methyltransferase, CheR-type  43.3 
 
 
286 aa  248  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.125019  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4209  MCP methyltransferase, CheR-type  42.21 
 
 
282 aa  242  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2077  MCP methyltransferase, CheR-type  44.96 
 
 
277 aa  242  6e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1001  protein-glutamate O-methyltransferase  42.64 
 
 
275 aa  240  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1134  MCP methyltransferase, CheR-type  44.15 
 
 
271 aa  239  5e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0014664  normal  0.105937 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0541  protein-glutamate O-methyltransferase  44.11 
 
 
278 aa  235  6e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126293  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3008  MCP methyltransferase, CheR-type  43.22 
 
 
284 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.47371  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0288  MCP methyltransferase, CheR-type  40.88 
 
 
369 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.891674  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2113  MCP methyltransferase, CheR-type  39.16 
 
 
565 aa  192  4e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.982588  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1653  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.96 
 
 
993 aa  155  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.7 
 
 
1306 aa  152  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  33.59 
 
 
1027 aa  151  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1246  methyltransferase CheR, putative  34.43 
 
 
1378 aa  150  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0229  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.58 
 
 
1138 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  32.92 
 
 
256 aa  146  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1788  putative PAS/PAC sensor protein  32.58 
 
 
998 aa  145  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1600  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.95 
 
 
1000 aa  144  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2460  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.34 
 
 
971 aa  143  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2162  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB  30.21 
 
 
879 aa  143  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  32.42 
 
 
1399 aa  142  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5237  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  29.18 
 
 
1324 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.395635 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0563  putative PAS/PAC sensor protein  32.71 
 
 
1035 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2549  fused CheR-type MCP methyltransferase and PAS sensor protein  35 
 
 
1006 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2045  CheB methylesterase:MCP methyltransferase, CheR-type  28.87 
 
 
868 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1028  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.43 
 
 
1248 aa  140  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.507304 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.11 
 
 
1535 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  29.68 
 
 
1160 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5709  MCP methyltransferase, CheR-type  29.56 
 
 
853 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.729466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2183  hypothetical protein  31.05 
 
 
980 aa  137  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.850093 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.04 
 
 
1407 aa  137  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.13 
 
 
1445 aa  137  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3046  hypothetical protein  32.84 
 
 
1010 aa  137  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164382 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0801  MCP methyltransferase, CheR-type  31.08 
 
 
259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.507771  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.14 
 
 
1408 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.24 
 
 
1215 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4605  MCP methyltransferase, CheR-type  30.18 
 
 
1092 aa  135  8e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315944  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  31.66 
 
 
1303 aa  135  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1989  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  33.08 
 
 
1110 aa  135  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175442  normal  0.013335 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.05 
 
 
1190 aa  134  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0471  MCP methyltransferase, CheR-type  32.95 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.94 
 
 
1453 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3128  MCP methyltransferase, CheR-type  28.82 
 
 
840 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0177  protein-glutamate O-methyltransferase  31.94 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0809  MCP methyltransferase, CheR-type  31.73 
 
 
269 aa  133  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3121  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  31.37 
 
 
617 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0152355  normal  0.805919 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1840  MCP methyltransferase, CheR-type  28.03 
 
 
840 aa  133  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.603716 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5175  MCP methyltransferase, CheR-type  30.42 
 
 
823 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.367936 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0370  protein-glutamate O-methyltransferase  29.5 
 
 
639 aa  132  6e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.181962  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  27.78 
 
 
1218 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 
1344 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1118  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.92 
 
 
852 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.742809 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5176  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  27.57 
 
 
1404 aa  130  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.190634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>