More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3336 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3336  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
277 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00537558 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0391  MCP methyltransferase, CheR-type  65.3 
 
 
269 aa  369  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.329659 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4246  Protein-glutamate O-methyltransferase  63.2 
 
 
274 aa  358  4e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.127197  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1033  MCP methyltransferase, CheR-type  61.71 
 
 
269 aa  356  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3352  protein-glutamate O-methyltransferase  58.58 
 
 
269 aa  341  1e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.110859  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2258  MCP methyltransferase, CheR-type  54.31 
 
 
273 aa  295  4e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.232236  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1030  MCP methyltransferase, CheR-type  50.76 
 
 
275 aa  283  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1268  MCP methyltransferase, CheR-type  50 
 
 
269 aa  278  6e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1072  MCP methyltransferase, CheR-type  49.25 
 
 
303 aa  275  6e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0475353  normal  0.619503 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4781  MCP methyltransferase, CheR-type  49.44 
 
 
276 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.735388  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2647  MCP methyltransferase, CheR-type  49.43 
 
 
277 aa  268  7e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0906  MCP methyltransferase, CheR-type  49.24 
 
 
285 aa  267  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2446  MCP methyltransferase, CheR-type:MCP methyltransferase, CheR-type  48.87 
 
 
280 aa  266  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.676059  hitchhiker  0.0010522 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1036  methyltransferase, CheR family  49.24 
 
 
285 aa  266  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3785  MCP methyltransferase, CheR-type  46.18 
 
 
298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3720  CheR-type protein glutamate methyltransferase  46.32 
 
 
281 aa  265  5e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1071  methyltransferase, CheR family  49.24 
 
 
285 aa  265  7e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29745e-42 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2713  chemotaxis protein methyltransferase CheR, putative  48.56 
 
 
288 aa  264  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0583099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4267  methyltransferase, CheR family  48.48 
 
 
285 aa  264  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109599 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1089  CheR family methyltransferase  48.86 
 
 
285 aa  263  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0931  CheR family methyltransferase  48.86 
 
 
285 aa  263  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0899  chemotaxis protein methyltransferase  48.86 
 
 
285 aa  263  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.391368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0995  CheR family methyltransferase  48.86 
 
 
285 aa  263  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1162  methyltransferase, CheR family  48.48 
 
 
285 aa  263  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2641  MCP methyltransferase, CheR-type  47.17 
 
 
280 aa  263  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0696969  normal  0.649849 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0916  chemotaxis protein methyltransferase  48.48 
 
 
285 aa  262  4e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0170  MCP methyltransferase, CheR-type  48.13 
 
 
269 aa  262  6e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2079  MCP methyltransferase, CheR-type  46.79 
 
 
280 aa  261  8.999999999999999e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.166097 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2588  MCP methyltransferase, CheR-type  48.12 
 
 
286 aa  261  1e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2143  MCP methyltransferase, CheR-type  47.17 
 
 
273 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255114  hitchhiker  0.000601426 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0021  MCP methyltransferase, CheR-type  47.31 
 
 
277 aa  259  4e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1962  MCP methyltransferase, CheR-type  47.23 
 
 
279 aa  258  6e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0162659  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1647  protein-glutamate O-methyltransferase  46.01 
 
 
279 aa  257  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2804  MCP methyltransferase, CheR-type  47.71 
 
 
284 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3008  MCP methyltransferase, CheR-type  47.21 
 
 
284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.47371  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2107  MCP methyltransferase, CheR-type  46.04 
 
 
273 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.314277  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2003  MCP methyltransferase, CheR-type  45.66 
 
 
273 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0541882 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3760  MCP methyltransferase, CheR-type  45.28 
 
 
273 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0586  Protein-glutamate O-methyltransferase  47.83 
 
 
274 aa  249  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4783  MCP methyltransferase CheR-type  43.49 
 
 
279 aa  244  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5354  MCP methyltransferase, CheR-type  45.15 
 
 
274 aa  242  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.510015 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9100  chemotaxis methyltransferase  40.07 
 
 
277 aa  241  9e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.437866  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1738  MCP methyltransferase, CheR-type  44.61 
 
 
274 aa  241  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.123373 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3995  MCP methyltransferase, CheR-type  43.85 
 
 
285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.318486  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3830  MCP methyltransferase, CheR-type  43.27 
 
 
279 aa  239  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.109211  normal  0.0246625 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0648  MCP methyltransferase, CheR-type  43.46 
 
 
277 aa  238  9e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687034  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4209  MCP methyltransferase, CheR-type  43.07 
 
 
282 aa  237  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0627  MCP methyltransferase, CheR-type  43.46 
 
 
277 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1001  protein-glutamate O-methyltransferase  50.43 
 
 
275 aa  236  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5389  MCP methyltransferase, CheR-type  43.02 
 
 
281 aa  235  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.087353 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1943  MCP methyltransferase, CheR-type  44.27 
 
 
286 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.125019  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2077  MCP methyltransferase, CheR-type  45.2 
 
 
277 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1217  MCP methyltransferase, CheR-type  42.26 
 
 
281 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702972  normal  0.558808 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0541  protein-glutamate O-methyltransferase  46.84 
 
 
278 aa  229  5e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126293  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1134  MCP methyltransferase, CheR-type  41.76 
 
 
271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0014664  normal  0.105937 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2113  MCP methyltransferase, CheR-type  40.23 
 
 
565 aa  202  7e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.982588  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0288  MCP methyltransferase, CheR-type  38.64 
 
 
369 aa  198  9e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.891674  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1653  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.1 
 
 
993 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  36.48 
 
 
256 aa  155  7e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2183  hypothetical protein  35.25 
 
 
980 aa  154  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.850093 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3046  hypothetical protein  34.72 
 
 
1010 aa  153  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164382 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0809  MCP methyltransferase, CheR-type  30.94 
 
 
269 aa  149  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  36.27 
 
 
1407 aa  149  5e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  36.5 
 
 
1348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2045  CheB methylesterase:MCP methyltransferase, CheR-type  31.75 
 
 
868 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0229  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.52 
 
 
1138 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0983  chemotaxis protein methyltransferase  32.27 
 
 
302 aa  146  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2549  fused CheR-type MCP methyltransferase and PAS sensor protein  33.58 
 
 
1006 aa  145  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.7 
 
 
1408 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1788  putative PAS/PAC sensor protein  30.99 
 
 
998 aa  145  9e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0563  putative PAS/PAC sensor protein  33.09 
 
 
1035 aa  144  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1600  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.96 
 
 
1000 aa  144  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1609  protein-glutamate O-methyltransferase  36.24 
 
 
259 aa  142  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00317018  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3013  MCP methyltransferase, CheR-type  34.55 
 
 
877 aa  142  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404945  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0227  MCP methyltransferase  32.82 
 
 
631 aa  142  7e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.993793  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2448  MCP methyltransferase, CheR-type  32.08 
 
 
258 aa  142  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000593357  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1246  methyltransferase CheR, putative  33.33 
 
 
1378 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0471  MCP methyltransferase, CheR-type  32.13 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  30.91 
 
 
1160 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.5 
 
 
1371 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.980757 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0780  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.23 
 
 
887 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0456  protein-glutamate O-methyltransferase  33.46 
 
 
250 aa  140  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0399  MCP methyltransferase, CheR-type  31.32 
 
 
820 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2355  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.7 
 
 
1008 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2162  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB  31.62 
 
 
879 aa  138  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  32.68 
 
 
1384 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0472  MCP methyltransferase, CheR-type  32.17 
 
 
256 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1410  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.73 
 
 
1120 aa  136  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132886  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3121  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  31.02 
 
 
617 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0152355  normal  0.805919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.8 
 
 
1218 aa  134  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1740  protein-glutamate O-methyltransferase  35.53 
 
 
269 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2384  protein-glutamate O-methyltransferase  31.6 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.31 
 
 
1361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0433  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  32.46 
 
 
618 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3377  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.68 
 
 
1242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0327  putative PAS/PAC sensor protein  31.15 
 
 
1008 aa  132  5e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5176  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.64 
 
 
1404 aa  132  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.190634 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.95 
 
 
1306 aa  132  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0460  MCP methyltransferase, CheR-type  30.36 
 
 
837 aa  132  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.604812  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  35.36 
 
 
1399 aa  132  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>