More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0648 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0627  MCP methyltransferase, CheR-type  99.64 
 
 
277 aa  560  1.0000000000000001e-159  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0648  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
277 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687034  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3995  MCP methyltransferase, CheR-type  83.21 
 
 
285 aa  475  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.318486  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3830  MCP methyltransferase, CheR-type  76.17 
 
 
279 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.109211  normal  0.0246625 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0170  MCP methyltransferase, CheR-type  66.92 
 
 
269 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4783  MCP methyltransferase CheR-type  66.04 
 
 
279 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9100  chemotaxis methyltransferase  63.7 
 
 
277 aa  364  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.437866  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1943  MCP methyltransferase, CheR-type  63.16 
 
 
286 aa  355  2.9999999999999997e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.125019  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5389  MCP methyltransferase, CheR-type  63.74 
 
 
281 aa  353  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.087353 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1217  MCP methyltransferase, CheR-type  64.1 
 
 
281 aa  350  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702972  normal  0.558808 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2647  MCP methyltransferase, CheR-type  59.33 
 
 
277 aa  348  4e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3760  MCP methyltransferase, CheR-type  59.34 
 
 
273 aa  346  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2713  chemotaxis protein methyltransferase CheR, putative  57.72 
 
 
288 aa  346  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0583099  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2143  MCP methyltransferase, CheR-type  59.34 
 
 
273 aa  346  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255114  hitchhiker  0.000601426 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2003  MCP methyltransferase, CheR-type  58.97 
 
 
273 aa  345  4e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0541882 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5354  MCP methyltransferase, CheR-type  63.02 
 
 
274 aa  344  7e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.510015 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4209  MCP methyltransferase, CheR-type  62.64 
 
 
282 aa  344  7e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2107  MCP methyltransferase, CheR-type  59.34 
 
 
273 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.314277  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2446  MCP methyltransferase, CheR-type:MCP methyltransferase, CheR-type  57.56 
 
 
280 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.676059  hitchhiker  0.0010522 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1072  MCP methyltransferase, CheR-type  60.75 
 
 
303 aa  341  7e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0475353  normal  0.619503 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1738  MCP methyltransferase, CheR-type  63.02 
 
 
274 aa  340  1e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.123373 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2588  MCP methyltransferase, CheR-type  60.44 
 
 
286 aa  340  2e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2804  MCP methyltransferase, CheR-type  60.07 
 
 
284 aa  335  5e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3785  MCP methyltransferase, CheR-type  48.34 
 
 
298 aa  300  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2079  MCP methyltransferase, CheR-type  47.43 
 
 
280 aa  277  1e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.166097 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0021  MCP methyltransferase, CheR-type  49.26 
 
 
277 aa  276  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3720  CheR-type protein glutamate methyltransferase  47.15 
 
 
281 aa  269  4e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1962  MCP methyltransferase, CheR-type  47.17 
 
 
279 aa  264  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0162659  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4781  MCP methyltransferase, CheR-type  46.79 
 
 
276 aa  263  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.735388  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2258  MCP methyltransferase, CheR-type  46.54 
 
 
273 aa  262  6e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.232236  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1268  MCP methyltransferase, CheR-type  46.21 
 
 
269 aa  254  8e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1647  protein-glutamate O-methyltransferase  47.46 
 
 
279 aa  253  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1036  methyltransferase, CheR family  42.96 
 
 
285 aa  247  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3008  MCP methyltransferase, CheR-type  42.65 
 
 
284 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.47371  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1071  methyltransferase, CheR family  42.91 
 
 
285 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29745e-42 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0906  MCP methyltransferase, CheR-type  42.16 
 
 
285 aa  244  9e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1162  methyltransferase, CheR family  42.54 
 
 
285 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4267  methyltransferase, CheR family  41.79 
 
 
285 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109599 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1089  CheR family methyltransferase  42.54 
 
 
285 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0931  CheR family methyltransferase  42.54 
 
 
285 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0899  chemotaxis protein methyltransferase  42.54 
 
 
285 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.391368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0995  CheR family methyltransferase  42.54 
 
 
285 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0916  chemotaxis protein methyltransferase  42.54 
 
 
285 aa  243  3e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2641  MCP methyltransferase, CheR-type  47.55 
 
 
280 aa  241  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0696969  normal  0.649849 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4246  Protein-glutamate O-methyltransferase  42.97 
 
 
274 aa  231  9e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.127197  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1030  MCP methyltransferase, CheR-type  43.45 
 
 
275 aa  229  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3336  MCP methyltransferase, CheR-type  44.44 
 
 
277 aa  228  6e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00537558 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0391  MCP methyltransferase, CheR-type  42.26 
 
 
269 aa  228  9e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.329659 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2077  MCP methyltransferase, CheR-type  44.92 
 
 
277 aa  224  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1033  MCP methyltransferase, CheR-type  41.95 
 
 
269 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3352  protein-glutamate O-methyltransferase  40 
 
 
269 aa  224  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.110859  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0541  protein-glutamate O-methyltransferase  52.51 
 
 
278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126293  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1134  MCP methyltransferase, CheR-type  44.87 
 
 
271 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0014664  normal  0.105937 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0586  Protein-glutamate O-methyltransferase  40.56 
 
 
274 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1001  protein-glutamate O-methyltransferase  44.86 
 
 
275 aa  205  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0288  MCP methyltransferase, CheR-type  33.2 
 
 
369 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.891674  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2113  MCP methyltransferase, CheR-type  36.96 
 
 
565 aa  176  5e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.982588  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2384  protein-glutamate O-methyltransferase  34.92 
 
 
256 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0809  MCP methyltransferase, CheR-type  30.35 
 
 
269 aa  140  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2183  hypothetical protein  31.72 
 
 
980 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.850093 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  33.96 
 
 
1027 aa  135  7.000000000000001e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2448  MCP methyltransferase, CheR-type  32.46 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000593357  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  36.24 
 
 
256 aa  132  6.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0713  MCP methyltransferase, CheR-type  32.66 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  35.94 
 
 
1303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.86 
 
 
1407 aa  130  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.88 
 
 
1348 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  35.59 
 
 
1399 aa  129  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  36.88 
 
 
1344 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1104  protein-glutamate O-methyltransferase  30.74 
 
 
259 aa  125  7e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.849239  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03023  methyltransferase  36.19 
 
 
604 aa  125  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.361036  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0227  MCP methyltransferase  32.18 
 
 
631 aa  125  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.993793  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0833  MCP methyltransferase, CheR-type  30.36 
 
 
260 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2549  fused CheR-type MCP methyltransferase and PAS sensor protein  32.95 
 
 
1006 aa  125  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.3 
 
 
1218 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.38 
 
 
1445 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1609  protein-glutamate O-methyltransferase  28.63 
 
 
259 aa  123  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00317018  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4605  MCP methyltransferase, CheR-type  35.42 
 
 
1092 aa  123  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315944  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0695  protein-glutamate O-methyltransferase  31.58 
 
 
259 aa  123  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.16 
 
 
1215 aa  122  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1246  methyltransferase CheR, putative  34.32 
 
 
1378 aa  122  5e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0471  MCP methyltransferase, CheR-type  30.31 
 
 
282 aa  122  6e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4203  MCP methyltransferase, CheR-type  29.67 
 
 
264 aa  122  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0106813  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4422  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.35 
 
 
1274 aa  122  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.381764  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  35.92 
 
 
1190 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4430  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.75 
 
 
1158 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0456  protein-glutamate O-methyltransferase  32.64 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1653  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.08 
 
 
993 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.32 
 
 
1408 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1716  MCP methyltransferase, CheR-type  35.58 
 
 
856 aa  120  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.92135  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1740  protein-glutamate O-methyltransferase  34.78 
 
 
269 aa  120  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6211  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  38.57 
 
 
1061 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820077  normal  0.703655 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5237  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.97 
 
 
1324 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.395635 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7206  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.84 
 
 
1499 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5709  MCP methyltransferase, CheR-type  32.37 
 
 
853 aa  119  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.729466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0310  MCP methyltransferase, CheR-type  33.46 
 
 
1149 aa  119  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.512157  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.18 
 
 
1453 aa  119  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1500  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  36.47 
 
 
1483 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2355  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.71 
 
 
1008 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3046  hypothetical protein  31 
 
 
1010 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>