More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0717 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0717  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
260 aa  525  1e-148  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00142456  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1727  MCP methyltransferase, CheR-type  66.54 
 
 
265 aa  351  5.9999999999999994e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0833  MCP methyltransferase, CheR-type  58.46 
 
 
260 aa  329  3e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2448  MCP methyltransferase, CheR-type  62.26 
 
 
258 aa  329  3e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000593357  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1609  protein-glutamate O-methyltransferase  54.3 
 
 
259 aa  293  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00317018  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0472  MCP methyltransferase, CheR-type  53.36 
 
 
256 aa  291  5e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2147  MCP methyltransferase, CheR-type  54.94 
 
 
257 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363754  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1604  MCP methyltransferase, CheR-type  52.55 
 
 
260 aa  278  5e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0143514  unclonable  1.76137e-23 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1522  chemotaxis protein methyltransferase  48.82 
 
 
265 aa  267  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.129899  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1511  chemotaxis protein methyltransferase  48.82 
 
 
265 aa  267  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1732  chemotaxis protein methyltransferase CheR  48.82 
 
 
260 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1810  chemotaxis protein methyltransferase CheR  48.03 
 
 
260 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1754  chemotaxis protein methyltransferase CheR  48.03 
 
 
260 aa  265  5e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1665  chemotaxis protein methyltransferase CheR  48.43 
 
 
260 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1547  chemotaxis protein methyltransferase CheR  48.43 
 
 
265 aa  264  8e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1700  chemotaxis protein methyltransferase CheR  48.03 
 
 
260 aa  262  3e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3646  chemotaxis protein methyltransferase CheR  48.03 
 
 
260 aa  262  4e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1551  MCP methyltransferase, CheR-type  47.64 
 
 
260 aa  256  3e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.742709  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1347  protein-glutamate O-methyltransferase  51.3 
 
 
231 aa  255  4e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0695  protein-glutamate O-methyltransferase  46.09 
 
 
259 aa  247  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4203  MCP methyltransferase, CheR-type  46.46 
 
 
264 aa  245  6e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0106813  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0471  MCP methyltransferase, CheR-type  47.64 
 
 
282 aa  239  4e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1104  protein-glutamate O-methyltransferase  46.46 
 
 
259 aa  236  4e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.849239  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0456  protein-glutamate O-methyltransferase  48.39 
 
 
250 aa  234  9e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0809  MCP methyltransferase, CheR-type  48.83 
 
 
269 aa  230  1e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2384  protein-glutamate O-methyltransferase  43.75 
 
 
256 aa  229  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1740  protein-glutamate O-methyltransferase  40.55 
 
 
269 aa  225  6e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0801  MCP methyltransferase, CheR-type  39.37 
 
 
259 aa  222  4e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.507771  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  40.94 
 
 
256 aa  217  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1689  MCP methyltransferase, CheR-type  40.86 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0713  MCP methyltransferase, CheR-type  41.57 
 
 
256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0862  MCP methyltransferase, CheR-type  39.84 
 
 
272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0987  protein-glutamate O-methyltransferase  43.92 
 
 
270 aa  203  2e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0956387  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20280  Protein-glutamate O-methyltransferase  39.31 
 
 
263 aa  192  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0058  MCP methyltransferase, CheR-type  33.98 
 
 
286 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0983  chemotaxis protein methyltransferase  35.94 
 
 
302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1767  MCP methyltransferase, CheR-type  38.91 
 
 
264 aa  171  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0227  MCP methyltransferase  34.77 
 
 
631 aa  169  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.993793  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  35.04 
 
 
297 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0433  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  34.02 
 
 
618 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1581  protein-glutamate O-methyltransferase  35.44 
 
 
269 aa  157  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.175681  normal  0.125652 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1545  protein-glutamate O-methyltransferase  33.75 
 
 
264 aa  157  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.474689  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3121  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  31.47 
 
 
617 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0152355  normal  0.805919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  32.93 
 
 
289 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3212  MCP methyltransferase, CheR-type  31.67 
 
 
291 aa  152  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.409906  hitchhiker  0.0000000000690371 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0040  CheR methyltransferase, SAM binding domain protein  39.41 
 
 
283 aa  150  3e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0259  protein-glutamate O-methyltransferase  34.22 
 
 
279 aa  150  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1494  protein-glutamate O-methyltransferase  33.97 
 
 
292 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3390  MCP methyltransferase, CheR-type  32.6 
 
 
617 aa  148  7e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1988  Protein-glutamate O-methyltransferase  35.68 
 
 
275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  32.44 
 
 
288 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1610  MCP methyltransferase, CheR-type  31.73 
 
 
274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1653  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.76 
 
 
993 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0737  protein-glutamate O-methyltransferase  33.86 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.730545  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0808  MCP methyltransferase, CheR-type  34.62 
 
 
272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  32.92 
 
 
280 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0527  MCP methyltransferase, CheR-type  33.59 
 
 
289 aa  145  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3372  MCP methyltransferase, CheR-type  30.45 
 
 
288 aa  145  8.000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1725  MCP methyltransferase, CheR-type  32.41 
 
 
270 aa  145  9e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0524  MCP methyltransferase, CheR-type  31.58 
 
 
288 aa  145  9e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1533  putative chemotaxis protein methyltransferase cheR  33.33 
 
 
292 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5176  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.77 
 
 
1404 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.190634 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.05 
 
 
1371 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.980757 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0647  chemotaxis protein methyltransferase  30.53 
 
 
271 aa  143  3e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.63831  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2045  CheB methylesterase:MCP methyltransferase, CheR-type  31.9 
 
 
868 aa  143  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0780  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.45 
 
 
887 aa  143  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3855  MCP methyltransferase, CheR-type  32.93 
 
 
291 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  33.88 
 
 
280 aa  143  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3498  protein-glutamate O-methyltransferase  33.2 
 
 
273 aa  143  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1457  protein-glutamate O-methyltransferase  34.8 
 
 
276 aa  143  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20760  putative chemotaxis protein methyltransferase  34.27 
 
 
274 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1782  putative chemotaxis protein methyltransferase  33.87 
 
 
274 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0626  MCP methyltransferase, CheR-type  32.2 
 
 
277 aa  142  6e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0177  protein-glutamate O-methyltransferase  32.02 
 
 
270 aa  142  6e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0250  MCP methyltransferase, CheR-type  29.58 
 
 
269 aa  142  6e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.539407  normal  0.0159386 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1330  protein-glutamate O-methyltransferase  32.35 
 
 
270 aa  142  7e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2491  methylase of chemotaxis methyl-accepting proteins, CheR-like  27.44 
 
 
273 aa  142  8e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0152  chemotaxis protein methyltransferase CheR  32.2 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2454  protein-glutamate O-methyltransferase  29.67 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2820  MCP methyltransferase, CheR-type  36.02 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.353038  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2227  MCP methyltransferase, CheR-type  32.03 
 
 
824 aa  141  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.78 
 
 
1361 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1246  methyltransferase CheR, putative  30.43 
 
 
1378 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0141  MCP methyltransferase, CheR-type  31.08 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0351158  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2231  MCP methyltransferase, CheR-type  34.6 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4243  MCP methyltransferase, CheR-type  30.45 
 
 
290 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1410  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.35 
 
 
1120 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132886  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22590  Protein-glutamate O-methyltransferase  34.57 
 
 
309 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2105  MCP methyltransferase, CheR-type  31.5 
 
 
283 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3916  MCP methyltransferase, CheR-type  31.94 
 
 
289 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0941  MCP methyltransferase, CheR-type  32.67 
 
 
271 aa  139  4.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  33.06 
 
 
281 aa  139  6e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.299383  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4252  MCP methyltransferase, CheR-type  34.4 
 
 
275 aa  139  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2851  MCP methyltransferase, CheR-type  33.6 
 
 
282 aa  139  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.188729 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3801  MCP methyltransferase, CheR-type  32.06 
 
 
294 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2183  hypothetical protein  30.8 
 
 
980 aa  139  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.850093 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1874  MCP methyltransferase, CheR-type  32.82 
 
 
291 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.87 
 
 
1218 aa  138  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3195  chemotaxis protein methyltransferase CheR,putative  33.04 
 
 
307 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1788  putative PAS/PAC sensor protein  29.08 
 
 
998 aa  138  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>