More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9100 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011984  Avi_9100  chemotaxis methyltransferase  100 
 
 
277 aa  571  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.437866  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4783  MCP methyltransferase CheR-type  72.43 
 
 
279 aa  427  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5354  MCP methyltransferase, CheR-type  70.15 
 
 
274 aa  397  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.510015 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1943  MCP methyltransferase, CheR-type  62.17 
 
 
286 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.125019  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3995  MCP methyltransferase, CheR-type  64.58 
 
 
285 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.318486  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3830  MCP methyltransferase, CheR-type  63.06 
 
 
279 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.109211  normal  0.0246625 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0627  MCP methyltransferase, CheR-type  63.7 
 
 
277 aa  364  1e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0648  MCP methyltransferase, CheR-type  63.7 
 
 
277 aa  364  1e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687034  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5389  MCP methyltransferase, CheR-type  64.15 
 
 
281 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.087353 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0170  MCP methyltransferase, CheR-type  60.53 
 
 
269 aa  353  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1217  MCP methyltransferase, CheR-type  62.64 
 
 
281 aa  349  4e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702972  normal  0.558808 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2713  chemotaxis protein methyltransferase CheR, putative  60 
 
 
288 aa  344  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0583099  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1738  MCP methyltransferase, CheR-type  60.67 
 
 
274 aa  338  5.9999999999999996e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.123373 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4209  MCP methyltransferase, CheR-type  61.51 
 
 
282 aa  338  7e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2647  MCP methyltransferase, CheR-type  57.04 
 
 
277 aa  337  9e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2446  MCP methyltransferase, CheR-type:MCP methyltransferase, CheR-type  58.87 
 
 
280 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.676059  hitchhiker  0.0010522 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2143  MCP methyltransferase, CheR-type  55.88 
 
 
273 aa  332  5e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255114  hitchhiker  0.000601426 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2003  MCP methyltransferase, CheR-type  55.88 
 
 
273 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0541882 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2107  MCP methyltransferase, CheR-type  56.67 
 
 
273 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.314277  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3760  MCP methyltransferase, CheR-type  55.88 
 
 
273 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2588  MCP methyltransferase, CheR-type  56.02 
 
 
286 aa  324  8.000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1072  MCP methyltransferase, CheR-type  54.72 
 
 
303 aa  319  3e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0475353  normal  0.619503 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2804  MCP methyltransferase, CheR-type  55.64 
 
 
284 aa  319  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3785  MCP methyltransferase, CheR-type  51.5 
 
 
298 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3720  CheR-type protein glutamate methyltransferase  47.39 
 
 
281 aa  280  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0021  MCP methyltransferase, CheR-type  50.18 
 
 
277 aa  280  3e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1268  MCP methyltransferase, CheR-type  47.94 
 
 
269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4781  MCP methyltransferase, CheR-type  47.57 
 
 
276 aa  270  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.735388  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1962  MCP methyltransferase, CheR-type  46.47 
 
 
279 aa  264  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0162659  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1647  protein-glutamate O-methyltransferase  48.5 
 
 
279 aa  262  3e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2079  MCP methyltransferase, CheR-type  42.97 
 
 
280 aa  255  5e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.166097 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3008  MCP methyltransferase, CheR-type  44.98 
 
 
284 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.47371  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0906  MCP methyltransferase, CheR-type  43.49 
 
 
285 aa  251  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1036  methyltransferase, CheR family  43.4 
 
 
285 aa  251  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4267  methyltransferase, CheR family  43.12 
 
 
285 aa  250  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109599 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2641  MCP methyltransferase, CheR-type  45.86 
 
 
280 aa  249  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0696969  normal  0.649849 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1162  methyltransferase, CheR family  43.49 
 
 
285 aa  249  3e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0931  CheR family methyltransferase  43.49 
 
 
285 aa  249  4e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0916  chemotaxis protein methyltransferase  43.49 
 
 
285 aa  249  4e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0899  chemotaxis protein methyltransferase  43.49 
 
 
285 aa  249  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.391368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0995  CheR family methyltransferase  43.49 
 
 
285 aa  249  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1071  methyltransferase, CheR family  43.12 
 
 
285 aa  248  8e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29745e-42 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1089  CheR family methyltransferase  43.49 
 
 
285 aa  248  9e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2258  MCP methyltransferase, CheR-type  42.75 
 
 
273 aa  248  9e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.232236  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0391  MCP methyltransferase, CheR-type  42.32 
 
 
269 aa  237  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.329659 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1033  MCP methyltransferase, CheR-type  43.45 
 
 
269 aa  235  7e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3352  protein-glutamate O-methyltransferase  40.45 
 
 
269 aa  233  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.110859  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1030  MCP methyltransferase, CheR-type  44.8 
 
 
275 aa  231  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2077  MCP methyltransferase, CheR-type  46.69 
 
 
277 aa  231  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4246  Protein-glutamate O-methyltransferase  41.64 
 
 
274 aa  230  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.127197  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0586  Protein-glutamate O-methyltransferase  41.97 
 
 
274 aa  229  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3336  MCP methyltransferase, CheR-type  41.57 
 
 
277 aa  223  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00537558 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0541  protein-glutamate O-methyltransferase  47.77 
 
 
278 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126293  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1134  MCP methyltransferase, CheR-type  41.2 
 
 
271 aa  209  5e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0014664  normal  0.105937 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1001  protein-glutamate O-methyltransferase  42.74 
 
 
275 aa  208  8e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2113  MCP methyltransferase, CheR-type  35.25 
 
 
565 aa  176  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.982588  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0288  MCP methyltransferase, CheR-type  31.18 
 
 
369 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.891674  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3046  hypothetical protein  32.11 
 
 
1010 aa  135  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164382 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0809  MCP methyltransferase, CheR-type  29.92 
 
 
269 aa  129  6e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2183  hypothetical protein  29.37 
 
 
980 aa  129  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.850093 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  34.93 
 
 
256 aa  129  6e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  30.5 
 
 
1027 aa  126  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  29.93 
 
 
1215 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.21 
 
 
1445 aa  123  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.02 
 
 
1348 aa  122  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0713  MCP methyltransferase, CheR-type  31.09 
 
 
256 aa  122  9e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5237  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.6 
 
 
1324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.395635 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3183  signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 
1279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4605  MCP methyltransferase, CheR-type  28.9 
 
 
1092 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315944  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1500  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  32.14 
 
 
1483 aa  120  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6264  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  29.66 
 
 
1163 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6211  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.09 
 
 
1061 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820077  normal  0.703655 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4422  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.34 
 
 
1274 aa  118  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.381764  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0460  MCP methyltransferase, CheR-type  31.99 
 
 
837 aa  118  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.604812  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  28.21 
 
 
1218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3377  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.11 
 
 
1242 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2549  fused CheR-type MCP methyltransferase and PAS sensor protein  29.66 
 
 
1006 aa  115  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1246  methyltransferase CheR, putative  31.5 
 
 
1378 aa  115  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5252  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.23 
 
 
1698 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2384  protein-glutamate O-methyltransferase  29.96 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1716  MCP methyltransferase, CheR-type  29.85 
 
 
856 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.92135  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3755  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.45 
 
 
1063 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03023  methyltransferase  31.9 
 
 
604 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.361036  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  30.71 
 
 
1160 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2355  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  29.7 
 
 
1008 aa  113  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0327  putative PAS/PAC sensor protein  29.6 
 
 
1008 aa  112  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.74 
 
 
1306 aa  112  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5709  MCP methyltransferase, CheR-type  27.86 
 
 
853 aa  112  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.729466 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1237  chemotaxis response regulator (methyltransferase)  29.37 
 
 
1618 aa  112  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.04 
 
 
1190 aa  112  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2045  CheB methylesterase:MCP methyltransferase, CheR-type  28.32 
 
 
868 aa  112  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1118  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.77 
 
 
852 aa  112  8.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.742809 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2264  putative PAS/PAC sensor protein  30.15 
 
 
1165 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.620072  normal  0.0600346 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1404  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.21 
 
 
1759 aa  112  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2460  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.07 
 
 
971 aa  112  9e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3739  MCP methyltransferase, CheR-type  29.48 
 
 
1045 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2448  MCP methyltransferase, CheR-type  27.73 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000593357  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30 
 
 
1453 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  29.15 
 
 
1380 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1653  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  26.74 
 
 
993 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>