More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0170 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_0170  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
269 aa  553  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2713  chemotaxis protein methyltransferase CheR, putative  77.07 
 
 
288 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0583099  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2647  MCP methyltransferase, CheR-type  76.23 
 
 
277 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2446  MCP methyltransferase, CheR-type:MCP methyltransferase, CheR-type  76.23 
 
 
280 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.676059  hitchhiker  0.0010522 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2143  MCP methyltransferase, CheR-type  74.72 
 
 
273 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255114  hitchhiker  0.000601426 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2003  MCP methyltransferase, CheR-type  74.72 
 
 
273 aa  431  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0541882 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3760  MCP methyltransferase, CheR-type  74.34 
 
 
273 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1072  MCP methyltransferase, CheR-type  75.47 
 
 
303 aa  424  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0475353  normal  0.619503 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2107  MCP methyltransferase, CheR-type  72.83 
 
 
273 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.314277  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2804  MCP methyltransferase, CheR-type  75.47 
 
 
284 aa  417  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2588  MCP methyltransferase, CheR-type  75.09 
 
 
286 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3995  MCP methyltransferase, CheR-type  67.29 
 
 
285 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.318486  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3830  MCP methyltransferase, CheR-type  67.67 
 
 
279 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.109211  normal  0.0246625 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0627  MCP methyltransferase, CheR-type  66.92 
 
 
277 aa  372  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0648  MCP methyltransferase, CheR-type  66.92 
 
 
277 aa  372  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687034  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4783  MCP methyltransferase CheR-type  60.3 
 
 
279 aa  353  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9100  chemotaxis methyltransferase  60.53 
 
 
277 aa  353  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.437866  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1738  MCP methyltransferase, CheR-type  60.75 
 
 
274 aa  345  5e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.123373 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4209  MCP methyltransferase, CheR-type  61.65 
 
 
282 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5389  MCP methyltransferase, CheR-type  61.28 
 
 
281 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.087353 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1943  MCP methyltransferase, CheR-type  59.62 
 
 
286 aa  335  5e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.125019  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1217  MCP methyltransferase, CheR-type  61.28 
 
 
281 aa  335  7e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702972  normal  0.558808 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5354  MCP methyltransferase, CheR-type  59.77 
 
 
274 aa  333  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.510015 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3785  MCP methyltransferase, CheR-type  53.58 
 
 
298 aa  315  7e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1962  MCP methyltransferase, CheR-type  53.21 
 
 
279 aa  294  8e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0162659  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0021  MCP methyltransferase, CheR-type  53.56 
 
 
277 aa  293  3e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2079  MCP methyltransferase, CheR-type  49.06 
 
 
280 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.166097 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4781  MCP methyltransferase, CheR-type  50.75 
 
 
276 aa  285  5e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.735388  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3720  CheR-type protein glutamate methyltransferase  51.71 
 
 
281 aa  281  7.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1647  protein-glutamate O-methyltransferase  51.32 
 
 
279 aa  278  8e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2258  MCP methyltransferase, CheR-type  49.62 
 
 
273 aa  277  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.232236  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3008  MCP methyltransferase, CheR-type  49.62 
 
 
284 aa  275  5e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.47371  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1268  MCP methyltransferase, CheR-type  47.74 
 
 
269 aa  264  8.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2641  MCP methyltransferase, CheR-type  50.74 
 
 
280 aa  263  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0696969  normal  0.649849 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1036  methyltransferase, CheR family  47.35 
 
 
285 aa  263  3e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4267  methyltransferase, CheR family  46.97 
 
 
285 aa  261  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109599 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0906  MCP methyltransferase, CheR-type  47.35 
 
 
285 aa  259  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1071  methyltransferase, CheR family  47.73 
 
 
285 aa  259  4e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29745e-42 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1162  methyltransferase, CheR family  47.35 
 
 
285 aa  258  8e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0931  CheR family methyltransferase  47.35 
 
 
285 aa  258  9e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0899  chemotaxis protein methyltransferase  47.35 
 
 
285 aa  258  9e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.391368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0995  CheR family methyltransferase  47.35 
 
 
285 aa  258  9e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1089  CheR family methyltransferase  47.35 
 
 
285 aa  258  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0916  chemotaxis protein methyltransferase  47.35 
 
 
285 aa  257  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0391  MCP methyltransferase, CheR-type  46.27 
 
 
269 aa  256  4e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.329659 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1030  MCP methyltransferase, CheR-type  47.91 
 
 
275 aa  254  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3336  MCP methyltransferase, CheR-type  50 
 
 
277 aa  249  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00537558 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4246  Protein-glutamate O-methyltransferase  45.42 
 
 
274 aa  248  9e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.127197  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1033  MCP methyltransferase, CheR-type  44.61 
 
 
269 aa  242  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3352  protein-glutamate O-methyltransferase  43.49 
 
 
269 aa  241  7.999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.110859  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2077  MCP methyltransferase, CheR-type  46.88 
 
 
277 aa  238  5.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0586  Protein-glutamate O-methyltransferase  42.97 
 
 
274 aa  223  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1001  protein-glutamate O-methyltransferase  45.71 
 
 
275 aa  218  7e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0541  protein-glutamate O-methyltransferase  48.4 
 
 
278 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126293  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1134  MCP methyltransferase, CheR-type  41.06 
 
 
271 aa  214  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0014664  normal  0.105937 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2113  MCP methyltransferase, CheR-type  36.57 
 
 
565 aa  186  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.982588  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0288  MCP methyltransferase, CheR-type  35.37 
 
 
369 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.891674  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.13 
 
 
1348 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.2 
 
 
1218 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  35.02 
 
 
256 aa  138  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2183  hypothetical protein  32.46 
 
 
980 aa  136  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.850093 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3046  hypothetical protein  34.09 
 
 
1010 aa  135  8e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164382 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03023  methyltransferase  36.64 
 
 
604 aa  133  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.361036  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0801  MCP methyltransferase, CheR-type  33.33 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.507771  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1653  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.48 
 
 
993 aa  129  6e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.21 
 
 
1408 aa  128  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0809  MCP methyltransferase, CheR-type  30.38 
 
 
269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3121  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  32.71 
 
 
617 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0152355  normal  0.805919 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2384  protein-glutamate O-methyltransferase  32.07 
 
 
256 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5237  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.52 
 
 
1324 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.395635 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.05 
 
 
1453 aa  126  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  32.49 
 
 
1027 aa  126  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 
1344 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.31 
 
 
1306 aa  125  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1500  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  32.85 
 
 
1483 aa  125  9e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  38.37 
 
 
1535 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1716  MCP methyltransferase, CheR-type  32.5 
 
 
856 aa  124  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.92135  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0460  MCP methyltransferase, CheR-type  32.35 
 
 
837 aa  124  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.604812  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.6 
 
 
1215 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6211  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  33.57 
 
 
1061 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820077  normal  0.703655 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0780  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  35.11 
 
 
887 aa  123  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1788  putative PAS/PAC sensor protein  32.17 
 
 
998 aa  123  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2045  CheB methylesterase:MCP methyltransferase, CheR-type  33.46 
 
 
868 aa  122  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  33.59 
 
 
1303 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6264  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  33.33 
 
 
1163 aa  122  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1246  methyltransferase CheR, putative  33.45 
 
 
1378 aa  122  7e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5709  MCP methyltransferase, CheR-type  31.77 
 
 
853 aa  122  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.729466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4422  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.02 
 
 
1274 aa  122  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.381764  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0227  MCP methyltransferase  28.68 
 
 
631 aa  121  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.993793  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0695  protein-glutamate O-methyltransferase  32.47 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  31.46 
 
 
1160 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2448  MCP methyltransferase, CheR-type  31.88 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000593357  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.09 
 
 
1371 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.980757 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3755  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.31 
 
 
1063 aa  119  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1600  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.97 
 
 
1000 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2549  fused CheR-type MCP methyltransferase and PAS sensor protein  29.5 
 
 
1006 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2487  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.33 
 
 
1535 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.162467  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.74 
 
 
1167 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3377  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.23 
 
 
1242 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1740  protein-glutamate O-methyltransferase  34.35 
 
 
269 aa  116  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>