More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2647 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2647  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
277 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2713  chemotaxis protein methyltransferase CheR, putative  85.19 
 
 
288 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0583099  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2446  MCP methyltransferase, CheR-type:MCP methyltransferase, CheR-type  84 
 
 
280 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.676059  hitchhiker  0.0010522 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2143  MCP methyltransferase, CheR-type  81.11 
 
 
273 aa  470  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255114  hitchhiker  0.000601426 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2107  MCP methyltransferase, CheR-type  81.48 
 
 
273 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.314277  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3760  MCP methyltransferase, CheR-type  80.74 
 
 
273 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2003  MCP methyltransferase, CheR-type  81.11 
 
 
273 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0541882 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0170  MCP methyltransferase, CheR-type  76.23 
 
 
269 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1072  MCP methyltransferase, CheR-type  74.54 
 
 
303 aa  429  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0475353  normal  0.619503 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2804  MCP methyltransferase, CheR-type  72.01 
 
 
284 aa  412  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2588  MCP methyltransferase, CheR-type  70.19 
 
 
286 aa  410  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3830  MCP methyltransferase, CheR-type  63.43 
 
 
279 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.109211  normal  0.0246625 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3995  MCP methyltransferase, CheR-type  60 
 
 
285 aa  350  1e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.318486  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0648  MCP methyltransferase, CheR-type  59.33 
 
 
277 aa  348  4e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687034  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0627  MCP methyltransferase, CheR-type  59.33 
 
 
277 aa  348  6e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4783  MCP methyltransferase CheR-type  56.16 
 
 
279 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9100  chemotaxis methyltransferase  57.04 
 
 
277 aa  337  9e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.437866  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3785  MCP methyltransferase, CheR-type  58.43 
 
 
298 aa  329  3e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1738  MCP methyltransferase, CheR-type  55.47 
 
 
274 aa  326  3e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.123373 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5389  MCP methyltransferase, CheR-type  56.6 
 
 
281 aa  323  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.087353 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4209  MCP methyltransferase, CheR-type  56.23 
 
 
282 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1943  MCP methyltransferase, CheR-type  56.39 
 
 
286 aa  318  5e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.125019  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5354  MCP methyltransferase, CheR-type  55.85 
 
 
274 aa  318  7e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.510015 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1217  MCP methyltransferase, CheR-type  55.47 
 
 
281 aa  316  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702972  normal  0.558808 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1962  MCP methyltransferase, CheR-type  55.35 
 
 
279 aa  304  8.000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0162659  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0021  MCP methyltransferase, CheR-type  54.92 
 
 
277 aa  298  9e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2079  MCP methyltransferase, CheR-type  51.33 
 
 
280 aa  295  4e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.166097 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4781  MCP methyltransferase, CheR-type  53.38 
 
 
276 aa  288  6e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.735388  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1268  MCP methyltransferase, CheR-type  51.52 
 
 
269 aa  285  4e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3720  CheR-type protein glutamate methyltransferase  50.57 
 
 
281 aa  281  8.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1647  protein-glutamate O-methyltransferase  53.18 
 
 
279 aa  278  5e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3008  MCP methyltransferase, CheR-type  50.56 
 
 
284 aa  271  7e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.47371  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4267  methyltransferase, CheR family  48.52 
 
 
285 aa  269  4e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109599 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0906  MCP methyltransferase, CheR-type  48.52 
 
 
285 aa  268  7e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0916  chemotaxis protein methyltransferase  48.52 
 
 
285 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1036  methyltransferase, CheR family  48.87 
 
 
285 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2258  MCP methyltransferase, CheR-type  48.46 
 
 
273 aa  267  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.232236  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1162  methyltransferase, CheR family  48.15 
 
 
285 aa  265  5e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0931  CheR family methyltransferase  47.78 
 
 
285 aa  264  8.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0899  chemotaxis protein methyltransferase  47.78 
 
 
285 aa  264  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.391368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0995  CheR family methyltransferase  47.78 
 
 
285 aa  264  8.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2641  MCP methyltransferase, CheR-type  50 
 
 
280 aa  264  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0696969  normal  0.649849 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1089  CheR family methyltransferase  47.78 
 
 
285 aa  263  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1071  methyltransferase, CheR family  47.41 
 
 
285 aa  263  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29745e-42 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1030  MCP methyltransferase, CheR-type  47.62 
 
 
275 aa  263  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0391  MCP methyltransferase, CheR-type  47.55 
 
 
269 aa  258  8e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.329659 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3336  MCP methyltransferase, CheR-type  51.19 
 
 
277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00537558 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3352  protein-glutamate O-methyltransferase  47.01 
 
 
269 aa  251  8.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.110859  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2077  MCP methyltransferase, CheR-type  47.47 
 
 
277 aa  248  7e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4246  Protein-glutamate O-methyltransferase  44.65 
 
 
274 aa  244  9e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.127197  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1033  MCP methyltransferase, CheR-type  45.28 
 
 
269 aa  236  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0586  Protein-glutamate O-methyltransferase  45.25 
 
 
274 aa  227  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0541  protein-glutamate O-methyltransferase  45.63 
 
 
278 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126293  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1134  MCP methyltransferase, CheR-type  41.83 
 
 
271 aa  223  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0014664  normal  0.105937 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1001  protein-glutamate O-methyltransferase  45.28 
 
 
275 aa  221  8e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2113  MCP methyltransferase, CheR-type  38.24 
 
 
565 aa  202  6e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.982588  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0288  MCP methyltransferase, CheR-type  36.08 
 
 
369 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.891674  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2183  hypothetical protein  34.09 
 
 
980 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.850093 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3046  hypothetical protein  35.36 
 
 
1010 aa  142  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164382 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.45 
 
 
1348 aa  137  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.05 
 
 
1190 aa  134  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  34.6 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5709  MCP methyltransferase, CheR-type  32.27 
 
 
853 aa  133  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.729466 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1653  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.51 
 
 
993 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.75 
 
 
1218 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 
1344 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0809  MCP methyltransferase, CheR-type  31.3 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6211  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  35.25 
 
 
1061 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820077  normal  0.703655 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0983  chemotaxis protein methyltransferase  35.55 
 
 
302 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.71 
 
 
1408 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.2 
 
 
1215 aa  129  6e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2549  fused CheR-type MCP methyltransferase and PAS sensor protein  31.94 
 
 
1006 aa  129  7.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2448  MCP methyltransferase, CheR-type  33.91 
 
 
258 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000593357  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6264  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.54 
 
 
1163 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5237  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.92 
 
 
1324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.395635 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1609  protein-glutamate O-methyltransferase  32.5 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00317018  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  32.85 
 
 
1384 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4422  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.87 
 
 
1274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.381764  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  31.52 
 
 
1027 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.11 
 
 
1535 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2045  CheB methylesterase:MCP methyltransferase, CheR-type  30.68 
 
 
868 aa  126  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1500  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  31.48 
 
 
1483 aa  126  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  31.75 
 
 
1303 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  31.02 
 
 
1160 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.33 
 
 
1306 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.58 
 
 
1380 aa  126  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3755  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  33.72 
 
 
1063 aa  125  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0259  protein-glutamate O-methyltransferase  32.42 
 
 
279 aa  125  7e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.72 
 
 
1407 aa  125  7e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03023  methyltransferase  32.97 
 
 
604 aa  125  8.000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.361036  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2355  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.36 
 
 
1008 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0737  protein-glutamate O-methyltransferase  32.02 
 
 
270 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.730545  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0227  MCP methyltransferase  28.95 
 
 
631 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.993793  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3121  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  31.54 
 
 
617 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0152355  normal  0.805919 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1788  putative PAS/PAC sensor protein  30.74 
 
 
998 aa  123  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1246  methyltransferase CheR, putative  32.47 
 
 
1378 aa  122  5e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0177  protein-glutamate O-methyltransferase  30.31 
 
 
270 aa  122  7e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3102  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.58 
 
 
1418 aa  122  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2487  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.85 
 
 
1535 aa  122  9e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.162467  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2162  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB  29.72 
 
 
879 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>