More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1647 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_1647  protein-glutamate O-methyltransferase  100 
 
 
279 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0021  MCP methyltransferase, CheR-type  60.89 
 
 
277 aa  353  2e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3785  MCP methyltransferase, CheR-type  59.33 
 
 
298 aa  342  4e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3720  CheR-type protein glutamate methyltransferase  48.54 
 
 
281 aa  294  1e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4783  MCP methyltransferase CheR-type  50.55 
 
 
279 aa  290  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2647  MCP methyltransferase, CheR-type  53.18 
 
 
277 aa  288  7e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1962  MCP methyltransferase, CheR-type  53.23 
 
 
279 aa  288  7e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0162659  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2804  MCP methyltransferase, CheR-type  51.87 
 
 
284 aa  287  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0170  MCP methyltransferase, CheR-type  51.32 
 
 
269 aa  285  8e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4781  MCP methyltransferase, CheR-type  49.63 
 
 
276 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.735388  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2641  MCP methyltransferase, CheR-type  49.62 
 
 
280 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0696969  normal  0.649849 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5354  MCP methyltransferase, CheR-type  51.88 
 
 
274 aa  281  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.510015 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2258  MCP methyltransferase, CheR-type  50 
 
 
273 aa  280  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.232236  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2143  MCP methyltransferase, CheR-type  51.49 
 
 
273 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255114  hitchhiker  0.000601426 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1072  MCP methyltransferase, CheR-type  49.43 
 
 
303 aa  275  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0475353  normal  0.619503 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2446  MCP methyltransferase, CheR-type:MCP methyltransferase, CheR-type  51.52 
 
 
280 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.676059  hitchhiker  0.0010522 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9100  chemotaxis methyltransferase  48.5 
 
 
277 aa  273  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.437866  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2713  chemotaxis protein methyltransferase CheR, putative  50.19 
 
 
288 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0583099  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1268  MCP methyltransferase, CheR-type  48.13 
 
 
269 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2003  MCP methyltransferase, CheR-type  50.37 
 
 
273 aa  272  6e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0541882 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2107  MCP methyltransferase, CheR-type  50 
 
 
273 aa  271  7e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.314277  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3760  MCP methyltransferase, CheR-type  50 
 
 
273 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3008  MCP methyltransferase, CheR-type  50.75 
 
 
284 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.47371  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3995  MCP methyltransferase, CheR-type  50.19 
 
 
285 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.318486  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2588  MCP methyltransferase, CheR-type  50 
 
 
286 aa  270  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0906  MCP methyltransferase, CheR-type  48.86 
 
 
285 aa  269  4e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0916  chemotaxis protein methyltransferase  48.48 
 
 
285 aa  268  7e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4267  methyltransferase, CheR family  48.48 
 
 
285 aa  268  7e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109599 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0931  CheR family methyltransferase  48.48 
 
 
285 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0899  chemotaxis protein methyltransferase  48.48 
 
 
285 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.391368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0995  CheR family methyltransferase  48.48 
 
 
285 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1943  MCP methyltransferase, CheR-type  48.88 
 
 
286 aa  267  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.125019  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1036  methyltransferase, CheR family  48.11 
 
 
285 aa  267  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1162  methyltransferase, CheR family  48.48 
 
 
285 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1089  CheR family methyltransferase  48.48 
 
 
285 aa  266  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1071  methyltransferase, CheR family  48.11 
 
 
285 aa  266  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29745e-42 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0391  MCP methyltransferase, CheR-type  46.77 
 
 
269 aa  264  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.329659 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0648  MCP methyltransferase, CheR-type  47.46 
 
 
277 aa  261  6.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687034  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1738  MCP methyltransferase, CheR-type  47.97 
 
 
274 aa  260  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.123373 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0627  MCP methyltransferase, CheR-type  47.1 
 
 
277 aa  260  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3830  MCP methyltransferase, CheR-type  47.27 
 
 
279 aa  258  6e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.109211  normal  0.0246625 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2079  MCP methyltransferase, CheR-type  47.17 
 
 
280 aa  257  1e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.166097 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4209  MCP methyltransferase, CheR-type  48.68 
 
 
282 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1030  MCP methyltransferase, CheR-type  45.66 
 
 
275 aa  252  5.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3352  protein-glutamate O-methyltransferase  43.98 
 
 
269 aa  250  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.110859  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5389  MCP methyltransferase, CheR-type  46.79 
 
 
281 aa  249  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.087353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3336  MCP methyltransferase, CheR-type  47.22 
 
 
277 aa  249  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00537558 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0541  protein-glutamate O-methyltransferase  47.06 
 
 
278 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126293  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0586  Protein-glutamate O-methyltransferase  44.53 
 
 
274 aa  246  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1217  MCP methyltransferase, CheR-type  45.66 
 
 
281 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702972  normal  0.558808 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2077  MCP methyltransferase, CheR-type  44.19 
 
 
277 aa  241  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1033  MCP methyltransferase, CheR-type  44.7 
 
 
269 aa  241  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4246  Protein-glutamate O-methyltransferase  42.55 
 
 
274 aa  236  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.127197  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1001  protein-glutamate O-methyltransferase  42.44 
 
 
275 aa  228  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1134  MCP methyltransferase, CheR-type  41.04 
 
 
271 aa  215  7e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0014664  normal  0.105937 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0288  MCP methyltransferase, CheR-type  37.88 
 
 
369 aa  207  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.891674  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2113  MCP methyltransferase, CheR-type  37.88 
 
 
565 aa  198  7.999999999999999e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.982588  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2183  hypothetical protein  33.8 
 
 
980 aa  155  7e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.850093 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  34.18 
 
 
256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2384  protein-glutamate O-methyltransferase  35.91 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.1 
 
 
1371 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.980757 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1653  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.95 
 
 
993 aa  146  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  30.97 
 
 
1027 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1788  putative PAS/PAC sensor protein  33.8 
 
 
998 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.95 
 
 
1380 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3046  hypothetical protein  33.7 
 
 
1010 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164382 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1246  methyltransferase CheR, putative  33.71 
 
 
1378 aa  140  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  31.99 
 
 
1384 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.31 
 
 
1215 aa  140  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3377  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.71 
 
 
1242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2355  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.58 
 
 
1008 aa  139  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2460  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.04 
 
 
971 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  33.1 
 
 
1344 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.44 
 
 
1535 aa  138  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.14 
 
 
1361 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3183  signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 
1279 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.18 
 
 
1445 aa  137  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0327  putative PAS/PAC sensor protein  31.23 
 
 
1008 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0177  protein-glutamate O-methyltransferase  33.94 
 
 
270 aa  135  8e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2045  CheB methylesterase:MCP methyltransferase, CheR-type  30.11 
 
 
868 aa  135  9e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0229  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.71 
 
 
1138 aa  135  9e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2549  fused CheR-type MCP methyltransferase and PAS sensor protein  31.18 
 
 
1006 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.83 
 
 
1408 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  32.05 
 
 
1160 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0801  MCP methyltransferase, CheR-type  31.22 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.507771  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1581  protein-glutamate O-methyltransferase  34.66 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.175681  normal  0.125652 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.32 
 
 
1190 aa  133  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5709  MCP methyltransferase, CheR-type  29.37 
 
 
853 aa  133  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.729466 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1600  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.83 
 
 
1000 aa  133  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1500  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  31.18 
 
 
1483 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1725  MCP methyltransferase, CheR-type  33.78 
 
 
270 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0259  protein-glutamate O-methyltransferase  31.37 
 
 
279 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.67 
 
 
1348 aa  132  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0460  MCP methyltransferase, CheR-type  30.51 
 
 
837 aa  132  9e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.604812  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1604  MCP methyltransferase, CheR-type  28.99 
 
 
260 aa  132  9e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0143514  unclonable  1.76137e-23 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0905  putative PAS/PAC sensor protein  29.63 
 
 
1170 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.968727 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  29.63 
 
 
1170 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2264  putative PAS/PAC sensor protein  28.89 
 
 
1165 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.620072  normal  0.0600346 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4203  MCP methyltransferase, CheR-type  33.47 
 
 
264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0106813  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.92 
 
 
1218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>