More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2446 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2446  MCP methyltransferase, CheR-type:MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
280 aa  580  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.676059  hitchhiker  0.0010522 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2713  chemotaxis protein methyltransferase CheR, putative  92.47 
 
 
288 aa  541  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0583099  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2647  MCP methyltransferase, CheR-type  84 
 
 
277 aa  489  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2143  MCP methyltransferase, CheR-type  81.25 
 
 
273 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255114  hitchhiker  0.000601426 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3760  MCP methyltransferase, CheR-type  79.78 
 
 
273 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2003  MCP methyltransferase, CheR-type  80.15 
 
 
273 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0541882 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2107  MCP methyltransferase, CheR-type  80.15 
 
 
273 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.314277  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0170  MCP methyltransferase, CheR-type  76.23 
 
 
269 aa  433  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2588  MCP methyltransferase, CheR-type  69.06 
 
 
286 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1072  MCP methyltransferase, CheR-type  69.53 
 
 
303 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0475353  normal  0.619503 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2804  MCP methyltransferase, CheR-type  70.04 
 
 
284 aa  401  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3830  MCP methyltransferase, CheR-type  61.76 
 
 
279 aa  357  9e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.109211  normal  0.0246625 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3995  MCP methyltransferase, CheR-type  58.36 
 
 
285 aa  349  2e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.318486  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0648  MCP methyltransferase, CheR-type  57.56 
 
 
277 aa  342  2.9999999999999997e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687034  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0627  MCP methyltransferase, CheR-type  57.2 
 
 
277 aa  341  1e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9100  chemotaxis methyltransferase  58.87 
 
 
277 aa  336  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.437866  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4783  MCP methyltransferase CheR-type  55.19 
 
 
279 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3785  MCP methyltransferase, CheR-type  55.43 
 
 
298 aa  322  4e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1738  MCP methyltransferase, CheR-type  54.58 
 
 
274 aa  321  6e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.123373 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4209  MCP methyltransferase, CheR-type  55.64 
 
 
282 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1943  MCP methyltransferase, CheR-type  56.82 
 
 
286 aa  318  7e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.125019  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5389  MCP methyltransferase, CheR-type  54.24 
 
 
281 aa  314  8e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.087353 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5354  MCP methyltransferase, CheR-type  55.26 
 
 
274 aa  311  6.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.510015 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1217  MCP methyltransferase, CheR-type  53.96 
 
 
281 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702972  normal  0.558808 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4781  MCP methyltransferase, CheR-type  53.38 
 
 
276 aa  297  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.735388  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1962  MCP methyltransferase, CheR-type  52.26 
 
 
279 aa  287  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0162659  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2079  MCP methyltransferase, CheR-type  48.86 
 
 
280 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.166097 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0021  MCP methyltransferase, CheR-type  51.89 
 
 
277 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1268  MCP methyltransferase, CheR-type  49.81 
 
 
269 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3720  CheR-type protein glutamate methyltransferase  49.43 
 
 
281 aa  276  4e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1647  protein-glutamate O-methyltransferase  51.52 
 
 
279 aa  268  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2258  MCP methyltransferase, CheR-type  47.88 
 
 
273 aa  266  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.232236  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3008  MCP methyltransferase, CheR-type  46.76 
 
 
284 aa  266  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.47371  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0916  chemotaxis protein methyltransferase  45.65 
 
 
285 aa  265  4e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4267  methyltransferase, CheR family  44.93 
 
 
285 aa  266  4e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109599 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1036  methyltransferase, CheR family  44.57 
 
 
285 aa  265  7e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0906  MCP methyltransferase, CheR-type  44.93 
 
 
285 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1162  methyltransferase, CheR family  45.29 
 
 
285 aa  263  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0931  CheR family methyltransferase  44.93 
 
 
285 aa  262  4e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0899  chemotaxis protein methyltransferase  44.93 
 
 
285 aa  262  4e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.391368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0995  CheR family methyltransferase  44.93 
 
 
285 aa  262  4e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1089  CheR family methyltransferase  44.93 
 
 
285 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1071  methyltransferase, CheR family  44.57 
 
 
285 aa  261  8e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29745e-42 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1030  MCP methyltransferase, CheR-type  47.53 
 
 
275 aa  256  4e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0391  MCP methyltransferase, CheR-type  47.35 
 
 
269 aa  255  4e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.329659 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3336  MCP methyltransferase, CheR-type  50.59 
 
 
277 aa  250  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00537558 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3352  protein-glutamate O-methyltransferase  45.49 
 
 
269 aa  250  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.110859  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2641  MCP methyltransferase, CheR-type  46.32 
 
 
280 aa  248  6e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0696969  normal  0.649849 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4246  Protein-glutamate O-methyltransferase  45.49 
 
 
274 aa  246  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.127197  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2077  MCP methyltransferase, CheR-type  46.48 
 
 
277 aa  239  4e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1033  MCP methyltransferase, CheR-type  44.49 
 
 
269 aa  234  9e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0586  Protein-glutamate O-methyltransferase  43.27 
 
 
274 aa  226  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0541  protein-glutamate O-methyltransferase  47.77 
 
 
278 aa  222  7e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126293  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1134  MCP methyltransferase, CheR-type  42.05 
 
 
271 aa  217  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0014664  normal  0.105937 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1001  protein-glutamate O-methyltransferase  46.91 
 
 
275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2113  MCP methyltransferase, CheR-type  38.31 
 
 
565 aa  190  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.982588  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0288  MCP methyltransferase, CheR-type  35.47 
 
 
369 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.891674  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3046  hypothetical protein  35.5 
 
 
1010 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164382 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.1 
 
 
1348 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2183  hypothetical protein  31.82 
 
 
980 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.850093 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0809  MCP methyltransferase, CheR-type  30.2 
 
 
269 aa  129  6e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.5 
 
 
1218 aa  129  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6211  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.35 
 
 
1061 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820077  normal  0.703655 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  34.18 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.08 
 
 
1408 aa  126  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0259  protein-glutamate O-methyltransferase  32.68 
 
 
279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1653  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.91 
 
 
993 aa  124  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1500  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  32.5 
 
 
1483 aa  123  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.33 
 
 
1306 aa  123  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1246  methyltransferase CheR, putative  31.16 
 
 
1378 aa  123  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5237  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.01 
 
 
1324 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.395635 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0695  protein-glutamate O-methyltransferase  32.46 
 
 
259 aa  122  8e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0177  protein-glutamate O-methyltransferase  30.2 
 
 
270 aa  122  9e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3755  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  33.59 
 
 
1063 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0737  protein-glutamate O-methyltransferase  31.5 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.730545  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  33.85 
 
 
1303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.18 
 
 
1535 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0227  MCP methyltransferase  26.9 
 
 
631 aa  119  3.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.993793  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2355  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.06 
 
 
1008 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5709  MCP methyltransferase, CheR-type  30.12 
 
 
853 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.729466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0983  chemotaxis protein methyltransferase  33.59 
 
 
302 aa  119  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  29.34 
 
 
1453 aa  119  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4605  MCP methyltransferase, CheR-type  31.93 
 
 
1092 aa  119  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315944  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03023  methyltransferase  32.21 
 
 
604 aa  119  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.361036  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1028  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.72 
 
 
1248 aa  119  7e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.507304 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  33.33 
 
 
1384 aa  118  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1725  MCP methyltransferase, CheR-type  30.47 
 
 
270 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0780  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.14 
 
 
887 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  30.74 
 
 
1027 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.05 
 
 
1407 aa  117  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2549  fused CheR-type MCP methyltransferase and PAS sensor protein  30.5 
 
 
1006 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4422  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.85 
 
 
1274 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.381764  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.68 
 
 
1380 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2448  MCP methyltransferase, CheR-type  30.43 
 
 
258 aa  115  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000593357  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  30.5 
 
 
1160 aa  115  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1104  protein-glutamate O-methyltransferase  29.51 
 
 
259 aa  115  8.999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.849239  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3183  signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 
1279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.18 
 
 
1190 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  31.13 
 
 
1344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1600  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.6 
 
 
1000 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>