More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3830 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3830  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
279 aa  570  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.109211  normal  0.0246625 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0627  MCP methyltransferase, CheR-type  76.17 
 
 
277 aa  436  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3995  MCP methyltransferase, CheR-type  76.19 
 
 
285 aa  435  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.318486  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0648  MCP methyltransferase, CheR-type  76.17 
 
 
277 aa  436  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687034  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0170  MCP methyltransferase, CheR-type  67.67 
 
 
269 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2647  MCP methyltransferase, CheR-type  63.43 
 
 
277 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9100  chemotaxis methyltransferase  63.06 
 
 
277 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.437866  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1943  MCP methyltransferase, CheR-type  64.29 
 
 
286 aa  364  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.125019  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2143  MCP methyltransferase, CheR-type  63.24 
 
 
273 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255114  hitchhiker  0.000601426 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4783  MCP methyltransferase CheR-type  64.15 
 
 
279 aa  360  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2713  chemotaxis protein methyltransferase CheR, putative  62.45 
 
 
288 aa  358  5e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0583099  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2003  MCP methyltransferase, CheR-type  61.4 
 
 
273 aa  358  7e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0541882 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2446  MCP methyltransferase, CheR-type:MCP methyltransferase, CheR-type  61.76 
 
 
280 aa  357  9e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.676059  hitchhiker  0.0010522 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3760  MCP methyltransferase, CheR-type  61.4 
 
 
273 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2107  MCP methyltransferase, CheR-type  61.19 
 
 
273 aa  354  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.314277  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2588  MCP methyltransferase, CheR-type  63.3 
 
 
286 aa  350  2e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1072  MCP methyltransferase, CheR-type  59.56 
 
 
303 aa  347  1e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0475353  normal  0.619503 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5354  MCP methyltransferase, CheR-type  63.06 
 
 
274 aa  345  4e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.510015 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5389  MCP methyltransferase, CheR-type  62.78 
 
 
281 aa  340  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.087353 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1738  MCP methyltransferase, CheR-type  61.42 
 
 
274 aa  338  4e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.123373 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1217  MCP methyltransferase, CheR-type  63.16 
 
 
281 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702972  normal  0.558808 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2804  MCP methyltransferase, CheR-type  60.36 
 
 
284 aa  333  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4209  MCP methyltransferase, CheR-type  62.03 
 
 
282 aa  331  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3785  MCP methyltransferase, CheR-type  50.19 
 
 
298 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3720  CheR-type protein glutamate methyltransferase  49.27 
 
 
281 aa  285  5e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0021  MCP methyltransferase, CheR-type  51.12 
 
 
277 aa  285  7e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2079  MCP methyltransferase, CheR-type  47.53 
 
 
280 aa  275  7e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.166097 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1962  MCP methyltransferase, CheR-type  48 
 
 
279 aa  274  9e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0162659  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2258  MCP methyltransferase, CheR-type  48.46 
 
 
273 aa  268  8.999999999999999e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.232236  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4781  MCP methyltransferase, CheR-type  45.59 
 
 
276 aa  262  4.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.735388  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1268  MCP methyltransferase, CheR-type  45.83 
 
 
269 aa  255  4e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1647  protein-glutamate O-methyltransferase  47.27 
 
 
279 aa  251  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2641  MCP methyltransferase, CheR-type  47.01 
 
 
280 aa  246  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0696969  normal  0.649849 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3008  MCP methyltransferase, CheR-type  42.05 
 
 
284 aa  246  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.47371  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1033  MCP methyltransferase, CheR-type  45.28 
 
 
269 aa  243  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0391  MCP methyltransferase, CheR-type  45.38 
 
 
269 aa  242  6e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.329659 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0906  MCP methyltransferase, CheR-type  39.05 
 
 
285 aa  241  9e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1071  methyltransferase, CheR family  39.42 
 
 
285 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29745e-42 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1036  methyltransferase, CheR family  38.69 
 
 
285 aa  241  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1089  CheR family methyltransferase  39.05 
 
 
285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0931  CheR family methyltransferase  39.05 
 
 
285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0899  chemotaxis protein methyltransferase  39.05 
 
 
285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.391368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0995  CheR family methyltransferase  39.05 
 
 
285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1162  methyltransferase, CheR family  39.05 
 
 
285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4267  methyltransferase, CheR family  38.32 
 
 
285 aa  239  5e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109599 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0916  chemotaxis protein methyltransferase  39.05 
 
 
285 aa  238  9e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4246  Protein-glutamate O-methyltransferase  43.46 
 
 
274 aa  233  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.127197  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3352  protein-glutamate O-methyltransferase  41.89 
 
 
269 aa  231  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.110859  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1030  MCP methyltransferase, CheR-type  43.07 
 
 
275 aa  231  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2077  MCP methyltransferase, CheR-type  44.53 
 
 
277 aa  226  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3336  MCP methyltransferase, CheR-type  45.63 
 
 
277 aa  226  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00537558 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0586  Protein-glutamate O-methyltransferase  41 
 
 
274 aa  218  7e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0541  protein-glutamate O-methyltransferase  50.7 
 
 
278 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126293  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1001  protein-glutamate O-methyltransferase  43.32 
 
 
275 aa  212  7e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1134  MCP methyltransferase, CheR-type  44.11 
 
 
271 aa  210  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0014664  normal  0.105937 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0288  MCP methyltransferase, CheR-type  31.18 
 
 
369 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.891674  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2113  MCP methyltransferase, CheR-type  34.36 
 
 
565 aa  168  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.982588  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  35.37 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  33.2 
 
 
1027 aa  132  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1104  protein-glutamate O-methyltransferase  30.3 
 
 
259 aa  132  9e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.849239  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2384  protein-glutamate O-methyltransferase  32.49 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1716  MCP methyltransferase, CheR-type  34.69 
 
 
856 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.92135  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0809  MCP methyltransferase, CheR-type  28.23 
 
 
269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2183  hypothetical protein  29.47 
 
 
980 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.850093 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0460  MCP methyltransferase, CheR-type  31.99 
 
 
837 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.604812  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3121  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  32.1 
 
 
617 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0152355  normal  0.805919 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1500  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  34.3 
 
 
1483 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0801  MCP methyltransferase, CheR-type  32.18 
 
 
259 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.507771  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.37 
 
 
1445 aa  123  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0327  putative PAS/PAC sensor protein  31.94 
 
 
1008 aa  123  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6211  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  33.71 
 
 
1061 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820077  normal  0.703655 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.91 
 
 
1408 aa  123  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  30.86 
 
 
1399 aa  122  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2448  MCP methyltransferase, CheR-type  30.08 
 
 
258 aa  122  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000593357  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4203  MCP methyltransferase, CheR-type  31.38 
 
 
264 aa  122  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0106813  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2264  putative PAS/PAC sensor protein  31.48 
 
 
1165 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.620072  normal  0.0600346 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3183  signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
1279 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3755  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  36.8 
 
 
1063 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6264  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.95 
 
 
1163 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4605  MCP methyltransferase, CheR-type  31.66 
 
 
1092 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315944  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0713  MCP methyltransferase, CheR-type  31.05 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3046  hypothetical protein  31.91 
 
 
1010 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164382 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0399  MCP methyltransferase, CheR-type  28 
 
 
820 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.47 
 
 
1407 aa  120  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0471  MCP methyltransferase, CheR-type  30.65 
 
 
282 aa  120  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1740  protein-glutamate O-methyltransferase  33.04 
 
 
269 aa  120  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03023  methyltransferase  36.25 
 
 
604 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.361036  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  32.42 
 
 
1303 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  29.89 
 
 
1218 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.75 
 
 
1535 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  33.46 
 
 
1190 aa  119  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2564  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.38 
 
 
1089 aa  118  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1788  putative PAS/PAC sensor protein  30.68 
 
 
998 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0695  protein-glutamate O-methyltransferase  31.14 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2549  fused CheR-type MCP methyltransferase and PAS sensor protein  30.86 
 
 
1006 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.37 
 
 
1348 aa  118  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4422  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.52 
 
 
1274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.381764  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5237  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.47 
 
 
1324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.395635 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5709  MCP methyltransferase, CheR-type  30.94 
 
 
853 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.729466 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  30.37 
 
 
1160 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>