More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5354 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009507  Swit_5354  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
274 aa  561  1.0000000000000001e-159  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.510015 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9100  chemotaxis methyltransferase  70.15 
 
 
277 aa  407  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.437866  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4783  MCP methyltransferase CheR-type  71.16 
 
 
279 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1943  MCP methyltransferase, CheR-type  69.63 
 
 
286 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.125019  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3995  MCP methyltransferase, CheR-type  63.81 
 
 
285 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.318486  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0648  MCP methyltransferase, CheR-type  63.02 
 
 
277 aa  357  9e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687034  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0627  MCP methyltransferase, CheR-type  63.02 
 
 
277 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3830  MCP methyltransferase, CheR-type  63.06 
 
 
279 aa  356  2.9999999999999997e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.109211  normal  0.0246625 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5389  MCP methyltransferase, CheR-type  62.26 
 
 
281 aa  344  7e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.087353 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1217  MCP methyltransferase, CheR-type  61.89 
 
 
281 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702972  normal  0.558808 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0170  MCP methyltransferase, CheR-type  59.77 
 
 
269 aa  337  9e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2804  MCP methyltransferase, CheR-type  60 
 
 
284 aa  328  9e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4209  MCP methyltransferase, CheR-type  60 
 
 
282 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2588  MCP methyltransferase, CheR-type  58.8 
 
 
286 aa  325  5e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2647  MCP methyltransferase, CheR-type  55.85 
 
 
277 aa  322  6e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2143  MCP methyltransferase, CheR-type  56.23 
 
 
273 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255114  hitchhiker  0.000601426 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2446  MCP methyltransferase, CheR-type:MCP methyltransferase, CheR-type  55.26 
 
 
280 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.676059  hitchhiker  0.0010522 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2713  chemotaxis protein methyltransferase CheR, putative  55.09 
 
 
288 aa  315  4e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0583099  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1738  MCP methyltransferase, CheR-type  57.62 
 
 
274 aa  315  5e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.123373 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1072  MCP methyltransferase, CheR-type  55.26 
 
 
303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0475353  normal  0.619503 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2107  MCP methyltransferase, CheR-type  53.96 
 
 
273 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.314277  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3760  MCP methyltransferase, CheR-type  53.96 
 
 
273 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2003  MCP methyltransferase, CheR-type  53.96 
 
 
273 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0541882 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3785  MCP methyltransferase, CheR-type  52.26 
 
 
298 aa  299  3e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0021  MCP methyltransferase, CheR-type  52.63 
 
 
277 aa  281  7.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1647  protein-glutamate O-methyltransferase  51.88 
 
 
279 aa  276  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3720  CheR-type protein glutamate methyltransferase  47.39 
 
 
281 aa  270  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4781  MCP methyltransferase, CheR-type  47.78 
 
 
276 aa  267  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.735388  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1036  methyltransferase, CheR family  45.11 
 
 
285 aa  267  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2641  MCP methyltransferase, CheR-type  48.89 
 
 
280 aa  267  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0696969  normal  0.649849 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1071  methyltransferase, CheR family  45.86 
 
 
285 aa  266  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29745e-42 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1162  methyltransferase, CheR family  45.86 
 
 
285 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0916  chemotaxis protein methyltransferase  45.86 
 
 
285 aa  265  5e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0931  CheR family methyltransferase  45.49 
 
 
285 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0899  chemotaxis protein methyltransferase  45.49 
 
 
285 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.391368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0995  CheR family methyltransferase  45.49 
 
 
285 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2079  MCP methyltransferase, CheR-type  45.45 
 
 
280 aa  265  8.999999999999999e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.166097 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0906  MCP methyltransferase, CheR-type  45.11 
 
 
285 aa  264  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1268  MCP methyltransferase, CheR-type  45.9 
 
 
269 aa  264  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1089  CheR family methyltransferase  45.11 
 
 
285 aa  263  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4267  methyltransferase, CheR family  44.74 
 
 
285 aa  261  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109599 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1962  MCP methyltransferase, CheR-type  45.52 
 
 
279 aa  260  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0162659  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2258  MCP methyltransferase, CheR-type  48.02 
 
 
273 aa  257  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.232236  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0391  MCP methyltransferase, CheR-type  46.64 
 
 
269 aa  257  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.329659 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3352  protein-glutamate O-methyltransferase  43.28 
 
 
269 aa  249  5e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.110859  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0586  Protein-glutamate O-methyltransferase  46.97 
 
 
274 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3008  MCP methyltransferase, CheR-type  43.28 
 
 
284 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.47371  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1033  MCP methyltransferase, CheR-type  44.57 
 
 
269 aa  241  9e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4246  Protein-glutamate O-methyltransferase  43.28 
 
 
274 aa  237  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.127197  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2077  MCP methyltransferase, CheR-type  44.92 
 
 
277 aa  230  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3336  MCP methyltransferase, CheR-type  45.67 
 
 
277 aa  229  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00537558 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1030  MCP methyltransferase, CheR-type  44.8 
 
 
275 aa  229  5e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0541  protein-glutamate O-methyltransferase  48.7 
 
 
278 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126293  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1001  protein-glutamate O-methyltransferase  43.32 
 
 
275 aa  208  8e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1134  MCP methyltransferase, CheR-type  39.93 
 
 
271 aa  201  9e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0014664  normal  0.105937 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0288  MCP methyltransferase, CheR-type  32.05 
 
 
369 aa  175  8e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.891674  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2113  MCP methyltransferase, CheR-type  36.1 
 
 
565 aa  171  9e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.982588  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3046  hypothetical protein  33.72 
 
 
1010 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164382 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2183  hypothetical protein  33.33 
 
 
980 aa  139  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.850093 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  33.98 
 
 
256 aa  138  7.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2384  protein-glutamate O-methyltransferase  32.49 
 
 
256 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03023  methyltransferase  36.23 
 
 
604 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.361036  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1500  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  36.8 
 
 
1483 aa  136  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1118  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  33.94 
 
 
852 aa  135  8e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.742809 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  33.59 
 
 
1027 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.6 
 
 
1445 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5237  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  33.59 
 
 
1324 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.395635 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  33.45 
 
 
1160 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2549  fused CheR-type MCP methyltransferase and PAS sensor protein  33.58 
 
 
1006 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.13 
 
 
1215 aa  132  6.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0713  MCP methyltransferase, CheR-type  30.61 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4605  MCP methyltransferase, CheR-type  33.33 
 
 
1092 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315944  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.23 
 
 
1348 aa  129  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0801  MCP methyltransferase, CheR-type  33.76 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.507771  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2460  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.84 
 
 
971 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2045  CheB methylesterase:MCP methyltransferase, CheR-type  32.13 
 
 
868 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0809  MCP methyltransferase, CheR-type  29.92 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1740  protein-glutamate O-methyltransferase  32.14 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6211  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  36.49 
 
 
1061 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820077  normal  0.703655 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1653  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.42 
 
 
993 aa  127  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6264  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.47 
 
 
1163 aa  126  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3183  signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 
1279 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1788  putative PAS/PAC sensor protein  36.24 
 
 
998 aa  126  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  33.47 
 
 
1384 aa  125  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.45 
 
 
1408 aa  124  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.57 
 
 
1380 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4430  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.69 
 
 
1158 aa  123  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.22 
 
 
1190 aa  123  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3377  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.45 
 
 
1242 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0227  MCP methyltransferase  28.47 
 
 
631 aa  122  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.993793  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5252  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.35 
 
 
1698 aa  122  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.92 
 
 
1453 aa  122  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  33.86 
 
 
1222 aa  122  7e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.03 
 
 
1361 aa  122  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2355  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.83 
 
 
1008 aa  122  8e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0460  MCP methyltransferase, CheR-type  30.51 
 
 
837 aa  122  8e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.604812  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0695  protein-glutamate O-methyltransferase  32.63 
 
 
259 aa  121  9e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3739  MCP methyltransferase, CheR-type  32.04 
 
 
1045 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.88 
 
 
1371 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.980757 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0327  putative PAS/PAC sensor protein  30.83 
 
 
1008 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>